检索结果-内蒙古大学图书馆

林业科学 2021年第9期57卷 52-65页

作者：唐芳赵树堂王丽娟宋学勤卢孟柱中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京 100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京 210037 中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京 100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京 210037 浙江农林大学林业与生物技术学院省部共建亚热带森林培育国家重点实验室杭州 311300

[目的] 次生维管系统再生能够在树干维管系统丧失后通过去分化、再分化或转分化等组织修复手段实现维管组织的再生.为了鉴定和研究次生维管系统发育相关的重要基因和调控元件,本文利用毛白杨次生维管再生系统,分析了不同再生时期的基因... 详细信息

[目的] 次生维管系统再生能够在树干维管系统丧失后通过去分化、再分化或转分化等组织修复手段实现维管组织的再生.为了鉴定和研究次生维管系统发育相关的重要基因和调控元件,本文利用毛白杨次生维管再生系统,分析了不同再生时期的基因表达模式,为进一步揭示木材形成的基因调控机制奠定基础.[方法] 将 4年生毛白杨无性系在形成层活动旺盛期进行环剥取样.对剥皮后的树皮内侧和树干表面的样本,以及再生第 7、10、14、18和21天5个不同时期获取的再生材料进行高通量转录组分析,并利用基因共表达分析( WGCNA)方法,得到与不同再生时期密切相关的模块,并对这些特异表达的基因进行表达网络和生物学功能分析.[结果] 将第0天(剥皮当天)树皮内侧样本与树干表面样本、再生第 7 天样本与树干表面样本,以及相邻再生时期的样本进行表达差异分析.对得到的14 202个差异基因进行 WGCNA分析,构建基因共表达网络,获得与维管再生过程相关的10个共表达模块.其中,Grey60模块的基因在再生第 7 天样本和树皮内侧样本中特异表达,主要涉及 DNA 复制、有丝分裂、细胞分裂和微管运动等功能;该模块还含有大量与表观遗传调控、细胞周期相关的基因,它们在再生第7天的高表达可能激活了脱分化木质部细胞的增殖和组织类型的改变,使其获得再分化能力.此外,Pink 模块的基因在第0天成熟维管组织样本中的表达量极低,但在再生过程中表达呈上升趋势,到第 21天达到最高值;这些基因主要参与细胞分裂、细胞壁修饰、韧皮部发育、碳水化合物代谢、 DNA 的转录调控等相关的生物学途径.Pink模块中与韧皮部分化相关的标记基因,比如 APL、NAC45/86、DOF、BSPA、PP2 和 SUS 的表达被重新激活,与调节形成层细胞增殖和分化的 CLE41/44和 CLV1一样,表达量都是从再生第 10 天开始逐渐增加.到次生维管系统再生后期的第18天和第21天,形成层已经完成了结构重构并能进行细胞的分裂、分化,此时木质部标记基因和次生壁调控因子有较高的表达.[结论] 毛白杨次生维管系统再生早期,脱分化的木质部细胞通过表观遗传和细胞周期调控重新获得细胞分生能力;之后,韧皮部的细胞分化程序被启动,再生形成层开始细胞增殖和分化;到再生后期,通过相关基因调控,形成层再分化木质部和韧皮部.通过对次生维管组织再生过程中基因的表达分析和调控模块的鉴定,进一步验证了次生维管再生的遗传调控基础,也可为揭示植物维管组织再生的调控机制奠定基础.

关键词：杨树次生维管系统再生基因表达 WGCNA

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毛白杨GM107再生体系和遗传转化体系的建立

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分子植物育种 2022年

作者：黄赛高凯苗得雨安新民北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室林木花卉育种生物工程国家林业和草原局重点实验室中国林业科学研究院亚热带林业研究所

本研究以毛白杨优良无性系GM107为试验材料，通过带芽茎段外植体消毒、接种生根获得无菌组培苗，利用无菌苗叶片建立了高频率的再生体系，筛选出最佳叶片分化生芽培养基为MS + TDZ 0.1 mg/L+ NAA 0.1 mg/L + BA 0.5 mg/L，分化生芽率约... 详细信息

