检索结果-内蒙古大学图书馆

国际呼吸杂志 2024年第10期44卷 1224-1228页

作者：李慧文张竹杨沛然翟振国哈尔滨医科大学附属第二医院呼吸与危重症医学科哈尔滨150086 国家呼吸医学中心呼吸和共病全国重点实验室国家呼吸疾病临床研究中心中国医学科学院呼吸病学研究院中日友好医院呼吸与危重症医学科北京100029 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院生理学系北京100005

代谢组学是一门分析生物体代谢物组成及变化的新兴学科,能够揭示疾病生理和病理状态下的代谢过程。静脉血栓栓塞症(VTE)作为严重的血管性疾病,包括深静脉血栓形成和肺血栓栓塞症,具有高发病率和高病死率。尽管VTE诊疗方式不断进步,但仍... 详细信息

代谢组学是一门分析生物体代谢物组成及变化的新兴学科,能够揭示疾病生理和病理状态下的代谢过程。静脉血栓栓塞症(VTE)作为严重的血管性疾病,包括深静脉血栓形成和肺血栓栓塞症,具有高发病率和高病死率。尽管VTE诊疗方式不断进步,但仍面临诸多挑战。代谢组学技术可识别VTE相关病理代谢过程,包括血栓形成、炎症反应和内皮功能障碍等代谢路径异常及代谢产物变化,为挖掘VTE新型标志物提供了重要线索。本文旨在总结代谢组学在VTE研究中的应用现状,探讨其在揭示疾病病程演变、风险评估和诊治中的潜力及未来研究方向。

关键词：静脉血栓栓塞代谢组学肺栓塞静脉血栓形成

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本体构建工具Py2ONTO的设计与实现

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中华医学图书情报杂志 2022年第9期31卷 42-50页

作者：王哲杨晟朱彦杨啸林中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院北京100730 中国中医科学院中医药信息研究所北京100700

目的:开发一个简单易用的本体构建工具Py2ONTO,探索人工方式和自动化方式相结合的本体构建方案。方法:通过将Owlready常用的底层函数封装为功能函数,在此基础上设计一个基于CSV模板的自动构建本体的流程,并在代码中提供功能函数的调用,... 详细信息

目的:开发一个简单易用的本体构建工具Py2ONTO,探索人工方式和自动化方式相结合的本体构建方案。方法:通过将Owlready常用的底层函数封装为功能函数,在此基础上设计一个基于CSV模板的自动构建本体的流程,并在代码中提供功能函数的调用,通过BioPortal、MedPortal等本体数据库实现术语映射功能。结果:开发了基于Python的本体建设工具Py2ONTO,该工具可以通过命令行方式及Python脚本调用功能函数方式构建本体。通过该工具构建了两个本体,测试结果证明本文构建的本体满足其术语覆盖度和可推理性评估要求。结论:为本体构建提供了一种较为简单且可靠的选择,有助于科研人员构建高质量的本体。

关键词：本体构建工具本体术语映射工作流程

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河北省汉族和满族成人高血压家族史与超重/肥胖对高血压发病的交互作用

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基础医学与临床 2023年第7期43卷 1053-1059页

作者：蒋晨晨崔泽潘利孙纪新何慧婧胡耀达单广良中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005 河北省疾病预防控制中心河北石家庄050000

目的探讨河北省汉族和满族成人高血压家族史、超重/肥胖以及二者的交互作用对高血压发病的影响,为河北省预防和控制高血压提供参考依据。方法于2017年7~8月在河北省采用多阶段分层整群抽样的方法对河北省4633名20~80岁汉族和满族进行横... 详细信息

目的探讨河北省汉族和满族成人高血压家族史、超重/肥胖以及二者的交互作用对高血压发病的影响,为河北省预防和控制高血压提供参考依据。方法于2017年7~8月在河北省采用多阶段分层整群抽样的方法对河北省4633名20~80岁汉族和满族进行横断面调查,包括问卷调查和体格检查。采用多因素非条件Logistic回归模型分析高血压家族史和超重/肥胖对高血压的作用。结果在校正了民族、性别、年龄、城乡、收入、教育程度、吸烟、饮酒、身体锻炼和体力劳动后,有高血压家族史人群患高血压的风险是无高血压家族史人群的3.60倍(95%CI:2.51~5.18),超重/肥胖人群患高血压的风险是非超重/肥胖人群的2.90倍(95%CI:1.92~4.37),二者同时存在时患高血压的风险是二者皆不存在时的9.78倍(95%CI:6.86~13.95)。交互作用超额相对危险度(RERI)为4.28(95%CI:2.59~5.96),交互作用指数(SI)为1.95(95%CI:1.54~2.47),交互作用归因比(AP)为0.44(95%CI:0.33~0.54)。结论高血压家族史和超重/肥胖均与高血压患病风险增加有关,二者存在正向的加法交互作用。

