检索结果-内蒙古大学图书馆

2023年γδT细胞肿瘤治疗领域重大进展述评

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中国肿瘤生物治疗杂志 2024年

作者：赵跃祺张建民陈慧何维中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院免疫学系医学分子生物学国家重点实验室T细胞与免疫治疗重点实验室常州西太湖细胞治疗前沿技术研究院

γδT细胞是一类表达γδT细胞受体（γδTCR）的特殊的固有免疫样T细胞，在机体抗感染免疫和肿瘤的免疫监视中发挥重要的作用[1，2]。γδT细胞在外周血和次级淋巴器官中含量很少，但富集于皮肤、消

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TPX2的表达对胰腺癌预后的影响

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基础医学与临床 2023年第6期43卷 875-881页

作者：苏靓誉张振西杜文静中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院细胞生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005 山西医科大学基础医学院细胞生理学教育部重点实验室山西太原030606

目的研究Xklp2靶蛋白(TPX2)在胰腺癌中的表达情况及其预测预后的潜在价值。方法基于200个糖酵解代谢相关基因,从TCGA和GEO数据库获取胰腺患者的信息,对后者的糖酵解代谢特征进行评价,同时综合患者代谢特征及差异基因,采用Cox回归和Lass... 详细信息

目的研究Xklp2靶蛋白(TPX2)在胰腺癌中的表达情况及其预测预后的潜在价值。方法基于200个糖酵解代谢相关基因,从TCGA和GEO数据库获取胰腺患者的信息,对后者的糖酵解代谢特征进行评价,同时综合患者代谢特征及差异基因,采用Cox回归和Lasso回归分析建立风险模型,获得关键糖酵解相关基因TPX2,并用GEO数据库验证该模型的预后有效性。基于预后基因的表达分析胰腺癌患者的生存期,并分析正常胰腺组织和胰腺癌中预后基因的表达差异,最后在细胞水平验证预后基因的功能。结果病例队列被分为高、中、低3个糖酵解代谢特征组,低速率糖酵解代谢患者存在一定生存优势,TPX2是该模型的关键基因,胰腺癌患者显示高表达TPX2,具有较差的预后。细胞水平上敲降TPX2可抑制胰腺癌细胞增殖和集落形成。结论本研究基于糖酵解代谢模型有效地预测了胰腺癌患者的预后,TPX2有望成为胰腺癌预后预测的潜在标志性基因。

关键词： TPX2 糖酵解胰腺癌增殖

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p53转录调控靶基因 GGT6 对人结肠癌的影响

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基础医学与临床 2023年第6期43卷 953-959页

作者：柳子朝杜文静李莉中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院细胞生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005 山西医科大学基础医学院细胞生理学教育部重点实验室山西太原030606

目的筛选出p53转录调控靶基因,并利用生物信息学分析该基因在结肠癌(COAD)中的作用。方法对p53蛋白稳定剂Nutlin处理的结肠癌细胞系HCT116的RNA-seq数据进行基因差异分析及GO、KEGG和GSEA富集分析;在HCT116及HCT8细胞中加入Nutlin稳定... 详细信息

目的筛选出p53转录调控靶基因,并利用生物信息学分析该基因在结肠癌(COAD)中的作用。方法对p53蛋白稳定剂Nutlin处理的结肠癌细胞系HCT116的RNA-seq数据进行基因差异分析及GO、KEGG和GSEA富集分析;在HCT116及HCT8细胞中加入Nutlin稳定或转染siRNA敲降p53的表达,利用实时荧光定量PCR检测候选靶基因的mRNA表达;双荧光素酶报告实验验证p53对靶基因的转录调控;利用TCGA数据库中的结肠癌数据分析靶基因在结肠癌组织中的表达及患者预后情况。结果Nutlin处理结肠癌细胞系HCT116后细胞周期、DNA复制及染色体分离等生物过程基因表达发生变化,同样p53信号通路也被激活。在HCT116及HCT8细胞中γ-谷氨酰转移酶(GGT6)的mRNA水平与p53蛋白表达呈正相关。双荧光素酶报告实验确定了GGT6是p53转录调控的靶基因。TCGA-COAD数据分析表明GGT6在结肠癌组织中表达高于癌旁组织(P<0.001),且GGT6高表达患者的总体生存时间较GGT6低表达患者更长(P<0.01),推测GGT6是结肠癌的抑癌因素。结论GGT6是一个p53正调控转录靶基因,在结肠癌中可能是一个抑癌因素。

关键词： p53 转录调控 γ-谷氨酰转移酶结肠癌

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骨骼肌的再生

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中国细胞生物学学报 2019年第9期41卷 1690-1702页

作者：傅鑫李虎杨雯隽韩婉虹张勇胡苹中国科学院分子细胞卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所细胞生物学国家重点实验室上海200031 中国科学院干细胞与再生创新研究院北京100101 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

骨骼肌是体内最大的器官,对呼吸、代谢、体温保持、运动等基本生命活动有重要的调控作用。运动、疾病、创伤以及其他因素会导致骨骼肌的损伤,骨骼肌能够通过再生对于这些损伤进行程度不同的修复。骨骼肌再生主要通过骨骼肌干细胞进行。... 详细信息