本研究以毛白杨优良无性系GM107为试验材料，通过带芽茎段外植体消毒、接种生根获得无菌组培苗，利用无菌苗叶片建立了高频率的再生体系，筛选出最佳叶片分化生芽培养基为MS + TDZ 0.1 mg/L+ NAA 0.1 mg/L + BA 0.5 mg/L，分化生芽率约为90%，每小圆片生芽数可达20个。利用农杆菌介导的叶盘转化法，建立了高效的遗传转化体系，并确定了毛白杨叶片不定芽诱导卡那霉素筛选浓度为100 mg/L，不定芽生根筛选浓度为50 mg/L。Cef 250 mg/L+Tim 250 mg/L +Car 250 mg/L组合可作为筛选培养基的最佳抑菌抗生素组合。在农杆菌侵染前，对GM107小圆片外植体进行7 d预培养为宜。利用已经构建的pCAMBIA2300-VvMYBA1载体，以最佳组合进行遗传转化，获得102个转化株系，通过PCR检测，获得33个阳性株系，阳性植株达到32.35%。本研究为毛白杨基因功能研究提供了高效的遗传转化平台。

关键词：毛白杨再生体系遗传转化根瘤农杆菌

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槲树不同发育时期胚珠石蜡切片制备体系的优化

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2024年第7期52卷 64-72页

作者：祁永梁李亚鹏李世安刘克林岳涵郑为军余海胡瑞阳任俊杰欧国范张淑敏于立新孙宇涵李云北京林业大学生物科学与技术学院林木遗传育种全国重点实验室国家林业和草原局刺槐工程技术研究中心林木育种与生态修复国家工程研究中心北京100083 北京市绿地养护管理事务中心北京102200 中国林业科学研究院华北林业研究中心北京102399 河北省洪崖山国有林场河北保定071000 平泉市国有黄土梁子林场河北承德067506

【目的】建立并优化适宜槲树子房或胚珠石蜡切片的制作体系,为后续槲树胚胎发育学研究提供技术支撑。【方法】以不同发育时期的槲树雌花为试验材料,将材料以60 d为界分为60 d前和60 d后两部分,对材料处理方式(授粉60 d前后的材料分别进... 详细信息

【目的】建立并优化适宜槲树子房或胚珠石蜡切片的制作体系,为后续槲树胚胎发育学研究提供技术支撑。【方法】以不同发育时期的槲树雌花为试验材料,将材料以60 d为界分为60 d前和60 d后两部分,对材料处理方式(授粉60 d前后的材料分别进行仅保留子房与胚珠处理)、浸蜡时间(18,24,36 h)与浸蜡条件(60℃烘箱内抽真空处理0,6,8,12 h)、切片厚度(6,8,10μm)进行优化;在此基础上,以授粉70 d样品切片为材料,对染色方法(染色液分别为5 g/L苏木精、1 g/L甲苯胺蓝和10 g/L番红-固绿)及染色时间(1,2,5,10,15 min)进行优化,建立适合槲树胚珠的石蜡切片制备体系。【结果】授粉60 d前的样品仅保留子房部分,授粉60 d后的样品仅保留胚珠,两者在50℃烘箱经甘油乙醇浸泡48 h的软化处理后,所得切片效果最佳,可避免蜡带破裂等不良现象出现。将浸蜡时间延长至36 h,并于第1次浸纯蜡过程中在60℃烘箱内先进行12 h抽真空处理,可保证发育后期体积较大材料的充分浸蜡;脱蜡前将玻片进行3 h抽真空处理,可明显降低脱片率;授粉60 d前样品的切片厚度以8μm为宜,授粉60 d及以后的样品以10μm最佳。槲树胚株石蜡切片制备时,采用5 g/L苏木精染色5 min时的制片效果最好。【结论】建立并优化了槲树不同发育时期子房或胚珠石蜡切片的制备体系,采用该优化体系可获得蜡带连续、结构完整、染色均匀、背景清晰的槲树子房或胚珠切片。

关键词：槲树胚珠胚胎发育石蜡切片制备体系

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美洲黑杨群体结构分析及核心种质库构建

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林业科学 2020年第9期56卷 67-76页

作者：陈存丁昌俊张静李波褚延广苏晓华黄秦军林木遗传育种国家重点实验室/国家林业局林木培育重点实验室/中国林业科学研究院林业研究所北京100091

【目的】利用SSR分子标记技术研究美洲黑杨种质资源的群体结构,构建美洲黑杨核心种质资源库,为美洲黑杨种质资源的科学管理、高效利用和有效保护提供理论依据。【方法】利用15对SSR引物,分析美洲黑杨6个种源23个采样点的338个个体的遗... 详细信息

