检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2005年第2期21卷 332-335页

作者：马素参黄海明高友鹤中国医学科学院基础医学研究所中国协和医科大学基础医学院蛋白质组学研究中心

介绍一种新的方法构建近随机多肽文库。选取从大基因组物种的组织或细胞中提取的基因组DNA ,利用切割频率高的限制性内切酶切割 ,产生的短片段可以近似地认为是随机序列的片段 ,将它们与匹配的载体连接后转化进宿主细胞进行表达 ,从而... 详细信息

介绍一种新的方法构建近随机多肽文库。选取从大基因组物种的组织或细胞中提取的基因组DNA ,利用切割频率高的限制性内切酶切割 ,产生的短片段可以近似地认为是随机序列的片段 ,将它们与匹配的载体连接后转化进宿主细胞进行表达 ,从而获得近随机多肽文库。这样的文库可以用于蛋白质相互作用的研究。同一种基因组DNA可以利用不同的酶切 ,再分别连接到表达载体的不同读码框架 ,从而产生不同编码序列的多种近随机多肽文库。介绍了充分利用烟草基因组DNA构建两种不同酶切 ,三种读码框架 ,共六种不同编码序列的近随机多肽文库的方法。

关键词：烟草基因组DNA 近随机多肽文库

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分泌蛋白质组研究进展

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分析化学 2007年第6期35卷 912-918页

作者：张海婧刘辉吕丽艳陈国强李智立中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所北京100176 中国医学科学院北京100005 中国医学科学院蛋白质组学研究中心国家人类基因组北方研究中心

分泌蛋白质组是指组织、细胞等分泌的全部蛋白质。分泌蛋白主要分布于体液和细胞质胞浆中,参与许多重要的生命过程。分泌蛋白质组的研究主要涉及分泌蛋白的制备、多维色谱或二维凝胶电泳分离、质谱鉴定及生物信息学分析等。本文主要介... 详细信息

分泌蛋白质组是指组织、细胞等分泌的全部蛋白质。分泌蛋白主要分布于体液和细胞质胞浆中,参与许多重要的生命过程。分泌蛋白质组的研究主要涉及分泌蛋白的制备、多维色谱或二维凝胶电泳分离、质谱鉴定及生物信息学分析等。本文主要介绍了分泌蛋白的合成途径、蛋白质组技术在分泌蛋白组研究中的应用、分泌蛋白组研究现状及存在的问题等。

关键词：分泌蛋白分泌蛋白质组蛋白质组质谱二维凝胶电泳

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蛋白质组学技术在人体简单系统蛋白质全谱检测的应用

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基础医学与临床 2003年第2期23卷 136-140页

作者：郭佳岩高友鹤崔莲仙中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所蛋白质组学研究中心北京100005

蛋白质作为生物体最基本的功能单位 ,一直被看作是开启生命奥秘的金钥匙。但由于其数量巨大、种类繁多、结构复杂、功能变化莫测 ,使人们对它的研究始终难以有突破性的进展。能够像研究基因组那样大批量研究蛋白质即绘制人体蛋白质图谱... 详细信息

蛋白质作为生物体最基本的功能单位 ,一直被看作是开启生命奥秘的金钥匙。但由于其数量巨大、种类繁多、结构复杂、功能变化莫测 ,使人们对它的研究始终难以有突破性的进展。能够像研究基因组那样大批量研究蛋白质即绘制人体蛋白质图谱一直是科学家努力的目标。但由于方法的局限 ,过去的蛋白组学研究通常集中在用比较蛋白组学的分析方法去研究人体蛋白。随着蛋白组学分离技术 (二维电泳、质谱等 )的不断改进与提高 ,人体简单系统蛋白质全谱的检测已成为可能。通过对目前蛋白质全谱研究最为全面的脑脊液、尿液及唾液检测技术的分析介绍。

关键词：蛋白质组学人体简单系统蛋白质全谱脑脊液尿液

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结构域蛋白质组学研究进展

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基础医学与临床 2003年第2期23卷 132-135页

