检索结果-内蒙古大学图书馆

基础医学与临床 2022年第6期42卷 933-939页

作者：沙务嘎李隽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的利用在大肠杆菌体系中诱导表达的人源NMNAT1蛋白筛选其抑制剂,寻找治疗肿瘤的新药物。方法利用酶切连接体系将人源NMNAT1插入pET21b(+)载体,将重组质粒转化入大肠杆菌BL21(DE3)菌株过表达蛋白,对重组蛋白进行纯化,通过3段式酶联荧... 详细信息

目的利用在大肠杆菌体系中诱导表达的人源NMNAT1蛋白筛选其抑制剂,寻找治疗肿瘤的新药物。方法利用酶切连接体系将人源NMNAT1插入pET21b(+)载体,将重组质粒转化入大肠杆菌BL21(DE3)菌株过表达蛋白,对重组蛋白进行纯化,通过3段式酶联荧光法在2280种天然化合物中筛选具有抑制NMNAT1活性的化合物,并在细胞水平验证其对肿瘤细胞的杀伤效果。结果纯化得到较高纯度和活性的人重组NMNAT1蛋白;筛选出6种高效的NMNAT1抑制剂;其中一种抑制剂fraxetin能降低乳腺癌细胞NAD+含量,促进细胞凋亡,与敲低NMNAT1后转录组测序(RNA-seq)分析得出的细胞凋亡通路增强一致。结论Fraxetin是NMNAT1强效抑制剂,能够促进乳腺癌细胞凋亡。

关键词：烟酰胺单核苷酸腺苷转移酶1(NMNAT1) 蛋白纯化高通量药物筛选凋亡

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昆虫细胞表达的HPV-58 L1病毒样颗粒的层析纯化及免疫原性分析

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基础医学与临床 2022年第5期42卷 763-767页

作者：王志荣张婷许雪梅中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物物理及结构生物学系北京100005

目的探索利用昆虫杆状病毒表达系统(IBEVS)表达的重组人乳头瘤病毒(HPV)58型主要衣壳蛋白L1病毒样颗粒(VLP)的简单可行的层析分离方法。方法收集高水平表达HPV-58 L1的昆虫细胞并制备裂解上清,建立硫酸铵沉淀(ASP)联合层析法纯化L1蛋白... 详细信息

目的探索利用昆虫杆状病毒表达系统(IBEVS)表达的重组人乳头瘤病毒(HPV)58型主要衣壳蛋白L1病毒样颗粒(VLP)的简单可行的层析分离方法。方法收集高水平表达HPV-58 L1的昆虫细胞并制备裂解上清,建立硫酸铵沉淀(ASP)联合层析法纯化L1蛋白的最佳条件,对纯化后的蛋白进行体外组装。对L1蛋白的纯化各个阶段中的组分、最终产品(纯品蛋白)及组装状态进行理化性质鉴定,分析其免疫原性。结果30%饱和硫酸铵(AS)分级分离后,L1蛋白得率为72%,纯度为9.34%;阴离子交换层析经300 mmol/L NaCl缓冲液洗脱后,L1蛋白得率>90%,纯度为13.6%;进一步经羟基磷灰石层析收获流穿液后,L1蛋白得率>80%,宿主蛋白质残留(HCPs)分析和L1蛋白的SDS-PAGE考马斯亮蓝染色显示蛋白纯度>99%。经上述3步分离纯化的L1蛋白,其总得率为55.7%,每升细胞悬浮培养液(约3.0×10^(9)个细胞)产量为57~65 mg。动态光散射(DLS)和透射电镜(TEM)分析显示,L1蛋白组装成了形状均一、直径约55 nm的VLPs。该法制备HPV-58 L1 VLPs诱导小鼠免疫系统产生的中和抗体水平与超离法制备的相当。结论本研究所建立的HPV58-L1 VLPs分离纯化方法是一套具有蛋白得率高、活性好,且操作简单等特点的成熟方案,为利用IBEVS生产成本低的HPV多价预防性疫苗奠定基础。

关键词：人乳头瘤病毒58型主要衣壳蛋白L1 病毒样颗粒(VLP) 昆虫细胞纯化

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长链非编码RNA ZFAS1在结直肠癌中的表达及生物学功能

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生物技术进展 2022年第3期12卷 427-435页

作者：武丽娜彭小忠鲁重美中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院消化内科北京100730 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京100730

为探讨长链非编码RNA锌指核转录因子反义链1(zinc finger nuclear transcription factor antisense RNA 1,ZFAS1)在结直肠癌中的表达及生物学功能,通过实时荧光定量PCR检测ZFAS1在结直肠癌中的表达水平,并分析其表达水平与患者临床病理... 详细信息

