检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物医学工程学报 2021年第5期40卷 531-539页

作者：孙若凡张唯唯中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

自体肋软骨雕刻法是目前治疗先天性小儿畸形的临床标准疗法,而耳软骨组织工程和3D生物打印是有前景的治疗方案。可是,这些治疗方案的核心—(复合物)支架构造缺乏基于医学图像的耳软骨自动分割方法。基于3D U-Net提出改进的网络模型,能... 详细信息

自体肋软骨雕刻法是目前治疗先天性小儿畸形的临床标准疗法,而耳软骨组织工程和3D生物打印是有前景的治疗方案。可是,这些治疗方案的核心—(复合物)支架构造缺乏基于医学图像的耳软骨自动分割方法。基于3D U-Net提出改进的网络模型,能够实现MRI图像的人体耳软骨解剖结构的自动分割。该网络模型结合残差结构和多尺度融合等设计,在减少网络参数量的同时实现12个耳软骨解剖结构的精确分割。首先,使用超短回波时间(UTE)序列采集40名志愿者单侧外耳的MRI图像;然后,对所采集的图像进行预处理、耳软骨和多解剖结构手动标注;接下来,划分数据集训练改进的3D U-Net模型,其中32例数据作为训练集、4例为验证集、4例为测试集;最后,使用三维全连接条件随机场对网络输出结果进行后处理。模型经过10折交叉验证后,耳软骨12个解剖结构的自动分割结果的平均Dice相似度系数(DSC)和平均95%豪斯多夫距离(HD95)分别为0.818和1.917,相比于使用基础的3D U-Net模型,DSC指标分别提高6.0%,HD95指标降低了3.186,其中耳软骨关键结构耳轮和对耳轮的DSC指标达到了0.907和0.901。实验结果表明,所提出的深度学习方法与专家手动标注两者之间的结果非常接近。在临床应用中,根据患者健侧UTE核磁图像,本研究提出的方法既可以为现有自体肋软骨雕刻法快速、自动生成三维个性化雕刻模板,也可以为组织工程或者3D生物打印技术构建耳软骨复合物支架提供高质量的可打印模型。

关键词：耳软骨超短回波时间 3D U-Net 自动分割

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模拟海拔5000m低氧环境对小鼠肠道免疫和肠道菌群的影响

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现代生物医学进展 2022年第8期22卷 1401-1407页

作者：秦鹏蕊王迦南刘诗颖王茜柴佳敏宋巧玥徐成丽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

目的:研究模拟海拔5000 m低压低氧环境下,不同低氧暴露时间对小鼠肠道组织结构、免疫因子和肠道菌群的影响。方法:采用低压低氧舱模拟海拔5000 m高度,构建8周龄雄性C57BL/6小鼠低氧模型,随机分为1、3、5、7、14和30 d低氧组及其常氧对照... 详细信息

目的:研究模拟海拔5000 m低压低氧环境下,不同低氧暴露时间对小鼠肠道组织结构、免疫因子和肠道菌群的影响。方法:采用低压低氧舱模拟海拔5000 m高度,构建8周龄雄性C57BL/6小鼠低氧模型,随机分为1、3、5、7、14和30 d低氧组及其常氧对照组,每组6只常规饲养,记录体重。在对应时间点取材,HE染色制作小鼠回肠组织切片、免疫组织化学染色分析小鼠肠道紧密连接occludin蛋白表达,ELISA检测小鼠血浆免疫因子IL-6、IL-22和TNF-α水平,16S r DNA测序分析肠道菌群变化。结果:与常氧对照组相比,各低氧组小鼠体重均显著降低(P<0.05)。小鼠回肠组织HE染色及免疫组化染色显示,各低氧组均出现不同程度的肠上皮绒毛缺损,淋巴细胞增多等变化,且7、14 d组低氧组小鼠紧密连接occludin蛋白表达量显著降低(P<0.05)。与常氧组相比,7 d低氧组小鼠血浆IL-6水平显著降低(P<0.05),14 d低氧组小鼠血浆IL-6水平显著增加(P<0.05);与相应的常氧组对比,低氧组TNF-α和IL-22的水平没有显著差异,但在各低氧组间出现差异。不同低氧时间组与其常氧对照组的肠道菌群构成具有显著差异;在菌属水平上,低氧组中普雷沃菌属(Prevotella)、阿克曼氏菌属(Akkermansia)、颤螺菌属(Oscillospira)、拟杆菌属(Bacteroides)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)和臭气杆菌属(Odoribacter),相对丰度较高且具有显著性差异(P<0.05);血浆免疫因子与肠道菌群相关分析表明,乳酸杆菌属(Lactobacillus)与IL-6、IL-22水平呈显著正相关(r=0.27,P<0.05;r=0.27,P<0.05)。结论:模拟海拔5000 m低压低氧环境显著改变C57BL/6小鼠肠道组织结构及其屏障功能和肠道菌群组成,肠道菌群的变化与免疫因子水平显著相关,这些变化与低氧暴露时间相关,是小鼠低氧应激响应肠道功能的适应性变化。

