检索结果-内蒙古大学图书馆

中国医学科学院学报 2021年第5期43卷 696-705页

作者：柳江枫杨晔宏武乐杨俊涛中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京100005 南开大学统计与数据科学学院天津300071

目的获取自然衰老C57BL/6J雄性小鼠肝脏的蛋白质组学与乙酰化修饰蛋白质组学特征。方法采用串联质谱标签标记定量与液相色谱-串联质谱联用技术,获取生理状况下2月龄与18月龄C57BL/6J雄性小鼠肝脏的蛋白质组学与乙酰化修饰蛋白质组学数据... 详细信息

目的获取自然衰老C57BL/6J雄性小鼠肝脏的蛋白质组学与乙酰化修饰蛋白质组学特征。方法采用串联质谱标签标记定量与液相色谱-串联质谱联用技术,获取生理状况下2月龄与18月龄C57BL/6J雄性小鼠肝脏的蛋白质组学与乙酰化修饰蛋白质组学数据,开展生物信息学分析。结果蛋白质组学共定量4712个蛋白质,其中,年轻、年老小鼠中有195个差异表达蛋白质;乙酰化修饰蛋白质组学共定量4818个位点,对应1367个蛋白质,其中,年轻、年老小鼠中有113个表达位点有差异,对应76个蛋白质。衰老相关的上调蛋白质主要与脂肪酸代谢、环氧合酶P450途径、药物分解代谢、有机羟基化合物代谢、花生四烯酸代谢等生物学过程相关,下调蛋白质主要与基因沉默、核小体组装、蛋白质异源四聚、干扰素反应、蛋白质-DNA复合物组装等生物学过程相关。伴随衰老上调的乙酰化修饰位点所在蛋白质主要与辅因子代谢、小分子分解代谢、磷酸核糖代谢、核糖核苷酸代谢、嘌呤代谢等生物学过程相关,含下调乙酰化位点的蛋白质主要与含硫化合物代谢、未折叠蛋白反应、氨基酸代谢等生物学过程相关。结论本研究客观展示了自然衰老C57BL/6J雄性小鼠肝脏的定量和乙酰化修饰蛋白质组学特征,为衰老相关机制探索和干预研究提供了可资参考的数据集。

关键词：衰老小鼠肝脏蛋白质组学乙酰化修饰

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Sirt6基因脑特异性敲除对老年小鼠大脑皮层的影响

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中华行为医学与脑科学杂志 2021年第6期30卷 481-488页

作者：王新寰侯琳阴彬刘伟彭小忠中国医学科学院基础医学研究所(北京协和医学院基础学院)医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系医学灵长类研究中心神经科学中心北京100005 中国医学科学院医学生物学研究所昆明650118

目的研究衰老基因沉默信息调节因子6(silent information regulator 6,Sirt6)敲除后对于老年小鼠大脑皮层的影响。方法构建Sirt6-flox转基因小鼠,利用Emx1-Cre工具鼠对小鼠脑组织进行特异性Sirt6基因敲除。根据基因分型,将11只野生型小... 详细信息

