检索结果-内蒙古大学图书馆

2012全国发育生物学大会

作者：武日茂翟丽丽王威李婷婷于潇华李常银钟冉周玉长张勇朱大海中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系

Myostatin属于TGF-beta生长因子超家族成员之一,功能研究表明Myostatin是骨骼肌生长发育负调控因子。但是,目前对Myostatin在骨骼肌干细胞的激活、增殖与分化过程中的功能及作用机制并不清楚。近年来的研究发现miRNA参与骨骼肌干细胞的... 详细信息

Myostatin属于TGF-beta生长因子超家族成员之一,功能研究表明Myostatin是骨骼肌生长发育负调控因子。但是,目前对Myostatin在骨骼肌干细胞的激活、增殖与分化过程中的功能及作用机制并不清楚。近年来的研究发现miRNA参与骨骼肌干细胞的激活、增殖与分化过程的调控。因此,我们利用Myostatin基因敲除小鼠通过miRNA芯片的分析,系统筛选了骨骼肌组织中受Myostatin信号调控的miRNAs,发现miR-A受Myostatin信号的负调控。采用C2C12细胞系的体外（In vitro）研究表明miR-A能够促进骨骼肌细胞的分化。为了进一步分析miR-A对骨骼肌干细胞功能的调控作用,我们制备了miR-A转基因小鼠。miR-A转基因鼠的骨骼肌组织发育正常,与野生型小鼠相比,miR-A转基因鼠的骨骼肌干细胞数量显著减少。采用Cardiotoxin（CTX）诱导的骨骼肌损伤-再生模型,发现骨骼肌组织损伤1.5天和3.5天后Pax7、MyoD及Pax7/MyoD的细胞数量在miR-A转基因小鼠中均高于野生型小鼠,这些数据提示miR-A能够促进骨骼肌干细胞的激活。进一步分析miR-A调控的靶基因,发现Eya4基因的3'-UTR含有miR-A的结合位点,通过报告基因分析表明miR-A可以靶向Eya4。miR-A转基因鼠骨骼肌组织中Eya4蛋白表达显著降低进一步证明miR-A可以调控Eya4基因的表达和功能。结论:总之,本研究发现Myostatin负调控的miR-A能够通过靶向Eya4基因促进骨骼肌干细胞的激活,从而促进骨骼肌再生。

关键词：骨骼肌干细胞 Myostatin miR-A 信号调节靶基因

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低氧微环境下胶质瘤干细胞表型的改变与RNA结合蛋白相关

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基础医学与临床 2018年第6期38卷 793-797页

作者：李珊珊胡佩珊韩为彭小忠中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室、生物化学与分子生物学系医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005

目的研究低氧微环境下胶质瘤干细胞表型变化与RNA结合蛋白表达之间的关系。方法 1%O_2的低氧条件培养胶质瘤干细胞U87MG-SLC和GSC5,20%O_2为常氧对照。分别利用MTS实验和肿瘤球形成实验检测其增殖能力和自我更新能力;Western blot检测... 详细信息

目的研究低氧微环境下胶质瘤干细胞表型变化与RNA结合蛋白表达之间的关系。方法 1%O_2的低氧条件培养胶质瘤干细胞U87MG-SLC和GSC5,20%O_2为常氧对照。分别利用MTS实验和肿瘤球形成实验检测其增殖能力和自我更新能力;Western blot检测干性相关蛋白和RNA结合蛋白表达水平的变化;通过吸光度扫描进行统计分析。结果低氧条件下肿瘤干细胞的增殖能力下降(P<0.05),自我更新能力上升(P<0.05),HIF-1α和干性标志物Nestin和SOX2上调(P<0.01;P<0.05)。与常氧组相比,低氧组胶质瘤干细胞的多种RNA结合蛋白表达水平发生变化:hnRNPF、UNRIP以及Hu D表达水平上调(P<0.05),PCBP2和UNR表达水平下调(P<0.01;P<0.05),而其他RNA结合蛋白(hnRNPK、ADAR1、PCBP1、CIRP、EBP1、e EF1A、PTBP1、PTBP2)表达水平没有显著性变化。结论低氧微环境下,胶质瘤干细胞的表型变化与RNA结合蛋白hnRNPF、UNRIP、Hu D、PCBP2和UNR表达水平相关。

关键词：低氧胶质瘤干细胞 RNA结合蛋白增殖自我更新

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载脂蛋白AI及其半胱氨酸突变体结合脂质状态下对内毒素血症小鼠作用的研究

载脂蛋白AI及其半胱氨酸突变体结合脂质状态下对内毒素血症小鼠作...