关键词：低氧小鼠肠道菌群 Occludin IL-6

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线粒体功能障碍在肌萎缩侧索硬化发病中作用的研究进展

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基础医学与临床 2023年第2期43卷 332-335页

作者：刘立洋柳青刘雅萍张学中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院医学遗传学系北京100005 中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院神经科北京100730 中国医学科学院、北京协和医学院临床医学专业试点班北京100730

线粒体功能障碍在肌萎缩侧索硬化(ALS)的发病中有着重要作用。线粒体功能障碍导致严重的氧化应激损伤和细胞钙稳态失衡,以及被异常释放的线粒体DNA激活炎性反应,这些可能是造成ALS患者运动神经元死亡的重要原因。线粒体自噬作为线粒体... 详细信息

线粒体功能障碍在肌萎缩侧索硬化(ALS)的发病中有着重要作用。线粒体功能障碍导致严重的氧化应激损伤和细胞钙稳态失衡,以及被异常释放的线粒体DNA激活炎性反应,这些可能是造成ALS患者运动神经元死亡的重要原因。线粒体自噬作为线粒体质量控制的最后环节,其功能的减弱或过度增强都会促进ALS的发展。

关键词：肌萎缩侧索硬化线粒体功能障碍

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梅毒螺旋体外膜蛋白研究进展

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微生物学报 2021年第3期61卷 539-554页

作者：王哲储引娣张艳娟李军范恩国中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病原学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院皮肤科北京100730

梅毒是由梅毒螺旋体(Treponema pallidum)亚种苍白螺旋菌引起的性传播感染性疾病,主要通过母婴感染或性接触的方式传播。梅毒螺旋体的外膜蛋白在梅毒螺旋体的传播和宿主的黏附等方面起重要作用,因此,鉴定可以作为抗生素作用靶点的梅毒... 详细信息

梅毒是由梅毒螺旋体(Treponema pallidum)亚种苍白螺旋菌引起的性传播感染性疾病,主要通过母婴感染或性接触的方式传播。梅毒螺旋体的外膜蛋白在梅毒螺旋体的传播和宿主的黏附等方面起重要作用,因此,鉴定可以作为抗生素作用靶点的梅毒螺旋体外膜蛋白一直是梅毒疫苗开发的研究重点。本文重点阐述了梅毒螺旋体外膜蛋白的结构功能等特性,并将目前针对细菌外膜蛋白为靶点的药物的研究进展进行总结,以期为针对梅毒螺旋体的外膜蛋白为靶点的相关药物的研发提供一些新思路。

关键词：梅毒螺旋体外膜蛋白抗生素药物靶点

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文献案例汇报和讨论在专业型硕士生临床流行病学教学中的应用

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基础医学与临床 2023年第9期43卷 1481-1485页

作者：韩慧君廖巍王丽中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院、流行病与卫生统计学系北京100005

