检索结果-内蒙古大学图书馆

中国医学科学院学报 2022年第4期44卷 668-672页

作者：苏琳凡赵红梅肖毅中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院呼吸与危重症医学科北京100730 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

慢性阻塞性肺疾病(COPD)是呼吸科的常见病和多发病,环境因素和遗传因素共同参与发病。近年来,随着全基因组关联研究等新方法的应用,研究人员发现了大量与肺功能和COPD相关的基因变异,为COPD的发病机制和潜在治疗靶点提供了新视角。本文... 详细信息

慢性阻塞性肺疾病(COPD)是呼吸科的常见病和多发病,环境因素和遗传因素共同参与发病。近年来,随着全基因组关联研究等新方法的应用,研究人员发现了大量与肺功能和COPD相关的基因变异,为COPD的发病机制和潜在治疗靶点提供了新视角。本文就目前基因组学在COPD的研究现状及应用进展进行综述。

关键词：慢性阻塞性肺疾病全基因组关联研究易感基因

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非诺多泮抑制小鼠胸主动脉瘤的实验研究

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安徽医科大学学报 2024年第4期59卷 569-575页

作者：周莹武栗妃杜文静曹济民山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室太原030000 山西医科大学生理学系太原030000 山西医科大学病理生理学系太原030000 中国医学科学院基础医学研究所细胞生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100000

目的探讨多巴胺一型受体激动剂非诺多泮(FNDP)是否对小鼠胸主动脉瘤(TAA)具有保护作用。方法对3周龄的雄性C57BL/6J小鼠采用β-氨基丙腈(BAPN)复制TAA模型。25只小鼠分为三组:对照组、BAPN组、BAPN+FNDP组(腹腔注射FNDP)。统计TAA的发... 详细信息

目的探讨多巴胺一型受体激动剂非诺多泮(FNDP)是否对小鼠胸主动脉瘤(TAA)具有保护作用。方法对3周龄的雄性C57BL/6J小鼠采用β-氨基丙腈(BAPN)复制TAA模型。25只小鼠分为三组:对照组、BAPN组、BAPN+FNDP组(腹腔注射FNDP)。统计TAA的发生率和生存率,观察胸主动脉的大体变化,弹力蛋白(Elastin)染色观察形态学改变。免疫组化法检测基质金属酶2(MMP2)、基质金属酶9(MMP9)和白细胞分化抗原68(CD68)的变化。明胶酶谱法检测MMP2和MMP9的活性。反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测多巴胺受体1(D1DR)、多巴胺受体2(D2DR)、多巴胺受体3(D3DR)、多巴胺受体5(D5DR)、白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)及平滑肌蛋白22α(SM22α)的mRNA表达情况。结果与对照组相比,BAPN组有明显的TAA形成,胸主动脉壁弹力纤维紊乱与断裂,且D1DR和D5DR的mRNA水平均显著下降。与BAPN组相比,BAPN+FNDP组小鼠TAA的形成率和动脉瘤破裂率明显降低;胸主动脉壁的弹力纤维紊乱与断裂明显改善;胸主动脉壁内MMP2和MMP9的表达水平均显著下降,血清中MMP2的酶活性显著降低;胸主动脉壁中巨噬细胞浸润显著降低,且IL-1β、IL-6、TNF-α和MCP-1的mRNA水平均显著下降;α-SMA和SM22αmRNA表达水平无显著差异。结论FNDP可抑制小鼠TAA的进展,有可能成为治疗TAA的一个潜在药物。

关键词：胸主动脉瘤多巴胺受体非诺多泮巨噬细胞炎症基质降解

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转录因子Ikzf1促进小鼠胎肝来源红系细胞终末分化

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基础医学与临床 2023年第6期43卷 916-922页

作者：王佳鑫余东林杨希刘雪会吕湘中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的通过分析单细胞转录组数据,挖掘红系终末分化过程中潜在的转录因子Ikzf1,并探究其在终末红系分化中的功能。方法利用SCENIC方法对人和小鼠红系细胞的单细胞转录组数据进行转录因子预测,从bulk转录组数据获取所预测因子Ikzf1在红系... 详细信息