关键词：高血压家族史超重/肥胖交互作用

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SIRT5通过调控ALDH5A1的琥珀酰化促进人乳腺癌细胞的增殖

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基础医学与临床 2022年第7期42卷 1099-1107页

作者：康有力赵丹杜文静李莉中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1(ALDH5A1)调控乳腺癌增殖的机制。方法使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因... 详细信息

目的利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1(ALDH5A1)调控乳腺癌增殖的机制。方法使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因改变、差异表达及与预后的相关性。利用质谱分析与SIRT5相互作用的蛋白质。使用Metascape对相互作用蛋白质组进行通路富集,并与酰化组学结果进行共分析。通过内外源免疫沉淀(IP)确定SIRT5与ALDH5A1间的相互作用。过表达或敲降SIRT5检测ALDH5A1的酰化水平与酶活改变。通过细胞增殖与克隆实验确定SIRT5与ALDH5A1对乳腺癌增殖的影响。结果SIRT5在乳腺癌等多种肿瘤中高表达并与不良预后成正相关(P<0.05)。SIRT5相互作用蛋白与酰化组学结果存在多个重叠,并主要富集到氨基酸代谢等代谢通路上。SIRT5与ALDH5A1存在相互作用。SIRT5可通过促进ALDH5A1的去琥珀酰化从而提高其酶活,进而促进乳腺癌细胞增殖(P<0.05)。结论SIRT5在肿瘤中的功能可能具有异质性,在乳腺癌中可通过ALDH5A1发挥促癌作用,为后续的临床靶向治疗提供理论基础。

关键词： SIRT5 ALDH5A1 乳腺癌增殖

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多组学分析发现LAMC2是调节泛癌微环境的关键因子

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基础医学与临床 2022年第4期42卷 545-552页

作者：苏路瑛黄容邹定峰许富李凯卢艳缪时英王琳芳宋伟中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用多种数据库对多黏连细胞外基质蛋白LAMC2进行了系统分析,多组学数据证明LAMC2是影响患者肿瘤发生和临床预后的关键分子。方法利用数据库分析了各种肿瘤及正常组织中LAMC2的蛋白质和RNA的表达量。并且比较了不同肿瘤类型间的LAMC... 详细信息

目的利用多种数据库对多黏连细胞外基质蛋白LAMC2进行了系统分析,多组学数据证明LAMC2是影响患者肿瘤发生和临床预后的关键分子。方法利用数据库分析了各种肿瘤及正常组织中LAMC2的蛋白质和RNA的表达量。并且比较了不同肿瘤类型间的LAMC2表达量与肿瘤患者生存间的关系,并进行免疫浸润分析;比较了在不同肿瘤类型中LAMC2的表达量与肿瘤微环境免疫浸润的关系。结果通过对LAMC2进行泛癌分析,发现LAMC2的mRNA和蛋白表达在多种肿瘤中表达量高于癌旁组织,并在部分肿瘤中集中表达于恶性肿瘤细胞上。此外,还发现LAMC2的表达不利于泛癌的临床预后,并跟多种肿瘤免疫浸润相关。结论LAMC2是一种重要的致癌基因,可能是有效治疗肿瘤的重要靶点。该结果为后续的分子靶向治疗提供理论依据。

关键词： LAMC2 泛癌分析预后分析

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Sirt6基因脑特异性敲除对老年小鼠大脑皮层的影响

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中华行为医学与脑科学杂志 2021年第6期30卷 481-488页

作者：王新寰侯琳阴彬刘伟彭小忠中国医学科学院基础医学研究所(北京协和医学院基础学院)医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所昆明650118

目的研究衰老基因沉默信息调节因子6(silent information regulator 6,Sirt6)敲除后对于老年小鼠大脑皮层的影响。方法构建Sirt6-flox转基因小鼠,利用Emx1-Cre工具鼠对小鼠脑组织进行特异性Sirt6基因敲除。根据基因分型,将11只野生型小... 详细信息