目的研究衰老基因沉默信息调节因子6(silent information regulator 6,Sirt6)敲除后对于老年小鼠大脑皮层的影响。方法构建Sirt6-flox转基因小鼠,利用Emx1-Cre工具鼠对小鼠脑组织进行特异性Sirt6基因敲除。根据基因分型,将11只野生型小鼠作为对照组(WT组),10只Sirt6基因敲除小鼠作为条件敲除组(cKO组)。对老年小鼠的体型和体质量进行测量,HE染色比较大脑皮层厚度;EdU标记分析大脑神经再生,Western blot检测衰老相关RNA结合蛋白HuR和凋亡相关蛋白Caspase-3的表达,同时检测皮层内组蛋白乙酰化水平。结果成功构建Sirt6脑组织特异性敲除小鼠,12月龄组实验中,与WT组小鼠脑组织面积[(2.07±0.22)cm^(2)]和皮层厚度[(970.56±80.91)μm]相比,Sirt6 cKO组脑组织面积[(1.61±0.14)cm^(2)]和皮层厚度[(822.88±53.94)μm]均偏小,均差异有统计学意义(均P<0.05);EdU掺入神经细胞实验显示,与WT组每100个室管膜区神经细胞中EdU掺入细胞数目[(10.29±1.93)个]相比,Sirt6 cKO组室管膜区神经细胞EdU掺入数目偏少[(4.75±1.48)个],且差异具有统计学意义(P<0.001);在17月龄组实验中,与WT组体型、体质量[(35.25±4.17)g]和脑组织面积[(1.98±0.18)cm^(2)]相比,Sirt6 cKO组小鼠体型偏小、体质量[(29.00±1.08)g]偏低且脑组织面积[(1.54±0.55)cm^(2)]偏小,差异具有统计学意义(均P<0.05)。这两个月龄段小鼠脑皮层蛋白中Caspase-3、HuR表达降低(t=2.95,5.38,均P<0.05),且H3K9ac、H3K56ac的表达增高(t=3.53,2.78,均P<0.05),但同源基因Sirt1表达无变化(t=1.26,P>0.05)。结论Sirt6的脑组织特异性缺失会导致老年小鼠大脑神经再生减少,衰老加剧,凋亡增加,这可能是导致其大脑皮层变薄,脑组织萎缩的原因,推测其分子机制与Sirt6敲除后乙酰化水平升高有关。

关键词：沉默信息调节因子6 条件性基因敲除组蛋白乙酰化神经再生衰老

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脉管瘤栓对ⅠA期肺腺癌患者术后无复发生存期的影响分析

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肿瘤学杂志 2023年第2期29卷 117-122页

作者：袁振龙曾慧张国超任静宇徐嘉溪黄宇菲任芳洲李仁达谭锋维薛奇国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院北京100021 中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院免疫学系医学分子生物学国家重点实验室北京100730

[目的]探讨脉管瘤栓对ⅠA期肺腺癌患者术后无复发生存期的影响。[方法]回顾性分析2014年1月至2017年6月中国医学科学院肿瘤医院收治的442例行手术治疗的ⅠA期肺腺癌患者的临床病理及随访资料。根据脉管瘤栓状态将患者分为两组,即无脉管... 详细信息

[目的]探讨脉管瘤栓对ⅠA期肺腺癌患者术后无复发生存期的影响。[方法]回顾性分析2014年1月至2017年6月中国医学科学院肿瘤医院收治的442例行手术治疗的ⅠA期肺腺癌患者的临床病理及随访资料。根据脉管瘤栓状态将患者分为两组,即无脉管瘤栓(367例)和有脉管瘤栓(75例)组;并根据UICC/AJCC第8版肺癌术后病理肿瘤大小T分期进行分层分析,其中pT_(1a)(pT≤1 cm,75例)、pT_(1b)(1 cm学意义,平均无复发生存期分别为(73.0±3.5)个月vs(91.3±0.9)个月(P<0.001)、(67.4±4.0)个月vs(91.5±1.2)个月(P=0.026)、(69.7±4.7)个月vs(85.3±2.1)个月(P=0.001)和(72.8±3.6)个月vs(91.0±1.0)个月(P<0.001)。[结论]对于ⅠA期肺腺癌患者,有脉管瘤栓患者复发率更高,无复发生存期更差。

关键词：肺腺癌 ⅠA期脉管瘤栓无复发生存期回顾性队列研究

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抗SARS-CoV-2相关线性表位抗体诱发小鼠神经炎性反应

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基础医学与临床 2023年第3期43卷 438-443页

作者：许津铭洪语萱韦晖许琪中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院、国家医学分子生物学重点实验室北京100005 北京市第一六六中学北京100006

目的评价已知的SARS-CoV-2刺突蛋白线性抗原表位相关非病毒中和抗体的潜在生物学功能。方法根据报道优选出COVID-19患者中响应频率最高、抗体存留时间最长的线性抗原表位S2-78为研究对象。用血蓝蛋白偶联的S2-78多肽(KLH-S2-78)免疫小鼠... 详细信息

