探讨载脂蛋白B(apolipoprotein B,apoB)基因单体型与维吾尔族自然长寿之间的关系.选择新疆和田地区191名年龄90岁以上的健康维吾尔族个体为研究对象,另选53名年龄65—70岁、民族、性别、地域相匹配的正常个体为对照.采用PCR—SSP(sequence specific primer),PCR—RFLP(restriction fragment length polymorphism)和PCR-直接测序(PCR—sequencing)等技术对apoB基因第1外显子5'端信号肽插入/缺失(insertion/deletion,PD)、第26外显子Xba Ⅰ限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphisms,Xba Ⅰ—RFLP)和第29外显子3'端可变数目重复序列(vaffable number of tandemly repeat,VNTR)进行分型.经Logistic回归分析显示,长寿组apoB基因X^+X^+基因型频率显著高于对照组;M,L的等位基因频率和其组成的基因型频率显著增高;在单体型分析中,长寿组中由X^+和M等位基因组成的单体型频率显著增高,而由X^-和S等位基因组成的单体型频率显著降低(均P〈0.05).研究认为:等位基因M,L,基因型X^+X^+,MM,ML,LL和单体型I—X^+-M,X^+-M与自然长寿显著正相关,可能为长寿的保护因素,而等位基因S,基因型SS和单体型X^+-S,D—S和D—X^+-S则可能是影响长寿的不利因素.
目的 应用Affymetrix全基因组芯片结合荧光定量PCR(quantitative real-timePCR,qPCR)技术,进行致病性DNA拷贝数变异的精细定位研究。方法以一个定位于染色体7q36的中国人遗传性三节拇指多并指综合征伴随Ⅳ型并指家系中的一例患者为研究对象。收集外周血标本,常规提取基因组DNA。应用Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array6.0芯片,将基因组DNA纯化,经过酶切、连接、扩增、标记、杂交、染色和扫描等步骤后得到原始数据,应用Affymetrix Genotyping Console3.0软件进行拷贝数分析。在经芯片分析所确定的重复范围内设计引物,采用qPCR方法进行验证,并进一步缩小断端范周、精确重复区域范围。结果将患者重复区域两断端范围由原来的113kb和33kb分别缩小到5.4kb和1.8kb,致病性DNA重复范围由原来的291~437kb精确至379~387kb。结论应用Affymetrix全基因组芯片联合qPCR技术可以实现对DNA拷贝数突变的精确、可靠的检测。
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