作者：李英娜高友鹤崔莲仙中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所蛋白质组学研究中心北京100005

蛋白质的结构域是蛋白质中具有特异结构和独立功能的区域。与蛋白质本身的数量相比 ,结构域的数量是有限 ,每个结构域所包含的成员数目也是有限的。在蛋白质组学研究的现阶段 ,研究方法上的限制尚无法全面实时地研究哺乳动物细胞的整个... 详细信息

蛋白质的结构域是蛋白质中具有特异结构和独立功能的区域。与蛋白质本身的数量相比 ,结构域的数量是有限 ,每个结构域所包含的成员数目也是有限的。在蛋白质组学研究的现阶段 ,研究方法上的限制尚无法全面实时地研究哺乳动物细胞的整个蛋白质组。由于结构域在功能上的重要性和其数量的有限性决定了以结构域为研究对象在蛋白质组学规模上进行研究不失为现阶段蛋白质组学研究的一种现实的选择。本文综述一些在这些方面所做出的早期的尝试。研究人员分别以SH3、PDZ和WW等结构域为对象进行蛋白质组学规模上的研究 ,并建立和完善了一些研究方法。总之。

关键词：结构域蛋白质组学研究进展 SH3 PDZ WW

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人骨肉瘤蛋白质组双向凝胶电泳图像分析方法的建立与应用

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吉林大学学报（医学版） 2007年第6期33卷 1038-1042页

作者：杨小玉顾锐高忠礼隋福革孙伟殷昭阳张善永吉林大学中日联谊医院骨科吉林长春130033 黑龙江省大庆油田医院骨科中国医学科学院基础医学研究所中国协和医科大学基础医学院蛋白质组学研究中心北京100005

目的：建立人骨肉瘤蛋白质组双向电泳图像分析方法。方法：组织标本分为骨肉瘤组和肿瘤旁组。对第一向双向电泳的关键因素与环节进行一系列优化。分离骨肉瘤总蛋白，银染，用ImageMasLer 2D Elite3．01分析软件分析图谱，使用基质辅助... 详细信息

目的：建立人骨肉瘤蛋白质组双向电泳图像分析方法。方法：组织标本分为骨肉瘤组和肿瘤旁组。对第一向双向电泳的关键因素与环节进行一系列优化。分离骨肉瘤总蛋白，银染，用ImageMasLer 2D Elite3．01分析软件分析图谱，使用基质辅助电离解析飞行时间质谱仪主要高丰度部分差异蛋白质进行鉴定。结果：获得分辨率和重复性好的双向电泳图谱。变异系数平均值（％）和变异系数范围（％）：骨肉瘤组为23．00±10．11和3．80～6．89，肿瘤旁组为20．33±9．90和2．70～6．89。同一蛋白质斑点在3次实验中等电点、分子量的相对标准差分别为（8．93±1．17）％、（10．16±2．02）％和（10．87±3．86）％。初步鉴定11个蛋白，其中9个蛋白质只在骨肉瘤中特异高峰度上调表达，分别为转甲状腺素蛋白、磷酸甘油醛异构酶、慢收缩骨骼肌钙蛋白T、心肌钙蛋白、肌动蛋白、肌球蛋白、膜联蛋白-5、热休克蛋白-1及Fanconi anemia groupD2蛋白；鉴定2个蛋白，锰超氧化物歧化酶、碳酸酐酶蛋白质下调表达。结论：成功构建了用于研究骨肉瘤蛋白质组双向凝胶图谱分析方法，认为初步鉴定的部分差异蛋白可能为骨肉瘤的关联蛋白，其在骨肉瘤发生和进展的病理过程中具有重要作用。

关键词：骨肉瘤蛋白质组电泳凝胶双向

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相互作用结构域SH3和WW的蛋白质组学研究

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基础医学与临床 2007年第2期27卷 129-133页

作者：田瑞高诗娟宋婀莉郑德先高友鹤中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所蛋白质组学研究中心病理生理学系北京100005

