检索结果-内蒙古大学图书馆

基础医学与临床 2021年第10期41卷 1533-1537页

作者：杨啸林张艳丽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物医学工程学系北京100005 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

北京协和医学院面向4+4临床医学试点班新生,在医学总论中设立《生物化学》复习课程,以Moodle平台配合混合式课堂实施,帮助不同专业学生对医预必修课《生物化学》进行复习、巩固与提高。在Moodle支持下建设自主学习环境,整合了Macmillan ... 详细信息

北京协和医学院面向4+4临床医学试点班新生,在医学总论中设立《生物化学》复习课程,以Moodle平台配合混合式课堂实施,帮助不同专业学生对医预必修课《生物化学》进行复习、巩固与提高。在Moodle支持下建设自主学习环境,整合了Macmillan Sapling电子学习资源,并建立了章节课前测验,提升学生基础知识掌握程度;采用Moodle的“Quiz”与“Workshop”两种不同模块进行案例教学,帮助学生建立生物化学变化与疾病的关联。这是以Moodle为手段,对适合4+4学生特点的《生物化学》授课模式的积极探索。

关键词：生物化学 Moodle 病例教学法 4+4临床医学试点班

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基于人工智能的心血管疾病预测模型研究现状

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蚌埠医科大学学报 2025年第1期50卷 6-13页

作者：彭石娟王小满高琴陈厚早蚌埠医科大学卫生管理学院安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学基础医学院生理学教研室安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学心脑血管疾病基础与临床重点实验室安徽蚌埠233030 中国医学科学院基础医学研究所暨北京协和医学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究国家重点实验室北京100005

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,... 详细信息

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,传统的风险模型通常无法捕捉危险因素之间的非线性关系。人工智能(AI)技术,特别是监督式机器学习和深度学习,为CVD预测提供了新视角和工具。近几年,基于电子病历、多模态影像等临床数据和衰老大数据可以准确地预测CVD的发病和死亡风险,因此,本文将从传统评分、基于AI的临床数据和衰老大数据的CVD预测模型研究现状分别进行阐述,为促进AI结合CVD提供思路。

关键词：心血管疾病人工智能预测模型衰老生物学年龄

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基于磁珠捕获和连接的免核酸提取的恒温扩增技术

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基础医学与临床 2021年第11期41卷 1653-1657页

作者：邱栎臻杨明珠骈红茹郑直中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的建立基于磁珠捕获和连接的环介导恒温扩增(CLIP-LAMP)方法体系,以适用于大体积样品处理,为病原体检测提供一种新的技术方法。方法在NCBI数据库搜索免疫缺陷病毒(HIV)的一段保守序列,使用实验室特有软件根据该保守序列设计相应的捕... 详细信息

目的建立基于磁珠捕获和连接的环介导恒温扩增(CLIP-LAMP)方法体系,以适用于大体积样品处理,为病原体检测提供一种新的技术方法。方法在NCBI数据库搜索免疫缺陷病毒(HIV)的一段保守序列,使用实验室特有软件根据该保守序列设计相应的捕获探针和检测探针。磁珠表面通过亲和作用偶联寡核苷酸来抓取捕获探针;由于特异性捕获探针的存在使得核酸提取步骤被省略,靶标DNA或RNA直接特异地结合捕获探针;检测探针经过连接步骤后作为最终模板参与荧光定量环介导恒温扩增反应。将此方法用于HIV体外转录(IVT)合成的RNA检测,并且评估方法的灵敏度和特异性。结果构建的方法体系成功应用于HIV的IVT检测;现阶段可以检测到32 CPs/μL。该方法有可能处理>1 mL的大体积样本,并且可在2 h内完成检测。结论建立了基于磁珠的CLIP-LAMP技术,为快速、简便地进行大体积病原体检测提供了新的方法和思路。

关键词：磁珠 HIV 环介导恒温扩增

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Snhg3通过促进Sestrin2的表达改善小鼠糖代谢

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基础医学与临床 2025年第6期45卷 714-719页

作者：张明龙高明月解相宏郭泽宇刘晓军闫莉中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病理生理学系中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系

