检索结果-内蒙古大学图书馆

中国医药生物技术 2009年第3期4卷 207-211页

作者：马宁张正国中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院生物医学工程系北京100005

目的探讨在基因芯片聚类分析前对数据进行主成分分析是否有助于提高聚类的准确性。方法选取3组包含大量被生物学家人为分类基因的芯片数据集Budding yeast、Saccharomyces cerevisiae、Central nervous system作为实验数据，分别计算对... 详细信息

目的探讨在基因芯片聚类分析前对数据进行主成分分析是否有助于提高聚类的准确性。方法选取3组包含大量被生物学家人为分类基因的芯片数据集Budding yeast、Saccharomyces cerevisiae、Central nervous system作为实验数据，分别计算对原数据直接聚类和提取主成分后聚类的结果，并以信息变化量为指标衡量这些结果与人为分类的匹配度。采用启发式算法搜寻最优主成分组合，比较欧几里德距离和相似系数2种距离度量方法以及层次聚类和K-重心聚类2种聚类算法的结果。结果在3组数据集中，层次聚类算法相比K-重心聚类算法效果均略好，且以主成分代替原数据进行聚类分析都没有显著提高聚类的准确性，有些情况下甚至不如后者。仅在Saccharomyces cerevisiae数据集中，当主成分个数足以覆盖原数据中90％-95％方差时，特定的主成分组合才展现出一定优势，但这种组合与主成分大小顺序并无规律可循。结论在基因芯片数据模型不清时，应避免盲目地使用数据中提取的主成分作为聚类分析的输入。

关键词：主成分分析寡核苷酸序列分析聚类分析计算生物学

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精胺-普鲁兰联合地氯雷他定介导的NOTCH1沉默对急性T淋巴细胞白血病细胞系Jurkat的影响

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基础医学与临床 2021年第6期41卷 786-791页

作者：王田许仕琳王涛温涛孟洁刘健许海燕中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程学系北京100005

目的以精胺-普鲁兰(Ps)作为NOTCH1 siRNA的载体,研究Ps联合溶酶体促渗剂地氯雷他定(DL)介导的NOTCH1沉默对急性T淋巴细胞白血病细胞系Jurkat的作用。方法采用动态光散射仪分析不同N/P比siRNA/Ps复合物的粒径和Zeta电位。将Jurkat细胞与s... 详细信息

目的以精胺-普鲁兰(Ps)作为NOTCH1 siRNA的载体,研究Ps联合溶酶体促渗剂地氯雷他定(DL)介导的NOTCH1沉默对急性T淋巴细胞白血病细胞系Jurkat的作用。方法采用动态光散射仪分析不同N/P比siRNA/Ps复合物的粒径和Zeta电位。将Jurkat细胞与siNOTCH1/Ps共孵育6 h,换液后加入含10μmol/L DL的RPMI 1640完全培养基继续孵育18 h;实时荧光定量PCR检测NOTCH1的沉默效率;流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡;Western blot检测NOTCH1下游蛋白C-MYC和凋亡相关蛋白caspase 3和cleaved caspase 3的表达。结果N/P比为5的siRNA/Ps复合物粒径为(203.97±1.07)nm,Zeta电位为(46.13±0.07)mV;复合物在10%FBS培养基中稳定。在Jurkat细胞中,与无DL组相比,siNOTCH1/Ps联合10μmol/L DL可高效沉默NOTCH1,诱导细胞周期阻滞在G 1期,促进细胞凋亡(P<0.05);同时,Jurkat细胞中cleaved caspase 3蛋白的表达水平升高,C-MYC及caspase 3蛋白的表达水平降低(P<0.05)。结论Ps联合溶酶体促渗剂DL有效介导Jurkat细胞中的NOTCH1沉默,从而诱导急性T淋巴细胞白血病细胞G 1期阻滞,并促进细胞凋亡。

关键词： NOTCH1 精胺-普鲁兰地氯雷他定急性T淋巴细胞白血病细胞系Jurkat 凋亡

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咖啡酸改性明胶水凝胶制备及其抗氧化功能

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基础医学与临床 2022年第7期42卷 1035-1041页

作者：郝博雅曾菲温涛孟洁许海燕刘健中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程学系北京100005

