检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物医学工程学报 2021年第5期40卷 531-539页

作者：孙若凡张唯唯中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

自体肋软骨雕刻法是目前治疗先天性小儿畸形的临床标准疗法,而耳软骨组织工程和3D生物打印是有前景的治疗方案。可是,这些治疗方案的核心—(复合物)支架构造缺乏基于医学图像的耳软骨自动分割方法。基于3D U-Net提出改进的网络模型,能... 详细信息

自体肋软骨雕刻法是目前治疗先天性小儿畸形的临床标准疗法,而耳软骨组织工程和3D生物打印是有前景的治疗方案。可是,这些治疗方案的核心—(复合物)支架构造缺乏基于医学图像的耳软骨自动分割方法。基于3D U-Net提出改进的网络模型,能够实现MRI图像的人体耳软骨解剖结构的自动分割。该网络模型结合残差结构和多尺度融合等设计,在减少网络参数量的同时实现12个耳软骨解剖结构的精确分割。首先,使用超短回波时间(UTE)序列采集40名志愿者单侧外耳的MRI图像;然后,对所采集的图像进行预处理、耳软骨和多解剖结构手动标注;接下来,划分数据集训练改进的3D U-Net模型,其中32例数据作为训练集、4例为验证集、4例为测试集;最后,使用三维全连接条件随机场对网络输出结果进行后处理。模型经过10折交叉验证后,耳软骨12个解剖结构的自动分割结果的平均Dice相似度系数(DSC)和平均95%豪斯多夫距离(HD95)分别为0.818和1.917,相比于使用基础的3D U-Net模型,DSC指标分别提高6.0%,HD95指标降低了3.186,其中耳软骨关键结构耳轮和对耳轮的DSC指标达到了0.907和0.901。实验结果表明,所提出的深度学习方法与专家手动标注两者之间的结果非常接近。在临床应用中,根据患者健侧UTE核磁图像,本研究提出的方法既可以为现有自体肋软骨雕刻法快速、自动生成三维个性化雕刻模板,也可以为组织工程或者3D生物打印技术构建耳软骨复合物支架提供高质量的可打印模型。

关键词：耳软骨超短回波时间 3D U-Net 自动分割

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模拟海拔5000m低氧环境对小鼠肠道免疫和肠道菌群的影响

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现代生物医学进展 2022年第8期22卷 1401-1407页

作者：秦鹏蕊王迦南刘诗颖王茜柴佳敏宋巧玥徐成丽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

目的:研究模拟海拔5000 m低压低氧环境下,不同低氧暴露时间对小鼠肠道组织结构、免疫因子和肠道菌群的影响。方法:采用低压低氧舱模拟海拔5000 m高度,构建8周龄雄性C57BL/6小鼠低氧模型,随机分为1、3、5、7、14和30 d低氧组及其常氧对照... 详细信息

目的:研究模拟海拔5000 m低压低氧环境下,不同低氧暴露时间对小鼠肠道组织结构、免疫因子和肠道菌群的影响。方法:采用低压低氧舱模拟海拔5000 m高度,构建8周龄雄性C57BL/6小鼠低氧模型,随机分为1、3、5、7、14和30 d低氧组及其常氧对照组,每组6只常规饲养,记录体重。在对应时间点取材,HE染色制作小鼠回肠组织切片、免疫组织化学染色分析小鼠肠道紧密连接occludin蛋白表达,ELISA检测小鼠血浆免疫因子IL-6、IL-22和TNF-α水平,16S r DNA测序分析肠道菌群变化。结果:与常氧对照组相比,各低氧组小鼠体重均显著降低(P<0.05)。小鼠回肠组织HE染色及免疫组化染色显示,各低氧组均出现不同程度的肠上皮绒毛缺损,淋巴细胞增多等变化,且7、14 d组低氧组小鼠紧密连接occludin蛋白表达量显著降低(P<0.05)。与常氧组相比,7 d低氧组小鼠血浆IL-6水平显著降低(P<0.05),14 d低氧组小鼠血浆IL-6水平显著增加(P<0.05);与相应的常氧组对比,低氧组TNF-α和IL-22的水平没有显著差异,但在各低氧组间出现差异。不同低氧时间组与其常氧对照组的肠道菌群构成具有显著差异;在菌属水平上,低氧组中普雷沃菌属(Prevotella)、阿克曼氏菌属(Akkermansia)、颤螺菌属(Oscillospira)、拟杆菌属(Bacteroides)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)和臭气杆菌属(Odoribacter),相对丰度较高且具有显著性差异(P<0.05);血浆免疫因子与肠道菌群相关分析表明,乳酸杆菌属(Lactobacillus)与IL-6、IL-22水平呈显著正相关(r=0.27,P<0.05;r=0.27,P<0.05)。结论:模拟海拔5000 m低压低氧环境显著改变C57BL/6小鼠肠道组织结构及其屏障功能和肠道菌群组成,肠道菌群的变化与免疫因子水平显著相关,这些变化与低氧暴露时间相关,是小鼠低氧应激响应肠道功能的适应性变化。

