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水产学报 2025年第2期49卷 77-85页

作者：黄光华彭敏杨春玲冯鹏霏曾地刚陈秀荔刘青云李强勇张永德朱威霖郁二蒙赵永贞广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室广西壮族自治区水产科学研究院农业农村部中国(广西)-东盟水产种质资源综合开发与利用重点实验室(部省共建) 广西壮族自治区水产科学研究院广西虾类繁育工程技术研究中心中国水产科学研究院珠江水产研究所

【目的】为了探索罗氏沼虾胚胎发育的分子调控机制。【方法】本研究对罗氏沼虾胚胎的卵裂期Ⅰ、卵裂期Ⅱ、囊胚期、原肠胚期、前无节幼体、无节幼体、前蚤状幼体、蚤状幼体8个发育阶段进行转录组测序。【结果】本研究共得到156.37 Gb cl... 详细信息

【目的】为了探索罗氏沼虾胚胎发育的分子调控机制。【方法】本研究对罗氏沼虾胚胎的卵裂期Ⅰ、卵裂期Ⅱ、囊胚期、原肠胚期、前无节幼体、无节幼体、前蚤状幼体、蚤状幼体8个发育阶段进行转录组测序。【结果】本研究共得到156.37 Gb clean data，预测得到22 964个unigenes。对罗氏沼虾8个不同发育阶段的胚胎样品的unigenes进行两两比较分析，获得各个时期之间的差异表达基因数量为587～8 620。对差异表达基因进行GO富集分析，上调表达基因主要富集在与细胞发育、生长、运动相关的GO功能类别，下调表达基因主要富集在与细胞的翻译调控、趋化、抗氧化、排毒活性相关的GO功能类别。KEEG富集分析发现，差异表达基因的pathway主要富集在与细胞的生长发育以及正常的生理生化过程相关的代谢途径。【结论】本研究获得了罗氏沼虾胚胎的大量转录本信息，发现了与胚胎发育相关的差异表达基因及其主要富集功能和途径，为罗氏沼虾胚胎研究提供了有用的转录组信息资源。

关键词：罗氏沼虾胚胎发育转录组基因表达

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合浦珠母贝表皮生长因子样(EGF-like)基因的克隆与表达分析

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水产学报 2015年第5期39卷 648-657页

作者：朱文杰黄桂菊张东玲范嗣刚刘宝锁毕晓敏喻达辉中国水产科学研究院南海水产种质资源与健康养殖重点实验室中国水产科学研究院农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室中国水产科学研究院南海水产研究所上海海洋大学水产与生命学院集美大学水产学院

为探究表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)在合浦珠母贝幼体发育以及组织生长过程中的作用,实验通过RACE技术克隆了合浦珠母贝EGF-like基因并做了相应的表达分析。实验结果获得c DNA全长序列4 107 bp,命名为Pf-egf1,开放阅读框(... 详细信息

为探究表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)在合浦珠母贝幼体发育以及组织生长过程中的作用,实验通过RACE技术克隆了合浦珠母贝EGF-like基因并做了相应的表达分析。实验结果获得c DNA全长序列4 107 bp,命名为Pf-egf1,开放阅读框(ORF)702 bp,编码234个氨基酸,包含一个信号肽序列和一个跨膜结构域,功能结构域分析发现Pf-egf1具有一个EGF-like结构域,有6个半胱氨酸残基,由3个二硫键维持,是表皮生长因子家族及其相关蛋白的特征结构域,但其余序列与现有相关基因序列差异较大,推测可能是一个新的EGF-like基因。表达结果显示,Pf-egf1 mRNA在合浦珠母贝外套膜、闭壳肌、鳃、肝胰腺、珍珠囊、肠和性腺中均有表达,在肠中的表达显著高于其他组织;在合浦珠母贝幼体发育的担轮期、D型期、壳顶期、眼点期和变态期的表达呈现逐渐升高的趋势,并且其在变态期的表达量极显著地高于其他时期。上述结果表明,Pf-egf1基因可能在合浦珠母贝肠道修复和幼虫变态发育阶段起着重要作用,为进一步开展育珠与生长调控奠定了基础。

关键词：合浦珠母贝表皮生长因子基因克隆表达谱

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凡纳滨对虾-鲻网围分隔混养池塘浮游植物群落结构特征的研究

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南方水产科学 2015年第1期11卷 45-54页

作者：郭永坚朱长波阴晓丽李俊伟颉晓勇陈素文罗昭林中国水产科学研究院南海水产研究所、农业部南海渔业资源开发利用重点实验室、中国水产科学研究院南海水产种质资源与健康养殖重点实验室广东广州510300

在池塘中构建围网研究了凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)单养及对虾-鲻(Mugil cephalus)混养池塘中浮游植物的动态变化特征。围网内鲻放养量依次为0(M0)、250(M 250)、500(M500)和800(M800)尾。结果显示,池塘浮游植物共计7门39属65种... 详细信息