为探讨长链非编码RNA锌指核转录因子反义链1(zinc finger nuclear transcription factor antisense RNA 1,ZFAS1)在结直肠癌中的表达及生物学功能,通过实时荧光定量PCR检测ZFAS1在结直肠癌中的表达水平,并分析其表达水平与患者临床病理特征之间的关系。利用细胞功能学试验检测ZFAS1对结肠癌细胞生长及迁移能力的影响,敲低ZFAS1,检测其潜在靶基因锌指核转录因子1(zinc finger nuclear transcription factor X-box binding 1-type containing 1,ZNFX1)在结肠癌细胞系中的表达量,并通过细胞功能学试验检测ZNFX1对结肠癌细胞生长及迁移能力的影响。结果显示,ZFAS1在结直肠癌细胞中高表达,敲低ZFAS1可以抑制结肠癌细胞的生长及迁移;敲低ZFAS1后,ZNFX1的表达上调;ZNFX1在结肠癌细胞系中低表达,过表达ZNFX1可以抑制结肠癌细胞的生长及迁移能力。研究结果为阐明ZFAS1在结直肠癌中的作用机制奠定了一定的理论基础。

关键词：长链非编码RNA 结直肠癌 ZFAS1 ZNFX1

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CLIP-PCR直接检测血液中疟原虫雌性配子体特异转录产物s25 mRNA

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基础医学与临床 2022年第1期42卷 139-144页

作者：杨珺源骈红茹杨明珠郑直中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的建立一种疟原虫雌性配子体的分子检测法。方法根据疟原虫雌性配子体特异性mRNA靶标(待测靶序列)即动合子表面蛋白(s25)的转录产物,设计特异性的捕获探针和连接探针。血液样品经裂解释放的mRNAs,无需核酸提取,通过“三明治”杂交被... 详细信息

目的建立一种疟原虫雌性配子体的分子检测法。方法根据疟原虫雌性配子体特异性mRNA靶标(待测靶序列)即动合子表面蛋白(s25)的转录产物,设计特异性的捕获探针和连接探针。血液样品经裂解释放的mRNAs,无需核酸提取,通过“三明治”杂交被捕获到96孔板表面。洗去未结合探针后,将结合在mRNA靶标上的连接探针进行连接,得到两端为特殊设计序列的单链扩增模板。再用通用引物进行染料法qPCR扩增,或在端部设计TaqMan探针序列,用通用引物和通用TaqMan探针进行探针法qPCR扩增。评价这一基于捕获和连接扩增的方法(CLIP-PCR)的灵敏度、特异性和重复性并与普通的RT-qPCR方法进行比较,将其应用于临床样品的检测。结果该CLIP-PCR具有较高的灵敏度和特异性。与普通的RT-qPCR一样,均可检测低至11拷贝数的s25 mRNA靶标;而且该CLIP-PCR操作更简便。该CLIP-PCR可准确检测到疟疾患者血液中的雌性配子体。可将96个样品的检测时间缩短至3 h。结论建立了灵敏高效的染料法和通用TaqMan探针法CLIP-PCR检测疟原虫雌性配子体,为疟疾传播的控制、配子体大规模筛查奠定了基础。

关键词：疟原虫配子体检测方法捕获连接

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异源物代谢的表观遗传学变异影响抗癫痫药3,4-DCPB药物代谢动力学表型个体差异

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Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences 2023年第1期32卷 1-16页

作者：逯颖媛张梅尹胜菊董晓娜张志远程海旭屠鹏飞窦桂芳车永胜徐争辉徐枫王宪吕闯楼雅卿章国良北京大学医学部基础医学院药理学系北京100191 北京军区总医院药剂科北京100700 北京大学医学部药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室北京100191 军事医学科学院放射医学研究所药物代谢动力学研究室北京100850 中国医学科学院生物医学技术研究所北京100050 博奥晶典生物技术股份有限公司北京102206 北京大学医学部基础医学院生理与病理生理学系北京100191 美国阿克森特药物治疗股份有限公司药物代谢与药物代谢动力学(DMPK)实验室美国马萨诸塞(MA)02425

抗癫痫药物治疗是控制癫痫的主要方法,但由于个体间对药物处置的差异性,患者对目前治疗的反应性并不一致。本研究通过在健康志愿者中进行的临床Ⅰ期剂量递增试验,考察了遗传和表观遗传变异是否影响抗癫痫药物氯桂丁胺(3,4-DCPB)的药代... 详细信息

