检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物医学工程学报 2009年第3期28卷 362-366,371页

作者：刘斌张正国中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

心电信号发生器在心电信号相关教学培训和心电医疗设备检测中有着广泛的应用。现有的心电信号发生器通常通过存储于设备内的实测心电信号或者用数学函数波形拟合发生心电信号波形,在逼真度和灵活度上各有缺陷。本研究试图研究一种能综... 详细信息

心电信号发生器在心电信号相关教学培训和心电医疗设备检测中有着广泛的应用。现有的心电信号发生器通常通过存储于设备内的实测心电信号或者用数学函数波形拟合发生心电信号波形,在逼真度和灵活度上各有缺陷。本研究试图研究一种能综合现有心电信号模拟方法优点的新的模拟方法,使心电信号发生器生成质量更高,更丰富的信号,拓展它的应用范围。通过将单周期心电信号模板库与RR间期模拟信号结合,本研究实现了种类丰富,逼真度高,可自由调节心率特性的心电信号的模拟。这种方法同时还具有运算量小和节省存储空间的特点。

关键词：心电信号模拟 RR间期

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本体支持的生物医学领域元数据异质性与可兼容性研究

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中国生物医学工程学报 2019年第3期38卷 324-331页

作者：张璐璐杨晟史涪仁潘虹洁王志刚杨啸林中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

利用本体支持数据元素的表示,是提升元数据机器可理解性的重要手段。采用生物医学通用数据元素数据库caDSR中的数据,评价相关的数据元素之间的语义异质性,并利用机器学习对元数据可兼容性进行判别。首先,从caDSR中选取60对通用数据元素... 详细信息

利用本体支持数据元素的表示,是提升元数据机器可理解性的重要手段。采用生物医学通用数据元素数据库caDSR中的数据,评价相关的数据元素之间的语义异质性,并利用机器学习对元数据可兼容性进行判别。首先,从caDSR中选取60对通用数据元素,涉及人口学、生活方式、既往病史和实验室测量等方面。依据ISO/IEC 111179标准抽提数据元素的必要组分,利用NCIT的本体支持,就每对关联数据元素的相似度进行评价。依据数据元素内部各组分的语义相似度,利用支持向量机,对数据元素间的可兼容性做出预测,其准确度超过80%。研究结果显示,目前在caDSR数据库中,对于元数据的定义存在较大的异质性,这些异质性在数据元素的概念域尤其集中。虽然如此,通过机器学习的方法,还是能够依据现有的数据元素的定义实现数据可兼容性的自动判断。研究所建立的方法,对于优化数据元素构建流程、丰富数据标准化工具具有一定的应用价值。

关键词：元数据异质性通用数据元素本体支持向量机

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阴离子化高分子包覆非病毒载体提高有血清环境下RNA干扰效率的研究

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中国生物医学工程学报 2016年第4期35卷 445-452页

作者：王晶谢丽菲孟洁刘健许海燕中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

大多数阳离子化高分子载体在血清环境中会大量吸附血清蛋白而导致转染效率低下,因而难以应用于临床。设计合成羧基化葡聚糖(Dex-COOH)和羧基化葡聚糖修饰富勒烯(C60-Dex-COOH)两种阴离子化高分子,并将其包覆在精胺化普鲁兰(Ps)与siRNA... 详细信息

大多数阳离子化高分子载体在血清环境中会大量吸附血清蛋白而导致转染效率低下,因而难以应用于临床。设计合成羧基化葡聚糖(Dex-COOH)和羧基化葡聚糖修饰富勒烯(C60-Dex-COOH)两种阴离子化高分子,并将其包覆在精胺化普鲁兰(Ps)与siRNA形成的复合物(PS/siRNA)外层,以减少复合物对血清蛋白的吸附。采用DLS/ELS检测阴离子包覆前后复合物的颗粒粒径及Zeta电位;用QCM-D验证阴离子包覆层的形成,并评价包覆层对牛血清白蛋白(BSA)吸附的影响;同时应用cck-8试剂、流式细胞术,检测包覆前后及不同包覆比例下复合物的细胞毒性、进入细胞的情况及对Hela-EGFP细胞的干扰效率。结果表明,Dex-COOH与C60-Dex-COOH能够在PS/siRNA外部形成稳定的负电性包覆层,有效阻止BSA的吸附,并在无血清的条件下显著降低复合物的细胞毒性;在有血清的环境中,表面包覆了阴离子化高分子的复合物可以不受血清蛋白的影响而被细胞大量摄取。对包覆了C60-Dex-COOH的PS/siRNA复合物转染组施加光照,可促使复合物从溶酶体中逃逸,将血清条件下PS/siRNA的干扰效率提高20%。该策略可有效提高阳离子化高分子载体介导的RNA干扰效率。

关键词：阳离子化高分子 siRNA载体阴离子包覆层蛋白吸附 RNA干扰

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乳腺癌休眠动物模型的建立

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中华病理学杂志 2007年第11期36卷 760-763页

