检索结果-内蒙古大学图书馆

合成生物学 2022年第2期3卷 352-368页

作者：许仕琳许海燕中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

单克隆抗体已经广泛用于肿瘤的靶向治疗,但由于肿瘤属于异质性疾病,涉及介导疾病进展的多种配受体信号变化以及信号级联通路之间的交互作用。因此,针对单一抗原的治疗难以有效抑制疾病的进程,而阻断多种不同的病理因素和途径是有望提高... 详细信息

单克隆抗体已经广泛用于肿瘤的靶向治疗,但由于肿瘤属于异质性疾病,涉及介导疾病进展的多种配受体信号变化以及信号级联通路之间的交互作用。因此,针对单一抗原的治疗难以有效抑制疾病的进程,而阻断多种不同的病理因素和途径是有望提高治疗效果的重要途径。近年来,合成生物学、生物工程和纳米技术等在不断发展,利用这些技术来设计工程化的治疗性抗体或可为肿瘤靶向免疫治疗带来新的思路。双特异性抗体是一种具有两种抗体特异性的人工抗体,可以同时识别不同的抗原或表位,由此实现多种功能,例如可以将T细胞重定向至肿瘤细胞并同时阻断两条不同的或相互串扰的细胞信号传导通路;与此同时,备受关注的纳米载体技术则为双抗体药物的研发与应用提供了有利的新工具。本文首先对双特异性抗体的生产和制备做简要介绍,然后对双特异性抗体在恶性血液肿瘤(急性髓细胞白血病和B细胞恶性血液肿瘤)和实体瘤(乳腺癌、卵巢癌、肺癌和头颈癌等)免疫治疗中的应用进展做分类介绍,并进一步介绍了双特异性抗体与纳米技术相结合形成的递送系统在肿瘤免疫治疗中的研究进展;最后讨论了双特异性抗体在设计和医学应用中面临的问题,并展望了纳米技术介导的靶向治疗策略在肿瘤治疗中的应用前景,以及双特异性抗体与免疫检查点抑制剂或疫苗等其他疗法联合应用的可能。

关键词：双特异性抗体免疫治疗靶向肿瘤纳米技术

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1号染色体长臂扩增削弱人胚胎干细胞神经分化潜能

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中华细胞与干细胞杂志（电子版） 2022年第3期12卷 129-137页

作者：李佳一张美丽黄粤中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

目的探讨1号染色体长臂(1q)的扩增对人胚胎干细胞(hESCs)神经分化的影响。方法通过对H9 hESCs克隆化培养的方法获得1q扩增的hESCs系。中期染色体计数的方法明确细胞内的染色体数目,核型分析鉴定染色体变异的情况,全基因组测序(WGS)分析... 详细信息

目的探讨1号染色体长臂(1q)的扩增对人胚胎干细胞(hESCs)神经分化的影响。方法通过对H9 hESCs克隆化培养的方法获得1q扩增的hESCs系。中期染色体计数的方法明确细胞内的染色体数目,核型分析鉴定染色体变异的情况,全基因组测序(WGS)分析基因组片段拷贝数变异的情况。使用碱性磷酸酶(AP)染色法检测细胞干性维持的情况,RT-qPCR和免疫荧光染色等方法检测胚胎干细胞(ESCs)标志物OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4等的表达。拟胚体(EB)形成实验进行hESCs不定向分化、全反式视黄酸(RA)诱导hESCs向外胚层分化、使用STEMdiff?SMADi Neural Induction Kit诱导hESCs向神经祖细胞(NPCs)定向分化,并通过RT-qPCR、AP染色和免疫荧光染色等方法检测其分化能力。两组间比较采用独立样本t检验。结果分离获得一株1q发生2个拷贝扩增的细胞,核型分析发现额外获得的2个1q是等臂染色体,核型为[47,XX,+i(1q)],将其命名为Amp(1q)。Amp(1q)AP染色呈阳性,且表达ESCs标志物OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4,具备干细胞自我更新的特征。EB分化过程中,与H9细胞相比,Amp(1q)向外胚层的分化能力下降,MAP2(29.67±1.53比66.67±1.15)和PAX6(8001±567.09比28308.00±1692.50)的表达降低(P均<0.05);RA诱导分化实验进一步证明,与H9细胞相比,Amp(1q)存在向外胚层分化的缺陷,MAP2(22.50±3.54比42.50±2.12)和PAX6(5403.00±569.93比38756.00±1068.44)的表达降低(P均<0.05)。当定向诱导向神经谱系分化时,Amp(1q)形成NPCs的能力降低,NPCs标志物PAX6的表达水平低于H9细胞(13.83±3.75比88.33±1.53)(P均<0.05)。结论Amp(1q)具有ESCs自我更新的能力,但1q的扩增会削弱hESCs神经分化的能力。