目的研究衰老基因沉默信息调节因子6(silent information regulator 6,Sirt6)敲除后对于老年小鼠大脑皮层的影响。方法构建Sirt6-flox转基因小鼠,利用Emx1-Cre工具鼠对小鼠脑组织进行特异性Sirt6基因敲除。根据基因分型,将11只野生型小鼠作为对照组(WT组),10只Sirt6基因敲除小鼠作为条件敲除组(cKO组)。对老年小鼠的体型和体质量进行测量,HE染色比较大脑皮层厚度;EdU标记分析大脑神经再生,Western blot检测衰老相关RNA结合蛋白HuR和凋亡相关蛋白Caspase-3的表达,同时检测皮层内组蛋白乙酰化水平。结果成功构建Sirt6脑组织特异性敲除小鼠,12月龄组实验中,与WT组小鼠脑组织面积[(2.07±0.22)cm^(2)]和皮层厚度[(970.56±80.91)μm]相比,Sirt6 cKO组脑组织面积[(1.61±0.14)cm^(2)]和皮层厚度[(822.88±53.94)μm]均偏小,均差异有统计学意义(均P<0.05);EdU掺入神经细胞实验显示,与WT组每100个室管膜区神经细胞中EdU掺入细胞数目[(10.29±1.93)个]相比,Sirt6 cKO组室管膜区神经细胞EdU掺入数目偏少[(4.75±1.48)个],且差异具有统计学意义(P<0.001);在17月龄组实验中,与WT组体型、体质量[(35.25±4.17)g]和脑组织面积[(1.98±0.18)cm^(2)]相比,Sirt6 cKO组小鼠体型偏小、体质量[(29.00±1.08)g]偏低且脑组织面积[(1.54±0.55)cm^(2)]偏小,差异具有统计学意义(均P<0.05)。这两个月龄段小鼠脑皮层蛋白中Caspase-3、HuR表达降低(t=2.95,5.38,均P<0.05),且H3K9ac、H3K56ac的表达增高(t=3.53,2.78,均P<0.05),但同源基因Sirt1表达无变化(t=1.26,P>0.05)。结论Sirt6的脑组织特异性缺失会导致老年小鼠大脑神经再生减少,衰老加剧,凋亡增加,这可能是导致其大脑皮层变薄,脑组织萎缩的原因,推测其分子机制与Sirt6敲除后乙酰化水平升高有关。

关键词：沉默信息调节因子6 条件性基因敲除组蛋白乙酰化神经再生衰老

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基于单细胞转录组测序分析描绘人类早期胚胎红细胞发育图谱

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基础医学与临床 2022年第5期42卷 776-781页

作者：陈仲扬马艳妮余佳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)在单细胞水平系统描绘人早期红系发育的细胞图谱及分子轨迹。方法通过对人妊娠第36天CS15后期的胚胎卵黄囊组织scRNA-seq数据进行主成分分析(PCA);聚类分析以及拟时序分析;观察标记基因在不同细胞... 详细信息

目的利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)在单细胞水平系统描绘人早期红系发育的细胞图谱及分子轨迹。方法通过对人妊娠第36天CS15后期的胚胎卵黄囊组织scRNA-seq数据进行主成分分析(PCA);聚类分析以及拟时序分析;观察标记基因在不同细胞群体中的表达情况;预测红系细胞发生时间和发育路径。结果在CS15的卵黄囊的不同细胞群体中,红细胞及其祖细胞、前体细胞等的标记基因存在差异性表达,不同细胞的发生时序不同,且卵黄囊内的红细胞存在一定的异质性。CS15的卵黄囊内存在类型丰富的细胞,可能包括血管内皮细胞、造血前体细胞、粒细胞、不同状态的红细胞以及单核细胞等。结论推测人早期红系发育路径大致为血管内皮细胞分化产生造血前体细胞,进一步分化成为红髓祖细胞,最终产生巨核细胞和红细胞。

关键词：单细胞转录组测序早期红系发育胚胎期卵黄囊

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非酒精性脂肪肝病模型小鼠的肝脏病理变化及肝细胞获取方法

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基础医学与临床 2022年第6期42卷 890-895页

作者：史冬雪原佳琪丁宝锋王小爽余佳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的检测非酒精性脂肪肝病(NAFLD)模型小鼠的肝脏病理变化,并探索一种获得大量高活性、高纯度的NAFLD小鼠原代肝细胞的实验方法。方法60只小鼠随机分为正常组(正常饲料,CD)和高脂组(高脂饲料,HFD),分饮食饲养20周。定期检测小鼠的体质量... 详细信息