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中华医学会心血管病学分会第十次全国心血管病学术会议

作者：王云龙中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室

目的利用内毒素血症小鼠模型来检测我们构建的八种重组高密度脂蛋白(野生型载脂蛋白AI及其7种半胱氨酸突变体结合脂质构成)的治疗效果。方法我们实验室构建了7种AI的半胱氨酸突变体:A-I(s52C),A-I(N74C),A-I(K107C),A-I(G129C),A-I(K19... 详细信息

目的利用内毒素血症小鼠模型来检测我们构建的八种重组高密度脂蛋白(野生型载脂蛋白AI及其7种半胱氨酸突变体结合脂质构成)的治疗效果。方法我们实验室构建了7种AI的半胱氨酸突变体:A-I(s52C),A-I(N74C),A-I(K107C),A-I(G129C),A-I(K195C)和A-I(S228C)。将这7种突变体及野生型AI与脂质结合构成八种重组的HDL:rHDL52,rHDL74,rHDL107,rHDL129,rHDL173.

关键词：内毒素血症野生型炎症因子半胱氨酸突变体小鼠模型

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CRISPR/Cas9基因编辑系统研究进展

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基础医学与临床 2018年第4期38卷 543-547页

作者：程成舒鹏程彭小忠中国医学科学院北京协和医学院北京100005 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室中国医学科学院医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005

CRISPR/Cas9基因编辑系统被广泛应用于生物学及医学各领域。该系统可在RNA的引导下对特定DNA位点进行靶向编辑。脱靶效应和编辑效率是该系统面临的两大问题。目前已有诸多研究从减少脱靶效应和提高编辑效率的方面对该系统进行优化,将有... 详细信息

CRISPR/Cas9基因编辑系统被广泛应用于生物学及医学各领域。该系统可在RNA的引导下对特定DNA位点进行靶向编辑。脱靶效应和编辑效率是该系统面临的两大问题。目前已有诸多研究从减少脱靶效应和提高编辑效率的方面对该系统进行优化,将有助于其安全性的提升及应用范围的拓展。

关键词： CRISPR/Cas9 基因编辑脱靶效应编辑效率

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Dicer1缺失对小鼠早期神经发育的影响

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基础医学与临床 2021年第6期41卷 818-824页

作者：刘高澳彭小忠舒鹏程中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物研究所云南昆明650118

目的利用Dicer1条件敲除小鼠,通过RNA-seq技术在转录组水平分析microRNAs(miRNAs)对哺乳动物大脑早期发育的影响。方法构建D6-Cre-Dicer1条件敲除小鼠,实验分为对照组(Ctrl)和条件敲除组(cKO)。苏木精-伊红和免疫荧光染色比较敲除前后... 详细信息

目的利用Dicer1条件敲除小鼠,通过RNA-seq技术在转录组水平分析microRNAs(miRNAs)对哺乳动物大脑早期发育的影响。方法构建D6-Cre-Dicer1条件敲除小鼠,实验分为对照组(Ctrl)和条件敲除组(cKO)。苏木精-伊红和免疫荧光染色比较敲除前后组织形态差异;选取E14.5 D6-Cre介导的Dicer1条件性敲除的小鼠背侧皮质,提取总RNA,利用RNA-seq技术分析Dicer1敲除前后转录水平差异。结果与对照组相比,条件敲除组1个月左右致死,P3时皮层神经元发育异常,皮层和海马结构部分缺失;通过RNA-seq分析,共筛选出差异表达基因45个,上调基因11个,下调基因34个(P<0.05)。差异基因富集于NF-κB信号通路、Wnt信号通路、MAPK-ERK信号通路、JAK-STAT信号通路和DNA损伤应激通路等。结论在发育早期E14.5时Dicer1参与调节多条信号通路,影响部分皮层层次标志物的表达,抑制lncRNA Xist的表达,调节皮质发育。

关键词： Dicer1 D6-Cre 大脑背侧皮质 RNA-seq lncRNA Xist

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新型冠状病毒(2019-nCoV)感染患者肺损伤相关的临床及生化指标研究

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中国科学：生命科学 2020年第3期50卷 258-269页

