检索结果-内蒙古大学图书馆

第二届全国计算生物学与生物信息学学术会议

作者：闫鹏程曾艳飞陈禹保北京市计算中心北京云计算关键技术与应用北京市重点实验室 100094 北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京 100091

高通量的转录组测序(RNA-seq)在模式和非模式物种的研究中已开始得到广泛应用。然而，在没有参考基因组序列的情况下，将海量的转录组短序列组装成正确的基因集面临很大困难。如今，已经出现不少针对转录组组装的工具。本研究利用实验... 详细信息

高通量的转录组测序(RNA-seq)在模式和非模式物种的研究中已开始得到广泛应用。然而，在没有参考基因组序列的情况下，将海量的转录组短序列组装成正确的基因集面临很大困难。如今，已经出现不少针对转录组组装的工具。本研究利用实验数据的分析对4种应用较多的组装软件进行了系统的比较，在准确性，易用性和计算资源消耗等几个方面进行了评价。比较发现：这4种软件对计算资源的消耗都比较高，计算时间较长，计算过程复杂不易使用。综合评估可以看出Trinity在转录组从头组装结果方面表现突出。

关键词：高通量测序从头组装转录组测序

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盐胁迫对柳树新品系的抗氧化酶活性及过氧化物含量的影响

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种子 2014年第10期33卷 20-23页

作者：刘铎丛日春党宏忠李庆梅刘艳巩云峰中国林业科学研究院荒漠化研究所北京100091 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京100091

以3种新培育的柳树新品系当年生种条为试验材料,研究在不同NaCl浓度盐水(0 mmol/L、25 mmol/L、50 mmol/L、100 mmol/L、150 mmol/L、200 mmol/L)灌溉胁迫20 d后,柳树叶片的抗氧化酶活性及过氧化物含量变化。结果表明:3种柳树的SOD活性... 详细信息

以3种新培育的柳树新品系当年生种条为试验材料,研究在不同NaCl浓度盐水(0 mmol/L、25 mmol/L、50 mmol/L、100 mmol/L、150 mmol/L、200 mmol/L)灌溉胁迫20 d后,柳树叶片的抗氧化酶活性及过氧化物含量变化。结果表明:3种柳树的SOD活性变化数盐柳1号变化最大,随着盐浓度的增大而增大,最高值为对照的1.54倍,而其它2种柳树均随着盐浓度的增大呈先升后降的变化趋势,渤海1号与渤海5号的最大值分别出现在盐浓度为150 mmol/L和100 mmol/L时,分别为对照的1.33倍和1.09倍。POD活性随着盐浓度增加呈先升后降的变化趋势,以盐柳1号的变化幅度最大,最高峰值为对照的2.14倍;CAT活性随着盐浓度增加呈先升后降的变化趋势,以渤海5号变化幅度最大,为对照的1.94倍,但是盐柳1号的活性最大。MDA含量随着盐浓度增加呈缓慢下降而又迅速升高的变化趋势,以盐柳1号在高盐浓度下MDA含量最少。从以上反应变化的趋势上看,3种耐盐柳树中盐柳1号耐盐性最好。

关键词：柳树盐胁迫抗氧化酶过氧化物

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青藏高原16个灌木树种苗期生长特性研究

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西北林学院学报 2014年第5期29卷 7-11页

作者：杜坤王军辉贾子瑞张会军甘肃小陇山林业科学研究所甘肃天水741022 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京100091

以青藏高原16个灌木树种的苗木为研究对象,用固定样株定期观测的方法,观测苗高生长节律,建立苗高生长的Logistic曲线方程,并结合观测时段内的气象资料计算出进入速生期的日最低气温阈值。结果表明:16个灌木树种的苗高生长期、速生期、... 详细信息