在池塘中构建围网研究了凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)单养及对虾-鲻(Mugil cephalus)混养池塘中浮游植物的动态变化特征。围网内鲻放养量依次为0(M0)、250(M 250)、500(M500)和800(M800)尾。结果显示,池塘浮游植物共计7门39属65种,其中绿藻门最多(21属33种),蓝藻门次之(7属17种),细胞丰度随鲻放养密度的增大而升高,养殖池塘藻类以小球藻为主(50%以上)。养殖末期鲻放养组绿藻丰度普遍高于对照组,蓝藻丰度反之。M250组绿藻丰度最高而蓝藻最低,且与对照组呈显著差异(P<0.05),其多样性指数在养殖末期居各组最高。养殖前中期高密度鲻组(M500、M800)浮游植物藻相较优,后期则以低密度鲻组M250最优。研究表明,虾塘围网混养鲻可有效提高池塘中绿藻密度,降低蓝藻密度,增加浮游植物群落多样性。

关键词：对虾鲻围网混养浮游植物

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基于AFLP的海萝野生群体遗传多样性分析

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中国水产科学 2015年第1期22卷 158-163页

作者：郭奕惠范嗣刚陈素文喻达辉吴进锋陈利雄朱长波郭永坚农业部南海渔业资源开发利用重点实验室、中国水产科学研究院南海水产种质资源与健康养殖重点实验室、南海水产研究所广东广州510300

应用AFLP分子标记技术对广东深圳、汕头和山东长岛的海萝（Gloiopeltis furcata）群体进行遗传多样性分析。应用筛选出的10对多态性丰富的AFLP引物,对这3个地理群体的90个个体进行扩增,共得到427个位点,多态性位点数为392（91.75%）,各... 详细信息

应用AFLP分子标记技术对广东深圳、汕头和山东长岛的海萝（Gloiopeltis furcata）群体进行遗传多样性分析。应用筛选出的10对多态性丰富的AFLP引物,对这3个地理群体的90个个体进行扩增,共得到427个位点,多态性位点数为392（91.75%）,各引物扩增位点数为30~59。长岛群体扩增位点最多,多态性也最高。群体内的等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、遗传多样性指数（H）和Shannon信息指数（I）变化趋势一致,均由高到低依次为长岛群体、汕头群体、深圳群体,表明长岛群体遗传多样性最高。3个海萝群体遗传变异主要来自群体间。群体间的基因流为0.3689,群体分化系数（Gst）为0.5754,表明群体间有高度分化。深圳群体和汕头群体的遗传距离最小（0.1102）,与长岛群体的遗传距离最大（0.3577）。UPGMA聚类分析显示广东深圳和汕头群体聚为一支,山东长岛群体为另一支,表明群体间的遗传差异与地理距离有关。本研究结果为海萝资源的保护与利用提供了基础数据。

关键词： AFLP 海萝遗传多样性地理群体

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合浦珠母贝3个地理群体杂交后代生长性状和闭壳肌拉力的比较分析

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南方水产科学 2015年第1期11卷 26-32页

作者：牛志凯刘宝锁张东玲谭才钢张博陈明强范嗣刚姜松黄桂菊李有宁喻达辉中国水产科学研究院南海水产研究所、中国水产科学研究院南海水产种质资源与健康养殖重点实验室、农业部南海渔业资源开发利用重点实验室广东广州510300 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 集美大学福建厦门361021

利用采自海南三亚(SY)、广东深圳(SZ)和越南(YN)的3个合浦珠母贝(Pinctada fucata)地理群体,按照完全双列杂交构建了9个选育群体。在养殖到20月龄时,从每个群体中随机挑选100个贝,测量4个形态性状(壳长、壳高、壳宽和绞合线长)、4个质... 详细信息

利用采自海南三亚(SY)、广东深圳(SZ)和越南(YN)的3个合浦珠母贝(Pinctada fucata)地理群体,按照完全双列杂交构建了9个选育群体。在养殖到20月龄时,从每个群体中随机挑选100个贝,测量4个形态性状(壳长、壳高、壳宽和绞合线长)、4个质量性状(体质量、壳质量、软体部质量和闭壳肌质量)和闭壳肌拉力。相关性分析显示,各性状与闭壳肌拉力均为正相关,与闭壳肌拉力相关系数最大的是壳质量(0.601),体质量(0.564)次之,壳宽(0.320)最小。综合比较形态性状,较优群体是YNSY、SYSZ和YNSZ;综合比较质量性状,较优群体是YNSY、SYSZ和YNSZ;综合比较闭壳肌拉力,较优的群体是YNSY、YNSZ和SZYN;综合筛选出生长性状和闭壳肌拉力都较优的YNSY和YNSZ群体可作为进一步的选育材料。

关键词：合浦珠母贝杂交生长性状闭壳肌拉力

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合浦珠母贝主要形态性状与体质量的灰色关联分析

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南方水产科学 2015年第2期11卷 35-40页

作者：谭才钢刘宝锁张东玲牛志凯张博陈明强范嗣刚姜松黄桂菊李有宁陈素文喻达辉中国水产科学研究院南海水产研究所中国水产科学研究院南海水产种质资源与健康养殖重点实验室农业部南海渔业资源开发利用重点实验室广东广州510300 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 集美大学福建厦门361021

