目的探索阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)发病中的关键E3泛素连接酶及其表达特征。方法通过生物信息学方法分析筛选AD发生发展过程中的差异基因,行基因本体(GO)分析,并构建蛋白质互作网络(PPI)。继而,通过The Human Protein Atla...
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目的探索阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)发病中的关键E3泛素连接酶及其表达特征。方法通过生物信息学方法分析筛选AD发生发展过程中的差异基因,行基因本体(GO)分析,并构建蛋白质互作网络(PPI)。继而,通过The Human Protein Atlas和Alzdata数据库,分别查找泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system,UPS)中的E3泛素连接酶的组织细胞学定位和AD患者/对照不同脑区中的表达值,并通过qPCR方法在AD小鼠脑组织中验证。结果我们发现UPS和泛素结合酶结构域UBCc分别在参与AD发生进程的生物学功能和结构域中位居首列;PPI互作网络中多个UPS分子位居关键节点;神经元中特异性高表达的E3泛素连接酶(MKRN2、NEDD4L、LNX1、RNF41、TRIM36、RNF8和DTX4)在AD患者和AD小鼠脑组织中表达量下调。结论这7个E3泛素连接酶可能作为驱动因子参与AD进展,这对进一步寻找诊断和治疗AD的新靶点以及深入的机制探索提供了重要线索。
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