目的制备咖啡酸改性明胶(CA-gel)水凝胶,研究不同接枝率对水凝胶理化性质的影响,初步评价其抗氧化性能。方法通过控制咖啡酸和明胶的投料比,制备不同接枝率的CA-gel,使用漆酶引发氧化交联反应,得到咖啡酸改性明胶水凝胶。使用高效液相色... 详细信息

目的制备咖啡酸改性明胶(CA-gel)水凝胶,研究不同接枝率对水凝胶理化性质的影响,初步评价其抗氧化性能。方法通过控制咖啡酸和明胶的投料比,制备不同接枝率的CA-gel,使用漆酶引发氧化交联反应,得到咖啡酸改性明胶水凝胶。使用高效液相色谱(HPLC)和核磁共振氢谱(^(1)H-NMR)表征CA-gel的分子结构;通过紫外-可见分光光度计测定咖啡酸接枝率;通过倒置试管法测定凝胶固化时间;使用微球压痕法测定其弹性模量;根据溶胀和降解前后质量变化计算溶胀率和降解速率;通过测定1,1-二苯基-2-2-三硝基苯肼自由基(DPPH·)溶液吸光度的变化计算其对DPPH自由基清除能力;使用细胞增殖-毒性检测(CCK-8)方法评价其细胞相容性及在过氧化氢环境中对成纤维细胞的保护作用。结果咖啡酸被接枝到明胶分子上,当接枝率分别为33.0μmol/g、61.8μmol/g、74.4μmol/g时,三种水凝胶的固化时间分别为33 min、42 min、47 min;弹性模量分别为7.2 kPa、29.4 kPa、34.5 kPa;溶胀率分别为896.5%、835.3%、803.9%;降解速率依次降低;对DPPH自由基清除能力分别为38.5%、41.9%、49.8%;具有良好的细胞相容性,并对过氧化氢环境中的成纤维细胞具有保护作用。结论CA-gel水凝胶获得了可调的固化时间、弹性模量、生物降解速率以及自由基清除能力,在高氧化应激微环境中对成纤维细胞有显著的保护作用。

关键词：明胶水凝胶咖啡酸抗氧化漆酶

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ICP-OES法与EDTA直接滴定法测定含石膏方剂中钙离子含量研究

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中国实验方剂学杂志 2013年第6期19卷 69-74页

作者：李晓晶马强盛振华葛尔宁苏燕内蒙古科技大学包头医学院基础学院内蒙古包头014060 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程学系北京100005 浙江中医药大学分析测试中心杭州310053

目的:通过对比EDTA直接滴定法和ICP-OES法测定钙标准液、单煎石膏药液、白虎汤、麻杏石甘汤和竹叶石膏汤同一样品中Ca2+溶出量差异,探讨复方汤剂中有机基底等因素对EDTA直接滴定法测定复方药液中Ca2+溶出量的影响程度并建立一种可信的... 详细信息

目的:通过对比EDTA直接滴定法和ICP-OES法测定钙标准液、单煎石膏药液、白虎汤、麻杏石甘汤和竹叶石膏汤同一样品中Ca2+溶出量差异,探讨复方汤剂中有机基底等因素对EDTA直接滴定法测定复方药液中Ca2+溶出量的影响程度并建立一种可信的测定方剂中Ca2+溶出量的方法。方法:通过对比EDTA直接滴定法和微波消解-ICP-OES法测定钙标准液、单煎石膏药液、白虎汤、麻杏石甘汤和竹叶石膏汤同一样品中Ca2+溶出量。结果:EDTA直接滴定法与ICP-OES法测定钙标准液结果间无显著差异,两方法测定结果相同。两方法测定单煎石膏、白虎汤、麻杏石甘汤和竹叶石膏汤样品中Ca2+溶出量结果间差异显著(P<0.01),EDTA直接滴定法测定结果较ICP-OES法偏大。结论:EDTA直接滴定法测定样品中Ca2+溶出量受样品基底复杂程度影响,影响因素对EDTA直接滴定法测定影响均匀且呈线性关系。EDTA直接滴定法测定复方中Ca2+溶出量偏大,较不适合用于测定中药复方中Ca2+溶出量。