目的探讨长链非编码RNA-小核仁RNA宿主基因3(lncRNA-Snhg3)在小鼠肝脏糖代谢途径中的作用及调节机制。方法通过尾静脉注射腺病毒的方法在糖尿病模型db/db小鼠过表达Snhg3,检测小鼠葡萄糖耐量和丙酮酸耐量，采用RT-qPCR分析小鼠肝脏糖... 详细信息

目的探讨长链非编码RNA-小核仁RNA宿主基因3(lncRNA-Snhg3)在小鼠肝脏糖代谢途径中的作用及调节机制。方法通过尾静脉注射腺病毒的方法在糖尿病模型db/db小鼠过表达Snhg3,检测小鼠葡萄糖耐量和丙酮酸耐量，采用RT-qPCR分析小鼠肝脏糖异生相关基因磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶Pepck、葡萄糖-6-磷酸酶G6pc及Snhg3的临近基因应激诱导蛋白2(Sestrin2,Sesn2)的变化；运用双荧光素酶报告基因实验检测293T细胞中Snhg3对Sesn2编码基因的启动子活性的作用。结果腺病毒过表达Snhg3改善db/db小鼠葡萄糖耐量和丙酮酸耐受性，抑制糖异生基因Pepck和G6pc的mRNA表达(P<0.05),促进了Sesn2的mRNA表达(P<0.01)。同时，在293T细胞中过表达Snhg3可明显促进Sesn2启动子活性(P<0.05)。结论 Snhg3通过促进Sestrin2的表达改善小鼠糖代谢稳态。

关键词：小核仁RNA宿主基因3 肝脏糖异生应激诱导蛋白2

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全转录组测序分析精子发生中RNA结合蛋白质的动态表达

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基础医学与临床 2021年第6期41卷 825-830页

作者：李凯邙新雨邹定峰李梦真缪时英王琳芳宋伟中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的系统解析RNA结合蛋白质(RBPs)在小鼠精子发生中的动态表达全貌、阶段特异性及协同表达模式,并预测其潜在调控作用。方法整合6种类型生精细胞的全转录组测序数据,分析精子发生全程差异表达的RBPs;利用时间序列分析软件(STEM)分析差... 详细信息

目的系统解析RNA结合蛋白质(RBPs)在小鼠精子发生中的动态表达全貌、阶段特异性及协同表达模式,并预测其潜在调控作用。方法整合6种类型生精细胞的全转录组测序数据,分析精子发生全程差异表达的RBPs;利用时间序列分析软件(STEM)分析差异表达RBPs动态表达模式;利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定精子发生中协同表达的RBPs;通过ClusterProfiler工具分别对差异表达以及协同表达的RBPs进行GO功能富集分析。结果精子发生中共鉴定519个阶段特异表达的RBPs,并具有7种动态表达模式,其中减数分裂时期的RBPs占比最高;GO分析显示RBPs主要参与mRNA选择性剪接、加工或翻译过程;WGCNA分析获得246个共表达RBPs,其中减数分裂时期共表达RBPs占比最高。结论RBPs在精子发生中呈现阶段特异性,并且以协同表达模式发挥调控作用。其在精子发生早期阶段参与RNA加工或剪接等过程,而在后期阶段参与核糖体组装或RNA翻译等过程。

关键词： RNA结合蛋白质转录组共表达精子发生

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PARP14在3种抑郁症模型小鼠海马区的表达升高及其与神经炎性反应的关系

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基础医学与临床 2021年第5期41卷 641-647页

作者：李辰修建波许琪中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的探究ADP核糖聚合酶14(PARP14)与抑郁症是否相关及其是否影响小胶质细胞的炎性反应。方法构建抑郁症小鼠模型,通过实时定量PCR和Western blot对比了慢性束缚(CRS)模型、慢性不可预知压力(CUMS)模型和脂多糖(LPS)模型,3种抑郁症模型... 详细信息

