检索结果-内蒙古大学图书馆

基础医学与临床 2025年第06期 735-740页

作者：夏澜荣誉夏洪恺马艳妮余佳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室

目的探究假基因GTF3AP2对红系分化的影响。方法通过高通量转录组测序鉴定可能在红系分化中发挥作用的功能性假基因GTF3AP2,在CD34+造血干祖细胞中通过shRNA抑制GTF3AP2内源表达，利用集落形成实验检测造血干细胞的集落形成能力以及流... 详细信息

目的探究假基因GTF3AP2对红系分化的影响。方法通过高通量转录组测序鉴定可能在红系分化中发挥作用的功能性假基因GTF3AP2,在CD34+造血干祖细胞中通过shRNA抑制GTF3AP2内源表达，利用集落形成实验检测造血干细胞的集落形成能力以及流式分析检测红系/巨核系祖细胞的比例变化，并通过转录组测序确定其在红系分化中的作用，揭示体外敲降GTF3PAP2后细胞分子水平的变化。结果抑制GTF3AP2的内源表达后，细胞的扩增能力显著增强，其中红系集落数目明显增多（P<0.001）,CD71+CD235a+红细胞前体细胞比例显著增加（P<0.01）,而CD71-CD235a+成熟红细胞比例减少（P<0.05）,同时红系分化相关基因如KLF1、HBB、GYPA、EPOR、TFRC等表达显著下降。结论敲降GTF3AP2促进红系前体细胞扩增，抑制红细胞成熟，提示GTF3AP2可能在红系分化过程中发挥调控作用。

关键词：假基因红系分化转录组测序 GTF3AP2

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基于人工智能的心血管疾病预测模型研究现状

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蚌埠医科大学学报 2025年第1期50卷 6-13页

作者：彭石娟王小满高琴陈厚早蚌埠医科大学卫生管理学院安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学基础医学院生理学教研室安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学心脑血管疾病基础与临床重点实验室安徽蚌埠233030 中国医学科学院基础医学研究所暨北京协和医学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究国家重点实验室北京100005

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,... 详细信息

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,传统的风险模型通常无法捕捉危险因素之间的非线性关系。人工智能(AI)技术,特别是监督式机器学习和深度学习,为CVD预测提供了新视角和工具。近几年,基于电子病历、多模态影像等临床数据和衰老大数据可以准确地预测CVD的发病和死亡风险,因此,本文将从传统评分、基于AI的临床数据和衰老大数据的CVD预测模型研究现状分别进行阐述,为促进AI结合CVD提供思路。

关键词：心血管疾病人工智能预测模型衰老生物学年龄

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麦角硫因对中老年小鼠组织代谢的影响

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基础医学与临床 2025年第06期 709-713页

作者：陈浩然王芳马艳妮余佳王琳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室

目的探究麦角硫因(EGT)对中老年小鼠组织代谢的影响。方法选取9个月龄的中老年C57BL/6J小鼠，实验组按照35 mg EGT/kg体质量的剂量进行EGT水溶液灌胃，对照组进行等量的水灌胃，每两天干预1次，两组小鼠均用不含EGT的饲料喂养。持续灌... 详细信息

目的探究麦角硫因(EGT)对中老年小鼠组织代谢的影响。方法选取9个月龄的中老年C57BL/6J小鼠，实验组按照35 mg EGT/kg体质量的剂量进行EGT水溶液灌胃，对照组进行等量的水灌胃，每两天干预1次，两组小鼠均用不含EGT的饲料喂养。持续灌胃7周后收集小鼠的肝脏、肾、小肠组织，借助超高效液相色谱-质谱(UHPLC-MS)技术进行非靶向代谢组学检测。挖掘差异代谢物并进行KEGG代谢通路富集分析。结果与对照组相比，经EGT灌胃处理后的中老年小鼠的肝脏、肾、小肠组织中氧化还原平衡相关的代谢物丰度未发生明显改变，但肝脏中(次)牛磺酸代谢(P<0.01)、肾中嘌呤代谢(P<0.01)、小肠中半胱氨酸和甲硫氨酸代谢(P<0.001)等受到了显著影响。结论麦角硫因作用下中老年小鼠肝脏、肾、小肠组织中发生了非氧化还原相关的代谢变化。