【目的】利用SSR分子标记技术研究美洲黑杨种质资源的群体结构,构建美洲黑杨核心种质资源库,为美洲黑杨种质资源的科学管理、高效利用和有效保护提供理论依据。【方法】利用15对SSR引物,分析美洲黑杨6个种源23个采样点的338个个体的遗传结构。应用GeneAlEx 6.503等软件计算等位基因数(N a)、有效等位基因数(N e)、Shannon’s信息多样性指数(I)、观测杂合度(H o)、Nei’s遗传多样性指数(H)和多态信息含量(PIC)等遗传参数,并进行主坐标(PCoA)分析。采用分组的逐步聚类方法结合位点等位基因数目最大化法和位点稀有等位基因优先相结合的取样策略构建核心种质库,并在核心种质库的基础上补充种质个体使等位基因保留比例达到100.00%,形成优化核心种质库。通过对相关遗传参数的t检验和PCoA分析验证核心种质库和优化核心种质库的有效性。【结果】美洲黑杨群体结构研究结果表明6个种源群体被划分为3大类型,即分布在圣劳伦斯河流域的Que种源的个体和哥伦比亚河流域的Was种源个体归为一类;分布在密西西比河中下游流域的种源个体(Mis、Lou、Ten)大致归为一类;分布在密西西比河上游的Iow种源的个体单独分为一类。基于群体结构分组筛选出19份核心种质,占原始种质的5.62%,等位基因数的保留比例为79.83%,N e、I、H o、H、PIC遗传参数的保留比例分别为102.75%、103.39%、125.31%、104.72%和105.27%,通过t检验和PCoA分析表明核心种质库具有代表性。通过在核心种质库中添加包含缺失等位变异基因的15个补充种质,构建包括34个个体的优化核心种质库,取样比例为10.06%,等位基因保留比例为100.00%,其他遗传参数N e、I、H o、H、PIC的保留比例分别为107.94%、110.93%、119.48%、107.52%和109.19%,t检验和PCoA分析结果均表明优化核心种质库的遗传多样性与原始种质库之间没有显著差异,包含的遗传信息优于核心种质库。【结论】美洲黑杨种质资源群体的6个种源分为三大类型:北方型美洲黑杨(Que、Was)、中间型美洲黑杨(Iow)和南方型美洲黑杨(Mis、Lou、Ten)。通过多种策略相结合构建的核心种质库和优化核心种质库的遗传多样性与原始种质库之间不存在显著差异,能够良好地代表美洲黑杨资源群体的遗传多样性。构建的优化核心种质库在保留原始种质库更多遗传多样性信息的基础上,去除遗传冗余,有利于美洲黑杨资源的有效保护和科学利用,为杨树育种工作奠定基础。

关键词：美洲黑杨群体结构核心种质库

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12个欧美杨无性系生长初期基因型与环境的互作效应

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林业科学 2020年第8期56卷 63-72页

作者：刘宁丁昌俊李波丁密苏晓华黄秦军林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091

【目的】研究12个欧美杨杂交无性系生长初期在不同环境下生长性状的观测值变异,从基因型与环境互作效应的角度入手,筛选可以推广的稳产、丰产的优良基因型;总结试验中适地适品种的规律;评价试验地点的区分力和代表性。为后续欧美杨的育... 详细信息