关键词： EDTA直接滴定法 ICP-OES法石膏含石膏方剂方法学比较

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基于Moodle的混合式教学在医学教育中的应用

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基础医学与临床 2021年第11期41卷 1701-1706页

作者：张艳丽王志刚史涪仁杨啸林中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程学系北京100005 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院网络中心北京100005

专业的教学管理信息化(LMS)平台建设是医学教育改革中的重要工作内容之一。北京协和医学院(PUMC)在医学教育改革实践的工作中,以开源教学管理软件并强调营造交互式自主学习环境(Moodle)为基础,建设了支持混合式教学法实施的信息化平台... 详细信息

专业的教学管理信息化(LMS)平台建设是医学教育改革中的重要工作内容之一。北京协和医学院(PUMC)在医学教育改革实践的工作中,以开源教学管理软件并强调营造交互式自主学习环境(Moodle)为基础,建设了支持混合式教学法实施的信息化平台。在这个过程中,建立和完善基于Moodle的混合式教学实施框架;在46门次课程中建成学习资源丰富、有序、教师引导互动、可监督、可反馈的学生自主学习环境;逐步探索虚拟学习环境与课堂教学的紧密融合、创新性和探索性教学活动的开展;并将信息化平台积累的教学活动数据应用于教学质量的评价。通过该平台的建设,有力推进了现代教学方法在PUMC不同类型高等医学教育工作中实施。

关键词： Moodle 混合式教学自主学习医学教育改革

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以趋化因子受体4为靶点的恶性肿瘤靶向特异性磁共振对比剂的构建及体外成像

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协和医学杂志 2013年第3期4卷 286-293页

作者：朱亮刘健雷晶许海燕孟洁何泳蓝金征宇薛华丹中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院放射科北京100730 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所生物医学工程系北京100005

目的构建以趋化因子受体4(C-X-C motif chemokine receptor4,CXCR4)为靶点的磁共振靶向对比剂并通过体外恶性肿瘤细胞的靶向磁共振成像探讨磁共振信号变化与肿瘤细胞CXCR4表达量的相关性。方法用细胞免疫荧光法和流式细胞计数法分别观... 详细信息

目的构建以趋化因子受体4(C-X-C motif chemokine receptor4,CXCR4)为靶点的磁共振靶向对比剂并通过体外恶性肿瘤细胞的靶向磁共振成像探讨磁共振信号变化与肿瘤细胞CXCR4表达量的相关性。方法用细胞免疫荧光法和流式细胞计数法分别观察和测定3种恶性肿瘤细胞株(胰腺癌PANC-1、乳腺癌MCF-7和肺癌A549)的CXCR4表达,并验证新型多肽Pep12与3种恶性肿瘤细胞表面的CXCR4特异性结合的能力。化学合成超顺磁性纳米氧化铁颗粒(ultrasmall paramagnetic iron oxide nanoparticle,USPIO-Np),并与Pep12实现共轭联接。动态光散射法测定Pep12-USPIO的水和直径;用MTS细胞增殖与毒性检测试剂盒测定其细胞毒性;磁共振成像检测不同浓度Pep12-USPIO溶液的T2/T2*信号变化。普鲁士蓝染色验证Pep12-USPIO与3种肿瘤细胞的特异性结合,磁共振成像验证Pep12-USPIO所致磁共振信号变化与3种肿瘤细胞CXCR4表达量的相关性。结果 3种恶性肿瘤细胞株均有不同水平的CXCR4表达,流式细胞计数的CXCR4阳性细胞百分比分别为PANC-1:18.7%;A549:2.9%;MCF-7:1.7%。多肽Pep12与3种恶性肿瘤细胞均能特异性结合,并且结合量与CXCR4表达量呈正相关性(r=0.999,P=0.027)。自行合成的Pep12-USPIO在室温下长时间保持稳定的胶体状态,水和直径为(86.60±1.48)nm。Pep12-USPIO细胞毒性较低,铁浓度低于25μg/ml时,ΔR2值和ΔR2*值与铁浓度呈现良好的线性正比关系(△R2:R2=0.996;△R2*:R2=0.977)。普鲁士蓝染色证实Pep12-USPIO能够与3种恶性肿瘤细胞实现靶向结合,磁共振成像证实Pep12-USPIO能够造成肿瘤细胞悬液磁共振T2/T2*值降低(P<0.01),并且ΔR2/ΔR2*值与肿瘤细胞CXCR4表达水平呈显著的正相关(ΔR2:r=0.997,P=0.050;ΔR2*:r=1.000,P=0.019)。结论 Pep12-USPIO物理性质稳定,细胞毒性较低,能够与不同恶性肿瘤细胞株上的CXCR4特异性结合并实现磁共振T2/T2*信号的减低,并且磁共振信号的变化与细胞株CXCR4的表达量呈正相关。