关键词：麦角硫因中老年小鼠代谢组代谢通路

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HAP1细胞有丝分裂过程中的动态转录物组研究

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基础医学与临床 2025年第06期 786-792页

作者：吴雪丽杨玉容保永莉吴汝成王莉莎陈阳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室

目的研究HAP1细胞在有丝分裂同步化后释放过程中分子水平上的动态变化，旨在全面了解有丝分裂期间的转录物图谱及其调控机制。方法使用诺考达唑对HAP1细胞进行有丝分裂同步化阻滞后释放，分别在释放后0 min、20 min、80 min收集细胞... 详细信息

目的研究HAP1细胞在有丝分裂同步化后释放过程中分子水平上的动态变化，旨在全面了解有丝分裂期间的转录物图谱及其调控机制。方法使用诺考达唑对HAP1细胞进行有丝分裂同步化阻滞后释放，分别在释放后0 min、20 min、80 min收集细胞样本并进行转录物组测序(RNA-seq)。对转录物组数据进行清洗后分析差异表达基因、表达趋势聚类和功能富集，结合蛋白质相互作用网络，探讨HAP1细胞在有丝分裂过程中信号通路的变化。结果 HAP1细胞在有丝分裂同步释放后的转录组在时间序列上经历了显著变化，差异基因聚类分析揭示了四个基因簇，富集于p53信号传导、细胞质翻译等重要生物学过程。结论 HAP1细胞有丝分裂过程中转录组呈现时间依赖性动态变化，细胞应激响应、翻译调控和染色质重塑关键信号通路协同作用，确保细胞在退出有丝分裂中平衡生长与应激反应。

关键词：有丝分裂转录物组细胞周期同步化信号通路调控

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微RNA在大脑新皮层层次形成中的调控作用

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生物化学与生物物理进展 2024年第10期51卷 2392-2404页

作者：舒鹏程窦欣怡中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院重大疾病共性机制全国重点实验室生物化学与分子生物学系北京100005

种类多样的神经元有序排列和特异性的连接形成了大脑新皮层的6层组织,从而构成了神经系统高级功能的核心。了解大脑新皮层发育形成的机制将为理解哺乳动物乃至人类的生理与行为提供理论基础,也为神经系统疾病诊疗带来重大影响。本文以微... 详细信息

种类多样的神经元有序排列和特异性的连接形成了大脑新皮层的6层组织,从而构成了神经系统高级功能的核心。了解大脑新皮层发育形成的机制将为理解哺乳动物乃至人类的生理与行为提供理论基础,也为神经系统疾病诊疗带来重大影响。本文以微RNA(microRNAs,miRNAs)为对象,结合笔者实验室工作,总结近年来所发现的miRNAs在大脑皮层层次形成过程中的研究进展,特别是在神经干细胞时序性命运决定、投射神经元多样性的形成、神经元放射状迁移,以及分裂后神经元进一步命运特化等方面的进展,为大脑皮层的发育机制研究提供新的思路。

关键词：大脑新皮层投射神经元层次形成微RNA Dicer

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口服草药来源的小RNA(XKC-sRNA-h3)可治疗血管紧张素Ⅱ诱导的小鼠高血压

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中国科学：生命科学 2024年第5期54卷 925-935页

作者：汤克功王小娜赵煜李晓北姜振宇梅颂陈明锐马一鸣杜芯仪乔翔宇孙娜刘佳齐蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005

高血压是心血管疾病发病和死亡的重要危险因素之一,也是全球公共卫生关注的焦点.目前,寡核苷酸药物已被证明可用于多种疾病治疗,是未来极有前景的药物研发方向.本研究展示了一条草药来源的小RNA(small RNA, sRNA)——XKC-sRNA-h3(B55710... 详细信息