目的探究ADP核糖聚合酶14(PARP14)与抑郁症是否相关及其是否影响小胶质细胞的炎性反应。方法构建抑郁症小鼠模型,通过实时定量PCR和Western blot对比了慢性束缚(CRS)模型、慢性不可预知压力(CUMS)模型和脂多糖(LPS)模型,3种抑郁症模型小鼠抑郁症相关脑区中相比于对照组PARP14的蛋白及mRNA表达水平变化。而后在永生化小胶质细胞系BV2中检测其敲低及过表达Parp14后对炎性反应的影响。结果在3种抑郁症模型小鼠海马区均观察到了PARP 4表达水平相较于对照组的升高(P<0.05),且在CRS模型组中观察到PARP14表达水平与组织中炎性反应因子的表达水平相关(P<0.05)。LPS刺激小鼠永生化小胶质细胞系BV2后PARP14表达水平也随之升高(P<0.05);同时过表达PARP14后的BV2细胞响应LPS刺激表达更多促炎性细胞因子(P<0.01),而敲低Parp14或使用PARP14抑制剂处理后表现与其相反(P<0.05)。结论抑郁模型小鼠海马区PARP14表达水平升高,这可能加剧小胶质细胞响应LPS的炎性反应,从而促使神经炎性反应水平升高。

关键词：重度抑郁症 ADP核糖聚合酶14(PARP14) 神经炎性反应小胶质细胞

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hnRNPA3通过影响mRNA出核调控hESCs多能性

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基础医学与临床 2021年第6期41卷 811-817页

作者：杨嘉宾陈仲扬周凡琦余佳马艳妮中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的探究RNA结合蛋白异质核核糖核蛋白A3(hnRNPA3)在人胚胎干细胞(hESCs)多能性维持中的生物学功能,揭示其在RNA运输过程中的新机制。方法在hESC中通过核孔复合物免疫共沉淀及细胞核质分离检测hnRNPA3与核孔互作情况及定位;抑制hnRNPA3... 详细信息

目的探究RNA结合蛋白异质核核糖核蛋白A3(hnRNPA3)在人胚胎干细胞(hESCs)多能性维持中的生物学功能,揭示其在RNA运输过程中的新机制。方法在hESC中通过核孔复合物免疫共沉淀及细胞核质分离检测hnRNPA3与核孔互作情况及定位;抑制hnRNPA3内源表达后进行克隆形成及碱性磷酸酶染色实验,qPCR检测多能性/分化标志基因的表达变化,利用RNA荧光原位杂交技术检测对polyA^(+)RNA及OCT4 mRNA核质分布的影响;预测hnRNPA3与已知出核相关蛋白结合情况。结果hnRNPA3定位在细胞核且与核孔互作,抑制hnRNPA3的内源表达后显著抑制了hESCs的克隆形成能力(P<0.05)并导致细胞分化标志基因表达水平升高(P<0.001),同时显著抑制了polyA^(+)RNA及OCT4 mRNA的出核(P<0.001)。蛋白质互作网络预测出hnRNPA3与约1/3的已知出核相关蛋白结合。结论hnRNPA3通过影响mRNA出核调控hESCs多能性。

关键词：人胚胎干细胞异质核核糖核蛋白A3 多能性与自我更新 mRNA运输

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Met-tRNAi^(Met)载体蛋白在急性髓系白血病(AML)中的表达及功能

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基础医学与临床 2021年第4期41卷 501-507页

作者：苏鹏忠何家驩于姗王小爽余佳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的探讨Met-tRNAi^(Met)载体蛋白eIF2A、eIF2D和MCTS1在正常造血干细胞(HSCs)和急性髓系白血病(AML)细胞中的表达,并研究上述蛋白对AML细胞增殖的影响。方法利用公共测序数据集分析Met-tRNAi^(Met)载体蛋白在小鼠HSCs分化不同阶段中的... 详细信息

目的探讨Met-tRNAi^(Met)载体蛋白eIF2A、eIF2D和MCTS1在正常造血干细胞(HSCs)和急性髓系白血病(AML)细胞中的表达,并研究上述蛋白对AML细胞增殖的影响。方法利用公共测序数据集分析Met-tRNAi^(Met)载体蛋白在小鼠HSCs分化不同阶段中的表达;利用单细胞转录组测序数据集分析Met-tRNAi^(Met)载体蛋白在人HSCs分化不同阶段中的表达;利用公共测序数据集分析Met-tRNAi^(Met)载体蛋白在健康人和AML患者骨髓细胞中的表达。在人急性髓细胞样白血病细胞系MOLM13中利用慢病毒传导分别抑制eIF2A或eIF2D的内源表达,检测细胞的增殖和周期变化。利用salubrinal(10μmol/L)处理和血清饥饿的方式处理白血病细胞系使其进入应激状态,检测eIF2A和eIF2D的表达改变。结果eIF2A和eIF2D在造血干祖细胞中的表达显著高于成熟血液细胞,并且eIF2A和eIF2D在AML患者中表达高于健康人。与之相反,MCTS1在正常造血分化过程和AML细胞中均未见表达差异。抑制内源eIF2A或eIF2D的表达后,MOLM13细胞的增殖能力受到显著抑制(P<0.001),且细胞周期阻滞在G_(2)/M期(P<0.001)。当MOLM13受到salubrinal或血清饥饿处理后,eIF2A和eIF2D的表达显著增加。结论eIF2A和eIF2D通过促进细胞周期的正常进行调控白血病细胞的增殖。

