检索结果-内蒙古大学图书馆

林业科学 2017年第8期53卷 54-63页

作者：王圣洁王胜坤林彩丽于少帅汪来发朴春根郭民伟田国忠中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室北京100091 中国林业科学研究院热带林业研究所广州510520

【目的】建立一种能够特异性检测和鉴定16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,实现16SrⅠ组植原体的快速检测。【方法】以植原体tuf基因作为靶标,通过序列比对,设计多组具有特异性的LAMP引物组,筛选出一套适用于16SrⅠ组植原体的特异性... 详细信息

【目的】建立一种能够特异性检测和鉴定16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,实现16SrⅠ组植原体的快速检测。【方法】以植原体tuf基因作为靶标,通过序列比对,设计多组具有特异性的LAMP引物组,筛选出一套适用于16SrⅠ组植原体的特异性检测体系。以16SrⅡ组、16SrⅤ组、16SrⅩⅨ组植原体样品按照此检测体系进行反应,来验证其特异性;同时将稀释后的感病组织样品同步进行PCR和LAMP检测,以确定其检测灵敏度。对来自不同省市的6份田间样品以及9份组培样品进行检测,以验证其检测的稳定性。【结果】16SrⅠ-LAMP在恒温63℃条件下40 min内完成扩增,能检测5种分别引起泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑树萎缩、莴苣黄化和长春花绿变病的16SrⅠ组植原体,不能检测其他组植原体包括16SrⅡ组的花生丛枝、甘薯丛枝、臭矢菜丛枝、16SrⅤ组的枣疯病、红花槐丛枝、樱桃致死黄化和16SrⅩⅨ组的板栗黄化皱缩植原体。通过在反应液中加入钙黄绿素肉眼判断绿色为阳性结果,褐色为阴性结果,与用荧光定量设备进行判读扩增曲线的结果一致。相比于PCR检测,16SrⅠ-LAMP检测的灵敏度提高了8倍;16SrⅠ-LAMP能够快速检测出来自不同区域的田间泡桐发病样品、感病泡桐组培苗和嫁接传病脱毒苗。【结论】以tuf基因作为靶标,建立能同时检测5种16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,具有高效、特异、操作简便、检测时间短及成本较低等优点,适合于基层和现场检测。

关键词：植原体环介导恒温扩增 tuf基因快速检测

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火力楠转录组测序与组织差异表达基因分析

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分子植物育种 2017年第11期15卷 4396-4404页

作者：李清莹仲崇禄姜清彬张勇陈羽魏永成陈珍中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广州510520

火力楠具有重要经济价值与生态功能,但缺乏其基因组信息,限制了其分子生物学、基因功能与分子育种的相关研究。以火力楠根、茎和叶为材料,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,并对得到的测序数据进行de novo组装,获得97 503条Uni... 详细信息

火力楠具有重要经济价值与生态功能,但缺乏其基因组信息,限制了其分子生物学、基因功能与分子育种的相关研究。以火力楠根、茎和叶为材料,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,并对得到的测序数据进行de novo组装,获得97 503条Unigenes,N50为1 010 bp、平均长度852 bp。与公共数据库进行比对,注释到NR、Swiss-Prot数据库的Unigenes分别为60 926、44 249条。将Unigenes与COG数据库比对,有42 344条Unigenes成功注释,根据功能大致分成25类;与GO数据库比对,有15 947条Unigenes获得注释,按功能可分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类55亚类,其中参与的生物学过程较多;以KEGG数据库参考,有26 267条Unigenes参与330条代谢途径分支,以代谢相关的途径较为集中;差异基因表达分析我们得出,根与茎的差异表达基因为2 826个,根与叶之间的差异表达基因为3 230个,这两组差异基因相对校多,除此之外茎与叶差异基因相对较少;差异基因的GO分类、GO富集以及pathway富集分析表明,主要在细胞组分、蛋白质活性、生物合成以及代谢过程等所占比例较高。这些研究结果极大地扩充了火力楠的基因资源,将有助于火力楠基因的发掘与利用、分子标记的开发及其种质资源遗传改良的研究等。