关键词：低氧小鼠肠道菌群 Occludin IL-6

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2022国际肺动脉高压新指南带来的诊疗策略优化

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中华结核和呼吸杂志 2023年第5期46卷 537-542页

作者：马双双孙璐刘吉祥张云霞万钧谢万木杨沛然季颖群翟振国北京中医药大学、中日友好医院呼吸与危重症医学科、中日友好医院呼吸中心、中国医学科学院呼吸病学研究院、国家呼吸疾病临床研究中心北京100029 中国医学科学院、北京协和医学院、中日友好医院呼吸与危重症医学科、中日友好医院呼吸中心中国医学科学院呼吸病学研究院、国家呼吸疾病临床研究中心北京100029 中日友好医院呼吸与危重症医学科、中日友好医院呼吸中心、中国医学科学院呼吸病学研究院、国家呼吸疾病临床研究中心北京100029 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生理学系北京100005 首都医科大学附属北京安贞医院呼吸与危重症医学科北京100011 上海市东方医院同济大学附属东方医院呼吸与危重症医学科上海200120

2022年8月底,欧洲呼吸杂志(ERJ)和欧洲心脏杂志(EHJ)同期在线发表了最新版《2022年ESC/ERS肺动脉高压诊断和治疗指南》。该指南从肺动脉高压(PH)的定义、诊断、不同类型PH的诊疗及肺动脉高压中心等方面进行了系统阐述,提出了可供临床专... 详细信息

2022年8月底,欧洲呼吸杂志(ERJ)和欧洲心脏杂志(EHJ)同期在线发表了最新版《2022年ESC/ERS肺动脉高压诊断和治疗指南》。该指南从肺动脉高压(PH)的定义、诊断、不同类型PH的诊疗及肺动脉高压中心等方面进行了系统阐述,提出了可供临床专家使用的推荐意见,体现了当前学术界对PH的认知。本文就该指南的更新要点进行解读,并提出我国PH中心的建设需要结合国际指南与国内的诊疗现状进一步探索,以期使PH患者得到更好的临床照护,为临床诊疗提供最新的研究内容。

关键词：国际指南肺动脉高压诊疗策略诊疗现状推荐意见临床诊疗临床专家心脏杂志

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右侧肢体偏瘫伴失语,左腰部疼痛——迷惑性极强的血管型Ehlers-Danlos综合征

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罕见病研究 2024年第2期3卷 224-231页

作者：付怡凝周敬敏李峰黄尚志王怡宁洪霞吕珂刘雅萍冷泠郑文洁邱正庆朱以诚郑月宏陈跃鑫中国医学科学院北京协和医院血管外科北京100730 中国医学科学院北京协和医院泌尿外科北京100730 中国医学科学院北京协和医院皮肤科北京100730 中国医学科学院北京协和医院放射科北京100730 中国医学科学院北京协和医院心理医学科北京100730 中国医学科学院北京协和医院超声医学科北京100730 中国医学科学院北京协和医院临床医学研究所北京100730 中国医学科学院北京协和医院风湿免疫科北京100730 中国医学科学院北京协和医院儿科北京100730 中国医学科学院北京协和医院神经科北京100730 中国医学科学院基础医学研究所北京100005

作为一种罕见的遗传性结缔组织疾病,Ehlers-Danlos综合征(EDS)在人群中发病率为(0.1~1)/万。而作为EDS中预后最差的一类分型,血管型EDS(vEDS)的发病率在全部EDS分型中极低。本文报道一例vEDS患者,表现为一过性右侧肢体偏瘫伴失语,左腰... 详细信息

作为一种罕见的遗传性结缔组织疾病,Ehlers-Danlos综合征(EDS)在人群中发病率为(0.1~1)/万。而作为EDS中预后最差的一类分型,血管型EDS(vEDS)的发病率在全部EDS分型中极低。本文报道一例vEDS患者,表现为一过性右侧肢体偏瘫伴失语,左腰部疼痛。通过基因检测最终诊断为vEDS,通过多学科会诊共同决策,为该患者制订后续的治疗方案。EDS分型复杂,表现多样,极易误诊,在此报告诊疗经验。