高血压是心血管疾病发病和死亡的重要危险因素之一,也是全球公共卫生关注的焦点.目前,寡核苷酸药物已被证明可用于多种疾病治疗,是未来极有前景的药物研发方向.本研究展示了一条草药来源的小RNA(small RNA, sRNA)——XKC-sRNA-h3(B55710460, F221.I000082.B11),通过靶向血管紧张素转换酶(angiotensin-converting enzyme, ACE)基因而在高血压小鼠模型中有显著的降压效果.相比降压药卡托普利,口服鞘氨醇(d18:1)-XKCsRNA-h3本草体可以更有效地缓解血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ, Ang Ⅱ)诱导的小鼠高血压性心脏损伤和肾脏损伤.这些结果表明, XKC-sRNA-h3有望成为一种新型可口服治疗高血压的ACEI类寡核苷酸药物.

关键词：高血压寡核苷酸药物口服给药

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靶向TLR4的口服寡核苷酸药物BZL-sRNA-20可有效缓解小鼠急性肺损伤

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中国科学：生命科学 2024年第7期54卷 1279-1291页

作者：赵丹丹秦宇豪刘佳齐汤克功鲁帅尧刘子睿林烨暄张聪黄凤鸣常佳慧李昌田明尧马一鸣李晓芸周丛照李霄彭小忠金宁一蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所昆明650031 中国农业科学院长春兽医研究所长春130122 中国科学技术大学合肥微尺度物质科学国家研究中心合肥230027

2019年12月底,新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)开始流行.急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)和急性肺损伤(acute lung injury,ALI)是由细菌脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)、禽流感病毒和新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)等引发的高致死疾病.Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)是ARDS和ALI病理通路中的关键靶点.草药小RNA(small RNA,sRNA)已被报道是草药药效的重要成分之一.本研究发现,半枝莲来源的小核酸BZL-sRNA-20(检索号:B59471456;ID:F2201.Q001979.B11)是TLR4及促炎细胞因子的有效抑制剂,可下调细菌脂磷壁酸(lipoteichoic acid,LTA)和聚肌苷酸-聚胞苷酸(Poly(I:C))引发上升的促炎细胞因子水平,并能挽救禽流感病毒H5N1,SARSCoV-2及其多种变异株感染所致的细胞死亡.此外,口服本草体(bencaosome):(鞘氨醇(d22:0)+BZL-sRNA-20)可缓解LPS与SARS-CoV-2诱导的小鼠急性肺损伤.本研究结果表明,半枝莲来源的BZL-sRNA-20可能是一种广谱治疗ARDS/ALI的寡核苷酸药物.

关键词：寡核苷酸药物中草药 ARDS/ALI SARS-CoV-2

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腹腔注射白消安对精原干细胞代谢特征的影响

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基础医学与临床 2024年第6期44卷 793-799页

作者：余志鑫邙新雨邹定峰缪时英宋伟李凯中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院、生物化学与分子生物学系、重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005

目的通过构建白消安处理的小鼠模型,探讨其对小鼠睾丸精原干细胞(SSCs)代谢的影响。方法采用8周龄C57BL/6J雄性小鼠,腹腔注射10 mg/kg白消安,于第0天、第5天和第10天取材,并通过免疫磁珠法分选出Thy1阳性细胞。随后对这些细胞进行了纯... 详细信息

目的通过构建白消安处理的小鼠模型,探讨其对小鼠睾丸精原干细胞(SSCs)代谢的影响。方法采用8周龄C57BL/6J雄性小鼠,腹腔注射10 mg/kg白消安,于第0天、第5天和第10天取材,并通过免疫磁珠法分选出Thy1阳性细胞。随后对这些细胞进行了纯度鉴定和代谢组学分析。结果实验发现白消安处理能明显降低小鼠睾丸质量(P<0.05),并损伤睾丸的组织结构。基于主成分分析(PCA)和偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)模型显示,处理0 d、5 d和10 d的样本组间存在显著的代谢差异。共筛选鉴定出89种差异代谢物,包括谷胱甘肽(GSH)、牛磺酸、精氨酸、必需氨基酸(EAAs)和不饱和脂肪酸(UFAs)等,其重要相关代谢途径涉及甘油磷脂代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等。结论白消安通过影响特定的代谢途径,产生明显的生殖毒性效应,导致小鼠睾丸质量下降和组织结构损伤。代谢组学分析其潜在的生殖毒性机制可能与脂质代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等代谢通路有关。

