检索结果-内蒙古大学图书馆

基础医学与临床 2020年第4期40卷 501-505页

作者：王町町梁俊波王晓月中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的探讨肝癌细胞系PLC/PRF/5中敲除ARID1A后对基因表达调控的影响。方法利用CRISPR-Cas9基因编辑技术敲除PLC/PRF/5细胞中ARID1A。然后分别对PLC/PRF/5 ARID1A野生型与敲除型细胞进行全转录组测序分析(RNA-seq),并用DESeq2鉴定ARID1A... 详细信息

目的探讨肝癌细胞系PLC/PRF/5中敲除ARID1A后对基因表达调控的影响。方法利用CRISPR-Cas9基因编辑技术敲除PLC/PRF/5细胞中ARID1A。然后分别对PLC/PRF/5 ARID1A野生型与敲除型细胞进行全转录组测序分析(RNA-seq),并用DESeq2鉴定ARID1A敲除后差异表达基因。最后,使用Metascape数据库对差异表达基因进行GO功能富集分析。结果成功构建PLC/PRF/5 ARID1A敲除细胞系。利用RNA-seq共筛选出978个差异表达基因,包括480个表达上调差异基因和498个表达下调差异基因。GO功能富集分析显示差异表达基因主要集中在细胞黏附、激素水平调节、激素代谢和MAP激酶活性调节等生物学过程。结论PLC/PRF/5肝癌细胞中,ARID1A可调控大量基因的表达,为进一步研究ARID1A在肝癌发生发展中的作用机制提供了新的线索。

关键词： ARID1A CRISPR 全转录组测序人肝癌细胞系PLC/PRF/5

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原发性肝癌的分层筛查与监测指南(2020版)

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肿瘤 2021年第1期41卷 1-23页

作者：中华预防医学会肝胆胰疾病预防与控制专业委员会中国研究型医院学会肝病专业委员会中华医学会肝病学分会中华预防医学会肿瘤预防与控制专业委员会感染性肿瘤防控学组杨永平卢实春丁惠国屠红曲春枫曹广文庄辉赵平徐小元不详解放军总医院肝病医学部北京100853 解放军总医院肝胆胰外科医学部北京100853 首都医科大学附属北京佑安医院肝病消化中心上海市肿瘤研究所癌基因与相关基因国家重点实验室国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室免疫室海军军医大学基础医学部流行病学教研室北京大学医学部基础医学院病原生物学系中国癌症基金会学术部北京大学第一医院感染科

中国原发性肝癌(简称肝癌)年龄调整发病率呈逐年下降趋势,但肝癌发病人数仍占全球的55%,肝癌所导致的疾病负担仍呈上升趋势,患者5年生存率无显著性提高。肝硬化和未抗病毒治疗的慢性乙型肝炎是中国肝癌的主要病因。指南推荐了适合临床... 详细信息

中国原发性肝癌(简称肝癌)年龄调整发病率呈逐年下降趋势,但肝癌发病人数仍占全球的55%,肝癌所导致的疾病负担仍呈上升趋势,患者5年生存率无显著性提高。肝硬化和未抗病毒治疗的慢性乙型肝炎是中国肝癌的主要病因。指南推荐了适合临床实践的低危、中危、高危和极高危4个层次的肝癌风险人群辨识特征。在医院和社区人群中筛查伴肝癌风险的患者,并科学地进行分层监测。伴有肝癌风险的患者需要终生监测,指南根据风险层次推荐了不同的肝癌监测间隔和工具,对于肝癌高危人群,6个月1次腹部超声联合血清甲胎蛋白监测(常规监测);对于肝癌极高危人群,3个月1次常规监测,6~12个月进行增强CT或MRI检查1次,以提高早期肝癌诊断率和降低监测成本;低中危人群中,肝癌年发生率低,可延长监测间隔为1年或以上。指南部分推荐意见的成本-效益仍需要进一步评价。

关键词：肝肿瘤肝硬化慢性乙型肝炎筛查监测

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原发性肝癌的分层筛查与监测指南(2020版)

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临床肝胆病杂志 2021年第2期37卷 286-295页

作者：中华预防医学会肝胆胰疾病预防与控制专业委员会中国研究型医院学会肝病专业委员会中华医学会肝病学分会中华预防医学会肿瘤预防与控制专业委员会感染性肿瘤防控学组丁惠国屠红曲春枫曹广文庄辉赵平徐小元杨永平卢实春不详首都医科大学附属北京佑安医院肝病消化中心上海市肿瘤研究所癌基因与相关基因国家重点实验室国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室免疫室海军军医大学基础医学部流行病学教研室北京大学医学部基础医学院病原生物学系中国癌症基金会学术部北京大学第一医院感染科解放军总医院肝病医学部肝癌诊疗中心解放军总医院肝胆胰外科医学部

