检索结果-内蒙古大学图书馆

菌物学报 2021年第6期40卷 1343-1356页

作者：王倩李振双杨富成陈彬梁俊峰陆俊锟中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业和草原局重点实验室广东广州510520 南京林业大学江苏南京210037

以广西凭祥红锥-马尾松混交林中红锥和马尾松为研究对象,采集林下外生菌根和根际土壤,利用高通量测序分析该混交林下的菌根际微生物群落结构。结果表明,红锥、马尾松菌根际优势真菌为红菇属Russula、被孢霉属Mortierella、乳菇属Lactar... 详细信息

以广西凭祥红锥-马尾松混交林中红锥和马尾松为研究对象,采集林下外生菌根和根际土壤,利用高通量测序分析该混交林下的菌根际微生物群落结构。结果表明,红锥、马尾松菌根际优势真菌为红菇属Russula、被孢霉属Mortierella、乳菇属Lactarius、鹅膏属Amanita、拟锁瑚菌属Clavulinopsis、丝盖伞属Inocybe、锁瑚菌属Clavulina和木霉属Trichoderma,其中,Russula为绝对优势类群,菌根和根际中共生真菌均以外生菌根真菌为主。而优势细菌主要为常见菌根辅助细菌,如伯克霍尔德氏菌属Burkholderia、假单细胞菌属Pseudomonas、慢生根瘤菌属Bradyrhizobium、根瘤菌属Rhizobium和土壤杆菌属Agrobacterium,除芽孢杆菌属Bacillus外,菌根内菌根辅助细菌均高于根际。PICRUST功能分析表明红锥和马尾松菌根中部分膜运输通路(ABC transporters、transporters和secretion system ABC)和信号转导通路(two-component system)的丰度高于根际。α多样性分析表明,菌根和根际微生物多样性存在显著差异,马尾松菌根、根际真菌群落多样性显著高于红锥;β多样性分析表明两树种菌根和根际分别具有相似的微生物群落结构。优势菌群和土壤环境因子的RDA分析表明,土壤pH、全磷和全钾是影响菌根际菌群结构的主要环境因子。

关键词：红锥-马尾松混交林外生菌根真菌菌根辅助细菌优势属

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以tuf基因为靶标的5种16SrⅠ组植原体环介导恒温扩增技术

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林业科学 2017年第8期53卷 54-63页

作者：王圣洁王胜坤林彩丽于少帅汪来发朴春根郭民伟田国忠中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室北京100091 中国林业科学研究院热带林业研究所广州510520

【目的】建立一种能够特异性检测和鉴定16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,实现16SrⅠ组植原体的快速检测。【方法】以植原体tuf基因作为靶标,通过序列比对,设计多组具有特异性的LAMP引物组,筛选出一套适用于16SrⅠ组植原体的特异性... 详细信息

【目的】建立一种能够特异性检测和鉴定16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,实现16SrⅠ组植原体的快速检测。【方法】以植原体tuf基因作为靶标,通过序列比对,设计多组具有特异性的LAMP引物组,筛选出一套适用于16SrⅠ组植原体的特异性检测体系。以16SrⅡ组、16SrⅤ组、16SrⅩⅨ组植原体样品按照此检测体系进行反应,来验证其特异性;同时将稀释后的感病组织样品同步进行PCR和LAMP检测,以确定其检测灵敏度。对来自不同省市的6份田间样品以及9份组培样品进行检测,以验证其检测的稳定性。【结果】16SrⅠ-LAMP在恒温63℃条件下40 min内完成扩增,能检测5种分别引起泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑树萎缩、莴苣黄化和长春花绿变病的16SrⅠ组植原体,不能检测其他组植原体包括16SrⅡ组的花生丛枝、甘薯丛枝、臭矢菜丛枝、16SrⅤ组的枣疯病、红花槐丛枝、樱桃致死黄化和16SrⅩⅨ组的板栗黄化皱缩植原体。通过在反应液中加入钙黄绿素肉眼判断绿色为阳性结果,褐色为阴性结果,与用荧光定量设备进行判读扩增曲线的结果一致。相比于PCR检测,16SrⅠ-LAMP检测的灵敏度提高了8倍;16SrⅠ-LAMP能够快速检测出来自不同区域的田间泡桐发病样品、感病泡桐组培苗和嫁接传病脱毒苗。【结论】以tuf基因作为靶标,建立能同时检测5种16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,具有高效、特异、操作简便、检测时间短及成本较低等优点,适合于基层和现场检测。