目的检测非酒精性脂肪肝病(NAFLD)模型小鼠的肝脏病理变化,并探索一种获得大量高活性、高纯度的NAFLD小鼠原代肝细胞的实验方法。方法60只小鼠随机分为正常组(正常饲料,CD)和高脂组(高脂饲料,HFD),分饮食饲养20周。定期检测小鼠的体质量,苏木精-伊红(HE)染色和天狼猩红染色观察肝脏组织病理特点。高脂饮食15周时,原位灌注Ⅳ型胶原酶6~8 mL消化得到混合肝细胞,铺于40%的Percoll分离液上,进行密度梯度离心获得纯化的肝细胞,锥虫蓝染色确定细胞的活性,显微镜观察其形态。结果随着建模时间的延长,HFD组小鼠的体质量逐渐增加,且增幅显著高于CD组;HFD组小鼠肝脏脂肪变性程度增加,在第20周伴随出现了纤维化;建模15周时,每只NAFLD小鼠可获得5×10^(7)~7×10^(7)个肝细胞,细胞存活率≥85%,细胞纯度≥95%,细胞呈圆形或椭圆形,其边缘平滑,且聚团少;通过精准控制温度、降低胶原酶浓度、使用低速离心和低速密度梯度离心等优化条件后,获得的细胞数量和质量均有显著提高。结论成功构建了NAFLD小鼠模型,并揭示了不同疾病阶段肝脏的病理特点。探索了一种高效、稳定的获取NAFLD小鼠原代肝细胞的方法。所得肝细胞的数量和活性都符合大多数实验的要求。

关键词：非酒精性脂肪肝病小鼠模型病理学

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CD19嵌合抗原受体T细胞治疗后细胞因子释放综合征的诊治进展

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白血病．淋巴瘤 2021年第9期30卷 568-571页

作者：张琪殷国桓肖毅华中科技大学同济医学院附属同济医院血液内科武汉430030 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100730

CD19嵌合抗原受体T细胞疗法是治疗B细胞血液肿瘤的新兴免疫疗法,并取得了较好的疗效。随着其使用的增加,免疫效应细胞相关细胞因子释放综合征的发生率也相应升高,迫切需要对其精确机制和治疗进行进一步的临床研究。文章总结了细胞因子... 详细信息

CD19嵌合抗原受体T细胞疗法是治疗B细胞血液肿瘤的新兴免疫疗法,并取得了较好的疗效。随着其使用的增加,免疫效应细胞相关细胞因子释放综合征的发生率也相应升高,迫切需要对其精确机制和治疗进行进一步的临床研究。文章总结了细胞因子释放综合征的机制、临床表现、分级系统、治疗以及管理策略。

关键词：受体,抗原,T细胞细胞因子受体gp130 免疫疗法

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不同类型抗炎药物治疗干眼随机对照试验的Meta分析

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眼科 2023年第2期32卷 108-119页

作者：宁垦王新铭李莹余洋朱舟瞿邢芳中国医学科学院、北京协和医院眼科 100730 中国医学科学院、北京协和医学院、基础医学研究所 100730 宾夕法尼亚州立大学、生物化学与分子生物学系美国16801 北京师范大学、国际中文教育学院 100875

目的汇总分析环孢素、糖皮质激素类和非甾体类滴眼液以及联合用药在干眼治疗中的疗效和优缺点。设计Meta分析。研究对象治疗干眼的随机对照试验文献。方法对截止2022年8月7日的有关环孢素、糖皮质激素类和非甾体类滴眼液治疗干眼的随机... 详细信息

目的汇总分析环孢素、糖皮质激素类和非甾体类滴眼液以及联合用药在干眼治疗中的疗效和优缺点。设计Meta分析。研究对象治疗干眼的随机对照试验文献。方法对截止2022年8月7日的有关环孢素、糖皮质激素类和非甾体类滴眼液治疗干眼的随机对照试验(RCT)文献进行检索。对纳入的文献数据使用R Meta(5.2.0)软件包进行分析。主要指标Schirmer泪液测试(SIT)、泪膜破裂时间(TBUT)、角膜荧光素染色(FL)、症状评分、有效率和不良反应发生率。结果共纳入57篇随机对照试验文献的5850例(7945眼)。其中试验组3008例(4056眼),对照组2842例(3889眼)。结果显示,糖皮质激素类和非甾体类药物较对照组不良反应率无显著差异,环孢素较对照组不良反应率升高,三种药物干眼症状评分均显著好于对照组;三类药物均能显著提高TBUT和FL的结果;环孢素滴眼液试验组的SIT(无麻醉)显著高于对照组;联合用药组在SIT(无麻醉)、TBUT、FL和不良反应率中均与单独用药组无显著差异。结论基于本Meta的数据结果显示,环孢素、糖皮质激素类和非甾体类滴眼液均能有效地改善和治疗干眼。环孢素和糖皮质激素类滴眼液在改善各类指标方面互有优劣,且均较非甾体类滴眼液更优。糖皮质激素、环孢素联合用药较糖皮质激素或环孢素单独用药无显著优越性,但联合用药并未导致不良反应率显著上升。

关键词：干眼/治疗 Meta分析

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