关键词：罕见病系统性血管炎血管型Ehlers-Danlos综合征多学科讨论

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通过盆底测试仪压力气囊评估盆底肌力的有效性研究

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生殖医学杂志 2023年第6期32卷 866-874页

作者：付琳茹郭涛孙智晶张晨昱王秀琪徐涛中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院妇产科国家妇产疾病临床医学研究中心北京100730 中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005

目的探讨应用盆底测试仪压力气囊测试最大阴道收缩压(MVCP)与手测肌力检查评估盆底肌力的相关性和一致性。方法前瞻性选取于2018年6月至2019年7月在北京协和医院体检、因盆底功能障碍性疾病(PFD)就诊及产后1年内随访的女性,分别为非PFD... 详细信息

目的探讨应用盆底测试仪压力气囊测试最大阴道收缩压(MVCP)与手测肌力检查评估盆底肌力的相关性和一致性。方法前瞻性选取于2018年6月至2019年7月在北京协和医院体检、因盆底功能障碍性疾病(PFD)就诊及产后1年内随访的女性,分别为非PFD组、PFD组及产后组。由同一名医生对受试者进行手测肌力检查,包括改良牛津肌力分级(MOS)和肛提肌检测分级(LAT);再依据随机数字表对受试者进行随机互盲分组,由两名盆底治疗师作为检查者,以交叉顺序使用盆底测试仪的压力气囊进行MVCP评估,每名检查者对同一受试者进行两次评估。采用Spearman秩相关系数(r)进行相关性评价,采用组内相关系数(ICC)、Bland-Altman分析进行一致性评价。结果非PFD组163例、PFD组154例和产后组151例受试者完成所有评估。在全部受试者中,盆底测试仪记录的MVCP与MOS和LAT之间相关性强(r=0.779~0.814,P<0.001),MVCP结果在同一检查者内存在高度一致性[分别为ICC=0.815,95%CI(0.782,0.843)和ICC=0.818,95%CI(0.785,0.846)],在不同检查者间也存在高度一致性[ICC=0.719,95%CI(0.663,0.765)]。MVCP的Bland-Altman分析显示,其95%一致性界限区间较窄,且落在95%一致性界限外的点比例在0.025~0.071之间,属可接受范围。在非PFD组、PFD组及产后组的亚组分析中,MVCP与MOS和LAT也存在强相关性(r=0.749~0.867,P<0.001),检查者内和检查者间一致性均较好。结论盆底测试仪通过压力气囊测试的MVCP与医生手测MOS和LAT相关性强,MVCP在同一检查者和不同检查者间均存在高度一致性。本研究结果表明盆底测试仪压力气囊在评估盆底肌力方面有效性好,具有较好的应用前景。

关键词：最大阴道收缩压盆底肌力评估改良牛津肌力分级肛提肌检测分级

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1株西藏来源链霉菌10-37的次级代谢产物研究

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中国抗生素杂志 2024年第11期49卷 1289-1296页

作者：王嘉涵常珊珊陈铭旭何宁王梦源解云英袁丽杰华北理工大学基础医学院河北省慢性疾病基础医学重点实验室唐山市慢性病临床基础研究重点实验室唐山063210 中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所药物合成生物学重点实验室北京100050

目的对1株西藏来源链霉菌10-37的次级代谢产物进行研究。方法在分子网络指导下,利用HW40 C凝胶柱、Flash快速液相分离制备色谱仪、半制备型高效液相色谱等方法对化合物进行分离纯化,运用核磁共振、高分辨液质联用技术对单体化合物进行... 详细信息

目的对1株西藏来源链霉菌10-37的次级代谢产物进行研究。方法在分子网络指导下,利用HW40 C凝胶柱、Flash快速液相分离制备色谱仪、半制备型高效液相色谱等方法对化合物进行分离纯化,运用核磁共振、高分辨液质联用技术对单体化合物进行结构鉴定,最后利用微量肉汤稀释法进行抗菌活性测定。结果从链霉菌10-37的菌丝体提取物中分离得到了4个代谢产物,包括2个新化合物oxazolomycin A3(1)和A4(2),以及2个已知化合物oxazolomycin A2(3)和oxazolomycin B(4)。其中化合物1和2为化合物3的一对几何异构体,它们三烯部分的构型分别为(4’E,6'E,8'E)(1)、(4’Z,6'E,8'E)(2)、(4’Z,6'Z,8'E)(3)、(4’E,6'E,8'E)(4)。结论西藏特境的地理优势结合分子网络分析的策略,可以更高效地挖掘新结构次级代谢产物。