以青藏高原16个灌木树种的苗木为研究对象,用固定样株定期观测的方法,观测苗高生长节律,建立苗高生长的Logistic曲线方程,并结合观测时段内的气象资料计算出进入速生期的日最低气温阈值。结果表明:16个灌木树种的苗高生长期、速生期、进入速生期的日最低气温阈值分别为:红砂111d、42d、12.5℃;黄花木121d、71d、14.7℃;沙棘121d、60d、12.5℃;驼绒藜127d、49d、12.5℃;唐古特莸129d、62d、17.1℃;梭梭130d、36d、11.7℃;鲜卑花133d、36d、13.0℃;山蚂蝗133d、45d、13.2℃;砂生槐134d、55d、17.1℃;白刺花137d、71d、17.1℃;金露梅137d、57d、14.3℃;霸王137d、59d、11.2℃;江孜沙棘152d、57d、17.0℃;尼泊尔锦鸡儿155d、56d、13.5℃;云南沙棘159d、52d、14.0℃;锦鸡儿169d、68d、12.5℃。依据生长期和进入速生期的日最低气温阈值提出短生长期和低阈值的红砂、霸王和梭梭可用于寒冷干旱的荒漠或半荒漠区的生态恢复;中等生长期和中等阈值沙棘、驼绒藜、鲜卑花,山蚂蝗,金露梅,黄花木可用于温凉干旱气候的生态恢复;长生长期或高阈值的江孜沙棘,唐古特莸、锦鸡儿、尼泊尔锦鸡儿、云南沙棘、白刺花和砂生槐则适宜于温凉干燥气候的生态恢复。

关键词： Logistic曲线方程生长期速生期日最低气温阈值

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川西云杉家系苗期性状遗传通径分析及综合选择

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东北林业大学学报 2014年第7期42卷 20-23页

作者：宋璐齐德新马建伟安三平王丽芳王军辉甘肃农业大学兰州730030 云南迪庆州香格里拉县林业局甘肃省小陇山林业实验局林业科学研究所国家林业局林木培育重点实验室(中国林业科学研究院林业研究所)

以61个川西云杉（Picea balfouriana）家系为研究对象,对各家系的2年生实生苗的苗高、地径、侧枝数、根系长和干质量5个生长性状进行了遗传分析和通径分析,并采用综合选择指数法评选优良家系。结果表明：川西云杉各性状在家系间存在极... 详细信息

以61个川西云杉（Picea balfouriana）家系为研究对象,对各家系的2年生实生苗的苗高、地径、侧枝数、根系长和干质量5个生长性状进行了遗传分析和通径分析,并采用综合选择指数法评选优良家系。结果表明：川西云杉各性状在家系间存在极显著差异（P〈0.01）,干质量的遗传变异系数最大,根系长最小,苗高、干质量的遗传力最大,地径的遗传力最小;地径对苗高的直接贡献最大,根系长通过地径对苗高的间接作用最大。通过综合选择指数法,评选出6个优良家系,这些家系的苗高实际增益为15.74%-65.95%,遗传增益为12.44%-52.13%。

关键词：川西云杉家系遗传变异通径分析

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砂生槐天然群体种实性状的表型多样性

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林业科学 2014年第4期50卷 137-143页

作者：林玲王军辉罗建陈帅西藏农牧学院资源与环境学院林芝860000 中国林业科学研究院林业研究所、国家林业局林木培育重点实验室北京100091 西藏高原生态研究所林芝860000

砂生槐（Sophora moorcroftiana）是豆科（Leguminosae）槐属落叶矮灌木,西藏高原特有植物种（吴征镒,1985;中国植物志编辑委员会,1994）。其主要分布于雅鲁藏布江流域海拔2 800～4 500 m的山坡、河谷沙地和阶地,是该流域干旱河谷耐旱... 详细信息

砂生槐（Sophora moorcroftiana）是豆科（Leguminosae）槐属落叶矮灌木,西藏高原特有植物种（吴征镒,1985;中国植物志编辑委员会,1994）。其主要分布于雅鲁藏布江流域海拔2 800～4 500 m的山坡、河谷沙地和阶地,是该流域干旱河谷耐旱灌丛的主要建群植物.

关键词：砂生槐天然群体种实性状表型多样性

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杨树新杂种无性系生长与材性的联合选择

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东北林业大学学报 2014年第2期42卷 10-13,16页

作者：于东阳梅芳王军辉朱景乐王金生三峡大学宜昌443002 国家林业局林木培育重点实验室(中国林业科学研究院林业研究所) 中国林业科学研究院经济林研究开发中心青海省农林科学院

以青海省西宁市湟水林场9年生10个杨树新杂种无性系为材料，对生长和材性等9个性状进行了方差分析和遗传参数估算。研究结果表明，树高、胸径、材积、Pilodyn值、南向外侧基本密度、整株木材基本密度、纤维长度、纤维宽度、纤维长宽比... 详细信息