骨骼肌是体内最大的器官,对呼吸、代谢、体温保持、运动等基本生命活动有重要的调控作用。运动、疾病、创伤以及其他因素会导致骨骼肌的损伤,骨骼肌能够通过再生对于这些损伤进行程度不同的修复。骨骼肌再生主要通过骨骼肌干细胞进行。骨骼肌再生涉及到多种细胞类型的协同作用,受到复杂、精细的调控,以保证再生过程的有序进行。该文对骨骼肌再生的最新进展进行简略综述。

关键词：骨骼肌骨骼肌损伤骨骼肌再生骨骼肌干细胞骨骼肌再生调控

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肺动脉高压iPSC-ECs的内皮间质转化和成管缺陷机制

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基础医学与临床 2018年第5期38卷 604-609页

作者：赵双周芳杨隽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院细胞生物系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用遗传性肺动脉高压(HPAH)患者和对照志愿者(CON)来源的诱导多能干细胞,研究其定向分化得到的内皮细胞(i PSC-ECs)表型及功能的差异,阐明骨形成蛋白Ⅱ型受体(BMPRII)突变引起的PAH特征性内皮紊乱病理机制。方法将CON志愿者和HPAH... 详细信息

目的利用遗传性肺动脉高压(HPAH)患者和对照志愿者(CON)来源的诱导多能干细胞,研究其定向分化得到的内皮细胞(i PSC-ECs)表型及功能的差异,阐明骨形成蛋白Ⅱ型受体(BMPRII)突变引起的PAH特征性内皮紊乱病理机制。方法将CON志愿者和HPAH患者的肺动脉平滑肌细胞诱导得到的i PSCs分化为ECs,通过荧光定量PCR分析i PSC-ECs分化过程中多能性和内皮相关基因的mRNA表达水平;免疫荧光鉴定i PSC-ECs表面特征分子;检测参与调控内皮-间充质转分化(Endo MT)过程的相关基因α-SMA、HMGA1、Slug和Snail1表达;比较HPAH和CON来源i PSCECs成管功能,检测血管内皮细胞生长因子受体2(VEGFR2)的mRNA和蛋白表达。结果 HPAH与CON多能性基因表达趋势基本一致,而ECs相关基因的表达变化存在差异;HPAH患者来源的i PSC-ECs的α-SMA和Endo MT过程的相关基因HMGA1、Slug和Snail1表达均高于CON ECs(P<0.05);与CON相比,HPAH患者来源的i PSC-ECs成管功能存在缺陷,VEGFR2的mRNA和蛋白水平均较低,VEGF165可使其得到恢复。结论 HPAH来源的i PSC-ECs存在Endo MT现象和成管功能缺陷,HMGA1、Snail家族转录因子和VEGF通路可能参与对PAH血管重构的调控。

关键词：肺动脉高压内皮细胞内皮间质转化血管内皮细胞生长因子受体2

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两种台式高通量测序平台应用于癫痫患者基因突变检测的对比研究

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国际遗传学杂志 2018年第1期41卷 1-6页

作者：司锘王蓉蓉张俐俐李小玲汪涵卢超霞柳青张学中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室麦库西克-张孝骞协和遗传医学中心中国医科大学细胞生物学系中国医学科学院北京协和医院神经科

目的应用Illumina MiSeq和Ion Torrent PGM两种台式高通量测序平台,使用同样的序列捕获系统,结合两个平合各自配备的标准化试剂及软硬件设备,对癫痫患者进行突变检测,对比两个平台在使用成本、操作难易度、突变检测效果等方面的表现,从... 详细信息

目的应用Illumina MiSeq和Ion Torrent PGM两种台式高通量测序平台,使用同样的序列捕获系统,结合两个平合各自配备的标准化试剂及软硬件设备,对癫痫患者进行突变检测,对比两个平台在使用成本、操作难易度、突变检测效果等方面的表现,从而针对癫痫多基因诊断panel优化检测流程、指导测序平台选择。方法获取患者知情同意后采集30名癫痫患者外周血,提取基因组DNA。其中8名患者DNA采用Ion Xpress;Plus gDNA Fragment Library Preparation,另22名患者基因组DNA采用Dlumina TruSeq DNA LT sample prep kit进行文库制备,之后使用NimbleGen定制序列捕获系统对428个目的基因的编码区进行富集。构建完成的文库分别采用Ion Torrent PGM和Illumina MiSeq测序平台测序。Ion Torrent PGM平台产出数据用Ion Torrent Suite3. 2软件进行序列比对及SNPs和Indels提取,Illumina MiSeq平台产出数据用BWA-MEM和Samtools软件进行序列比对和变异提取。结果 Illumina MiSeq平台测序每次运行最多可完成12个样品的测序,总数据量超过5Gb,平均测序深度达137×,靶区域覆盖度为96.4%,平均每个样本提取2056±9. 042个变异,从样本制备到数据产出周期约6天。Ion Torrent PGM平台一张318 v2芯片可得到1. 4 Gb数据量,8个样本平均测序深度达70×,靶区域覆盖度为96. 1%,平均每个样本提取3028±678. 9个变异,从样品制备到数据产出周期约6天。PGM平台使用成本低于MiSeq,而MiSeq平台操作易用性及测序质量优于PGM平台。结论靶序列捕获结合下一代测序技术可以实现对癫痫致病基因的批量快速检测,两种台式高通量测序仪均可满足检测需求,Ion Torrent PGM平台应用灵活、成本经济。Iliumina MiSeq平台单次运行产出数据大,数据准确性高,适用于大批量样品检测。