中国原发性肝癌(简称肝癌)年龄调整发病率呈逐年下降趋势,但肝癌发病人数占全球55%,肝癌所导致的疾病负担仍呈上升趋势,患者5年生存率无显著性提高。肝硬化和未抗病毒治疗的慢性乙型肝炎是中国肝癌的主要病因。指南推荐了适合临床实践... 详细信息

中国原发性肝癌(简称肝癌)年龄调整发病率呈逐年下降趋势,但肝癌发病人数占全球55%,肝癌所导致的疾病负担仍呈上升趋势,患者5年生存率无显著性提高。肝硬化和未抗病毒治疗的慢性乙型肝炎是中国肝癌的主要病因。指南推荐了适合临床实践的低危、中危、高危和极高危4个层次的肝癌风险人群辨识特征。在医院和社区人群中筛查伴肝癌风险的患者,并科学地进行分层监测。伴有肝癌风险的患者需要终生监测,指南根据风险层次推荐了不同的肝癌监测间隔和工具,对于肝癌高危人群,6个月1次腹部超声联合血清甲胎蛋白监测(常规监测);对于肝癌极高危人群,3个月1次常规监测,6~12个月增强CT或MRI检查1次,以提高早期肝癌诊断率和降低监测成本;低中危人群中,肝癌年发生率低,可延长监测间隔为1年或以上。指南部分推荐意见的成本-效益仍需要进一步评价。

关键词：肝肿瘤肝硬化乙型肝炎,慢性筛查监测诊疗准则(主题)

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Regional Differences of the Urinary Proteomes in Healthy Chinese Individuals

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Chinese Medical Sciences Journal 2019年第3期34卷 157-167页

作者：吴建强秦伟伟潘利王小蓉张彪单广良高友鹤中国医学科学院北京协和医院医学科学研究中心中国医学科学院北京协和医学院中国医学科学院基础医学研究所病理生理学系中国医学科学院北京协和医学院北京师范大学生命科学学院生物化学与分子生物学系基因工程药物与生物技术北京重点实验室中国医学科学院基础医学研究所流行病与卫生统计学系中国医学科学院北京协和医学院

Objective Urine is a promising biomarker source for clinical proteomics *** physiological differences are common in multi-center clinical *** this study,we investigate whether significant differences are present in the urinary proteomes of individuals from different regions in *** In this study,morning urine samples were collected from healthy urban residents in three regions of China(Haikou,Xi’an and Xining)and urinary proteins were preserved using a membrane-based method(Urimem).The urine proteomes of 27 normal samples were analyzed using LC-MS/MS and compared among three *** annotation of the differential proteins among the three areas was analyzed using the DAVID online database,and pathway enrichment of the differential urinary proteins was analyzed using *** We identified 1898 proteins from Urimem samples using label-free proteome quantification,of which 56 urine proteins were differentially expressed among the three regions(P<0.05).Hierarchical clustering analysis showed that inter-regional differences caused less significant changes in the urine proteome than intersex *** gender stratification,16 differential proteins were identified in male samples and 84 differential proteins were identified in female *** these differential proteins,several proteins have been previously reported as urinary disease *** Urimem will facilitate urinary protein storage for large-scale urine sample *** differences are a confounding factor influencing the urine proteome and should be considered in future multicenter biomarker studies.

关键词： urine proteomics biobank biomarkers regional differences

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5-羟色胺对重症社区获得性肺炎严重程度的预测研究

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基础医学与临床 2020年第9期40卷 1195-1200页

作者：何权刘丹瑜叶君张艳丽朱华栋蒋澄宇徐军中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院急诊科北京100730 北京大学第一医院呼吸和危重症医学科北京100034

目的利用非靶向代谢组学分析方法,探寻重症社区获得性肺炎(SCAP)潜在预后标志物。方法采用液相色谱质谱联用分析技术(LC-MS),对2015年1月至2019年6月收集于北京协和医院的30名健康成人志愿者和68例重症社区获得性肺炎患者的血浆样本进... 详细信息