关键词： 1号染色体长臂扩增人胚胎干细胞自我更新神经分化

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一次读懂医学统计:混杂与效应修饰

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中华放射肿瘤学杂志 2025年第1期34卷 103-103页

作者：王擎何慧婧中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005

在科研活动,如研究设计、数据分析及文献审阅中,混杂(confounding)与效应修饰(effect modification)是两个关键的流行病学概念。理解这两个概念对于正确解释研究结果至关重要。目前仍有大量研究论文中对这两者进行了错误的使用或混淆。... 详细信息

在科研活动,如研究设计、数据分析及文献审阅中,混杂(confounding)与效应修饰(effect modification)是两个关键的流行病学概念。理解这两个概念对于正确解释研究结果至关重要。目前仍有大量研究论文中对这两者进行了错误的使用或混淆。本文通过明确的解释和实例分析,帮助读者清楚地区分和理解这两个重要的流行病学概念。

关键词：医学统计科研活动流行病学数据分析混杂读懂实例分析

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炙甘草来源的sRNA可能通过靶向TNF-α缓解轻度ADRS模型小鼠的肺损伤

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基础医学与临床 2023年第7期43卷 1030-1039页

作者：姜振宇王小娜汤克功陈明锐蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的探索靶向TNF-α的小RNA(sRNA)在急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中的影响和作用机制。方法以TNF-α为靶点,通过生物信息学方法从四逆汤水煎液sRNA数据库中筛选sRNAs;用双荧光素酶报告基因系统验证sRNAs靶向TNF-α的效果;将sRNA转染进细胞... 详细信息

目的探索靶向TNF-α的小RNA(sRNA)在急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中的影响和作用机制。方法以TNF-α为靶点,通过生物信息学方法从四逆汤水煎液sRNA数据库中筛选sRNAs;用双荧光素酶报告基因系统验证sRNAs靶向TNF-α的效果;将sRNA转染进细胞中,通过ELISA检测脂多糖(LPS)或poly(I:C)刺激的人肺腺癌细胞系A549的炎性因子IL-1β、IL-6和TNF-α;通过RT-qPCR检测LPS或poly(I:C)刺激的A549细胞炎性因子IL-1β、IL-6和TNF-α的mRNA水平;用LPS或poly(I:C)气管滴注构建小鼠轻度ARDS模型,将小鼠分为native组、模型组、NC组和sRNA治疗组,通过ELISA检测小鼠支气管肺泡灌洗液(BALF)和血清中炎性因子IL-1β、IL-6和TNF-α的浓度;观察轻度ARDS模型小鼠存活情况,统计分析小鼠的存活率。结果生物信息学分析筛选出50条可能与TNF-αmRNA结合的sRNA;双荧光素酶报告基因系统和人单核细胞白血病细胞系(THP1)炎性细胞模型筛选出1条能靶向TNF-α的TNF-α-sRNA-9,这条sRNA来源于四逆汤中的炙甘草;与NC组相比,TNF-α-sRNA-9降低了LPS或poly(I:C)刺激的A549细胞炎性因子IL-1β、IL-6和TNF-α水平(P<0.05),降低了mRNA水平(P<0.05);与NC组相比,TNF-α-sRNA-9的治疗降低了轻度ARDS模型小鼠的支气管肺泡灌洗液和血清中的IL-1β、IL-6和TNF-α水平(P<0.05),增加了小鼠的生存率。结论TNF-α-sRNA-9可能通过靶向TNF-α缓解轻度ARDS模型小鼠的肺损伤。