以青海省西宁市湟水林场9年生10个杨树新杂种无性系为材料，对生长和材性等9个性状进行了方差分析和遗传参数估算。研究结果表明，树高、胸径、材积、Pilodyn值、南向外侧基本密度、整株木材基本密度、纤维长度、纤维宽度、纤维长宽比在无性系间存在极显著或显著差异。无性系8-25的材积最高，为0．213 m3；8-24的最低，为8-25的14．5％。各性状的重复力在0．711～0．977，其中树高重复力最高，为0．977，纤维长度的最低，为0．711，胸径和材积的均高于0．900。 Pilodyn测定结果与木材密度的相关分析结果表明无性系Pilodyn平均值、南向外侧木材基本密度平均值和整株木材基本密度平均值间存在极显著的相关关系，相关系数为-0．846～0．981。胸径与树高、材积、南向外侧木材基本密度单株间存在极显著和显著的相关关系，相关系数分别为0．852、0．962和0．462。通过对10个无性系生长和材性之间的相关分析，发现杨树新杂种无性系胸径、材积、纤维长与南向外侧整株木材密度显著相关；参试无性系与对照北京杨和青杨比较，杂种无性系都超过青杨对照，有两个超过了北京杨，整株木材密度与对照相近，差异不显著。利用多性状主成分分析，选出8-6、8-16、8-25综合性状表现优良的无性系，其中8-25生长最好，胸径分别是对照青杨、北京杨的1．14、1．61倍，单株材积分别是对照青杨、北京杨的1．80、5．76倍。

关键词：杨树杂种无性系遗传分析联合选择

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杨树新品种‘渤丰1号’杨和‘渤丰2号’杨的综合评价

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林业科学 2014年第5期50卷 75-81页

作者：黄秦军苏晓华王胜东蔄胜军杨志岩沈应柏中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京100091 辽宁省杨树研究所盖州115200 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

以60个黑杨杂种候选新品系为试验材料,108杨为对照,在北京进行苗期测定,辽宁凌海,山东诸城、鄄城、宁阳、莒县等地多点田间测试,结合抗病性、木材品质、纸浆造纸性能和养分利用效率等性状的综合评价,最终获得‘渤丰1号’杨和‘渤丰2号’... 详细信息

以60个黑杨杂种候选新品系为试验材料,108杨为对照,在北京进行苗期测定,辽宁凌海,山东诸城、鄄城、宁阳、莒县等地多点田间测试,结合抗病性、木材品质、纸浆造纸性能和养分利用效率等性状的综合评价,最终获得‘渤丰1号’杨和‘渤丰2号’杨2个优良纸浆材良种。在辽宁凌海,6年生‘渤丰1号’杨平均单株材积达0.348 7 m3,"渤丰2号"杨平均单株材积达0.323 9 m3,分别超过108杨(0.282 3 m3)23.52%和14.73%。同时该品种还具有抗病能力强、材质优良、氮素养分利用高效、适应性广等特点,是适合于我国环渤海湾区域内推广应用的高效高产优质欧美杨优良纸浆材新品种。

关键词：杨树高产纸浆材综合评价

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梓树属不同种种子发芽条件研究

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种子 2014年第1期33卷 68-71,74页

作者：韩云花王军辉李平英于永明魏秀琴陈静甘肃省小陇山林业科学研究所甘肃天水741022 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京100091

研究了紫葳科(Bignoniaceae)梓树属(Catalpa Scop)中楸树(*** ***)、灰楸(*** Bureau)及国外引进的紫葳楸(***)、黄金树(***)4个种种子的表型性状和发芽特性,测定了种子的千粒重、长度、宽度、长宽比等表型性状及发芽率、发芽势、发芽... 详细信息

研究了紫葳科(Bignoniaceae)梓树属(Catalpa Scop)中楸树(*** ***)、灰楸(*** Bureau)及国外引进的紫葳楸(***)、黄金树(***)4个种种子的表型性状和发芽特性,测定了种子的千粒重、长度、宽度、长宽比等表型性状及发芽率、发芽势、发芽指数等发芽特性,并比较浸种时间(6、12、24、48 h)和温度、光照时间(30℃光照8 h/20℃黑暗16 h,25℃、20℃光照8 h/20℃黑暗16 h),冷藏处理(4℃冷藏0、7、14 d)对种子发芽的影响。结果表明,梓树属不同种间种子表型性状差异极显著;不同温度处理条件下梓树属种子都能萌发,但在30℃/8 h,20℃/16 h的变温培养条件下楸树种子萌发率最高,为1。灰楸种子萌发需要较低温度,在20℃/24 h培养条件下种子发芽率最高,为1;浸种时间对梓树属种子发芽率有极显著或显著影响:楸树种子浸种6 h的发芽率显著低于浸种12、24、48 h的发芽率,延长浸种时间有利于楸树种子萌发;灰楸种子浸种12、48 h,发芽率显著高于浸种6、24 h的发芽率,表明灰楸种子吸水是间断性的。紫葳楸浸种12 h发芽率最高,浸种24、48 h可显著提高种子发芽势、发芽指数。浸种时间对黄金树种子的发芽率无显著影响;灰楸、楸树种子4℃冷藏14 d,可显著提高发芽率、发芽势,对楸树发芽指数有极显著促进作用。