关键词：植原体环介导恒温扩增 tuf基因快速检测

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柚木无性系扦插育苗研究

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中南林业科技大学学报 2019年第10期39卷 24-29页

作者：杨光梁坤南黄桂华周再知王西洋中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室

以3月龄柚木嫩枝为材料,采用基质、生长调节剂种类及其浓度三因素正交实验设计,研究各因素对柚木扦插育苗的影响,并运用隶属函数法对各处理组合的育苗效果进行综合评价。结果表明:两个无性系的扦插育苗效果明显存在差异,7029无性系的生... 详细信息

以3月龄柚木嫩枝为材料,采用基质、生长调节剂种类及其浓度三因素正交实验设计,研究各因素对柚木扦插育苗的影响,并运用隶属函数法对各处理组合的育苗效果进行综合评价。结果表明:两个无性系的扦插育苗效果明显存在差异,7029无性系的生根率和株高均极显著高于7514无性系(P<0.01);三因素中生长调节剂种类对插穗生根影响最大,尤以IAA扦插育苗效果最佳,生根率、根生物量、叶面积和株高均优于另外两种生长调节剂;3种扦插基质中A3的生根率、根系直径和根体积均优于基质A1和A2,在叶面积和株高方面基质A2最优;生长调节剂浓度对插穗生根率以及根系生长均无显著影响(P≥0.05);通过隶属函数综合评价选出处理4(基质A2+生长调节剂NAA+浓度200 mg/kg)为7029无性系扦插育苗效果最佳的组合;处理9(基质A3+生长调节剂IAA+浓度200 mg/kg)为7514无性系扦插育苗效果最佳的组合。

关键词：柚木扦插育苗基质生长调节剂

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油榄仁种胚高质量组培快繁体系

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中南林业科技大学学报 2023年第9期43卷 53-61,88页

作者：王欢曾琪瑶王春胜郭俊杰曾杰中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林草局重点实验室广东广州510520 中国林业科学研究院热带林业实验中心广西凭祥532600

【目的】探究油榄仁组培快繁各阶段的最佳培养基配方以及硅酸钾对苗高整齐度的影响,建立油榄仁高质量组培快繁体系,为油榄仁良种繁育和定向培育提供理论和技术支持。【方法】以油榄仁优良家系种子为试验材料,开展消毒方法以及增殖和生... 详细信息

【目的】探究油榄仁组培快繁各阶段的最佳培养基配方以及硅酸钾对苗高整齐度的影响,建立油榄仁高质量组培快繁体系,为油榄仁良种繁育和定向培育提供理论和技术支持。【方法】以油榄仁优良家系种子为试验材料,开展消毒方法以及增殖和生根阶段培养基配方筛选试验,探讨硅酸钾对增殖苗整齐度的调控方法,分析不同处理间种子消毒效果、增殖质量以及生根情况的差异,确定适宜的消毒方法以及增殖和生根培养基。【结果】合适的种子消毒方法为:油榄仁种子经浓硫酸浸泡7 h后,用0.1%升汞溶液消毒种胚8 min,无菌胚萌芽率超过80%。增殖培养中,6-BA与IBA质量浓度比值为10,且KH_(2)PO_(4)和MgSO_(4)·7H_(2)O的质量浓度分别为MS培养基的2倍和1.5倍时,油榄仁的增殖效果最好,表现为增殖系数高且生长状态好,接种培养30 d其增殖系数、增殖苗高度和叶绿素含量分别可达5.6、3.75 cm和2.51 mg·g-1。油榄仁的最佳增殖培养基为改良MS(KH_(2)PO_(4)和MgSO_(4)·7H_(2)O的质量浓度分别为255 mg·L^(-1)和740 mg·L^(-1))+1.0 mg·L^(-1)6-BA+0.1 mg·L^(-1)IBA+30 g·L^(-1)蔗糖。硅酸钾可以提高增殖苗的整齐度,其最佳浓度为1.5 mmol·L^(-1),整齐度比对照高2.63倍。通过生根培养筛选出最佳生根配方为WPM+0.2 mg·L^(-1)NAA+20 g·L^(-1)蔗糖,生根率达94%以上。【结论】构建了油榄仁的组培快繁体系,尤其是通过培养基中添加适宜浓度的硅酸钾可改善油榄仁组培苗的整齐度。该体系不仅可获得优质组培苗,还能提高组培苗的整齐度,降低育苗成本,为油榄仁优良种质组培苗产业化生产提供技术支撑。