关键词：急性呼吸窘迫综合征急性肺损伤小RNA TNF-α 四逆汤

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BEND6过表达对小鼠神经干细胞基因转录表达的影响

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基础医学与临床 2023年第2期43卷 246-251页

作者：周梦杰孙倩倩于洋中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的探究在小鼠神经干细胞(NSCs)中过表达BEND6对其基因转录表达的影响,分析BEND6在小鼠神经发育过程中潜在的生物学功能。方法在贴壁培养的小鼠NSCs中分别瞬时转染pCMV-mScarlet(对照组)和pCMV-mScarlet-BEND6(实验组)质粒,24 h后在显... 详细信息

目的探究在小鼠神经干细胞(NSCs)中过表达BEND6对其基因转录表达的影响,分析BEND6在小鼠神经发育过程中潜在的生物学功能。方法在贴壁培养的小鼠NSCs中分别瞬时转染pCMV-mScarlet(对照组)和pCMV-mScarlet-BEND6(实验组)质粒,24 h后在显微镜下观察细胞中红色荧光的表达以确认mScarlet和mScarlet-BEND6蛋白的表达。分别提取两组细胞的总RNA,通过全转录组二代测序并对测序数据进行质控、参考基因组比对、定量分析、差异基因表达分析和富集分析,从而表征BEND6过表达对小鼠NSCs基因转录表达的影响及其在小鼠神经发育中的潜在功能。结果成功获取并贴壁培养小鼠NSCs。全转录组测序分析发现,与对照组相比,过表达BEND6的神经干细胞中有165个差异表达基因,其中有102个基因上调,63个基因下调。富集分析显示这些差异表达基因主要与膜电位改变,突触传递,刺激反应,生长发育等生物学过程的调节有关。结论BEND6过表达能够调控小鼠NSCs中的特定基因的转录水平,可能具有调控特定生物学过程及小鼠生长发育的功能。

关键词： BEN结构域 BEND6蛋白神经干细胞

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纳米材料组织工程支架在女性生殖系统再生中的应用研究

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基础医学与临床 2022年第1期42卷 26-32页

作者：胡雪纯许海燕中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

生殖系统的健康与女性生殖能力和生活质量密切相关。近年来女性生殖系统相关疾病发病率日渐升高并呈现年轻化趋势,对女性生殖健康带来诸多不利影响,亟需发展有效的治疗方法。通过组织工程技术引导组织再生,从而实现器官功能的恢复,为相... 详细信息

生殖系统的健康与女性生殖能力和生活质量密切相关。近年来女性生殖系统相关疾病发病率日渐升高并呈现年轻化趋势,对女性生殖健康带来诸多不利影响,亟需发展有效的治疗方法。通过组织工程技术引导组织再生,从而实现器官功能的恢复,为相关疾病的治疗提供了新途径。本文对近年来基于纳米结构和生物材料的组织工程支架构建以及组织工程技术在卵巢早衰、卵泡体外培养、子宫宫腔黏连、子宫缺损修复、盆腔器官脱垂等疾病治疗中的应用研究进行回顾总结和综合评述。

关键词：女性生殖系统组织再生组织工程

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BEguider:一个单碱基编辑器sgRNA设计与编辑效率预测工具

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生物信息学 2023年第2期21卷 106-113页

作者：高靖静王晓月中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

单碱基编辑器是实用且高效的基因编辑工具,其编辑效率与单向导RNA(single guide RNA,sgRNA)序列的设计密切相关。目前单碱基编辑器sgRNA序列的设计缺少特定的法则,主要依靠经验和大量尝试完成。本研究基于卷积神经网络,开发了一个单碱... 详细信息

单碱基编辑器是实用且高效的基因编辑工具,其编辑效率与单向导RNA(single guide RNA,sgRNA)序列的设计密切相关。目前单碱基编辑器sgRNA序列的设计缺少特定的法则,主要依靠经验和大量尝试完成。本研究基于卷积神经网络,开发了一个单碱基编辑器sgRNA序列设计工具BEguider。BEguider利用TensorFlow 2深度学习框架建立编辑效率预测模型,能够在人基因组范围内针对NGG PAM序列依赖的单碱基编辑器ABE7.10-NGG和BE4-NGG批量设计sgRNA序列,预测编辑效率。此外,通过整合Cas-OFFinder,BEguider能够提供对sgRNA脱靶情况的评估。利用BEguider设计sgRNA序列,有助于研究人员提高实验效率,节约实验成本。