目的通过分析单细胞转录组数据,挖掘红系终末分化过程中潜在的转录因子Ikzf1,并探究其在终末红系分化中的功能。方法利用SCENIC方法对人和小鼠红系细胞的单细胞转录组数据进行转录因子预测,从bulk转录组数据获取所预测因子Ikzf1在红系终末分化过程中的表达情况并在小鼠胎肝红系分化体系中进行RT-qPCR验证。在小鼠胎肝来源的红系细胞中利用短发夹RNA(shRNA)干扰技术敲低Ikzf1,流式分选GFP阳性的成功转染细胞,RT-qPCR验证其敲低效率,流式细胞术分析Ikzf1敲低后对红系分化和脱核的影响。结果SCENIC预测Ikzf1是人与小鼠红系终末分化共同的转录因子,转录组及RT-qPCR分析显示其在终末分化较早期的原红和早幼红细胞阶段表达量较高。将小鼠胎肝来源红系细胞中Ikzf1基因的表达成功敲低,流式细胞术检测发现Ikzf1敲低导致红细胞分化阻滞在早幼红细胞时期,细胞脱核率显著降低(P<0.05)。结论转录因子Ikzf1在红系终末分化早期高表达并参与促进红系终末分化和脱核。

关键词： Ikzf1 红系终末分化红系脱核

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组胺刺激棕色和米色脂肪产热

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生理学报 2021年第5期73卷 821-827页

作者：冯月瑶张玉洁常永生天津医科大学基础医学院生理与病理生理学系中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院医学分子生物学国家重点实验室

3-肾上腺素受体激动剂能够刺激棕色脂肪适应性产热,并能促进白色脂肪米色化。然而到目前为止,有哪些代谢产物参与介导β3-肾上腺素受体激动剂促进脂肪产热作用尚不清楚。本研究通过给予8周龄C57/BL6J雄性小鼠腹腔注射β3-肾上腺素受体... 详细信息

3-肾上腺素受体激动剂能够刺激棕色脂肪适应性产热,并能促进白色脂肪米色化。然而到目前为止,有哪些代谢产物参与介导β3-肾上腺素受体激动剂促进脂肪产热作用尚不清楚。本研究通过给予8周龄C57/BL6J雄性小鼠腹腔注射β3-肾上腺素受体激动剂CL316,243,分离提取小鼠脂肪组织进行RNA-Seq检测,结果显示组胺合成限速酶组氨酸脱羧酶(histidine decarboxylase, HDC)在脂肪中被CL316,243强烈诱导,因此推测HDC的代谢产物组胺可能参与了脂肪组织的产热过程。通过给予正常饮食与高脂饮食C57BL/6J小鼠静脉注射组胺,以明确组胺促进脂肪产热的生理作用和机制。结果显示,组胺可刺激正常饮食小鼠棕色脂肪和皮下白色脂肪中产热基因的表达,包括过氧化物酶体增殖物激活受体γ-辅活化因子-1α(peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-1α, PGC-1α)和解耦联蛋白1 (uncoupling protein 1, UCP1)。HE染色表明,组胺处理降低了脂肪细胞中脂滴的大小。此外,组胺还可以促进高脂饮食诱导的肥胖小鼠脂肪产热,改善糖耐量和脂肪肝表型。最后,我们通过脂肪原代前体细胞实验验证了组胺促进产热是细胞的自主特性。本研究结果表明,组胺可能参与介导了β3-肾上腺素受体激动剂促进脂肪的产热。

关键词：组胺产热肥胖 UCP1 PGC-1α

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核转录因子NFYB和NFYC促进红系终末分化

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基础医学与临床 2022年第6期42卷 920-926页

作者：余东林杨希阴佳滢刘雪会吕湘中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的利用单细胞转录组数据分析挖掘红系终末分化的潜在转录因子,并重点对预测得到的核转录因子NFYB和NFYC在红系终末分化中的表达和功能进行探究。方法使用人骨髓红系终末分化单细胞转录组数据,结合SCENIC分析预测分化阶段特异性转录调... 详细信息

目的利用单细胞转录组数据分析挖掘红系终末分化的潜在转录因子,并重点对预测得到的核转录因子NFYB和NFYC在红系终末分化中的表达和功能进行探究。方法使用人骨髓红系终末分化单细胞转录组数据,结合SCENIC分析预测分化阶段特异性转录调控因子。利用公共测序数据集重点分析预测出的NFYB和NFYC在人与小鼠红系终末分化不同阶段中的表达;荧光激活细胞分选技术(FACS)分选小鼠胎肝体外红系终末分化各阶段的细胞,检测Nfyb和Nfyc的表达水平。在小鼠胎肝红系分化体系中使用慢病毒感染,分别敲低Nfyb和Nfyc,检测红系终末分化及脱核的变化。结果通过SCENIC分析预测出NFYB和NFYC是红系终末分化早期的调控因子,在人与小鼠的红系终末分化早期表达较高,晚期则降低。在小鼠胎肝体外红系分化体系中分别敲低Nfyb和Nfyc,均可显著抑制红系终末分化(P<0.05)及脱核(P<0.05)。结论NFYB和NFYC促进红系终末分化过程。