【目的】研究12个欧美杨杂交无性系生长初期在不同环境下生长性状的观测值变异,从基因型与环境互作效应的角度入手,筛选可以推广的稳产、丰产的优良基因型;总结试验中适地适品种的规律;评价试验地点的区分力和代表性。为后续欧美杨的育种工作提供相关技术支撑。【方法】试验材料为3年生的12个不同基因型的欧美杨杂交无性系,设计了辽宁黑山、河北滦南、湖北石首和山东诸城、郓城、宁阳6个试验地点,测定树高、胸径,计算变异系数和均值进行初步比较,利用ASReml-R软件建立混合效应模型,利用预测性状值作GGE双标图,分析并总结其中规律用以评价试验地点和筛选优良基因型。【结果】整体上胸径的变异大于树高,黑山和石首的变异较大。均值统计的结果表明,不同基因型的生长性状在同一环境下的表现不同,同一基因型的生长性状在不同环境下的表现也不同;经混合线性模型检验,基因型、环境及基因型与环境的互作对于生长初期的欧美杨树高、胸径存在极显著(P<0.01)的效应,由区组带来的效应也极显著。提取性状预测值作GGE双标图,拟合度均在80%以上,结果近乎与实际情况一致。GGE双标图的结果表明,对于树高的表现和胸径的表现,环境间的关系相似但不相同;树高、胸径的表现均存在交叉性互作现象;入选基因型有5号、7号、3号、4号和9号,其中4号、5号和7号为全同胞家系。父本的遗传物质和种源地对杂交无性系的表现有明显可见的影响,荷兰北方型的欧洲黑杨N146是优良的父本材料。【结论】1)生长初期欧美杨杂交无性系树高、胸径在东北地区和华中地区变异较大;欧美杨杂交无性系在生长初期的生长性状受基因型、环境及其交互作用的显著影响。2)由GGE双标图中的信息,综合筛选出丰产性较高稳产性最高的基因型7号、丰产基因型5号、高于平均产量且丰产稳产都较好的基因型4号。3)在黑山地区和诸城地区适合栽植基因型3号和4号;在宁阳地区和石首地区适合栽植5号基因型;滦南地区和郓城地区适合栽植7号基因型。

关键词：欧美杨无性系混合效应模型基因型与环境互作 GGE双标图基因型筛选

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杉木林土壤和苗木内生溶磷细菌的筛选及其溶磷特性

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林业科学 2020年第12期56卷 1-9页

作者：韦宜慧陈嘉琪赵光宇董玉红厚凌宇焦如珍中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091

【目的】筛选和鉴定杉木高效溶磷菌,研究其溶磷特性,探讨其生态适应性和溶磷特点,为研制杉木适用的微生物肥料提供菌种资源和培养条件。【方法】利用PVK无机磷培养基从杉木林地土壤和杉木植株分离溶磷菌,筛选出高效溶磷菌并结合生理生... 详细信息

【目的】筛选和鉴定杉木高效溶磷菌,研究其溶磷特性,探讨其生态适应性和溶磷特点,为研制杉木适用的微生物肥料提供菌种资源和培养条件。【方法】利用PVK无机磷培养基从杉木林地土壤和杉木植株分离溶磷菌,筛选出高效溶磷菌并结合生理生化试验和16S rDNA基因序列对其进行鉴定,采用单因素试验分析高效溶磷菌在不同pH、温度、碳源、氮源、磷源等培养条件下的溶磷特性。【结果】1)共分离筛选出20株溶磷菌,其中溶磷能力最强的3株菌株为P5、RP2和RP22(分别为195.61 mg·L^-1、109.20 mg·L^-1、78.86 mg·L^-1)。2)通过生理生化试验,结合16S rDNA序列分析及系统发育树的构建,菌株P5鉴定为Burkholderia ubonensis,RP2为Pseudomonas frederiksbergensis,RP22为Pseudomonas grimontii。3)单因素试验溶磷培养条件研究结果显示,P5菌株在pH为5,温度为30℃,碳源为蔗糖,氮源为氯化铵,磷源为磷酸钙时溶磷能力最强;RP2菌株在pH为7,温度为30℃,碳源为葡萄糖,氮源为硝酸钾,磷源为磷酸钙时溶磷能力最强;RP22菌株在pH为7,温度为25℃,碳源为葡萄糖,氮源为硝酸钾,磷源为磷酸钙时溶磷能力最强。【结论】所筛选溶磷菌具有高效溶磷能力,其中菌株P5在酸性和高温条件下仍有较高的溶磷能力,在微生物肥料研制中具有巨大潜力。

关键词：杉木溶磷菌筛选鉴定培养条件

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百合多倍体育种研究

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应用技术学报 2025年第1期25卷 109-116,124页

作者：桑娟王艺程于瑶函李玺张志国秦巧平刘翔上海应用技术大学生态技术与工程学院上海201418 中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海200032 中国林业科学研究院林木遗传育种全国重点实验室北京100091

百合(Lilium spp.)是一类重要的多年生单子叶球根花卉。最近,研究人员通过多倍体育种的方式,获得了许多优质的新品种。对百合多倍体育种的研究进展进行了综述,从外植体类型、诱变剂的种类、浓度和处理时间及诱导方式等方面介绍了体细胞... 详细信息