目的评价已知的SARS-CoV-2刺突蛋白线性抗原表位相关非病毒中和抗体的潜在生物学功能。方法根据报道优选出COVID-19患者中响应频率最高、抗体存留时间最长的线性抗原表位S2-78为研究对象。用血蓝蛋白偶联的S2-78多肽(KLH-S2-78)免疫小鼠后,对其血清中的anti-S2-78 IgG抗体水平、小鼠行为学表型和大脑中小胶质细胞数量密度进行检测。结果KLH-S2-78免疫小鼠外周血中出现高滴度的anti-S2-78 IgG抗体(最高滴度为25600,A_(450)=0.3055),呈现为感觉运动门控缺陷、嗅觉功能受损和自发活动能力受损的精神病样行为学表型,大脑前额叶皮质和海马体中小胶质细胞数量密度显著增加(P<0.05),处于中枢炎性反应应激状态。结论Anti-S2-78 IgG抗体有可能通过激发机体的炎性反应导致大脑神经炎性损伤。

关键词： COVID-19 SARS-CoV-2 线性抗原表位非病毒中和抗体小胶质细胞激活

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非诺多泮抑制小鼠胸主动脉瘤的实验研究

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安徽医科大学学报 2024年第4期59卷 569-575页

作者：周莹武栗妃杜文静曹济民山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室太原030000 山西医科大学生理学系太原030000 山西医科大学病理生理学系太原030000 中国医学科学院基础医学研究所细胞生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100000

目的探讨多巴胺一型受体激动剂非诺多泮(FNDP)是否对小鼠胸主动脉瘤(TAA)具有保护作用。方法对3周龄的雄性C57BL/6J小鼠采用β-氨基丙腈(BAPN)复制TAA模型。25只小鼠分为三组:对照组、BAPN组、BAPN+FNDP组(腹腔注射FNDP)。统计TAA的发... 详细信息

目的探讨多巴胺一型受体激动剂非诺多泮(FNDP)是否对小鼠胸主动脉瘤(TAA)具有保护作用。方法对3周龄的雄性C57BL/6J小鼠采用β-氨基丙腈(BAPN)复制TAA模型。25只小鼠分为三组:对照组、BAPN组、BAPN+FNDP组(腹腔注射FNDP)。统计TAA的发生率和生存率,观察胸主动脉的大体变化,弹力蛋白(Elastin)染色观察形态学改变。免疫组化法检测基质金属酶2(MMP2)、基质金属酶9(MMP9)和白细胞分化抗原68(CD68)的变化。明胶酶谱法检测MMP2和MMP9的活性。反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测多巴胺受体1(D1DR)、多巴胺受体2(D2DR)、多巴胺受体3(D3DR)、多巴胺受体5(D5DR)、白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)及平滑肌蛋白22α(SM22α)的mRNA表达情况。结果与对照组相比,BAPN组有明显的TAA形成,胸主动脉壁弹力纤维紊乱与断裂,且D1DR和D5DR的mRNA水平均显著下降。与BAPN组相比,BAPN+FNDP组小鼠TAA的形成率和动脉瘤破裂率明显降低;胸主动脉壁的弹力纤维紊乱与断裂明显改善;胸主动脉壁内MMP2和MMP9的表达水平均显著下降,血清中MMP2的酶活性显著降低;胸主动脉壁中巨噬细胞浸润显著降低,且IL-1β、IL-6、TNF-α和MCP-1的mRNA水平均显著下降;α-SMA和SM22αmRNA表达水平无显著差异。结论FNDP可抑制小鼠TAA的进展,有可能成为治疗TAA的一个潜在药物。

关键词：胸主动脉瘤多巴胺受体非诺多泮巨噬细胞炎症基质降解

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多组学分析发现LAMC2是调节泛癌微环境的关键因子

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基础医学与临床 2022年第4期42卷 545-552页

作者：苏路瑛黄容邹定峰许富李凯卢艳缪时英王琳芳宋伟中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用多种数据库对多黏连细胞外基质蛋白LAMC2进行了系统分析,多组学数据证明LAMC2是影响患者肿瘤发生和临床预后的关键分子。方法利用数据库分析了各种肿瘤及正常组织中LAMC2的蛋白质和RNA的表达量。并且比较了不同肿瘤类型间的LAMC... 详细信息