关键词：链霉菌次级代谢产物结构鉴定分子网络

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定量方法比较研究的样本量考虑

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临床检验杂志 2023年第5期41卷 380-384页

作者：陈飞龙徐涛中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005

目的构建并验证基于最小二乘回归法的样本量计算公式用于评估定量方法的一致性,并用Bland-Altman法样本量公式比较其差异性。方法利用最小二乘回归法和统计推断的基本原理,推导出基于该方法的样本量公式。另选取1个实例验证本公式的准确... 详细信息

目的构建并验证基于最小二乘回归法的样本量计算公式用于评估定量方法的一致性,并用Bland-Altman法样本量公式比较其差异性。方法利用最小二乘回归法和统计推断的基本原理,推导出基于该方法的样本量公式。另选取1个实例验证本公式的准确性,并将本公式计算结果与Bland-Altman法样本量进行比较。结果通过公式推导得到基于最小二乘回归的定量指标一致性评价的样本量计算公式:n_(1)=[(Z_(1-α/2)+Z_(1-β/2))·σ_(ε)/(b_(0)+Δ_(0))·S_(x)]^(2)·(S_(x)^(2)+x^(2))+1,n_(2)=[(Z_(1-α/2)+Z_(1-β/2))·σ_(ε)/(|b_(1)-1|+Δ_(1))·S_(x)]^(2)+1。根据小样本预试验得到参数,本公式计算所得样本量与Bland-Altman法样本量公式并不完全相同,但在后续验证试验中,在满足样本量条件下两方法均得到一致性结论,进一步验证了推导公式的正确性。结论本研究构建的公式补充了国内外研究的空白,为定量数据一致性评估中使用最小二乘回归法提供了方法学支持。

关键词：最小二乘回归一致性评价样本量公式定量指标

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文献案例汇报和讨论在专业型硕士生临床流行病学教学中的应用

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基础医学与临床 2023年第9期43卷 1481-1485页

作者：韩慧君廖巍王丽中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院、流行病与卫生统计学系北京100005

目的为了增强临床医学专业型硕士生的科研能力,在临床流行病学教学中尝试文献案例汇报与讨论的新教学模式并对其教学效果进行评价。方法选取北京协和医学院2019~2021年各学年选修临床流行病学课程的临床医学专业型硕士生(128名)为研究... 详细信息

目的为了增强临床医学专业型硕士生的科研能力,在临床流行病学教学中尝试文献案例汇报与讨论的新教学模式并对其教学效果进行评价。方法选取北京协和医学院2019~2021年各学年选修临床流行病学课程的临床医学专业型硕士生(128名)为研究对象。2019年全部采用专题讲授式教学,2020年和2021年针对“队列研究”专题增设了文献案例汇报和讨论课。2021年选课学生就新教学模式提供了问卷反馈。结果2020年学生期末考试全部题目的题均得分率高于2019年(中位值分别为84.7%vs 75.4%,P<0.001);两学年学生的队列研究题目的题均得分率差异无统计学意义。2020年学生的队列研究案例讨论课得分率与期末考试队列研究题目的题均得分率、全部题目的题均得分率均呈正相关(r=0.40,P<0.01;r=0.31,P<0.05)。2021年学生中,80%自评达到了案例讨论课的知识学习目标,90%认为文献案例汇报与讨论式教学有助于提升临床研究设计能力、文献阅读能力、学术汇报交流能力及团队协作能力,全部学生对案例讨论课表示满意。结论在临床流行病学教学中开展文献案例汇报和讨论式教学,有助于学生更好地掌握临床研究方法学并提升综合科研能力,值得推广。

关键词：流行病学教学方法临床医学专业学位硕士研究生案例教学科研能力

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黄连生物碱改善小鼠原代肝细胞糖异生与脂质蓄积

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基础医学与临床 2023年第6期43卷 923-930页

作者：颜家琦王思齐王峥李隽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的筛选能改善小鼠原代肝细胞糖异生与脂质蓄积的黄连生物碱单体并探讨其作用机制。方法分离小鼠原代肝细胞,使用不同剂量黄连总生物碱或单体成分处理,CCK-8法检测细胞存活率。使用丙酮酸钠、乳酸钠与胰高血糖素诱导小鼠原代肝细胞糖... 详细信息