关键词：火力楠转录组 Illumina高通量测序基因注释差异表达基因

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林冠受损对小坑林场土壤固碳微生物群落结构的影响

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微生物学通报 2017年第10期44卷 2297-2306页

作者：禹飞梁俊峰史静龙王胜坤陆俊锟中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广东广州510520

【目的】以典型南亚热带常绿阔叶林小坑林场土壤为研究对象,模拟2008年冰雪灾害对森林造成的损伤设置实验,分析不同林冠开度和凋落物输入量对土壤固碳微生物群落结构的影响。【方法】试验设置对照(CN)、损伤处理+移除处理枝叶(TR)、损... 详细信息

【目的】以典型南亚热带常绿阔叶林小坑林场土壤为研究对象,模拟2008年冰雪灾害对森林造成的损伤设置实验,分析不同林冠开度和凋落物输入量对土壤固碳微生物群落结构的影响。【方法】试验设置对照(CN)、损伤处理+移除处理枝叶(TR)、损伤处理+保留处理枝叶(TD)、未处理+添加处理枝叶(UD)4个处理,受损处理一年后,采用MiSeq高通量测序技术对土壤固碳微生物的功能基因cbbL进行测序分析。【结果】通过生物信息学及统计学分析表明,森林林冠损伤后林冠开度和凋落物输入量增加,导致土壤固碳微生物种群数量降低,多样性增加,群落结构也受到影响,亚硝化螺菌属(Nitrosospira)明显增加,成为优势种群,而原来的优势菌群慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)明显减少。主成分分析(PCA)表明,与对照相比,其他3个样地的土壤固碳微生物结构均发生明显改变。【结论】模拟林冠损伤处理一年后,凋落物的大量骤然输入和林冠开度增大提高了土壤固碳微生物群落多样性,但降低了其种群数量,影响了土壤固碳微生物群落结构,这为进一步的研究提供了依据。

关键词： cbbL基因凋落物输入量固碳微生物林冠开度群落结构

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不同立地条件下杉木人工林材种结构间伐效应的长期定位研究

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安徽农业大学学报 2018年第3期45卷 444-449页

作者：杨桂娟段爱国邓伦秀孙建军相聪伟张建国中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京100091 贵州省林业科学研究院贵阳550011 中国林业科学研究院亚热带林业实验中心分宜336600

采用江西大岗山27年生不同间伐处理杉木人工林定位观测数据,研究了杉木林分活立木规格材材种结构间伐动态效应,得到3点主要结论:(1)不同间伐强度林分活立木规格材出材率随间伐强度和立地指数级的增大而增大;(2)林龄27年时,16立地指数级... 详细信息

采用江西大岗山27年生不同间伐处理杉木人工林定位观测数据,研究了杉木林分活立木规格材材种结构间伐动态效应,得到3点主要结论:(1)不同间伐强度林分活立木规格材出材率随间伐强度和立地指数级的增大而增大;(2)林龄27年时,16立地指数级强度与中度间伐时大径材出材率较大,表现为中度间伐>强度间伐>对照>弱度间伐,分别为19.0%、17.1%、2.2%和1.8%,出材量分别为56.376、44.239、6.832和6.325 m^3·hm^(-2);中径材出材率表现为对照>强度间伐>中度间伐>弱度间伐,分别为47.3%、42.3%、41.6%、24.2%,出材量分别为146.928、123.783、105.196和85.408 m^3·hm^(-2);小径材出材率为弱度间伐>对照>中度间伐>强度间伐,分别为48.4%、25.9%、18.8%和17.8%,出材量分别为171.099、80.561、52.837和47.121 m^3·hm^(-2);(3)立地条件是杉木大径材培育的限制因子,而间伐可有效调控规格材出材比例,并提高规格材出材率。

关键词：杉木材种结构间伐强度立地指数林龄

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山核桃不同无性系脂肪酸及氨基酸组成分析

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中南林业科技大学学报 2018年第4期38卷 20-26页