作者：苏广彦刘玉琴任乐荣刘险峰顾蓓董继红高进中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院北京100005

目的模拟乳腺癌患者术后体内有少量肿瘤细胞存在,但长期无症状,也无特殊体征的特点而建立小鼠乳腺癌休眠模型并确定休眠细胞的存在。方法采用500个小鼠乳腺癌 Ca761-03细胞肌肉接种于30只615小鼠,以小鼠2个月(相当人5年)不成瘤为休眠标... 详细信息

目的模拟乳腺癌患者术后体内有少量肿瘤细胞存在,但长期无症状,也无特殊体征的特点而建立小鼠乳腺癌休眠模型并确定休眠细胞的存在。方法采用500个小鼠乳腺癌 Ca761-03细胞肌肉接种于30只615小鼠,以小鼠2个月(相当人5年)不成瘤为休眠标准,按休眠观察组、休眠验证组和复发验证组三组(各10只小鼠)连续观察肿瘤休眠发生情况。肿瘤细胞休眠的确认方法为,采用给予连续外伤刺激,接种部位取材,组织固定和 HE 染色观察肿瘤再生成情况。结果 500个小鼠乳腺癌 Ca761-03细胞肌肉接种于小鼠2个月后,有30%小鼠成瘤,70%处于休眠状态。休眠肿瘤给予连续外伤刺激5个月后,有90%小鼠成瘤。显示乳腺癌肿瘤细胞可以在小鼠体内长期保持休眠状态,在外伤刺激的作用下,休眠的肿瘤细胞可以再次增殖,成为肿瘤复发的根源。结论成功建立了小鼠乳腺癌休眠模型,并用外伤刺激休眠细胞增殖的方法确定了休眠肿瘤细胞在体内的存在。这一动物模型填补了实体瘤休眠动物模型缺乏的空白。

关键词：乳腺肿瘤模型动物休眠

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MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台

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中国生物医学工程学报 2017年第5期36卷 557-564页

作者：郭靖文杨晟史涪仁邵晨张璐璐王恒杨啸林中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应... 详细信息

在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台。通过复用NCBO BioPortal技术,搭建MedPotal软件框架。遴选精准医学相关本体,建立本体资源库。对原框架中的代码和本体处理工具进行修正和完善,使之能够在本体稳定运行的基础上满足大批量数据的自动化处理。目前,该平台已整合42个生物医学本体,建立了本体之间术语映射关系,通过页面和REST API方式,提供术语检索、本体映射、数据标准化注释等本体应用服务(http://***)。MedPortal本体平台将为生物医学数据整合提供帮助。

关键词：生物医学本体 MedPortal 数据库本体映射本体注释

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短时非线性方法用于心率变异性分析

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中国生物医学工程学报 2015年第2期34卷 229-236页

作者：刘红夺儿朱逸湛萍王志刚彭屹中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

非线性分析为揭示心率变异性(HRV)的生理和病理变化提供了新的视角,不仅可反映更多关于心脏自主神经对于心率动力学调节的信息,而且与传统的时域和频域分析形成互补。特别是短时非线性分析契合了心率动力学的非线性和非平稳特征。文中... 详细信息

非线性分析为揭示心率变异性(HRV)的生理和病理变化提供了新的视角,不仅可反映更多关于心脏自主神经对于心率动力学调节的信息,而且与传统的时域和频域分析形成互补。特别是短时非线性分析契合了心率动力学的非线性和非平稳特征。文中就符号动力学、去趋势波动分析中的短时分形尺度指数α1,与复杂度相关的近似熵和样本熵,以及定量递归分析等方法,分别介绍了它们在短时RR间期序列分析中的应用。同时从短时非线性分析与长时序列结合,以及基于多分析域指标的判别分析这两方面,说明了短时非线性方法在HRV分析中的应用拓展。最后,就这些方法应用于临床需要解决的问题进行了阐述。

关键词：心率变异性非线性分析短时序列心脏自主神经

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蛋白质相互作用的文本挖掘研究进展

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中国生物医学工程学报 2008年第5期27卷 764-772,782页

作者：张智张正国中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

生物体的生理功能主要由细胞中的蛋白质调控,因此研究蛋白质间的相互作用成为理解生命活动的基础。使用文本挖掘方法研究蛋白质相互作用可以充分利用现有的大量文献揭示出与蛋白质相关的潜在知识,构造蛋白质相互作用网络。着重从相关的... 详细信息

生物体的生理功能主要由细胞中的蛋白质调控,因此研究蛋白质间的相互作用成为理解生命活动的基础。使用文本挖掘方法研究蛋白质相互作用可以充分利用现有的大量文献揭示出与蛋白质相关的潜在知识,构造蛋白质相互作用网络。着重从相关的语料集和工具、所涉及的技术和方法等方面,对蛋白质相互作用的文本挖掘进行综述,并对研究前景进行展望。