关键词： NFYB NFYC SCENIC 红系终末分化

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蛋白酪氨酸磷酸酶4A3(PTP4A3)促进小鼠胎肝来源红系细胞脱核

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基础医学与临床 2022年第7期42卷 1026-1030页

作者：胡欣俊余东林范宏韩改净薛征吕湘中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的探索在小鼠胎肝来源红系细胞中蛋白酪氨酸磷酸酶4A3(PTP4A3)在红系终末分化和脱核中的作用及分子机制。方法RT-qPCR检测Ptp4a3在终末分化过程中的表达情况。利用短发夹RNA(shRNA)干扰技术在小鼠胎肝诱导红系分化体系中敲低Ptp4a3的... 详细信息

目的探索在小鼠胎肝来源红系细胞中蛋白酪氨酸磷酸酶4A3(PTP4A3)在红系终末分化和脱核中的作用及分子机制。方法RT-qPCR检测Ptp4a3在终末分化过程中的表达情况。利用短发夹RNA(shRNA)干扰技术在小鼠胎肝诱导红系分化体系中敲低Ptp4a3的表达,流式细胞分选GFP阳性细胞后RT-qPCR验证其敲低效率,流式细胞测量术分析检测Ptp4a3敲低后对红系分化和脱核的影响。RNA表达谱测序并分析在红系细胞终末分化过程中Ptp4a3敲低影响的通路和基因。结果PTP4A3在红系细胞终末分化过程中表达水平逐渐升高。在小鼠胎肝来源红系细胞中成功敲低Ptp4a3的表达,流式细胞测量术检测发现敲低Ptp4a3可显著降低红系细胞脱核率(P<0.05)。表达谱分析发现敲低Ptp4a3影响红系终末分化过程中细胞周期相关基因表达。结论PTP4A3在红系细胞终末分化晚期高表达,并参与调控细胞脱核过程。

关键词：蛋白酪氨酸磷酸酶4A3 红系终末分化红系脱核细胞周期

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细胞终末分化过程中三维基因组结构与功能调控的分子机制

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遗传 2020年第1期42卷 32-44页

作者：杨科薛征吕湘中国医学科学院基础医学研究所病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室

真核细胞中的染色质DNA高度折叠形成复杂的三维结构,其空间组织方式对精准调控基因的表达和细胞发挥正常功能都起着重要的作用。细胞终末分化成熟过程中形态及基因表达谱常发生显著改变,同时伴随着明显的基因组三维结构变化。本文在简... 详细信息

真核细胞中的染色质DNA高度折叠形成复杂的三维结构,其空间组织方式对精准调控基因的表达和细胞发挥正常功能都起着重要的作用。细胞终末分化成熟过程中形态及基因表达谱常发生显著改变,同时伴随着明显的基因组三维结构变化。本文在简单介绍三维基因组多层次组织结构(染色质领域、A/B区室、拓扑相关结构域和成环构象等)基础上,重点综述了细胞终末分化过程中三维基因组结构变化与功能调控方面的研究进展,并探讨了当前三维基因组研究在解析细胞分化成熟过程时存在的问题和前景。

关键词：三维基因组 A/B区室拓扑相关结构域成环构象细胞终末分化

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6硝酸纤维膜和丙酮沉淀尿蛋白质保存方法的比较

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生物工程学报 2014年第6期30卷 982-989页

作者：王小蓉李逊斗贾露露高友鹤中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医科大学基础医学院生理与病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

硝酸纤维膜法是一种简单、快速、经济的尿液蛋白质保存方法,但其与传统尿液蛋白质丙酮沉淀方法的差异有待进一步研究.相同尿液分别经硝酸纤维膜法和丙酮沉淀法制备尿蛋白质,经液相串联质谱分析鉴定蛋白质,采用谱图数定量,研究两种不同... 详细信息

硝酸纤维膜法是一种简单、快速、经济的尿液蛋白质保存方法,但其与传统尿液蛋白质丙酮沉淀方法的差异有待进一步研究.相同尿液分别经硝酸纤维膜法和丙酮沉淀法制备尿蛋白质,经液相串联质谱分析鉴定蛋白质,采用谱图数定量,研究两种不同方法的差别.结果显示硝酸纤维膜法和丙酮沉淀法鉴定蛋白质数目几乎相同,鉴定蛋白质在谱图数的分布上几乎相同,鉴定蛋白质在蛋白质变异系数的分布上也几乎相同.因此,硝酸纤维膜法处理尿蛋白质与丙酮沉淀法基本一致,可以应用于大规模临床尿液样本的保存.