目的利用多种数据库对多黏连细胞外基质蛋白LAMC2进行了系统分析,多组学数据证明LAMC2是影响患者肿瘤发生和临床预后的关键分子。方法利用数据库分析了各种肿瘤及正常组织中LAMC2的蛋白质和RNA的表达量。并且比较了不同肿瘤类型间的LAMC2表达量与肿瘤患者生存间的关系,并进行免疫浸润分析;比较了在不同肿瘤类型中LAMC2的表达量与肿瘤微环境免疫浸润的关系。结果通过对LAMC2进行泛癌分析,发现LAMC2的mRNA和蛋白表达在多种肿瘤中表达量高于癌旁组织,并在部分肿瘤中集中表达于恶性肿瘤细胞上。此外,还发现LAMC2的表达不利于泛癌的临床预后,并跟多种肿瘤免疫浸润相关。结论LAMC2是一种重要的致癌基因,可能是有效治疗肿瘤的重要靶点。该结果为后续的分子靶向治疗提供理论依据。

关键词： LAMC2 泛癌分析预后分析

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SIRT5通过调控ALDH5A1的琥珀酰化促进人乳腺癌细胞的增殖

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基础医学与临床 2022年第7期42卷 1099-1107页

作者：康有力赵丹杜文静李莉中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1(ALDH5A1)调控乳腺癌增殖的机制。方法使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因... 详细信息

目的利用多种数据库分析SIRT5在泛癌中的表达及与预后的关系并探究SIRT5通过醛脱氢酶5家族成员A1(ALDH5A1)调控乳腺癌增殖的机制。方法使用cBioPortal、TNMplot、GEPIA与The Kaplan-Meier Plotter等数据库分析SIRT5在多种肿瘤中的基因改变、差异表达及与预后的相关性。利用质谱分析与SIRT5相互作用的蛋白质。使用Metascape对相互作用蛋白质组进行通路富集,并与酰化组学结果进行共分析。通过内外源免疫沉淀(IP)确定SIRT5与ALDH5A1间的相互作用。过表达或敲降SIRT5检测ALDH5A1的酰化水平与酶活改变。通过细胞增殖与克隆实验确定SIRT5与ALDH5A1对乳腺癌增殖的影响。结果SIRT5在乳腺癌等多种肿瘤中高表达并与不良预后成正相关(P<0.05)。SIRT5相互作用蛋白与酰化组学结果存在多个重叠,并主要富集到氨基酸代谢等代谢通路上。SIRT5与ALDH5A1存在相互作用。SIRT5可通过促进ALDH5A1的去琥珀酰化从而提高其酶活,进而促进乳腺癌细胞增殖(P<0.05)。结论SIRT5在肿瘤中的功能可能具有异质性,在乳腺癌中可通过ALDH5A1发挥促癌作用,为后续的临床靶向治疗提供理论基础。

关键词： SIRT5 ALDH5A1 乳腺癌增殖

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基于单细胞转录组测序分析描绘人类早期胚胎红细胞发育图谱

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基础医学与临床 2022年第5期42卷 776-781页

作者：陈仲扬马艳妮余佳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)在单细胞水平系统描绘人早期红系发育的细胞图谱及分子轨迹。方法通过对人妊娠第36天CS15后期的胚胎卵黄囊组织scRNA-seq数据进行主成分分析(PCA);聚类分析以及拟时序分析;观察标记基因在不同细胞... 详细信息

目的利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)在单细胞水平系统描绘人早期红系发育的细胞图谱及分子轨迹。方法通过对人妊娠第36天CS15后期的胚胎卵黄囊组织scRNA-seq数据进行主成分分析(PCA);聚类分析以及拟时序分析;观察标记基因在不同细胞群体中的表达情况;预测红系细胞发生时间和发育路径。结果在CS15的卵黄囊的不同细胞群体中,红细胞及其祖细胞、前体细胞等的标记基因存在差异性表达,不同细胞的发生时序不同,且卵黄囊内的红细胞存在一定的异质性。CS15的卵黄囊内存在类型丰富的细胞,可能包括血管内皮细胞、造血前体细胞、粒细胞、不同状态的红细胞以及单核细胞等。结论推测人早期红系发育路径大致为血管内皮细胞分化产生造血前体细胞,进一步分化成为红髓祖细胞,最终产生巨核细胞和红细胞。