关键词：油榄仁高整齐度基本培养基硅酸钾

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城乡梯度3种林分类型土壤酶活性及影响因素

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森林与环境学报 2024年第1期44卷 35-44页

作者：杨紫浓肖以华马海宾王圣洁李明付志高中国林业科学研究院热带林业研究所广东广州510520 热带林业研究国家林业和草原局重点实验室广东广州510520

以广州市城区、近郊和乡村森林土壤为研究对象,探讨马尾松林、针阔混交林和常绿阔叶林土壤酶活性特征及其与理化性质和重金属之间的关系。结果表明:马尾松林土壤酸性磷酸酶(AP)、脲酶(URE)活性以及针阔混交林土壤过氧化氢酶(CAT)、URE... 详细信息

以广州市城区、近郊和乡村森林土壤为研究对象,探讨马尾松林、针阔混交林和常绿阔叶林土壤酶活性特征及其与理化性质和重金属之间的关系。结果表明:马尾松林土壤酸性磷酸酶(AP)、脲酶(URE)活性以及针阔混交林土壤过氧化氢酶(CAT)、URE、脱氢酶(DH)活性均为近郊>乡村>城区,而常绿阔叶林土壤AP、URE、DH活性为近郊>城区>乡村。城区、近郊针阔混交林土壤pH值、砂粒含量均显著高于马尾松林和常绿阔叶林(P<0.05);土壤有机质(SOM)、总氮(TN)、总磷(TP)含量均为马尾松林<针阔混交林<常绿阔叶林;乡村针阔混交林土壤SOM含量、阳离子交换量(CEC)、黏粒含量、粉粒含量、含水率在3种林分中均最低。城区马尾松林土壤重金属铜(Cu)、锌(Zn)、铅(Pb)含量在3种林分间均最低,而镉(Cd)含量在3种林分间相同;近郊、乡村常绿阔叶林土壤重金属Zn、Pb含量在3种林分中均最高。土壤含水率、SOM含量、pH值、CEC、Cu含量、黏粒含量、TN含量是土壤酶活性的主要影响因子。相关性分析表明,土壤SOM、TN含量与土壤CAT、AP活性呈显著正相关(P<0.05);土壤TP含量与土壤AP、URE活性呈显著正相关(P<0.05);土壤含水率与土壤DH活性呈显著正相关(P<0.05);而土壤Cu含量与URE活性呈显著负相关(P<0.05)。

关键词：城乡梯度林分类型土壤酶活性土壤理化性质重金属广州市

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广州南沙湿地中人工红树林区的植物群落结构和土壤性质动态

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湿地科学 2023年第5期21卷 716-722页

作者：李玫管伟姜仲茂廖宝文陈玉军中国林业科学研究院热带林业研究所广东广州510520 热带林业研究国家林业和草原局重点实验室广东广州510520

以2002年在广州市南沙湿地中人工营造的6种红树林群落为研究对象,分别于2005年10月、2010年8月和2016年11月,通过野外调查和采样,对6种红树群落的结构和其分布区的土壤性质动态进行研究,旨在为广东省红树林生态恢复提供借鉴。研究结果表... 详细信息