作者：刘映霞杨扬张聪黄凤鸣王福祥袁静王召钦李金秀李建明冯程张政王力非彭凌陈莉秦宇豪赵丹丹谭曙光尹路徐军周丛照蒋澄宇刘磊南方科技大学附属第二医院深圳市第三人民医院国家感染性疾病临床医学研究中心深圳市病原微生物与免疫重点实验室感染病国家重点学科深圳518112 中国科学技术大学合肥微尺度物质科学国家实验室生命科学学院合肥230027 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005 中国科学院微生物研究所北京100101 北京协和医院急诊科北京100731

Ⅱ新型冠状病毒(2019-n Co V)2019年12月在湖北省武汉市暴发,并迅速传播到中国多地及其他国家.在本研究中,我们报告了来自中国深圳早期的2019-n Co V感染患者的流行病学、临床指标、生化指标和影像学特征,以及可用于预测疾病严重程度的... 详细信息

Ⅱ新型冠状病毒(2019-n Co V)2019年12月在湖北省武汉市暴发,并迅速传播到中国多地及其他国家.在本研究中,我们报告了来自中国深圳早期的2019-n Co V感染患者的流行病学、临床指标、生化指标和影像学特征,以及可用于预测疾病严重程度的潜在生物标记物.所有12例2019-n Co V感染患者均发展为肺炎,其中一半患者进一步发展为急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS).最常见的生化指标异常是低白蛋白(albumin, ALB)血症、淋巴细胞(lymphocytes, LYM)计数减少、淋巴细胞百分比和中性粒细胞(neutrophils, NEU)百分比降低、C反应蛋白(C-reactive protein, CRP)和乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase, LDH)水平升高,以及CD8细胞计数降低.从患者呼吸道特别是下呼吸道检测到的2019-n Co V病毒滴度与肺部疾病的严重程度正相关. ALB,LYM, LYM(%), LDH, NEU(%)和CRP的水平与急性肺损伤程度高度相关.年龄、病毒滴度、肺损伤评分和血液生化指标(ALB, CRP, LDH, LYM(%), LYM及NEU(%))可能是疾病严重程度的预测指标.此外, 2019-n Co V感染患者的血浆血管紧张素Ⅱ水平显著升高,并且与病毒滴度和肺损伤程度线性相关.该研究结果提供了多种潜在的可用于诊断的生物标志物,并提出了血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂(angiotensin Ⅱ receptor blocker, ARB)药物或可作为治疗2019-n Co V感染的潜在药物进行深入研究.

关键词： 2019-nCoV 血管紧张素Ⅱ 急性呼吸窘迫综合征

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RNA结合蛋白作为氯福克酚药靶的机制初探

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基础医学与临床 2020年第5期40卷 621-626页

作者：张美莲王志星胡艳冉坤念韩为彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的探索氯福克酚靶向RNA结合蛋白的抗胶质瘤机制。方法Biotin pull-down实验检测RNA结合蛋白N-ras上游蛋白(UNR)与靶基因Krüppel样因子13(KLF13)mRNA各片段的结合,以及氯福克酚对UNR与下游靶基因KLF13 mRNA片段结合能力的影响;氯... 详细信息

目的探索氯福克酚靶向RNA结合蛋白的抗胶质瘤机制。方法Biotin pull-down实验检测RNA结合蛋白N-ras上游蛋白(UNR)与靶基因Krüppel样因子13(KLF13)mRNA各片段的结合,以及氯福克酚对UNR与下游靶基因KLF13 mRNA片段结合能力的影响;氯福克酚靶点稳定性的药物亲和反应(DARTS)样品质谱检测结果与转录组芯片分析相结合,筛选其他RNA结合蛋白作用靶点,并对其他下游靶基因进行预测分析。结果氯福克酚可以增强UNR与KLF13 mRNA片段的结合;氯福克酚还可与其他RNA结合蛋白相互作用,参与mTOR信号通路以及由肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)激活的凋亡信号通路。结论氯福克酚可通过作用于RNA结合蛋白而起到抗胶质瘤的效果。

关键词：氯福克酚胶质瘤 UNR KLF13 mRNA RNA结合蛋白

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HOTAIRM1调节OCT4表达维持胶质瘤干细胞的自我更新

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基础医学与临床 2019年第6期39卷 792-797页

作者：王珊珊彭小忠韩为中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的探究粒细胞特异表达的HOXA转录本反义RNA1(HOTAIRM1)在胶质瘤干细胞中发挥的功能及分子机制。方法Real-timePCR检测HOTAIRM1在胶质瘤干细胞中的表达谱;肿瘤球形成实验和有限稀释实验检测过表达或敲低HOTAIRM1后胶质瘤干细胞自我更... 详细信息

