本研究利用线粒体COI基因片段序列分析比较了尼罗罗非鱼(Oreochromis. niloticus)、奥利亚罗非鱼(O. aureus)、莫桑比克罗非鱼(O. mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT strain of O. niloticus)及3种红罗非鱼品系(Oeochromis ssp.)(台湾红罗...
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本研究利用线粒体COI基因片段序列分析比较了尼罗罗非鱼(Oreochromis. niloticus)、奥利亚罗非鱼(O. aureus)、莫桑比克罗非鱼(O. mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT strain of O. niloticus)及3种红罗非鱼品系(Oeochromis ssp.)(台湾红罗非鱼、马来西亚红罗非鱼、以色列红罗非鱼)共336个样本的遗传多样性和系统进化关系。实验最终获得了基因序列片段1596bp,多态性位点180个,单倍型98个。在所有的COI序列中,A、T、G和C碱基的平均含量分别为28.7%、28.6%、25.1%和17.6%。7个群体的平均单倍型多样性为0.944,核苷酸多样性为0.036,平均核苷酸差异数为57.35。中性检验显示,尼罗罗非鱼群体达到显著水平(P<0.05),吉富罗非鱼和马来西亚罗非鱼群体达到极显著水平(P<0.01)。两两群体间遗传分化系数Fst分析显示:除了马来西亚红罗非鱼和以色列红罗非鱼群体,其他群体的遗传分化均到达了极显著水平(P<0.01)。基于群体间K2P遗传距离(0.000-0.071)的UPGMA聚类树显示:3种红罗非鱼先聚类,再与吉富罗非鱼和尼罗罗非鱼聚类,最终与莫桑比克罗非鱼和奥利亚罗非鱼依此聚类。AMOVA分析结果显示:所述群体存在显著的遗传变异和分化(P<0.01),主要变异来源于群体间(70.78%)。研究表明:本实验中的奥利亚罗非鱼的遗传多样性最低,其他6种罗非鱼的遗传多样性丰富,可为今后罗非鱼的种质资源利用提供必要的科学依据。
海城碘泡虫原始描述中形态数据较为简单,且存在多个宿主及寄生部位,其有效性有待确定。利用现行主流的黏孢子虫形态特征和基因标记系统分析相结合的分类学方法,对采自太湖棒花鱼鳃丝的海城碘泡虫进行了补充描述。该碘泡虫孢囊呈白色,圆形,大小为(0.6—1.1)mm。成熟孢子正面观近似椭圆形,上端稍尖,侧面观呈纺锤型,孢子长(10.8±0.7)μm(10.1—11.5μm),孢子宽:(8.1±0.5)μm(7.5—9.0μm),孢子厚:(5.7±0.4)μm(5.2—9.0μm);两极囊呈梨形,大小存在细微差别,极囊顶端存在突起,大极囊长:(4.7±0.5)μm(4.8—6.7μm),宽:(2.5±0.2)μm(3.2—4.3μm),小极囊长:(4.4±0.2)μm(4.1—4.8μm),宽:(2.2±0.1)μm(2.0—2.5μm);极丝盘绕4—5圈。基于18S r DNA序列(Gen Bank登录号:KY965936)比对分析,该碘泡虫与放射孢子虫Hexactinomyxon type 2相似率最高,为97%。系统发育分析表明,该碘泡虫与Hexac-caudatus和Myxobolus squamae聚为独立分支,和其他已报道的黏孢子虫亲缘关系较远。研究在补充了海城碘泡虫形态学、基因标记序列信息基础上,推断了该虫生活史。
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