在过去十年的研究中,发现许多蛋白质相互作用是通过相互作用结构域(如SH2,WW,SH3等)与其识别的另一个蛋白质中一段短肽序列的结合完成的,蛋白质相互作用结构域在蛋白质亚细胞定位、信号传导和蛋白复合体的组装等方面发挥重要功能。随着... 详细信息

在过去十年的研究中,发现许多蛋白质相互作用是通过相互作用结构域(如SH2,WW,SH3等)与其识别的另一个蛋白质中一段短肽序列的结合完成的,蛋白质相互作用结构域在蛋白质亚细胞定位、信号传导和蛋白复合体的组装等方面发挥重要功能。随着蛋白质组学技术的发展,高通量技术用于结构域结合特性及相互作用网络的研究。本文通过概述SH3和WW结构域的蛋白质组学研究策略的最新进展,总结结构域的几种现有研究策略。

关键词：蛋白质相互作用 SH3结构域 WW结构域高通量研究方法

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PICK1:一个功能多样的药靶蛋白

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中国生物化学与分子生物学报 2007年第9期23卷 697-705页

作者：宋婀莉高友鹤中国医学科学院基础医学研究所中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室蛋白质组学研究中心病理生理学系北京100005

蛋白质是生命功能的执行者.生命体中某些关键蛋白的功能异常往往是导致疾病发生的根本原因.这些疾病相关蛋白极有可能成为药物靶点,为新药研发和疾病治疗提供重要线索.PICK1蛋白(protein interacting with Cαkinase1)结合能力广泛、功... 详细信息

蛋白质是生命功能的执行者.生命体中某些关键蛋白的功能异常往往是导致疾病发生的根本原因.这些疾病相关蛋白极有可能成为药物靶点,为新药研发和疾病治疗提供重要线索.PICK1蛋白(protein interacting with Cαkinase1)结合能力广泛、功能多样以及在多种重要疾病(如:癌症、精神分裂症、疼痛、帕金森综合症等)的发生发展过程中发挥潜在的作用,使其成为一个可能的药靶蛋白.PICK1与绝大多数配体蛋白的相互作用是通过其PDZ结构域与配体C末端区域的结合介导的,使PICK1的PDZ结构域成为一个潜在的药物靶点.因此,可以利用生物小分子物质特异性地结合PICK1的PDZ结构域,干扰或阻断PICK1与配体蛋白的天然相互作用,最终达到治疗相关疾病的目的.

关键词： PICK1(protein interacting with Cαkinase 1) PDZ结构域药物靶点阻断性多肽

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验证性筛选PDZ结构域结合配体文库快速研究HtrA2/Omi PDZ结构域的结合特性

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中国科学（C辑） 2007年第1期37卷 107-116页

作者：马素参宋婀莉高诗娟田瑞高友鹤中国医学科学院基础医学研究所中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室蛋白质组学研究中心病理生理学系北京100005

HtrA2/Omi是一种线粒体丝氨酸蛋白酶,在哺乳动物细胞中具有双重功能,即诱导细胞凋亡和参与维持线粒体活性的动态平衡.PDZ结构域是最重要的蛋白质相互作用结构域之一,参与多种生物学过程,如细胞信号转导、蛋白质降解、细胞骨架组织等.最... 详细信息

HtrA2/Omi是一种线粒体丝氨酸蛋白酶,在哺乳动物细胞中具有双重功能,即诱导细胞凋亡和参与维持线粒体活性的动态平衡.PDZ结构域是最重要的蛋白质相互作用结构域之一,参与多种生物学过程,如细胞信号转导、蛋白质降解、细胞骨架组织等.最近研究发现,HtrA2/Omi蛋白的PDZ结构域与配体的相互作用,可以调节HtrA2/Omi蛋白自身的水解酶活性.以HtrA2/Omi PDZ结构域为研究对象,用酵母双杂交系统验证性筛选PDZ结构域结合配体文库,快速研究该结构域的结合特性,并在人类全蛋白质组范围内预测并发现该结构域新的相互作用蛋白,最后分析这些新的相互作用所能够形成的最小相互作用网络来评估其可信度.研究结果揭示了HtrA2/Omi PDZ结构域新的结合特性,即:不仅能够结合已报道的II类PDZ配体而且还可以结合I类和III类PDZ配体,并且配体-3位氨基酸具有一定范围内的可变性.而且,发现了7个新的HtrA2/Omi PDZ结构域相互作用蛋白,为进一步阐明HtrA2/Omi蛋白的生物学功能提供了重要线索.同时证明了验证性筛选目的结构域结合配体文库,这一结构域结合特性研究新策略的实用性和高效性.