目的利用非靶向代谢组学分析方法,探寻重症社区获得性肺炎(SCAP)潜在预后标志物。方法采用液相色谱质谱联用分析技术(LC-MS),对2015年1月至2019年6月收集于北京协和医院的30名健康成人志愿者和68例重症社区获得性肺炎患者的血浆样本进行代谢物检测。根据临床预后,患者可分为存活组(n=1949)和死亡组(n=1919)。采用多元统计分析方法OPLS-DA和单变量统计分析方法Kruskal Wallis检验筛选差异代谢物。对差异代谢物进行预后分析和相关性分析。结果液相色谱质谱联用分析技术检测出健康成人与重症社区获得性肺炎患者共有代谢物3463个。OPLS-DA和Kruskal Wallis Test分析方法筛选出差异代谢物126个。5-羟色胺(5-HT)在存活组和死亡组间具有显著性差异(P<0.05,AUC>0.75)。5-HT与氧合指数(OI)呈正相关,与急性生理与慢性健康评分Ⅱ(APACHEⅡ)呈负相关。结论5-HT能够预测重症社区获得性肺炎患者的预后,可作为预后预测的潜在生物标志物。

关键词： 5-羟色胺(5-HT) 重症社区获得性肺炎(SCAP) 预后标志物代谢组学

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hsa-miR-10a-5p在重症社区获得性肺炎中的应用研究

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基础医学与临床 2020年第10期40卷 1313-1319页

作者：叶君刘丹瑜何权黄凤鸣朱华栋徐军蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院急诊科北京100730 北京大学第一医院呼吸和危重症医学科北京100034

目的探究hsa-miR-10a-5p在重症社区获得性肺炎(SCAP)中的作用,评估hsa-miR-10a-5p作为SCAP标志物的潜能。方法利用microRNA测序(27个SCAP血样和10个健康对照血样)和生物信息学方法探究hsa-miR-10a-5p指示社区获得性肺炎严重性的能力。结... 详细信息

目的探究hsa-miR-10a-5p在重症社区获得性肺炎(SCAP)中的作用,评估hsa-miR-10a-5p作为SCAP标志物的潜能。方法利用microRNA测序(27个SCAP血样和10个健康对照血样)和生物信息学方法探究hsa-miR-10a-5p指示社区获得性肺炎严重性的能力。结合mRNA测序(41个SCAP血样和10个健康对照血样)和靶基因预测及基因功能富集分析来探究hsa-miR-10a-5p在SCAP中的作用。结果hsa-miR-10a-5p水平在SCAP中显著下调,且死亡组下调更多。hsa-miR-10a-5p水平与急性生理功能和慢性健康状况评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分呈负相关,且microRNA水平预测SCAP预后的受试者工作特征曲线下面积(AUC)为0.776。SCAP发生时,hsa-miR-10a-5p预测靶向的基因能调控与肺炎发展密切相关的生物学过程和通路。结论hsa-miR-10a-5p能提示社区获得性肺炎严重性,且能预测预后。hsa-miR-10a-5p可作为SCAP的潜在标志物。

关键词：重症社区获得性肺炎生物标志物 hsa-miR-10a-5p

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三胸家族核心成员DPY30与ASH2L的表达相关性分析

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基础医学与临床 2020年第8期40卷 1047-1052页

作者：文畅李梁舒鹏程强伯勤彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的探究三胸家族(TrxG)核心成员DPY30与ASH2L表达是否具有相关性。方法Northern blot检测DPY30与ASH2L在多种人体组织中的表达及佛波醇肉豆蔻酸酯(PMA)诱导人慢性髓源白血病(K562)细胞分化过程中的DPY30与ASH2L表达变化;Western blot与... 详细信息

目的探究三胸家族(TrxG)核心成员DPY30与ASH2L表达是否具有相关性。方法Northern blot检测DPY30与ASH2L在多种人体组织中的表达及佛波醇肉豆蔻酸酯(PMA)诱导人慢性髓源白血病(K562)细胞分化过程中的DPY30与ASH2L表达变化;Western blot与RT-qPCR分别检测ASH2L条件性敲除小鼠(ASH2L-cKO)大脑皮质TrxG成员的蛋白及TrxG核心成员RNA表达情况;利用IGV软件可视化分析小鼠大脑皮质ChIP-seq结果中ASH2L、H3K4me3在ASH2L、DPY30基因染色质上的分布情况。结果DPY30与ASH2L的表达在人体各组织中分布有一定相似性;DPY30与ASH2L在PMA诱导K562细胞分化过程中的表达均逐渐减少;ASH2L-cKO小鼠大脑皮质中DPY30蛋白水平减少,DPY30的RNA水平改变无统计学意义。结论DPY30与ASH2L的表达具有相关性,ASH2L可能调控了DPY30蛋白水平。

关键词： DPY30 ASH2L 基因表达

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RNA结合蛋白作为氯福克酚药靶的机制初探

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基础医学与临床 2020年第5期40卷 621-626页