目的为了增强临床医学专业型硕士生的科研能力,在临床流行病学教学中尝试文献案例汇报与讨论的新教学模式并对其教学效果进行评价。方法选取北京协和医学院2019~2021年各学年选修临床流行病学课程的临床医学专业型硕士生(128名)为研究... 详细信息

目的为了增强临床医学专业型硕士生的科研能力,在临床流行病学教学中尝试文献案例汇报与讨论的新教学模式并对其教学效果进行评价。方法选取北京协和医学院2019~2021年各学年选修临床流行病学课程的临床医学专业型硕士生(128名)为研究对象。2019年全部采用专题讲授式教学,2020年和2021年针对“队列研究”专题增设了文献案例汇报和讨论课。2021年选课学生就新教学模式提供了问卷反馈。结果2020年学生期末考试全部题目的题均得分率高于2019年(中位值分别为84.7%vs 75.4%,P<0.001);两学年学生的队列研究题目的题均得分率差异无统计学意义。2020年学生的队列研究案例讨论课得分率与期末考试队列研究题目的题均得分率、全部题目的题均得分率均呈正相关(r=0.40,P<0.01;r=0.31,P<0.05)。2021年学生中,80%自评达到了案例讨论课的知识学习目标,90%认为文献案例汇报与讨论式教学有助于提升临床研究设计能力、文献阅读能力、学术汇报交流能力及团队协作能力,全部学生对案例讨论课表示满意。结论在临床流行病学教学中开展文献案例汇报和讨论式教学,有助于学生更好地掌握临床研究方法学并提升综合科研能力,值得推广。

关键词：流行病学教学方法临床医学专业学位硕士研究生案例教学科研能力

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黄连生物碱改善小鼠原代肝细胞糖异生与脂质蓄积

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基础医学与临床 2023年第6期43卷 923-930页

作者：颜家琦王思齐王峥李隽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系北京100005

目的筛选能改善小鼠原代肝细胞糖异生与脂质蓄积的黄连生物碱单体并探讨其作用机制。方法分离小鼠原代肝细胞,使用不同剂量黄连总生物碱或单体成分处理,CCK-8法检测细胞存活率。使用丙酮酸钠、乳酸钠与胰高血糖素诱导小鼠原代肝细胞糖... 详细信息

目的筛选能改善小鼠原代肝细胞糖异生与脂质蓄积的黄连生物碱单体并探讨其作用机制。方法分离小鼠原代肝细胞,使用不同剂量黄连总生物碱或单体成分处理,CCK-8法检测细胞存活率。使用丙酮酸钠、乳酸钠与胰高血糖素诱导小鼠原代肝细胞糖异生模型,应用试剂盒检测培养基中葡萄糖含量,RT-qPCR检测糖异生相关基因表达,蛋白印迹检测p-AKT水平。应用棕榈酸与油酸诱导脂质蓄积模型,油红O检测细胞内脂质含量,蛋白印迹检测FAS、PLIN1、PPARγ蛋白水平。结果低剂量(0.5、1、2μg/mL)的黄连总生物碱处理24 h后小鼠原代肝细胞存活率在80%以上。糖异生模型组葡萄糖含量与G6PC、PCX的mRNA水平较对照组升高(P<0.05),p-AKT蛋白水平较对照组降低(P<0.05);黄连总生物碱(1、2μg/mL)与小檗碱(2.5、5μmol/L)处理后葡萄糖含量与G6PC、PCX的mRNA水平较模型组降低(P<0.05),p-AKT蛋白水平较模型组升高(P<0.05)。脂质蓄积模型组油红O染色较对照组增加(P<0.01),FAS、PLIN1、PPARγ蛋白水平较对照组升高(P<0.01);黄连总生物碱(1、2μg/mL)、黄连碱(2.5、5μmol/L)与小檗碱(2.5、5μmol/L)组的油红O染色较模型组减少(P<0.05),FAS、PLIN1、PPARγ蛋白水平较模型组降低(P<0.05)。结论小檗碱通过上调p-AKT水平而降低小鼠原代肝细胞糖异生,黄连碱与小檗碱通过降低FAS、PLIN1、PPARγ的表达而减少小鼠原代肝细胞脂质蓄积。