关键词： HtrA2/Omi PDZ结构域结构域结合特性验证性筛选蛋白质相互作用生物信息学

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Apak的组织表达谱及其白血病相关性分析

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军事医学 2011年第2期35卷 100-103页

作者：窦睿郭兴田春艳曾慧敏艾辉胜张令强范礼斌安徽医科大学生命科学学院生物学教研室合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850 中国医学科学院北京协和医学院基础医学院北京100730 解放军307医院北京100071

目的探讨P53负调控蛋白Apak的组织分布特征并分析其白血病相关性。方法利用组织斑点杂交分析Apak在多种组织中的分布情况,Northern杂交分析其在5种白血病细胞系的转录,并用RT-PCR分析Apak在32例白血病患者和12例健康人外周血中的mRNA水... 详细信息

目的探讨P53负调控蛋白Apak的组织分布特征并分析其白血病相关性。方法利用组织斑点杂交分析Apak在多种组织中的分布情况,Northern杂交分析其在5种白血病细胞系的转录,并用RT-PCR分析Apak在32例白血病患者和12例健康人外周血中的mRNA水平。结果 Apak的组织表达谱分析表明该基因只在胎肝、胎脾以及成人唾液腺、膀胱、左右心室和心尖中高表达。在多种白血病细胞系Jurkat,AHH-1,MOLT-4,SKO-007和HL-60和部分白血病患者的外周血中Apak也呈现高转录,提示Apak在白血病发生中可能发挥重要功能。结论本研究揭示了Apak是一种具有组织特异性分布的P53负调节蛋白,其在白血病中的高表达提示其可能与该病的发生有一定的关联。

关键词：肿瘤抑制蛋白P53 Apak 组织表达谱白血病细胞系,肿瘤细胞周期转录因子

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快速LacZ检测法提高酵母双杂交试验的敏感度

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生物技术 2004年第1期14卷 31-33页

作者：郭佳岩宋婀莉马素参高友鹤中国医学科学院基础医学研究所中国协和医科大学基础医学院中国医学科学院蛋白质组学研究中心北京100005

目的 :建立快速简单敏感准确的LacZ检测法。方法 :将在SD/ -Trp -Leu培养液中过夜培养的待检测酵母菌直接点样在滤纸上进行LacZ检测 ,筛选出LacZ阳性克隆。结果 :将小鼠 3T3文库转化含有WWP1的酵母菌 ,选出 10个较大的SD/ -Trp -Leu -Hi... 详细信息

目的 :建立快速简单敏感准确的LacZ检测法。方法 :将在SD/ -Trp -Leu培养液中过夜培养的待检测酵母菌直接点样在滤纸上进行LacZ检测 ,筛选出LacZ阳性克隆。结果 :将小鼠 3T3文库转化含有WWP1的酵母菌 ,选出 10个较大的SD/ -Trp -Leu -His培养阳性的克隆 ,利用快速LacZ检测法检测这 10个酵母克隆 ,结果在 5h内不同程度地变蓝 ,呈阳性结果 ;而作为对照的传统检测方法在 8h内的检测结果均显示为阴性。结论 :采用快速LacZ检测法检测蛋白质之间的相互作用可以大大缩短筛选的时间 ,简化筛选的步骤。

关键词：传统LaeZ检测法酵母双杂交技术蛋白质相互作用快速LacZ检测法

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