百合(Lilium spp.)是一类重要的多年生单子叶球根花卉。最近,研究人员通过多倍体育种的方式,获得了许多优质的新品种。对百合多倍体育种的研究进展进行了综述,从外植体类型、诱变剂的种类、浓度和处理时间及诱导方式等方面介绍了体细胞染色体加倍,利用化学试剂和高温诱导2n配子等方式来实现多倍体育种,以及多倍体鉴定方法的形态学、细胞学、染色体计数和分子水平鉴定等研究。总结了百合多倍体育种的成果,并提出了从分离嵌合体、组合多种的诱导方式来提高成功率,结合分子标记技术实现精准育种,深入多倍体百合植株的研究和应用对百合多倍体育种进行展望。通过这些研究,可以更好地理解和利用百合的遗传变异,为百合多倍体育种技术及其应用的研究提供参考,为百合种质资源的创新提供理论依据,为百合产业的发展作出更大的贡献。

关键词：百合多倍体育种研究进展展望

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毛果杨类胡萝卜素裂解双加氧酶基因家族全基因组水平鉴定及其干旱与盐胁迫响应分析

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植物研究 2021年第6期41卷 993-1005页

作者：田双慧程赫张洋刘聪夏德安魏志刚林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学哈尔滨150040 国家林业和草原局盐碱地研究中心中国林业科学研究院北京100091

CCD基因编码的类胡萝卜素裂解双加氧酶催化胡萝卜素共轭双键裂解形成脱辅基类胡萝卜素及其衍生物,研究表明CCD基因在植物生长发育与逆境胁迫响应中发挥着重要作用。然而,目前尚无木本模式植物毛果杨(Populus trichocarpa)PtrCCD的研究报... 详细信息

CCD基因编码的类胡萝卜素裂解双加氧酶催化胡萝卜素共轭双键裂解形成脱辅基类胡萝卜素及其衍生物,研究表明CCD基因在植物生长发育与逆境胁迫响应中发挥着重要作用。然而,目前尚无木本模式植物毛果杨(Populus trichocarpa)PtrCCD的研究报导,本研究发现其在盐胁迫和干旱胁迫下的表达量存在明显差异,据此拟从分子水平上揭示该基因家族成员功能。本研究从全基因组水平对毛果杨PtrCCD基因家族成员数量、进化关系、染色体位置、基因结构、编码蛋白基本特征和启动子顺式作用元件等特征进行了分析。结果表明:PtrCCD家族由11个基因组成,可分为CCD4和CCD8两个亚族,分别包括9个和2个基因;PtrCCD家族存在5对Ka/Ks均远小于1的旁系同源基因;PtrCCD家族编码蛋白均含有5个共有保守结构域Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 9和Motif 11,且处于同一进化分支的基因编码蛋白序列高度保守;PtrCCD家族基因启动子区含有大量非生物胁迫和激素响应元件,其中PtrCCD8a启动子含有5种类型、16个元件。PtrCCD家族基因表达特性分析表明:PtrCCD家族基因在根、茎和叶中表达量存在明显差异,并且多数成员在茎部表达量要高于其他2个部位;干旱胁迫不同时间下,处于同一进化分支的基因表达模式基本相同,不同分枝的基因表达量存在明显差异;NaCl胁迫不同时间下,PtrCCD家族各基因在根、茎和叶中表达量不同、但均表现出先上升后下降再上升的变化趋势,处于同一进化分支的基因表达模式基本相同。PtrCCD家族基因在干旱和盐胁迫情况下具有不同程度的响应能力,进一步表明该基因家族在非生物胁迫中具有重要作用。

关键词：毛果杨 CCD基因家族全基因组干旱胁迫盐胁迫响应特性

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实验田4年生转基因毛白杨嫁接苗和自根苗安全性研究

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林业科学研究 2022年第2期35卷 56-66页

作者：侯荣轩赵烨田彦挺佀化玙张华新李娟纪清巨杨庆山孙宇涵李云北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 中国林业科学研究院北京100091 盐山县自然资源和规划局河北沧州061300 沧州市自然资源和规划局种苗站河北沧州061001 山东省林业科学研究院山东济南250014