关键词：黄连生物碱原代肝细胞糖异生脂质蓄积

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定量方法比较研究的样本量考虑

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临床检验杂志 2023年第5期41卷 380-384页

作者：陈飞龙徐涛中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005

目的构建并验证基于最小二乘回归法的样本量计算公式用于评估定量方法的一致性,并用Bland-Altman法样本量公式比较其差异性。方法利用最小二乘回归法和统计推断的基本原理,推导出基于该方法的样本量公式。另选取1个实例验证本公式的准确... 详细信息

目的构建并验证基于最小二乘回归法的样本量计算公式用于评估定量方法的一致性,并用Bland-Altman法样本量公式比较其差异性。方法利用最小二乘回归法和统计推断的基本原理,推导出基于该方法的样本量公式。另选取1个实例验证本公式的准确性,并将本公式计算结果与Bland-Altman法样本量进行比较。结果通过公式推导得到基于最小二乘回归的定量指标一致性评价的样本量计算公式:n_(1)=[(Z_(1-α/2)+Z_(1-β/2))·σ_(ε)/(b_(0)+Δ_(0))·S_(x)]^(2)·(S_(x)^(2)+x^(2))+1,n_(2)=[(Z_(1-α/2)+Z_(1-β/2))·σ_(ε)/(|b_(1)-1|+Δ_(1))·S_(x)]^(2)+1。根据小样本预试验得到参数,本公式计算所得样本量与Bland-Altman法样本量公式并不完全相同,但在后续验证试验中,在满足样本量条件下两方法均得到一致性结论,进一步验证了推导公式的正确性。结论本研究构建的公式补充了国内外研究的空白,为定量数据一致性评估中使用最小二乘回归法提供了方法学支持。

关键词：最小二乘回归一致性评价样本量公式定量指标

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双特异性抗体及纳米技术在肿瘤免疫治疗中的应用进展

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合成生物学 2022年第2期3卷 352-368页

作者：许仕琳许海燕中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

单克隆抗体已经广泛用于肿瘤的靶向治疗,但由于肿瘤属于异质性疾病,涉及介导疾病进展的多种配受体信号变化以及信号级联通路之间的交互作用。因此,针对单一抗原的治疗难以有效抑制疾病的进程,而阻断多种不同的病理因素和途径是有望提高... 详细信息

单克隆抗体已经广泛用于肿瘤的靶向治疗,但由于肿瘤属于异质性疾病,涉及介导疾病进展的多种配受体信号变化以及信号级联通路之间的交互作用。因此,针对单一抗原的治疗难以有效抑制疾病的进程,而阻断多种不同的病理因素和途径是有望提高治疗效果的重要途径。近年来,合成生物学、生物工程和纳米技术等在不断发展,利用这些技术来设计工程化的治疗性抗体或可为肿瘤靶向免疫治疗带来新的思路。双特异性抗体是一种具有两种抗体特异性的人工抗体,可以同时识别不同的抗原或表位,由此实现多种功能,例如可以将T细胞重定向至肿瘤细胞并同时阻断两条不同的或相互串扰的细胞信号传导通路;与此同时,备受关注的纳米载体技术则为双抗体药物的研发与应用提供了有利的新工具。本文首先对双特异性抗体的生产和制备做简要介绍,然后对双特异性抗体在恶性血液肿瘤(急性髓细胞白血病和B细胞恶性血液肿瘤)和实体瘤(乳腺癌、卵巢癌、肺癌和头颈癌等)免疫治疗中的应用进展做分类介绍,并进一步介绍了双特异性抗体与纳米技术相结合形成的递送系统在肿瘤免疫治疗中的研究进展;最后讨论了双特异性抗体在设计和医学应用中面临的问题,并展望了纳米技术介导的靶向治疗策略在肿瘤治疗中的应用前景,以及双特异性抗体与免疫检查点抑制剂或疫苗等其他疗法联合应用的可能。