关键词：恶性肿瘤细胞分子影像学磁共振靶向对比剂趋化因子受体4

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雄黄新剂型对K562细胞的作用研究

雄黄新剂型对K562细胞的作用研究

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The 3rd Doctoral Forum of Nanobiology and Medical Science(第三届全国纳米生物与医学博士生学术论坛)

作者：王川马强孟洁刘健许海燕中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程系

雄黄从20世纪七十年代开始应用于白血病的治疗。经过半个世纪的临床应用,取得了一定疗效,并逐步有含雄黄的创新药物如复方黄黛片等面世。慢性髓细胞性白血病(Chronic Myelogenous Leukemia,CML)是最常见的一类慢性白血病,占所有白血病... 详细信息

雄黄从20世纪七十年代开始应用于白血病的治疗。经过半个世纪的临床应用,取得了一定疗效,并逐步有含雄黄的创新药物如复方黄黛片等面世。慢性髓细胞性白血病(Chronic Myelogenous Leukemia,CML)是最常见的一类慢性白血病,占所有白血病的15～20％,发病原因尚不完全明确。伊马替尼(imatinib,IM)作为CML的一线用药在世界各国广泛应用,在临床治疗中取得了很好的疗效。但IM对急变期(blast phase,CML-BP)患者疗效不佳,长期使用约有1/3左右的患者会产生耐药。临床治疗结果表明：雄黄对急变期(blast phase,CML-BP)患者和IM耐药患者有效。此外,雄黄对白血病治疗的适用范围更广,对多种白血病有效。但是,雄黄只溶于强碱溶液,难溶于水和盐酸;口服给药的生物利用度只有约4％。因此,研制新剂型对于提高其生物利用度和治疗功效以及白血病的药物治疗均具有重要意义。

关键词：雄黄 K562 分化凋亡白血病

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3D生物打印肿瘤模型诊治平台质量控制标准

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肿瘤 2023年第7期43卷 559-569页

作者：孙铭浩杨华瑜孙乐家孙航张健刚庞媛余剑伟王亚南黄鹏羽孙伟毛一雷中国医学科学院北京协和医院肝脏外科北京100730 南京医科大学第一附属医院普通外科江苏南京210029 清华大学机械工程系生物制造中心北京100084 生物制造与快速成形技术北京市重点实验室北京100084 海尔施生物医药股份有限公司浙江宁波315040 中国医学科学院基础医学研究所-北京协和医学院基础学院生理学系北京100005 中国医学科学院生物医学工程研究所天津300192 中国医学科学院天津医学健康研究院先进医用材料与医疗器械全国重点实验室天津301600

3D生物打印是一种创新生物制造策略,该技术可以在规定的3D层次结构中精确定位包括活细胞和类细胞外基质成分在内的生物制品,创建具有生物活性的人工多细胞组织或器官,为研发更接近真实状态的新型人类组织体外模型提供了一种全新的思路... 详细信息