作者：常君任华东姚小华王开良滕建华周建光周燕傅国林中国林业科学研究院亚热带林业研究所浙江省林木育种技术研究重点实验室浙江富阳311400 浙江省金华市婺城区东方红林场浙江金华321000 建德市林业局浙江建德311600

采用国家标准、方差分析、多重比较等方法对山核桃无性系测定试验林11个无性系粗脂肪、蛋白质含量及脂肪酸和氨基酸组成进行了分析。结果表明:山核桃种仁富含脂肪(52.64%~58.51%)、蛋白质(55.07~65.50 mg·g^(-1))和氨基酸(49.41~65... 详细信息

采用国家标准、方差分析、多重比较等方法对山核桃无性系测定试验林11个无性系粗脂肪、蛋白质含量及脂肪酸和氨基酸组成进行了分析。结果表明:山核桃种仁富含脂肪(52.64%~58.51%)、蛋白质(55.07~65.50 mg·g^(-1))和氨基酸(49.41~65.23 mg·g^(-1));山核桃种仁脂肪酸主要由棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、亚麻酸、顺-11-二十碳烯酸和棕榈烯酸组成,其中棕榈酸和顺-11-二十碳烯酸在无性系间表现出极显著差异,山核桃种仁脂肪酸以不饱和脂肪酸为主,其含量为92.53%~92.90%;山核桃不同无性系呈味氨基酸含量和比例也表现出极显著差异。基于山核桃营养成分特点,综合筛选出大源2号和大源4号2个无性系不仅在油用资源开发利用上有极高的开发利用前景,还可作为优质果用无性系进一步开发利用。

关键词：山核桃无性系脂肪酸氨基酸

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KingFisher Flex核酸纯化系统上树木叶片DNA的提取方法

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分子植物育种 2017年第5期15卷 1854-1861页

作者：杨合宇李发根翁启杰李梅陈升侃姬红霞周长品甘四明中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室北京100093 中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广州510520

以桉树4种/杂种的叶片为材料,比较了5种磁珠试剂盒在King Fisher Flex核酸纯化系统上自动提取的DNA得率和纯度,初步选出了2种较好的试剂盒。比较了King Fisher Flex上不同的洗涤速度,最优为Medium。初选的2种试剂盒所提的DNA均可有效用... 详细信息

以桉树4种/杂种的叶片为材料,比较了5种磁珠试剂盒在King Fisher Flex核酸纯化系统上自动提取的DNA得率和纯度,初步选出了2种较好的试剂盒。比较了King Fisher Flex上不同的洗涤速度,最优为Medium。初选的2种试剂盒所提的DNA均可有效用于PCR扩增,表明DNA纯度均较好,确定得率最高的为最优试剂盒。对比手动的改良CTAB法(DNA得率19.0μg/g,OD_(260)/OD_(280)为1.97,OD_(260)/OD_(230)为2.03),本研究优化的方法可显著提高DNA得率(103.6μg/g)且DNA纯度相似(OD_(260)/OD_(280)为1.93,OD_(260)/OD_(230)为1.89)。优化的方法可有效用于马占相思、银中杨、降香黄檀、思茅松、马尾松和短枝木麻黄叶片的DNA提取。这对树木分子生物学研究的高通量DNA提取有重要的应用价值,对非木本植物的DNA提取和其他基于磁珠法的纯化系统亦可提供有益的方法参考。

关键词：树木 DNA提取 KingFisher Flex

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火力楠混交林早期生长效果分析

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林业与环境科学 2018年第4期34卷 54-57页

作者：苏棣坤李保军袁俊陈伟俊姜清彬广东省云浮林场广东云浮527400 中国林业科学研究院热带林业研究所/热带林业研究国家林业局重点实验室广东广州510520 广东省龙眼洞林场广东广州510520