关键词：台式高通量测序平台 MiSeq测序仪 PGM测序仪

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人结直肠癌细胞Drosha基因敲除细胞模型的构建

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医学研究杂志 2014年第6期43卷 21-24页

作者：李芸侨李尚泽宋伟王任先张晓东王琳芳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室100005 武汉大学生命科学学院细胞与发育生物学系 430072

目的为研究核酸酶Drosha与结直肠癌的关系,利用腺相关病毒(AAV)介导的染色体同源重组技术,构建Drosha基因敲除的HCT116结直肠癌细胞模型。方法设计引物通过PCR扩增Drosha基因的同源臂,构建Drosha的AAV病毒打靶载体,通过病毒的包装、感... 详细信息

目的为研究核酸酶Drosha与结直肠癌的关系,利用腺相关病毒(AAV)介导的染色体同源重组技术,构建Drosha基因敲除的HCT116结直肠癌细胞模型。方法设计引物通过PCR扩增Drosha基因的同源臂,构建Drosha的AAV病毒打靶载体,通过病毒的包装、感染、抗生素新霉素(G418)药物筛选、PCR以及Western blot鉴定获得基因敲除阳性细胞株,通过Cre病毒感染去除抗性基因,最终建立敲除Drosha基因的结直肠癌细胞模型。结果经过两轮打靶,分别将DNA双链上的Drosha基因去除并经Western blot鉴定,获得Drosha-/-阳性的HCT116细胞株。结论通过AAV病毒介导的染色体同源重组技术,成功构建Drosha基因敲除的HCT116细胞系。

关键词：基因敲除同源重组结直肠癌

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非洲爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白C'末端SBP-3×Flag标记的HCT 116结直肠癌细胞模型的建立

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中国医学科学院学报 2011年第6期33卷 624-628页

作者：黄泽彬张泽延张晓东缪时英王琳芳杜润蕾中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京100005 武汉大学生命科学学院细胞与发育生物学系武汉430072

目的建立非洲爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白(TPX2)C'末端SBP-3×Flag标记的HCT116结直肠癌细胞模型。方法 PCR扩增同源臂,构建TPX2的腺相关病毒打靶载体,包装病毒后打靶HCT116结直肠癌细胞,G418和PCR筛选获得含有新霉素抗性基因的... 详细信息

目的建立非洲爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白(TPX2)C'末端SBP-3×Flag标记的HCT116结直肠癌细胞模型。方法 PCR扩增同源臂,构建TPX2的腺相关病毒打靶载体,包装病毒后打靶HCT116结直肠癌细胞,G418和PCR筛选获得含有新霉素抗性基因的阳性细胞株,最后通过Cre病毒感染去除抗性基因,并用PCR方法筛选获得TPX2C末端SBP和3×Flag内源性双标签的HCT116结直肠癌细胞株。结果筛选获得2个含有新霉素抗性基因的细胞株,随后经Cre病毒感染得到去除新霉素抗性基因的阳性细胞克隆,并经Western blot检测验证了SBP-3×Flag基因的敲入。结论成功建立了TPX2 C'末端SBP-3×Flag标记的HCT116结直肠癌细胞模型。

关键词：非洲爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白基因敲入同源重组 HCT116 结直肠癌

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一种宏观基因调控分子SATB1

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中国细胞生物学学报 2010年第1期32卷 31-36页

作者：王娟薛征董文吉中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院细胞生物学系北京100005 山东大学威海分校海洋学院威海264209 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

自身多聚化的SATB1(special AT-rich sequences binding protein 1)围绕异染色质形成笼状结构分布在细胞核中,SATB1不仅结合染色质DNA的核基质结合区(matrix attachment regions,MARs),也结合核基质,能够使DNA锚定在核基质并形成袢环状... 详细信息

自身多聚化的SATB1(special AT-rich sequences binding protein 1)围绕异染色质形成笼状结构分布在细胞核中,SATB1不仅结合染色质DNA的核基质结合区(matrix attachment regions,MARs),也结合核基质,能够使DNA锚定在核基质并形成袢环状结构(loop)。SATB1的磷酸化、乙酰化和小泛素化样修饰可调节其DNA结合能力和细胞核内亚结构的定位;SATB1与多种蛋白质相互作用,能够募集染色质重塑复合物和组蛋白修饰酶,实现对其靶基因表达的时空特异性调控。SATB1在调节细胞分化、细胞凋亡、肿瘤生长与转移和X染色体失活等方面起到重要作用,并有可能成为肿瘤转移的治疗靶点。

关键词： SATB1 核基质结合区翻译后修饰肿瘤转移

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