作者：张美莲王志星胡艳冉坤念韩为彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的探索氯福克酚靶向RNA结合蛋白的抗胶质瘤机制。方法Biotin pull-down实验检测RNA结合蛋白N-ras上游蛋白(UNR)与靶基因Krüppel样因子13(KLF13)mRNA各片段的结合,以及氯福克酚对UNR与下游靶基因KLF13 mRNA片段结合能力的影响;氯... 详细信息

目的探索氯福克酚靶向RNA结合蛋白的抗胶质瘤机制。方法Biotin pull-down实验检测RNA结合蛋白N-ras上游蛋白(UNR)与靶基因Krüppel样因子13(KLF13)mRNA各片段的结合,以及氯福克酚对UNR与下游靶基因KLF13 mRNA片段结合能力的影响;氯福克酚靶点稳定性的药物亲和反应(DARTS)样品质谱检测结果与转录组芯片分析相结合,筛选其他RNA结合蛋白作用靶点,并对其他下游靶基因进行预测分析。结果氯福克酚可以增强UNR与KLF13 mRNA片段的结合;氯福克酚还可与其他RNA结合蛋白相互作用,参与mTOR信号通路以及由肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)激活的凋亡信号通路。结论氯福克酚可通过作用于RNA结合蛋白而起到抗胶质瘤的效果。

关键词：氯福克酚胶质瘤 UNR KLF13 mRNA RNA结合蛋白

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利用经典的Zbed3敲除鼠探索ZBED3在小鼠大脑皮质发育过程中的作用

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基础医学与临床 2020年第7期40卷 948-954页

作者：孙长杰舒鹏程彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的利用敲除鼠探索锌指BED结构域超家族成员ZBED3在小鼠皮质发育过程中的作用。方法利用原位杂交和免疫荧光技术检测Zbed3敲除鼠的敲除效率。利用免疫荧光技术检测Zbed3敲除对小鼠皮质神经前体细胞增殖的影响。利用EdU标记技术和免疫... 详细信息

目的利用敲除鼠探索锌指BED结构域超家族成员ZBED3在小鼠皮质发育过程中的作用。方法利用原位杂交和免疫荧光技术检测Zbed3敲除鼠的敲除效率。利用免疫荧光技术检测Zbed3敲除对小鼠皮质神经前体细胞增殖的影响。利用EdU标记技术和免疫荧光技术检测Zbed3敲除对皮质层次形成的影响。利用RT-qPCR和免疫印迹技术探索Zbed3敲除鼠中其他分子的表达变化。结果Zbed3敲除鼠中检测不到Zbed3 mRNA和蛋白的表达。Zbed3敲除不影响神经祖细胞增殖和皮质层次形成。在Zbed3敲除鼠中,β-catenin的表达水平上调。结论Zbed3敲除对小鼠皮质发育无明显影响。

关键词： Zbed3 皮质发育经典Wnt信号通路 β-catenin

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基于探针的无标记表面增强拉曼光谱(SERS)用于鉴别乳腺癌患者的血清代谢谱

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基础医学与临床 2025年第5期45卷 651-657页

作者：王盟沈学静刘佳尚璐璐张沫中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物物理及结构生物学系北京100005 钢研纳克检测技术股份有限公司纳克研究院北京100081 中国人民解放军河南省军区郑州第三离职干部休养所综合门诊部河南郑州450006

目的应用无标记的表面增强拉曼光谱(SERS)检测血清代谢物,快速区分乳腺癌患者和健康受试者的代谢谱。方法合成等离激元纳米材料作为SERS的探针,检测拉曼报告分子,评估基于该探针的SERS分析能力。收集乳腺癌患者和健康受试者的血清样品,... 详细信息

目的应用无标记的表面增强拉曼光谱(SERS)检测血清代谢物,快速区分乳腺癌患者和健康受试者的代谢谱。方法合成等离激元纳米材料作为SERS的探针,检测拉曼报告分子,评估基于该探针的SERS分析能力。收集乳腺癌患者和健康受试者的血清样品,用甲醇沉淀蛋白质并去除后得到血清代谢物。基于探针的SERS分析患者的血清代谢物,探究乳腺癌患者的代谢谱变化。结果合成了SERS探针并进行了表征;建立了基于SERS探针的分析方法,实现了4个数量级的线性范围(LR),检测限(LOD)可达10 nmol/L;分析了5例乳腺癌患者和5名健康受试者的血清代谢物的拉曼光谱(RS),研究了代谢物变化的差异(P<0.001)。结论本研究通过基于探针的SERS方法筛选出乳腺癌患者血清代谢物的分子谱图差异,有助于解释乳腺癌引起的代谢改变,为乳腺癌的筛查、快速检测提供新方法。

关键词：乳腺癌探针快速检测表面增强拉曼光谱代谢谱

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