关键词：白消安生殖毒性代谢组学精原干细胞

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鉴定顺铂对人肝癌细胞系转录物组的影响

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基础医学与临床 2024年第3期44卷 352-360页

作者：郭鑫冀梦蝶王琦李雪媛陈阳中国医学科学院、北京协和医学院基础医学研究所、生物化学与分子生物学系、重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005

目的通过不同浓度顺铂(CDDP)处理人肝癌细胞系并进行转录物组测序分析,旨在揭示顺铂处理对肝癌细胞转录水平的影响。方法使用终浓度为0、20、50、100和200μmol/L的顺铂处理肝癌细胞系HepG2、Huh712 h后进行细胞活性检测、免疫荧光和转... 详细信息

目的通过不同浓度顺铂(CDDP)处理人肝癌细胞系并进行转录物组测序分析,旨在揭示顺铂处理对肝癌细胞转录水平的影响。方法使用终浓度为0、20、50、100和200μmol/L的顺铂处理肝癌细胞系HepG2、Huh712 h后进行细胞活性检测、免疫荧光和转录物组测序(RNA-seq),并进行差异表达(DEG)、KEGG及蛋白质相互作用网络分析。结果顺铂处理后HepG2、Huh7细胞活性下降,且DNA损伤增多,不同顺铂浓度处理下两种细胞系中共同上调的基因共有59个,共同下调的基因有81个。共同上调的基因主要富集在肿瘤发生发展相关通路,共同下调的81个基因主要富集在Rap1信号通路、Ras信号通路、调控干细胞多能性的信号通路、轴突的指导和黏附连接等相关通路。分析共同上下调基因的蛋白质相互作用网络中关键节点的生存预后,Jun原癌基因,AP-1转录因子(JUN)的高表达与患者生存期的延长呈显著相关,生长停滞DNA损伤可诱导蛋白α(GADD45A)的低表达与患者生存期的延长呈显著相关。结论揭示了肝癌细胞在顺铂处理下的共性转录物变化。JUN和GADD45A的表达差异可能是耐药机制的关键节点,也为临床治疗提供了重要的预后指标。

关键词：肝癌转录物组测序顺铂基因转录

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BioMGE——一个用于采集和分析生物医用材料和多组学数据的数据库

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工程科学学报 2024年第2期46卷 279-289页

作者：龚海燕张晓彤张司臣李铭鸿赵赫王婧宇王秀梅陈阳北京科技大学计算机与通信工程学院北京市高精尖中心北京100083 北京科技大学新材料技术研究院北京100083 北京科技大学顺德创新学院佛山528399 北京中医药大学东直门医院骨科三科北京100700 北京中医药大学中医学院北京100029 清华大学材料科学与工程学院新型陶瓷及其精细加工国家重点实验室先进材料教育部重点实验室北京100084 中国医学科学院基础医学研究所生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005

随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科... 详细信息

随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科交叉联合分析的基石.本文介绍了BioMGE,一个基于灵活的自定义平台NMDMS(国家材料数据管理与服务平台)实现的数据库建设案例,用于收集生物医用材料和多组学测序数据.NMDMS的动态容器框架允许用户定义个性化的数据提交模式,存储来自生物医用材料和多组学研究领域的数据.自2019年以来,BioMGE已收集了1547100个生物医用材料和多组学数据集.BioMGE提供了数据导出接口,方便用户直接导出数据以进行数据分析.以组学数据可视化为例,提供BioMGE-viewer模块以实现对生物染色质结构数据从一维到三维的数据可视化.该数据库可为其他跨领域研究的数据共享提供了新的思路和平台.

关键词：生物医用材料多组学动态容器数据库异构数据存储可视化

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