目的筛选能改善小鼠原代肝细胞糖异生与脂质蓄积的黄连生物碱单体并探讨其作用机制。方法分离小鼠原代肝细胞,使用不同剂量黄连总生物碱或单体成分处理,CCK-8法检测细胞存活率。使用丙酮酸钠、乳酸钠与胰高血糖素诱导小鼠原代肝细胞糖异生模型,应用试剂盒检测培养基中葡萄糖含量,RT-qPCR检测糖异生相关基因表达,蛋白印迹检测p-AKT水平。应用棕榈酸与油酸诱导脂质蓄积模型,油红O检测细胞内脂质含量,蛋白印迹检测FAS、PLIN1、PPARγ蛋白水平。结果低剂量(0.5、1、2μg/mL)的黄连总生物碱处理24 h后小鼠原代肝细胞存活率在80%以上。糖异生模型组葡萄糖含量与G6PC、PCX的mRNA水平较对照组升高(P<0.05),p-AKT蛋白水平较对照组降低(P<0.05);黄连总生物碱(1、2μg/mL)与小檗碱(2.5、5μmol/L)处理后葡萄糖含量与G6PC、PCX的mRNA水平较模型组降低(P<0.05),p-AKT蛋白水平较模型组升高(P<0.05)。脂质蓄积模型组油红O染色较对照组增加(P<0.01),FAS、PLIN1、PPARγ蛋白水平较对照组升高(P<0.01);黄连总生物碱(1、2μg/mL)、黄连碱(2.5、5μmol/L)与小檗碱(2.5、5μmol/L)组的油红O染色较模型组减少(P<0.05),FAS、PLIN1、PPARγ蛋白水平较模型组降低(P<0.05)。结论小檗碱通过上调p-AKT水平而降低小鼠原代肝细胞糖异生,黄连碱与小檗碱通过降低FAS、PLIN1、PPARγ的表达而减少小鼠原代肝细胞脂质蓄积。

关键词：黄连生物碱原代肝细胞糖异生脂质蓄积

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1号染色体长臂扩增削弱人胚胎干细胞神经分化潜能

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中华细胞与干细胞杂志（电子版） 2022年第3期12卷 129-137页

作者：李佳一张美丽黄粤中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

目的探讨1号染色体长臂(1q)的扩增对人胚胎干细胞(hESCs)神经分化的影响。方法通过对H9 hESCs克隆化培养的方法获得1q扩增的hESCs系。中期染色体计数的方法明确细胞内的染色体数目,核型分析鉴定染色体变异的情况,全基因组测序(WGS)分析... 详细信息

目的探讨1号染色体长臂(1q)的扩增对人胚胎干细胞(hESCs)神经分化的影响。方法通过对H9 hESCs克隆化培养的方法获得1q扩增的hESCs系。中期染色体计数的方法明确细胞内的染色体数目,核型分析鉴定染色体变异的情况,全基因组测序(WGS)分析基因组片段拷贝数变异的情况。使用碱性磷酸酶(AP)染色法检测细胞干性维持的情况,RT-qPCR和免疫荧光染色等方法检测胚胎干细胞(ESCs)标志物OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4等的表达。拟胚体(EB)形成实验进行hESCs不定向分化、全反式视黄酸(RA)诱导hESCs向外胚层分化、使用STEMdiff?SMADi Neural Induction Kit诱导hESCs向神经祖细胞(NPCs)定向分化,并通过RT-qPCR、AP染色和免疫荧光染色等方法检测其分化能力。两组间比较采用独立样本t检验。结果分离获得一株1q发生2个拷贝扩增的细胞,核型分析发现额外获得的2个1q是等臂染色体,核型为[47,XX,+i(1q)],将其命名为Amp(1q)。Amp(1q)AP染色呈阳性,且表达ESCs标志物OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4,具备干细胞自我更新的特征。EB分化过程中,与H9细胞相比,Amp(1q)向外胚层的分化能力下降,MAP2(29.67±1.53比66.67±1.15)和PAX6(8001±567.09比28308.00±1692.50)的表达降低(P均<0.05);RA诱导分化实验进一步证明,与H9细胞相比,Amp(1q)存在向外胚层分化的缺陷,MAP2(22.50±3.54比42.50±2.12)和PAX6(5403.00±569.93比38756.00±1068.44)的表达降低(P均<0.05)。当定向诱导向神经谱系分化时,Amp(1q)形成NPCs的能力降低,NPCs标志物PAX6的表达水平低于H9细胞(13.83±3.75比88.33±1.53)(P均<0.05)。结论Amp(1q)具有ESCs自我更新的能力,但1q的扩增会削弱hESCs神经分化的能力。

关键词： 1号染色体长臂扩增人胚胎干细胞自我更新神经分化

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