关键词： eIF2A eIF2D 造血干细胞急性髓系白血病

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精神分裂症“二次打击”小鼠模型的建立与评价

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基础医学与临床 2021年第6期41卷 779-785页

作者：尤鹏升韦晖许琪中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的探究精神分裂症的风险因素孕期感染和产后炎性反应对疾病表型是否具有累加效应。方法给GD 9.5孕鼠腹腔注射聚肌胞苷酸建立母体免疫激活模型,其子代于青春期或成年早期再次注射polyⅠ:C,建立“二次打击”小鼠模型:1)通过ELISA和RT-q... 详细信息

目的探究精神分裂症的风险因素孕期感染和产后炎性反应对疾病表型是否具有累加效应。方法给GD 9.5孕鼠腹腔注射聚肌胞苷酸建立母体免疫激活模型,其子代于青春期或成年早期再次注射polyⅠ:C,建立“二次打击”小鼠模型:1)通过ELISA和RT-qPCR检测模型小鼠外周血和大脑中的炎性因子表达;2)通过前脉冲抑制和MK-801诱导的自发活动等行为学实验,检测小鼠的精神分裂症表型。结果1)MIA小鼠成年后表现出明显的行为学改变,如感觉运动门控障碍、MK-801的高敏感性等,且雌性小鼠受累程度较雄性小鼠更重;2)“二次打击”之后,MIA小鼠的感觉运动门控障碍减轻,精神分裂症相关表型部分缓解。结论青春期或成年早期的炎性反应与孕期感染间不存在协同的病理效应。

关键词：精神分裂症母体免疫激活二次打击 polyⅠ:C

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苹果酸酶2通过调控SHCBP1促进肝癌的发生发展

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基础医学与临床 2025年第6期45卷 741-747页

作者：秋昱翀杜文静中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院细胞生物学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室中国医学科学院北京协和医学院

目的筛选苹果酸酶2(ME2)调控的基因并探究其在肝癌发生发展中的作用与机制。方法对ME2敲降细胞的RNA-seq数据进行差异基因分析、聚类分析、GO和KEGG富集分析；在HepG2细胞中通过荧光定量PCR检测ME2敲降或者过表达后候选靶基因SHCBP1 m... 详细信息

目的筛选苹果酸酶2(ME2)调控的基因并探究其在肝癌发生发展中的作用与机制。方法对ME2敲降细胞的RNA-seq数据进行差异基因分析、聚类分析、GO和KEGG富集分析；在HepG2细胞中通过荧光定量PCR检测ME2敲降或者过表达后候选靶基因SHCBP1 mRNA的水平；Western blot检测ME2对下游信号通路的影响；通过细胞增殖、划痕与集落形成实验检测SHCBP1对肝癌细胞增殖与迁移的影响；利用TCGA LIHC数据库中肝癌患者的生存数据分析SHCBP1对肝癌患者预后的影响。结果敲降ME2后差异基因富集于PI3K-Akt信号通路、细胞周期、丝氨酸磷酸化等生物过程。在HepG2中敲降ME2后SHCBP1的mRNA水平降低，过表达ME2后SHCBP1的mRNA水平升高，两者呈正相关。Western blot结果显示ME2通过SHCBP1激活PI3K-Akt信号通路。荧光定量PCR结果显示SHCBP1在肝癌细胞系中表达显著高于正常肝细胞，并促进肝癌细胞的增殖与迁移，且与不良预后相关。结论 ME2正向调控SHCBP1并激活PI3K-Akt信号通路，SHCBP1高表达促进肝癌的发生发展，为肝癌治疗提供了新的靶点。

关键词：苹果酸酶2(ME2) PI3K-Akt信号通路 SHCBP1 肝癌

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