目的探究粒细胞特异表达的HOXA转录本反义RNA1(HOTAIRM1)在胶质瘤干细胞中发挥的功能及分子机制。方法Real-timePCR检测HOTAIRM1在胶质瘤干细胞中的表达谱;肿瘤球形成实验和有限稀释实验检测过表达或敲低HOTAIRM1后胶质瘤干细胞自我更新能力;real-timePCR和Westernblot检测干性标志物的表达;双荧光素酶报告基因实验检测OCT4启动子活性。全反式维甲酸(ATRA)处理NB4急性早幼粒细胞白血病细胞和胶质瘤干细胞GSC2后检测HOTAIRM1表达。结果与对照组相比,过表达HOTAIRM1的胶质瘤干细胞自我更新能力呈显著上升(P<0.05);干性标志物NESTIN、OCT4及SOX2表达增加(P<0.05)。敲低HOTAIRM1则结果相反。过表达HOTAIRM1可促进OCT4启动子转录活性(P<0.05)。ATRA处理GSC2后HOTAIRM1表达下调(P<0.01)。结论HOTAIRM1通过调节OCT4表达维持胶质瘤干细胞的自我更新。

关键词：胶质瘤干细胞 HOTAIRM1 OCT4 自我更新

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利用经典的Zbed3敲除鼠探索ZBED3在小鼠大脑皮质发育过程中的作用

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基础医学与临床 2020年第7期40卷 948-954页

作者：孙长杰舒鹏程彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的利用敲除鼠探索锌指BED结构域超家族成员ZBED3在小鼠皮质发育过程中的作用。方法利用原位杂交和免疫荧光技术检测Zbed3敲除鼠的敲除效率。利用免疫荧光技术检测Zbed3敲除对小鼠皮质神经前体细胞增殖的影响。利用EdU标记技术和免疫... 详细信息

目的利用敲除鼠探索锌指BED结构域超家族成员ZBED3在小鼠皮质发育过程中的作用。方法利用原位杂交和免疫荧光技术检测Zbed3敲除鼠的敲除效率。利用免疫荧光技术检测Zbed3敲除对小鼠皮质神经前体细胞增殖的影响。利用EdU标记技术和免疫荧光技术检测Zbed3敲除对皮质层次形成的影响。利用RT-qPCR和免疫印迹技术探索Zbed3敲除鼠中其他分子的表达变化。结果Zbed3敲除鼠中检测不到Zbed3 mRNA和蛋白的表达。Zbed3敲除不影响神经祖细胞增殖和皮质层次形成。在Zbed3敲除鼠中,β-catenin的表达水平上调。结论Zbed3敲除对小鼠皮质发育无明显影响。

关键词： Zbed3 皮质发育经典Wnt信号通路 β-catenin

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IDH1调控干扰素通路相关基因IFIT3的表达

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基础医学与临床 2021年第7期41卷 988-994页

作者：唐婉军彭小忠韩为中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的探究在人胶质瘤细胞系LN229中异柠檬酸脱氢酶1基因(IDH1)对RNA结合蛋白(RBPs)表达的影响。方法首先通过慢病毒感染构建IDH1稳定敲低和对照组LN229细胞株,分别对两组细胞株进行转录组测序(RNA-seq),利用limma包分析差异表达基因(DEGs... 详细信息

目的探究在人胶质瘤细胞系LN229中异柠檬酸脱氢酶1基因(IDH1)对RNA结合蛋白(RBPs)表达的影响。方法首先通过慢病毒感染构建IDH1稳定敲低和对照组LN229细胞株,分别对两组细胞株进行转录组测序(RNA-seq),利用limma包分析差异表达基因(DEGs)及其富集通路;然后通过string比对RBP数据库筛选出差异表达的RBPs,构建蛋白相互作用网络并挑选出候选RBPs;最后在IDH1敲低、过表达和R132H突变的细胞系中进行表达量验证。结果在IDH1敲低的LN229细胞株中,利用RNA-seq共筛选到259个DEGs,其中146个表达上调,113个表达下调;这些DEGs中包括14个编码RBP的基因,其中9个RBPs均为干扰素通路相关基因,并且具有密切的相互作用;与对照组相比,IDH1敲低时这9个RBPs表达水平均显著上调(P<0.001),IDH1过表达时仅IFIT3表达显著下降(P<0.01),而IDH1突变时IFIT3的表达水平的改变无统计学意义。结论在人胶质瘤细胞系LN229中,IDH1可调控干扰素通路相关基因IFIT3的表达。

关键词：胶质瘤 IDH1 干扰素通路 IFIT3

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