3D生物打印是一种创新生物制造策略,该技术可以在规定的3D层次结构中精确定位包括活细胞和类细胞外基质成分在内的生物制品,创建具有生物活性的人工多细胞组织或器官,为研发更接近真实状态的新型人类组织体外模型提供了一种全新的思路和方法。尽管目前该技术仍处于早期阶段,但生物打印策略已被广泛证实在精准治疗和再生医学中拥有巨大潜力。3D生物打印不仅可以在体外生成人体正常的类组织器官,其生成的肿瘤模型还能够极大程度地保留与亲本肿瘤相一致的组织病理学特征、生物标志物表达以及基因突变和表达谱,不仅可以作为新药研发的优良模型,而且在药物敏感度检测预测患者疗效中的准确度也较高,因此可以为肿瘤患者的个体化精准治疗提供有力支持。然而,3D生物打印技术在指导临床治疗中的应用尚处于起步阶段,与传统的2D组织培养相比,3D生物打印肿瘤模型的建立需要更为严格的质量控制标准和更高的技术水平。随着近年来3D生物打印技术的飞速发展,3D生物打印肿瘤模型已经广泛应用于包括肝细胞癌、胰腺癌、结直肠癌、卵巢癌和神经母细胞瘤在内的多种实体瘤中,但目前在全世界范围内尚无利用3D生物打印肿瘤模型进行药物敏感度检测的规范化标准。因此,为了推动3D生物打印技术在肿瘤药物敏感度检测及精准治疗方面的规范应用,本团队基于自身多年积累的研究成果撰写了本文,且后续将根据研究进展不断地进行更新和修订。

关键词： 3D生物打印肿瘤模型药物敏感度精准医疗质量规范化控制

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Moodle在4+4临床医学试点班生物化学教学中的应用体会

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基础医学与临床 2021年第10期41卷 1533-1537页

作者：杨啸林张艳丽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程学系北京100005 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

北京协和医学院面向4+4临床医学试点班新生,在医学总论中设立《生物化学》复习课程,以Moodle平台配合混合式课堂实施,帮助不同专业学生对医预必修课《生物化学》进行复习、巩固与提高。在Moodle支持下建设自主学习环境,整合了Macmillan ... 详细信息

北京协和医学院面向4+4临床医学试点班新生,在医学总论中设立《生物化学》复习课程,以Moodle平台配合混合式课堂实施,帮助不同专业学生对医预必修课《生物化学》进行复习、巩固与提高。在Moodle支持下建设自主学习环境,整合了Macmillan Sapling电子学习资源,并建立了章节课前测验,提升学生基础知识掌握程度;采用Moodle的“Quiz”与“Workshop”两种不同模块进行案例教学,帮助学生建立生物化学变化与疾病的关联。这是以Moodle为手段,对适合4+4学生特点的《生物化学》授课模式的积极探索。

关键词：生物化学 Moodle 病例教学法 4+4临床医学试点班

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血清蛋白对siRNA复合物颗粒尺寸及RNA干扰效率的影响

血清蛋白对siRNA复合物颗粒尺寸及RNA干扰效率的影响

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The 3rd Doctoral Forum of Nanobiology and Medical Science(第三届全国纳米生物与医学博士生学术论坛)

作者：刘会可刘健许海燕中国医学科学院基础医学研究所-北京协和医学院基础学院生物医学工程系北京 100005

RNA干扰技术在肿瘤和病毒感染等疾病治疗中具有良好的应用前景,尤其是与蛋白表达相关的肿瘤。过去的几十年里,人们对该技术进行了大量研究并取得了一定的成果,在这个过程中,siRNA的递送一直备受关注,同时也是影响RNA干扰效率的重要因素... 详细信息

RNA干扰技术在肿瘤和病毒感染等疾病治疗中具有良好的应用前景,尤其是与蛋白表达相关的肿瘤。过去的几十年里,人们对该技术进行了大量研究并取得了一定的成果,在这个过程中,siRNA的递送一直备受关注,同时也是影响RNA干扰效率的重要因素。众所周知,病毒作为siRNA载体可以有效的转运siRNA,但是病毒具有易突变和免疫原性等缺点,因此人工合成载体得到广泛关注,人工载体具有易合成、低免疫原性、可以保护siRNA免于降解进而提高RNA干扰效率等特点。阳离子聚合物是目前研究、应用最多的非病毒载体之一。阳离子聚合物递送siRNA过程中可以与培养基中的血清蛋白(Pr)非特异性结合,从而降低RNA干扰效率。为了不受血清的影响,体外实验中通常的做法是使用无血清培养基。然而,无血清培养条件下,阳离子聚合物可以非特异的与细胞膜结合,对细胞具有较大的毒性。

关键词：血清蛋白普鲁兰精氨 RNA干扰

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