为探讨并了解火力楠(Michelia macclurei)混交造林的生长效果,通过开展火力楠与灰木莲(Manglietia conifera)、湿加松(Pinus elliottii×***)混交种植试验,对3个树种混交林和纯林的树高和胸径进行调查,并计算3.5 a生时的材积和蓄积... 详细信息

为探讨并了解火力楠(Michelia macclurei)混交造林的生长效果,通过开展火力楠与灰木莲(Manglietia conifera)、湿加松(Pinus elliottii×***)混交种植试验,对3个树种混交林和纯林的树高和胸径进行调查,并计算3.5 a生时的材积和蓄积量,进行数据分析,结果表明:混交造林1.5 a时,仅火力楠与湿加松混交时,火力楠胸径显著高于纯林,其余均无差异;但3.5 a生时,混交林中的灰木莲、湿加松的生长、材积和蓄积量显著高于各自纯林,而混交林中火力楠生长状况低于其纯林。由此可知,灰木莲、湿加松与火力楠混交能显著提高自身林分生长,火力楠作为伴生树种在今后的混交造林中具有较大推广价值。

关键词：火力楠灰木莲湿加松混交林早期生长

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广州市帽峰山森林公园动植物多样性资源监测概况

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生态科学 2018年第5期37卷 191-194页

作者：裴男才陈步峰史欣中国林业科学研究院热带林业研究所广东珠江三角洲森林生态系统国家定位观测研究站/热带林业研究国家林业局重点实验室广州510520

珠江三角洲地区是我国城市化水平最为发达的三大城市群之一。为了更好地掌握该区域的生物多样性资源和生态环境质量等基本特征,建立起广东珠江三角洲森林生态系统国家定位观测研究站,研究区域涉及广州(主站点为帽峰山)、佛山、中山、肇... 详细信息

珠江三角洲地区是我国城市化水平最为发达的三大城市群之一。为了更好地掌握该区域的生物多样性资源和生态环境质量等基本特征,建立起广东珠江三角洲森林生态系统国家定位观测研究站,研究区域涉及广州(主站点为帽峰山)、佛山、中山、肇庆等地,也是中国森林生态系统研究网络的重要成员(CFERN;http://***/***)。该文较为全面地梳理了近15年来以广州市帽峰山森林公园为研究对象的各类公开发表文献,主要是生物基本要素(植物多样性、群落和景观多样性、鸟类多样性等);生物多样性资源监测结果可为相关研究和管理工作提供参考。

关键词：城市林业森林生物学中国森林生态系统监测网络珠江三角洲

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滇南亚高山巨桉种源/家系变异及早期选择研究

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热带亚热带植物学报 2017年第3期25卷 257-263页

作者：吴世军陈广超徐建民李光友粟国磊罗成学周兴荣姜成中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广州510520 云南云景林业开发有限公司云南景谷666499

为筛选滇南亚高山的巨桉(Eucalyptus grandis)优良品系,对53月生的巨桉11种源173家系的生长性状进行分析。结果表明,所有生长性状在种源和家系间均呈极显著差异;胸径、树高、单株材积、干形、分枝和冠幅的表型和遗传变异系数分别为26.90... 详细信息

为筛选滇南亚高山的巨桉(Eucalyptus grandis)优良品系,对53月生的巨桉11种源173家系的生长性状进行分析。结果表明,所有生长性状在种源和家系间均呈极显著差异;胸径、树高、单株材积、干形、分枝和冠幅的表型和遗传变异系数分别为26.90%~28.84%、23.84%~25.28%、62.34~67.55、13.04%~25.62%、13.04%~25.41%和35.07~39.93,各性状种源遗传力为0.94~0.96,家系遗传力为0.88~0.95。相关分析表明,胸径与树高、单株材积、干形和冠幅呈极显著正相关,树高与其他性状均呈极显著正相关关系,干形与分枝的相关系数为0.70,冠幅与干形和分枝均呈负相关关系(r2=-0.03)。单株材积的遗传增益始终最大,以5%为入选率时,遗传增益高达66.11%;入选率不同,胸径与树高、干形与分枝的遗传增益的变化趋势基本相同,但不同性状的遗传增益值的排序发生变化。以10%为入选率,经综合指数选择有17个家系入选,均来自1号(昆士兰Copperlode)、4号(昆士兰Koombooloomba)、6号(昆士兰Copperlode Falls Dam)、7号(昆士兰Bambaroo)、9号(福建天马东溪)和11号(四川乐山)种源,2号(昆士兰Ravenshoe)和8号(昆士兰Tully Gorge National Park)种源表现最差,排前6名的家系为289号、283号、2号、42号、121号和82号,也分别分布在入选种源中,说明入选家系不仅生长优良而且遗传多样性比较丰富。