关键词：双特异性抗体免疫治疗靶向肿瘤纳米技术

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1号染色体长臂扩增削弱人胚胎干细胞神经分化潜能

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中华细胞与干细胞杂志（电子版） 2022年第3期12卷 129-137页

作者：李佳一张美丽黄粤中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

目的探讨1号染色体长臂(1q)的扩增对人胚胎干细胞(hESCs)神经分化的影响。方法通过对H9 hESCs克隆化培养的方法获得1q扩增的hESCs系。中期染色体计数的方法明确细胞内的染色体数目,核型分析鉴定染色体变异的情况,全基因组测序(WGS)分析... 详细信息

目的探讨1号染色体长臂(1q)的扩增对人胚胎干细胞(hESCs)神经分化的影响。方法通过对H9 hESCs克隆化培养的方法获得1q扩增的hESCs系。中期染色体计数的方法明确细胞内的染色体数目,核型分析鉴定染色体变异的情况,全基因组测序(WGS)分析基因组片段拷贝数变异的情况。使用碱性磷酸酶(AP)染色法检测细胞干性维持的情况,RT-qPCR和免疫荧光染色等方法检测胚胎干细胞(ESCs)标志物OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4等的表达。拟胚体(EB)形成实验进行hESCs不定向分化、全反式视黄酸(RA)诱导hESCs向外胚层分化、使用STEMdiff?SMADi Neural Induction Kit诱导hESCs向神经祖细胞(NPCs)定向分化,并通过RT-qPCR、AP染色和免疫荧光染色等方法检测其分化能力。两组间比较采用独立样本t检验。结果分离获得一株1q发生2个拷贝扩增的细胞,核型分析发现额外获得的2个1q是等臂染色体,核型为[47,XX,+i(1q)],将其命名为Amp(1q)。Amp(1q)AP染色呈阳性,且表达ESCs标志物OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4,具备干细胞自我更新的特征。EB分化过程中,与H9细胞相比,Amp(1q)向外胚层的分化能力下降,MAP2(29.67±1.53比66.67±1.15)和PAX6(8001±567.09比28308.00±1692.50)的表达降低(P均<0.05);RA诱导分化实验进一步证明,与H9细胞相比,Amp(1q)存在向外胚层分化的缺陷,MAP2(22.50±3.54比42.50±2.12)和PAX6(5403.00±569.93比38756.00±1068.44)的表达降低(P均<0.05)。当定向诱导向神经谱系分化时,Amp(1q)形成NPCs的能力降低,NPCs标志物PAX6的表达水平低于H9细胞(13.83±3.75比88.33±1.53)(P均<0.05)。结论Amp(1q)具有ESCs自我更新的能力,但1q的扩增会削弱hESCs神经分化的能力。

关键词： 1号染色体长臂扩增人胚胎干细胞自我更新神经分化

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一次读懂医学统计:混杂与效应修饰

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中华放射肿瘤学杂志 2025年第1期34卷 103-103页

作者：王擎何慧婧中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005

在科研活动,如研究设计、数据分析及文献审阅中,混杂(confounding)与效应修饰(effect modification)是两个关键的流行病学概念。理解这两个概念对于正确解释研究结果至关重要。目前仍有大量研究论文中对这两者进行了错误的使用或混淆。... 详细信息

在科研活动,如研究设计、数据分析及文献审阅中,混杂(confounding)与效应修饰(effect modification)是两个关键的流行病学概念。理解这两个概念对于正确解释研究结果至关重要。目前仍有大量研究论文中对这两者进行了错误的使用或混淆。本文通过明确的解释和实例分析,帮助读者清楚地区分和理解这两个重要的流行病学概念。

关键词：医学统计科研活动流行病学数据分析混杂读懂实例分析

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