以2002年在广州市南沙湿地中人工营造的6种红树林群落为研究对象,分别于2005年10月、2010年8月和2016年11月,通过野外调查和采样,对6种红树群落的结构和其分布区的土壤性质动态进行研究,旨在为广东省红树林生态恢复提供借鉴。研究结果表明,2008年的低温冷害使人工营造的海桑(Sonneratia caseolaris)群落消亡,重新种植海桑后,2016年11月,海桑植株的保存率仍为0;在秋茄(Kandelia obovata)生长初期,随着树高的增高,秋茄的胸径变粗,秋茄群落的植株密度减小,在秋茄生长的中、后期,秋茄的树高几乎不再增高,其胸径继续变粗;在无瓣海桑(Sonneratia apetala)生长初期,随着树高的生长,其胸径增粗,在无瓣海桑生长的中、后期,其树高持续增高,胸径不断增粗,但是无瓣海桑群落的植株密度逐渐减小,体现了无瓣海桑林的自疏作用;无瓣海桑+红海榄(Rhizophora stylosa)群落、无瓣海桑+木榄(Bruguiera gymnorrhiza)群落和无瓣海桑+秋茄群落中植物的生长过程与无瓣海桑群落的相似,林下红海榄、木榄、秋茄的生长速度依次减小;2008年的低温冷害导致无瓣海桑+红海榄群落内的红海榄植株死亡;随着红树林恢复时间的增长,各红树群落区土壤中的黏粒和粉粒所占比例增大,表层土壤含盐量、有机质含量、速效氮含量、速效磷含量和速效钾含量有所增大,红树林的恢复有助于土壤结构和肥力的改善。

关键词：红树林土壤性质无瓣海桑木榄南沙湿地

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珍贵树种火力楠转录组SSR特征分析

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基因组学与应用生物学 2019年第4期38卷 1674-1682页

作者：李清莹仲崇禄姜清彬张勇陈羽魏永成陈珍中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广州510520

为了全面了解珍贵乡土树种火力楠转录组SSR位点的分布及序列特征,为火力楠遗传资源的保存和合理开发利用提供遗传学资料,为同属植物及近缘种SSR标记的开发及遗传研究提供便利。利用Illumina Hiseq2000高通量测序平台对火力楠进行转录组... 详细信息

为了全面了解珍贵乡土树种火力楠转录组SSR位点的分布及序列特征,为火力楠遗传资源的保存和合理开发利用提供遗传学资料,为同属植物及近缘种SSR标记的开发及遗传研究提供便利。利用Illumina Hiseq2000高通量测序平台对火力楠进行转录组测序,再通过MISA软件对测序所得Unigenes进行SSR位点的发掘和分析。分析的结果显示发现含SSR的序列21 218条,共得到27 379个SSR,出现频率为28.08%,平均约每3 kb出现1个SSR。单碱基和二碱基重复为火力楠SSR主要重复单元类型,分别占SSR总数的42.18%和35.66%,所有重复基元共85种,其中(A/T) n所占比例最高41.65%,然后是(AG/CT)n(29.47%)、(AAG/CTT)n (6.83%)和(AC/GT)n (4.11%)。在SSR和CDS的交集基因中,共发现24 668个SSR位点,其中3 805个位于编码区,出现频率为0.099 SSR/kb,而非编码区为0.287 SSR/kb,在基因编码区中出现频率最高的是三碱基重复(2 030, 53.35%)。在SSR序列长度方面,长度变化范围最大的为单碱基重复SSR,其次是二碱基重复。火力楠转录组SSR位点的出现频率高、分布密度大、基元类型丰富、重复次数较高、长片段较多,具有较高的多态性潜能,用于遗传分析的潜力很大,能满足该物种的保护遗传学研究。

关键词：火力楠转录组 SSR特征多态性

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巨桉糖原合成酶激酶EgrSK41的克隆与表达分析

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分子植物育种 2021年

作者：胡冰李文欣曾炳山中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业与草原局重点实验室

糖原合成酶激酶3 (GSK3)是一种普遍存在于真核生物中且非常保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，调控着植物的生长发育和胁迫响应等多种生理过程。本研究以巨桉无性系GL1为研究材料，克隆了一个巨桉GSK3基因，命名为EgrSK41 (登录号：MT628392... 详细信息