关键词：巨桉生长性状形质性状遗传力

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中国不同地区泡桐越冬休眠枝的植原体检测和组织培养研究

中国不同地区泡桐越冬休眠枝的植原体检测和组织培养研究

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中国植物病理学会第十一届全国会员代表大会暨2018年学术年会

作者：孔德治田国忠张文鑫于少帅王圣洁宋传生林彩丽中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所/国家林业局森林保护学重点实验室中国林业科学研究院热带林业研究所菏泽学院

泡桐(Paulownia spp.)是我国重要的速生用材树种,其自然分布范围较广,横跨亚热带与暖温带地区,涵盖了9个种、变种及丰富的遗传变异类型。而由植原体引起的泡桐丛枝病是危害泡桐的主要病害之一。前期的研究检测到不同地区发病泡桐体内的... 详细信息

泡桐(Paulownia spp.)是我国重要的速生用材树种,其自然分布范围较广,横跨亚热带与暖温带地区,涵盖了9个种、变种及丰富的遗传变异类型。而由植原体引起的泡桐丛枝病是危害泡桐的主要病害之一。前期的研究检测到不同地区发病泡桐体内的植原体株系之间存在着明显的分子变异,但尚不清楚这些遗传变异是否与病害发生与流行相关。本研究通过对不同株系、生境的发病泡桐越冬枝条外植体的组织培养获得不同遗传背景的植原体一寄主共生体,旨在阐明泡桐丛枝植原体不同株系间的致病性变异及其与寄主的互作关系。本研究分别从福建、四川、浙江、江苏、山西、陕西以及北京等地调查采集到不同品种的感病泡桐越冬休眠枝,进行室内水培试验,然后用水培萌发的嫩枝芽作为外植体进行组织培养。同时以新鲜叶片提取的总DNA为模板,进行植原体16S rDNA的直接PCR、巢式PCR和tuf-LAMP检测。结果显示:中国不同地区泡桐丛枝病发生程度差异很大,其中华北和黄淮海地区危害较重,南方地区危害较轻。各地采集的越冬存活病枝大多能水培萌芽,且部分病枝萌条即表现小叶和腋芽萌生等病状。对新鲜叶片样品提取的DNA采用常规的直接PCR检测,其产物均未检测到植原体的存在,而巢式PCR检测到部分样品植原体的繁殖;以本实验室建立的16SrⅠ-LAMP检测方法,同样检测到部分样品植原体的繁殖,进一步验证了巢式PCR检测结果。以休眠枝萌条和直接采自野外发病新鲜枝条作为外植体分别进行组织培养,发现来源于休眠枝萌条外植体的组培污染程度较轻,易于组培成功;根据外植体组培实验观察记录发现,升汞消毒时间控制在8～10min为宜。现已成功获得的福建、四川、江苏三省的泡桐带毒外植体组培苗中,部分组培苗已表现出植原体感染的典型丛枝、小叶症状。根据本研究初步推断我国不同株系、生境的泡桐丛枝植原体都能够在树枝部顺利越冬存活,次年随嫩枝萌芽而运转繁殖致病,而不必运转至地下根部越冬。为下一步对不同菌株组培苗的致病性的差异研究奠定基础。

关键词：泡桐丛枝病植原体 16S rDNA 休眠枝组织培养 LAMP检测

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