关键词： CRISPR/Cas9 单碱基编辑器 sgRNA设计编辑效率卷积神经网络

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利用Hnf4α敲除的小鼠肝脏类器官探究发育模型的应用潜力

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基础医学与临床 2023年第5期43卷 724-732页

作者：张智玉曹军梁俊波中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的探讨胆管类器官(ICO)分化模型用作肝脏发育模型的应用潜力。方法结合CRISPR/Cas9基因编辑技术和ICO分化模型,使用分别在扩增培养基、分化培养基及敲除肝细胞核因子4α(Hnf4α)后在分化培养基培养的类器官的全转录组测序数据分析ICO... 详细信息

目的探讨胆管类器官(ICO)分化模型用作肝脏发育模型的应用潜力。方法结合CRISPR/Cas9基因编辑技术和ICO分化模型,使用分别在扩增培养基、分化培养基及敲除肝细胞核因子4α(Hnf4α)后在分化培养基培养的类器官的全转录组测序数据分析ICO的转分化过程,使用公共测序数据集分析胎肝发育过程中的分化,并从基因表达的变化趋势、生物学功能,以Hnf4α为例的regulon调控关系这三个方面对两种分化过程进行比较。结果ICO转分化过程中基因表达的变化趋势与胎肝发育总体一致;转分化过程中表达上调的差异基因主要富集在与肝实质细胞生物学功能密切相关的代谢相关通路;ICO转分化过程中Hnf4α的下游靶基因与胎肝发育部分相似。结论ICO转分化模型可以部分模拟胎肝发育中的分化过程。

关键词：胆管类器官转录组测序分化肝细胞核因子4α(Hnf4α)

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一次读懂医学统计:置信区间,医学研究的不确定性度量尺

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中华放射肿瘤学杂志 2025年第3期34卷 310-310页

作者：韩伟何慧婧中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005

一、置信区间帮助理解结果的可靠程度科学研究的本质是探索我们尚不了解的自然现象、规律和原理(总体),但我们只能获取一部分资料(样本)。用样本推断总体存在风险,医学研究中尤为明显。可信区间或置信区间(confidence interval,CI)恰恰... 详细信息

一、置信区间帮助理解结果的可靠程度科学研究的本质是探索我们尚不了解的自然现象、规律和原理(总体),但我们只能获取一部分资料(样本)。用样本推断总体存在风险,医学研究中尤为明显。可信区间或置信区间(confidence interval,CI)恰恰是“量化”随机误差带来的不确定性的工具,它提供了一个估计值的可能范围,帮助我们理解研究结果的可靠性。

关键词：置信区间医学统计不确定性度量帮助理解随机误差可信区间可靠程度估计值

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基因治疗中的核酸药物及非病毒递送载体的研究进展

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基础医学与临床 2022年第1期42卷 41-50页

作者：刘健中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

基因治疗是针对基因异常相关疾病的终极治疗技术,各种具有不同机制的核酸药物的出现为基因治疗带来了更多的可能性。但是,由于存在体内稳定性差、难以高效进入靶细胞等问题,核酸药物需要载体的帮助而进入目标细胞并到达特定的胞内位置,... 详细信息

基因治疗是针对基因异常相关疾病的终极治疗技术,各种具有不同机制的核酸药物的出现为基因治疗带来了更多的可能性。但是,由于存在体内稳定性差、难以高效进入靶细胞等问题,核酸药物需要载体的帮助而进入目标细胞并到达特定的胞内位置,因此,开发安全高效的核酸递送系统是基因治疗的基石。与病毒载体相比,非病毒载体具有更高的安全性,但转染效率较低。随着纳米技术的发展,非病毒载体的效率得到了显著的提升,进入临床研究的数量逐渐增多。本文简要介绍基因治疗中的核酸药物及其递送载体,对非病毒核酸药物递送技术的瓶颈及进展做综合评述。

关键词：基因治疗核酸药物非病毒载体药物递送系统

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