糖原合成酶激酶3 (GSK3)是一种普遍存在于真核生物中且非常保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，调控着植物的生长发育和胁迫响应等多种生理过程。本研究以巨桉无性系GL1为研究材料，克隆了一个巨桉GSK3基因，命名为EgrSK41 (登录号：MT628392)。生物信息学分析表明，EgrSK41可编码422个氨基酸，分子量为48.03 kD，等电点为8.37，属于稳定蛋白、亲水蛋白，可能定位于细胞核，具有27个磷酸化位点。系统进化分析和蛋白质结构域分析表明，EgrSK41的蛋白序列具有保守的Protein Kinase domain及TREE结构域，属于Ⅳ亚族。表达模式分析表明：EgrSK41在成熟叶中的表达量相对较高；在节间的表达量显著高于茎顶端，且随着节间次生发育越成熟，表达量逐渐降低；EgrSK41的表达量受盐、缺氮、缺硼、缺磷等逆境胁迫的诱导而上调。由此说明，EgrSK41与GL1茎的次生发育有密切的关系且对GL1响应逆境胁迫具有重要的调控作用。

关键词：桉树 GSK3 基因克隆表达分析非生物胁迫

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火力楠转录组测序与组织差异表达基因分析

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分子植物育种 2017年第11期15卷 4396-4404页

作者：李清莹仲崇禄姜清彬张勇陈羽魏永成陈珍中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广州510520

火力楠具有重要经济价值与生态功能,但缺乏其基因组信息,限制了其分子生物学、基因功能与分子育种的相关研究。以火力楠根、茎和叶为材料,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,并对得到的测序数据进行de novo组装,获得97 503条Uni... 详细信息

火力楠具有重要经济价值与生态功能,但缺乏其基因组信息,限制了其分子生物学、基因功能与分子育种的相关研究。以火力楠根、茎和叶为材料,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,并对得到的测序数据进行de novo组装,获得97 503条Unigenes,N50为1 010 bp、平均长度852 bp。与公共数据库进行比对,注释到NR、Swiss-Prot数据库的Unigenes分别为60 926、44 249条。将Unigenes与COG数据库比对,有42 344条Unigenes成功注释,根据功能大致分成25类;与GO数据库比对,有15 947条Unigenes获得注释,按功能可分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类55亚类,其中参与的生物学过程较多;以KEGG数据库参考,有26 267条Unigenes参与330条代谢途径分支,以代谢相关的途径较为集中;差异基因表达分析我们得出,根与茎的差异表达基因为2 826个,根与叶之间的差异表达基因为3 230个,这两组差异基因相对校多,除此之外茎与叶差异基因相对较少;差异基因的GO分类、GO富集以及pathway富集分析表明,主要在细胞组分、蛋白质活性、生物合成以及代谢过程等所占比例较高。这些研究结果极大地扩充了火力楠的基因资源,将有助于火力楠基因的发掘与利用、分子标记的开发及其种质资源遗传改良的研究等。

关键词：火力楠转录组 Illumina高通量测序基因注释差异表达基因

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杉木单木枯损率与初植密度、竞争和气候因子的关系

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林业科学 2019年第3期55卷 72-78页

作者：张雄清王翰琛鲁乐乐陈传松段爱国张建国中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 中国林业科学研究院亚热带林业实验中心分宜336600

【目的】分析杉木单木枯损率与初植密度、竞争和气候因子的关系,为杉木科学经营管理提供决策依据。【方法】以江西杉木密度试验林为研究对象,选取常用的logit、probit和cloglog 3种二分类变量数据结构模型构建杉木单木枯损率基础模型,... 详细信息

【目的】分析杉木单木枯损率与初植密度、竞争和气候因子的关系,为杉木科学经营管理提供决策依据。【方法】以江西杉木密度试验林为研究对象,选取常用的logit、probit和cloglog 3种二分类变量数据结构模型构建杉木单木枯损率基础模型,并进行选择。以选择出的最优模型为基础,引入样地和样木的随机效应构建杉木单木枯损率混合效应模型。【结果】logit模型的AIC值最小(4 700.419),probit模型次之,cloglog模型最差。考虑样地和样木两水平随机效应的混合效应模型模拟精度最高,其AUC值为0.966 8。初植密度、林分优势高越大,杉木单木枯损率越高;相对直径d/D_g越大,杉木单木枯损率越低;气候越干旱,杉木单木枯损率越高;温度升高,杉木单木枯损率减小。【结论】考虑样地和样木两水平的logit模型能够较好分析杉木单木枯损率与初植密度、竞争、立地和气候因子的关系,并且随着气候干旱发生,杉木单木枯损率提高。

关键词：单木枯损率杉木连接模型初植密度气候变量竞争

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