抗癫痫药物治疗是控制癫痫的主要方法,但由于个体间对药物处置的差异性,患者对目前治疗的反应性并不一致。本研究通过在健康志愿者中进行的临床Ⅰ期剂量递增试验,考察了遗传和表观遗传变异是否影响抗癫痫药物氯桂丁胺(3,4-DCPB)的药代动力学表型。采用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)法测定血浆中3,4-DCPB母药及其主要代谢物M1的浓度。通过基因分型和DNA甲基化水平分析细胞色素P4502D6(CYP2D6)、CYP2C9、CYP1A2、CYP2C19、CYP3A5、转运体ABCB1(C1236T)、核受体AhR、CAR和PXR的单核苷酸多态性(SNPs)。与野生型CYP2D6*1/*1纯合子(广泛代谢型,EMs)相比,变异等位基因CYP2D6*10携带者(中间代谢型,IMs)中,代谢产物M1与3,4-DCPB母药的药时曲线下面积(AUC0–t)的比值更低,血浆半衰期(t1/2)更久,DNA甲基化水平更高。这些数据表明胞嘧啶的丢失(CYP2D6*10,C>T)所诱导的表观基因突变可能解释3,4-DCPB基因型、表观基因型和药代动力学表型在个体差异之间的关系,为癫痫的个性化治疗提供新的思路。

关键词：药物代谢动力学抗癫痫药氯桂丁胺个体差异 DNA甲基化 CYP2D6*10携带者表突变临床Ⅰ期剂量递增试验

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孤独症患者过早死亡风险及死亡原因

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北京大学学报（医学版） 2023年第2期55卷 375-383页

作者：赵亚楠范慧芸王翔宇罗雅楠张嵘郑晓瑛中国医学科学院北京协和医学院群医学与公共卫生学院北京100730 北京大学中国卫生发展研究中心北京100191 北京大学亚太经合组织健康科学研究院北京100871 北京大学人口研究所北京100871 北京大学公共卫生学院全球卫生学系北京100191 北京大学神经科学研究所北京大学基础医学院神经生物学系神经科学教育部重点实验室卫生部神经科学重点实验室北京100191 北京大学医学部孤独症研究中心北京100191

孤独症谱系障碍(autism spectrum disorder,ASD)是一系列神经发展功能失调的综合,其核心特征包括:社会交往功能异常、刻板、重复性行为[《精神障碍诊断与统计手册(第五版)》(Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders,DSM... 详细信息

孤独症谱系障碍(autism spectrum disorder,ASD)是一系列神经发展功能失调的综合,其核心特征包括:社会交往功能异常、刻板、重复性行为[《精神障碍诊断与统计手册(第五版)》(Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders,DSM-5)][1]。随着研究的不断深入,ASD这一概念将之前孤独症的概念进行了整合,包括典型孤独症、不典型孤独症、阿斯伯格综合征(Asperger syndrome)、孤独症边缘、孤独症疑似等[1],因其诊疗和康复原则基本相同,为叙述方便,后文将谱系内疾病统称为孤独症。

关键词：孤独症谱系障碍死亡风险死亡率死亡原因系统性综述

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本体构建工具Py2ONTO的设计与实现

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中华医学图书情报杂志 2022年第9期31卷 42-50页

作者：王哲杨晟朱彦杨啸林中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院北京100730 中国中医科学院中医药信息研究所北京100700

目的:开发一个简单易用的本体构建工具Py2ONTO,探索人工方式和自动化方式相结合的本体构建方案。方法:通过将Owlready常用的底层函数封装为功能函数,在此基础上设计一个基于CSV模板的自动构建本体的流程,并在代码中提供功能函数的调用,... 详细信息

目的:开发一个简单易用的本体构建工具Py2ONTO,探索人工方式和自动化方式相结合的本体构建方案。方法:通过将Owlready常用的底层函数封装为功能函数,在此基础上设计一个基于CSV模板的自动构建本体的流程,并在代码中提供功能函数的调用,通过BioPortal、MedPortal等本体数据库实现术语映射功能。结果:开发了基于Python的本体建设工具Py2ONTO,该工具可以通过命令行方式及Python脚本调用功能函数方式构建本体。通过该工具构建了两个本体,测试结果证明本文构建的本体满足其术语覆盖度和可推理性评估要求。结论:为本体构建提供了一种较为简单且可靠的选择,有助于科研人员构建高质量的本体。

关键词：本体构建工具本体术语映射工作流程

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代谢组学在静脉血栓栓塞症中的应用研究进展

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国际呼吸杂志 2024年第10期44卷 1224-1228页

作者：李慧文张竹杨沛然翟振国哈尔滨医科大学附属第二医院呼吸与危重症医学科哈尔滨150086 国家呼吸医学中心呼吸和共病全国重点实验室国家呼吸疾病临床研究中心中国医学科学院呼吸病学研究院中日友好医院呼吸与危重症医学科北京100029 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院生理学系北京100005