[目的]对种植于天津滨海的自根苗转AhDREB1基因毛白杨((Populus tomentosa×***)×***)以及种植于沧州盐山的嫁接苗转基因株系进行安全性研究,评估转基因毛白杨对环境可能造成的影响。[方法]利用PCR扩增以及电泳技术,对种植在... 详细信息

[目的]对种植于天津滨海的自根苗转AhDREB1基因毛白杨((Populus tomentosa×***)×***)以及种植于沧州盐山的嫁接苗转基因株系进行安全性研究,评估转基因毛白杨对环境可能造成的影响。[方法]利用PCR扩增以及电泳技术,对种植在天津滨海和沧州盐山实验田的4年生转基因毛白杨基因组DNA、土壤DNA、沧州嫁接苗砧木DNA以及抗性微生物基因组DNA进行PCR特异性检测。对天津实验田土壤中根际微生物数量进行连续动态监测(3月、4月、5月)。分别在天津滨海和沧州盐山实验田模拟自然条件下转基因毛白杨植株枯落物掉落,检测不同生长阶段的不同器官(新生嫩芽、多年生枝条、新生根尖、多年生侧根、新生嫩叶、当年生老叶)的降解时间。通过化感实验,检测天津滨海和沧州盐山实验田转基因毛白杨植株叶片对白菜(Brassica pekinensis)种子的生长是否造成影响。[结果]电泳结果显示:外源基因稳定存在于转基因毛白杨基因组中,实验田土壤DNA、抗性微生物DNA样品以及沧州嫁接苗砧木DNA中均未出现目的基因片段;天津非转基因植株和转基因植株的根际土壤中可培养微生物数量没有显著差异;转基因毛白杨的枯落物,无论是飘落在杂草表面、土壤表面还是埋入土壤,2个月后外源基因均被降解。化感实验结果显示:非转基因植株以及转基因植株对白菜种子的胚轴和胚根生长的影响没有显著差异。[结论]未发现实验田种植4 a的转基因毛白杨对周围的环境造成影响。

关键词：转基因毛白杨嫁接苗与自根苗转基因安全性评价基因水平转移土壤微生物数量

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萱草海水胁迫相关WRKY转录因子密码子偏向性分析

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应用技术学报 2024年第2期24卷 245-253页

作者：桑娟王艺程李玺张世杰朱盛杰席志俊张琼张志国秦巧平刘翔上海应用技术大学生态技术与工程学院上海201418 中国林业科学研究院林木遗传育种全国重点实验室北京100091 山西省大同市农业农村委局山西大同037000

在植物进化的过程中,不同物种的基因具有特定的密码子使用偏好性。WRKY基因家族在植物抗逆过程中扮演着重要角色。萱草是一种抗逆性极强的优秀园艺植物。为了深入探究萱草WRKY基因的密码子使用特征,采用CodonW和EMBOSS在线程序对海水胁... 详细信息

在植物进化的过程中,不同物种的基因具有特定的密码子使用偏好性。WRKY基因家族在植物抗逆过程中扮演着重要角色。萱草是一种抗逆性极强的优秀园艺植物。为了深入探究萱草WRKY基因的密码子使用特征,采用CodonW和EMBOSS在线程序对海水胁迫诱导相关21条WRKY转录因子(HfWRKY)进行密码子分析。同时,利用Excel和Rstudio软件绘制中性分析图、ENc-plot图和PR2-plot图,旨在揭示HfWRKY基因的密码子使用规律。HfWRKY基因GC平均含量为48.31%,GC3平均含量为51.72%,这表明HfWRKY基因更倾向使用G/C结尾的密码子,且其密码子使用偏好性较弱。相对同义密码子分析显示,28个密码子的RSCU值>1,其中13个以A或T结尾,15个以G或C结尾。此外,有效密码子数的取值范围在46.54~59.64之间,密码子适应指数范围为0.158~0.274。通过中性分析、ENc-plot和PR2-plot图发现HfWRKY基因的密码子使用模式受到突变和自然选择等因素的影响。最后,鉴定出10个HfWRKY基因家族的最优密码子并证明其与抗性相关。本研究结果对于进一步挖掘HfWRKY基因家族在萱草在海水胁迫方面的作用和分子育种提供了理论依据。

关键词：萱草 WRKY 转录因子密码子偏向性最优密码子

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