关键词：文本挖掘关系抽取蛋白质相互作用模式识别

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致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建

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中国生物医学工程学报 2012年第6期31卷 882-888页

作者：许三岗庄永龙郝志勇单广良杨啸林王恒中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fis... 详细信息

为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fisher's精确检验R程序包对Gene Ontology和Pathway的注释结果进行富集效应分析,并调用Graphviz工具对蛋白质相互作用结果进行图形化描述。致病疟原虫分子功能注释二级数据库提供多入口的分子注释类型,使Gene Ontology、Pathway及蛋白质相互作用注释信息以图形化界面直观显示。该数据库为疟原虫致病分子机制研究提供良好的高通量数据分析工具,可有效促进疟原虫基因功能、信号通路及疟疾疫苗抗原筛选等方面的研究。

关键词：疟原虫功能注释二级数据库

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急进和渐进西藏对南极考察昆仑站预选队员心血管功能及其应激因子的影响

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中国应用生理学杂志 2020年第5期36卷 419-424页

作者：卢艳花熊艳蕾方露陈楠徐成丽中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院北京100005

目的:分析急进和渐进西藏高原对拟进入中国南极考察昆仑站的第31、32和33次预选队员的心血管功能及其相关应激因子水平的影响,为选拔合格的内陆考察队员提供科学依据。方法:以2014~2016年第31、32和33次队共85名中国南极考察昆仑站预选... 详细信息

目的:分析急进和渐进西藏高原对拟进入中国南极考察昆仑站的第31、32和33次预选队员的心血管功能及其相关应激因子水平的影响,为选拔合格的内陆考察队员提供科学依据。方法:以2014~2016年第31、32和33次队共85名中国南极考察昆仑站预选队员为研究对象,依据进入高原方式分为乘飞机急进高原组(急进组,n=55)和乘火车渐进高原组(渐进组,n=30),分别在上海出发(海拔4 m)、到达拉萨(海拔3658 m)和进入更高海拔的羊八井(海拔4300 m)3个时间点,采用心功能仪和心电图仪动态检测预选队员的心血管功能,并同步采集队员的唾液样本,采用ELISA法检测唾液中应激因子睾酮(T)、皮质醇(COR)和免疫球蛋白A(IgA)水平。结果:与海拔4 m相比,两组队员在到达海拔3658 m、4300 m高原时,心率(HR)显著升高(P<0.05),指端静脉血氧饱和度(SpO 2)显著下降(P<0.05),但两组间在相同海拔高度上无显著差异;两组间心电传导异常率无显著差异;与海拔4 m相比,到达3658 m和4300 m处两组队员的血压均显著升高(P<0.05),部分心肌收缩和泵血功能指标均显著降低(P<0.05),但由于心率增加代偿,心输出量(CO)无显著变化。在海拔4300 m时,急进组的肺水指数(TFC)显著高于渐进组(P<0.01)。进入高原后与出发水平的差值比较,两组在海拔3658 m处T变化量无显著性差异(P>0.05),急进组COR和IgA变化量显著高于渐进组(P<0.05);在海拔4300 m处急进组IgA变化量显著高于渐进组(P<0.05)。结论:对比渐进高原,急进高原对南极考察昆仑站预选队员的心血管功能及唾液中的应激激素和免疫球蛋白水平均有更明显影响。提示应在岗前严格选拔能适应南极昆仑站低氧环境的考察队员,保障南极考察队员身心健康,确保南极考察任务顺利实施。

关键词：西藏高原中国南极考察预选队员心血管功能应激因子

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代谢重编程在肺动脉高压发病机制中的研究进展

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中国病理生理杂志 2021年第11期37卷 2062-2071页

作者：齐先梅罗娅王婧中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100730

肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)是一组严重的进行性心肺疾病,肺血管收缩、肺中小动脉重构及原位血栓形成引起肺血管阻力逐渐增加,最终导致右心衰竭甚至死亡[1-2]。目前认为促进PH发生发展的关键机制是血管细胞的过度增殖和/或... 详细信息

肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)是一组严重的进行性心肺疾病,肺血管收缩、肺中小动脉重构及原位血栓形成引起肺血管阻力逐渐增加,最终导致右心衰竭甚至死亡[1-2]。目前认为促进PH发生发展的关键机制是血管细胞的过度增殖和/或抗凋亡[3],同时血管收缩、炎症及纤维化也参与其中[4-5]。PH患病人数庞大,发病率逐年升高[6],由于对PH发生的病理生理机制认识不全,目前尚无治愈方法[7]。代谢重编程通过供给能量、生物合成中间物和还原性物质,维持细胞的氧化还原稳态并保证生物分子合成,使细胞呈现增殖、迁移以及抗凋亡的肿瘤样恶性表型,导致肺血管重构和右心室肥厚,加速PH的发生发展[7]。

关键词：肺动脉高压代谢重编程发病机制

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