关键词：尿蛋白质保存硝酸纤维素膜蛋白质组学生物样本保存

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PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定

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基础医学与临床 2013年第6期33卷 694-698页

作者：赵阿妮朱丽媛吴朝刘雪梅阴彬张靖中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京100005 河北北方学院病理及病理生理学实验室河北张家口075000

目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进... 详细信息

目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱。结果筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式。结论使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘。找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs。

关键词： ESTs 生物信息学分析 long noncoding RNA 筛选鉴定表达谱分析

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尿液可能是比血液更好的生物标志物来源

尿液可能是比血液更好的生物标志物来源

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第八届全国医学生物化学与分子生物学第五届全国临床应用生物化学与分子生物学2013华东六省一市生物化学与分子生物学联合学术研讨会

作者：高友鹤中国医学科学院基础医学研究所生理与病理生理学系医学分子生物学国家重点实验室

虽然质谱仪的灵敏度和鉴定速度提高很快,生物标志物的研究没有像很多人预想的那样很快地取得很多成果。最近几十年来我们关注的标志物来源基本就是血液。百分之九十几的生物标志物文章都含有血,血浆或者血清。毕竟血液和所有的器官都联... 详细信息

虽然质谱仪的灵敏度和鉴定速度提高很快,生物标志物的研究没有像很多人预想的那样很快地取得很多成果。最近几十年来我们关注的标志物来源基本就是血液。百分之九十几的生物标志物文章都含有血,血浆或者血清。毕竟血液和所有的器官都联系的那么直接和紧密,获取也不是那么的困难和痛苦。但是有可能我们寻找标志物的地方不对吗?稳定的内环境是高等生物的生存优势,是生理学的基础。血液作为内环境的一个重要组成部分也倾向稳定。这个稳定不只是在酸碱盐等小分子无机物上,在蛋白质等大分子上也应该是一样的。外源蛋白和多肽在血中的半衰期很短,很少有成功的非抗体的蛋白类药物就是个旁证。抗体由于本身是血液的一个正常成分,药物抗体可能有更长的半衰期。尿液是血液经过肾脏而生成,尿液完全没有稳定的必要性和机制。不稳定的尿液不仅不会降低生物的生存优势,反而为此保障了血液的稳定,而提高了生存优势。生物标志物本质上就是一个变量。被引入到血液的变量,会被肝、肾、肺、皮肤等器官利用各种机制把血中的这个变量缩小,在血液中找标志物就是和血液玩捉迷藏。要在血液消除掉这个变量前,找到这个变量。而尿液本身就是很多变量的累积,有可能比血液更能体现这个最初引入到血液的变量。当然这也决定了影响尿液的因素会很多。除了研究人员所研究的那个疾病的标志物,还有很多可能的干扰因素。影响尿液的因素越多,在生物标志物验证的时候就越需要大量的样本。由于尿液取得完全无创的特点,技术上伦理上取得样本并不该是瓶颈。尿蛋白质组样品能吸附在膜上,干燥真空的保存,这使得样品的保存不仅简便而且经济,为像记录和保存病历一样,全面系统地保存病人的生物学样品提供了可能性。非常有利于提高后续标志物大规模验证的效率和产出标志物的质量。由于尿液和泌尿系统天然的直接关系,从尿液中寻找泌尿系统疾病的生物标志物可能是生物标志物领域最容易取得突破的地方。记录病历为分析病历提高医疗水平奠定了基础,曾经改变了上个世纪医学的面貌。全面大规模的保存尿液蛋白质组为深入解读病人的尿液信息提供了基础,现在的分析仪器和计算水平也正在快速提高。如果能有更多的研究人员更多的基金管理机构更多的生物技术公司和药企参加尿生物标志物的研究,也许会极大地加快医学的发展,更快地进入个体化,改变下一个世纪医学研究和医学实践的面貌,提高人类的健康水平。

关键词：生物标志物

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