代谢组学是一门分析生物体代谢物组成及变化的新兴学科,能够揭示疾病生理和病理状态下的代谢过程。静脉血栓栓塞症(VTE)作为严重的血管性疾病,包括深静脉血栓形成和肺血栓栓塞症,具有高发病率和高病死率。尽管VTE诊疗方式不断进步,但仍... 详细信息

代谢组学是一门分析生物体代谢物组成及变化的新兴学科,能够揭示疾病生理和病理状态下的代谢过程。静脉血栓栓塞症(VTE)作为严重的血管性疾病,包括深静脉血栓形成和肺血栓栓塞症,具有高发病率和高病死率。尽管VTE诊疗方式不断进步,但仍面临诸多挑战。代谢组学技术可识别VTE相关病理代谢过程,包括血栓形成、炎症反应和内皮功能障碍等代谢路径异常及代谢产物变化,为挖掘VTE新型标志物提供了重要线索。本文旨在总结代谢组学在VTE研究中的应用现状,探讨其在揭示疾病病程演变、风险评估和诊治中的潜力及未来研究方向。

关键词：静脉血栓栓塞代谢组学肺栓塞静脉血栓形成

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河北省汉族和满族成人高血压家族史与超重/肥胖对高血压发病的交互作用

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基础医学与临床 2023年第7期43卷 1053-1059页

作者：蒋晨晨崔泽潘利孙纪新何慧婧胡耀达单广良中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005 河北省疾病预防控制中心河北石家庄050000

目的探讨河北省汉族和满族成人高血压家族史、超重/肥胖以及二者的交互作用对高血压发病的影响,为河北省预防和控制高血压提供参考依据。方法于2017年7~8月在河北省采用多阶段分层整群抽样的方法对河北省4633名20~80岁汉族和满族进行横... 详细信息

目的探讨河北省汉族和满族成人高血压家族史、超重/肥胖以及二者的交互作用对高血压发病的影响,为河北省预防和控制高血压提供参考依据。方法于2017年7~8月在河北省采用多阶段分层整群抽样的方法对河北省4633名20~80岁汉族和满族进行横断面调查,包括问卷调查和体格检查。采用多因素非条件Logistic回归模型分析高血压家族史和超重/肥胖对高血压的作用。结果在校正了民族、性别、年龄、城乡、收入、教育程度、吸烟、饮酒、身体锻炼和体力劳动后,有高血压家族史人群患高血压的风险是无高血压家族史人群的3.60倍(95%CI:2.51~5.18),超重/肥胖人群患高血压的风险是非超重/肥胖人群的2.90倍(95%CI:1.92~4.37),二者同时存在时患高血压的风险是二者皆不存在时的9.78倍(95%CI:6.86~13.95)。交互作用超额相对危险度(RERI)为4.28(95%CI:2.59~5.96),交互作用指数(SI)为1.95(95%CI:1.54~2.47),交互作用归因比(AP)为0.44(95%CI:0.33~0.54)。结论高血压家族史和超重/肥胖均与高血压患病风险增加有关,二者存在正向的加法交互作用。

关键词：高血压家族史超重/肥胖交互作用

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SIRT5通过调控ALDH5A1的琥珀酰化促进人乳腺癌细胞的增殖

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基础医学与临床 2022年第7期42卷 1099-1107页

作者：康有力赵丹杜文静李莉中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1(ALDH5A1)调控乳腺癌增殖的机制。方法使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因... 详细信息

目的利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1(ALDH5A1)调控乳腺癌增殖的机制。方法使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因改变、差异表达及与预后的相关性。利用质谱分析与SIRT5相互作用的蛋白质。使用Metascape对相互作用蛋白质组进行通路富集,并与酰化组学结果进行共分析。通过内外源免疫沉淀(IP)确定SIRT5与ALDH5A1间的相互作用。过表达或敲降SIRT5检测ALDH5A1的酰化水平与酶活改变。通过细胞增殖与克隆实验确定SIRT5与ALDH5A1对乳腺癌增殖的影响。结果SIRT5在乳腺癌等多种肿瘤中高表达并与不良预后成正相关(P<0.05)。SIRT5相互作用蛋白与酰化组学结果存在多个重叠,并主要富集到氨基酸代谢等代谢通路上。SIRT5与ALDH5A1存在相互作用。SIRT5可通过促进ALDH5A1的去琥珀酰化从而提高其酶活,进而促进乳腺癌细胞增殖(P<0.05)。结论SIRT5在肿瘤中的功能可能具有异质性,在乳腺癌中可通过ALDH5A1发挥促癌作用,为后续的临床靶向治疗提供理论基础。

关键词： SIRT5 ALDH5A1 乳腺癌增殖

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