关键词：梓树属种种子发芽条件

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基于B/S结构的胡杨转化基因组数据库管理信息系统研建分析

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林业资源管理 2014年第4期 125-130页

作者：石焱梁宝君周婧陈加飞戴慧国家林业局管理干部学院中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室

基于B/S体系三层结构实现了胡杨转化基因组数据库管理系统,系统使用SQL数据库提供基因数据管理和查询功能。数据库管理采用在线方式及时、有效地管理数据库。对实现分子育种方法,培育高抗、优质林木新品种提供数据管理,可为研究人员提... 详细信息

基于B/S体系三层结构实现了胡杨转化基因组数据库管理系统,系统使用SQL数据库提供基因数据管理和查询功能。数据库管理采用在线方式及时、有效地管理数据库。对实现分子育种方法,培育高抗、优质林木新品种提供数据管理,可为研究人员提供信息服务,并对相关数据库的建设有借鉴作用。

关键词：胡杨转化基因组数据库 B/S体系信息管理

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青藏高原20种灌木抗旱形态和生理特征

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植物生态学报 2014年第6期38卷 562-575页

作者：邱权潘昕李吉跃王军辉马建伟杜坤华南农业大学林学院广州510642 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京100091 甘肃省小陇山林业科学研究所甘肃天水741022

该研究以青藏高原地区采集的柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)等20种灌木树种为研究对象,将其二年生幼苗移栽至苗圃培育,通过田间试验测定三年生苗木生物量根冠比(RSR)、叶片蒸腾速率(Tr)、瞬时水分利用效率(WUEi)、稳定碳同位素组成(... 详细信息

该研究以青藏高原地区采集的柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)等20种灌木树种为研究对象,将其二年生幼苗移栽至苗圃培育,通过田间试验测定三年生苗木生物量根冠比(RSR)、叶片蒸腾速率(Tr)、瞬时水分利用效率(WUEi)、稳定碳同位素组成(δ13C)、叶片解剖结构特征和根系特征(长度、表面积、体积和根尖数)指标,综合分析其抗旱性能差异,为青藏高原干旱地区灌木树种抗逆性(耐旱)评价指标的建立、优良抗逆性树种的筛选及各种灌木树种的合理立地配置提供必要的理论依据。研究结果表明:所选20种灌木为适应长期的干旱逆境,不同植物种具有不同的抗旱策略。研究中将灌木抗旱机制划分为6个类型:根系特征抗旱型、叶片旱生结构型、叶片旱生形态型、生物量分配型、节水型、高水分利用效率型。不同属和同属不同种灌木抗旱性有所差异,沙棘属(Hippophae)植物总体抗旱性不佳,而金露梅(Potentilla fruticosa)、豪猪刺(Berberis julianae)、树锦鸡儿(Caragana arborescens)、绣线菊(Spiraea salicifolia)和蒙古沙棘(Hippophae rhamnoides ***)综合抗旱性能较好,总体上属于根系和叶片抗旱特征明显、低耗水、高生产效率的抗旱性强树种,可以在青藏高原地区植被恢复树种筛选时优先考虑。根系特征值之间存在极显著正相关关系,叶片结构特征指标之间也存在不同程度的相关关系,但RSR、T3r、WUEi和δ1C与根系特征值和叶片解剖结构特征指标之间总体上相关性不显著。主成分分析结果显示灌木全根和细根的长度、表面积、体积、根尖数和叶片栅栏组织厚度、海绵组织厚度、瞬时水分利用效率因子载荷较高,能较好地反映青藏高原灌木树种抗旱性差异相关信息。此外,灌木树种原产地与抗旱性也存在一定的联系,青海西宁地区采集的灌木树种总体抗旱性优于甘肃天水和西藏拉萨地区。

关键词：根系特征抗旱性叶片解剖结构青藏高原灌木

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