关键词：单细胞转录组测序早期红系发育胚胎期卵黄囊

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非酒精性脂肪肝病模型小鼠的肝脏病理变化及肝细胞获取方法

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基础医学与临床 2022年第6期42卷 890-895页

作者：史冬雪原佳琪丁宝锋王小爽余佳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的检测非酒精性脂肪肝病(NAFLD)模型小鼠的肝脏病理变化,并探索一种获得大量高活性、高纯度的NAFLD小鼠原代肝细胞的实验方法。方法60只小鼠随机分为正常组(正常饲料,CD)和高脂组(高脂饲料,HFD),分饮食饲养20周。定期检测小鼠的体质量... 详细信息

目的检测非酒精性脂肪肝病(NAFLD)模型小鼠的肝脏病理变化,并探索一种获得大量高活性、高纯度的NAFLD小鼠原代肝细胞的实验方法。方法60只小鼠随机分为正常组(正常饲料,CD)和高脂组(高脂饲料,HFD),分饮食饲养20周。定期检测小鼠的体质量,苏木精-伊红(HE)染色和天狼猩红染色观察肝脏组织病理特点。高脂饮食15周时,原位灌注Ⅳ型胶原酶6~8 mL消化得到混合肝细胞,铺于40%的Percoll分离液上,进行密度梯度离心获得纯化的肝细胞,锥虫蓝染色确定细胞的活性,显微镜观察其形态。结果随着建模时间的延长,HFD组小鼠的体质量逐渐增加,且增幅显著高于CD组;HFD组小鼠肝脏脂肪变性程度增加,在第20周伴随出现了纤维化;建模15周时,每只NAFLD小鼠可获得5×10^(7)~7×10^(7)个肝细胞,细胞存活率≥85%,细胞纯度≥95%,细胞呈圆形或椭圆形,其边缘平滑,且聚团少;通过精准控制温度、降低胶原酶浓度、使用低速离心和低速密度梯度离心等优化条件后,获得的细胞数量和质量均有显著提高。结论成功构建了NAFLD小鼠模型,并揭示了不同疾病阶段肝脏的病理特点。探索了一种高效、稳定的获取NAFLD小鼠原代肝细胞的方法。所得肝细胞的数量和活性都符合大多数实验的要求。

关键词：非酒精性脂肪肝病小鼠模型病理学

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传统与光谱流式细胞仪对自发荧光样本检测的比较

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基础医学与临床 2023年第5期43卷 809-816页

作者：陈家欢李丹丹孙艳王艺蕾王铎孔杰刘晓玲中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005 中国医学科学院北京协和医学院、北京协和医院检验科北京100730 长治医学院山西长治046000

目的比较传统与光谱流式细胞仪检测自发荧光样本的性能。方法以annexin V(AV)/碘化丙啶(PI)染色检测细胞凋亡为模型,制备带有自发荧光的单细胞样本,分别用传统与光谱流式细胞仪采集同一样本荧光信号。结果自发荧光干扰异硫氰酸荧光素(FI... 详细信息

目的比较传统与光谱流式细胞仪检测自发荧光样本的性能。方法以annexin V(AV)/碘化丙啶(PI)染色检测细胞凋亡为模型,制备带有自发荧光的单细胞样本,分别用传统与光谱流式细胞仪采集同一样本荧光信号。结果自发荧光干扰异硫氰酸荧光素(FITC)通道荧光信号,传统流式细胞仪应避免使用FITC通道的荧光素;而光谱流式细胞仪可以清楚分辨FTIC通道的荧光素和自发荧光。同时优化了样本制备方法和annexin V/PI染色方案。结论光谱流式细胞仪对于自发荧光样本的检测在一定条件下具有相对优良的性能。

关键词：自发荧光流式细胞术光谱异硫氰酸荧光素(FITC)

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