文章采用灰色关联分析方法对合浦珠母贝（Pinctada fucata）12个家系的壳长、壳高、壳宽和绞合线长4个形态性状与体质量的关联度进行了分析和评价。结果显示,12个家系的平均体质量、壳长、壳高、壳宽和绞合线长分别为35.96 g、57.36 mm... 详细信息

文章采用灰色关联分析方法对合浦珠母贝（Pinctada fucata）12个家系的壳长、壳高、壳宽和绞合线长4个形态性状与体质量的关联度进行了分析和评价。结果显示,12个家系的平均体质量、壳长、壳高、壳宽和绞合线长分别为35.96 g、57.36 mm、59.24 mm、23.55 mm和56.93 mm。各个性状的变异系数较大（8.30%-21.30%）,其中壳高和壳宽的变异系数相对较小,而体质量的变异系数相对较大。体质量与各形态性状灰色关联系数之和以壳高为最大（8.950 8）,且家系间较均一,壳长为最小（8.189 8）,但家系间变化幅度较大。体质量与4个形态性状的关联度大小趋势为壳高（0.745 9）〉绞合线长（0.714 8）〉壳宽（0.705 9）〉壳长（0.682 5）。根据上述结果,可将壳高作为间接选育合浦珠母贝体质量性状的重要评价指标,以提高体质量的选育效率。

关键词：合浦珠母贝形态性状灰色关联选择育种

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鱼类特有的Ring型E3泛素连接酶MARCH5A基因在刺激隐核虫感染下的表达分析

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水产学报 2016年第3期40卷 289-298页

作者：张东玲喻达辉陈健叶坤王志勇集美大学水产学院农业部东海海水健康养殖重点实验室福建中国水产科学研究院南海水产研究所南海生物资源开发与利用协同创新中心

为探究大黄鱼MARCH5A的免疫作用,实验采用反转录PCR确认了该基因的c DNA序列。该序列全长1045 bp,包含1个长度为867 bp的开放阅读框,编码288个氨基酸;序列分析显示该蛋白含1个RINGv和4个跨膜结构域。进化树分析表明大黄鱼有11个MARCH家... 详细信息

为探究大黄鱼MARCH5A的免疫作用,实验采用反转录PCR确认了该基因的c DNA序列。该序列全长1045 bp,包含1个长度为867 bp的开放阅读框,编码288个氨基酸;序列分析显示该蛋白含1个RINGv和4个跨膜结构域。进化树分析表明大黄鱼有11个MARCH家族蛋白(与哺乳动物相同),但鱼类存在多个亚型,MARCH5A为鱼类特有蛋白,其蛋白理化性质和三维结构均与MARCH5B存在一定的差异。荧光定量PCR分析显示,MARCH5A在健康大黄鱼的多个组织中均有表达,在血液和心脏中表达量最高,其次为鳃和脑,而在肾脏和皮肤中表达量最少。刺激隐核虫感染大黄鱼后,MARCH5A在皮肤中早期表达量显著上调,第2天为对照组的9.65倍,后期下调。在鳃、脾脏和头肾中的前期表达量也有所增加,后期下降。结果表明大黄鱼MARCH5A在抗刺激隐核虫免疫应答过程中可能发挥重要作用。

关键词： MARCH5A 刺激隐核虫免疫应答大黄鱼 E3泛素连接酶

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柘林湾海洋牧场不同功能区食物网结构

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水产学报 2018年第7期42卷 1026-1039页

作者：林会洁秦传新黎小国陈丕茂莫宝霖马欢郑忠明宁波大学海洋学院浙江海洋高效健康养殖协同创新中心中国水产科学研究院南海水产研究所中国水产科学研究院海洋牧场技术重点实验室农业部南海渔业资源环境科学观测实验站

海洋牧场是由多个功能区组成的生态系统工程,不同功能区的生态环境和食物网结构各不相同,通过研究不同功能区食物网结构有助于了解功能区之间生态系统差异。实验通过对南澳柘林湾海洋牧场渔业资源环境调查,利用碳氮稳定同位素技术对海... 详细信息

海洋牧场是由多个功能区组成的生态系统工程,不同功能区的生态环境和食物网结构各不相同,通过研究不同功能区食物网结构有助于了解功能区之间生态系统差异。实验通过对南澳柘林湾海洋牧场渔业资源环境调查,利用碳氮稳定同位素技术对海洋牧场不同功能区食物网结构进行比较,并借助SIBER对稳定同位素数据进行分析。结果显示,海洋牧场调查共采获生物种类78种,其中,消费者的δ13C比值介于–19.94‰–13.62‰,δ15N比值介于8.78‰15.29‰,营养级范围介于1.733.64。不同功能区同位素数据对比表明,人工鱼礁区生物资源相对丰富,食物网结构较为复杂;海藻增殖区中生物生态位分布最广,营养冗余程度较高;贝类增殖区生物生态位较窄,营养级分布较为集中。在不同功能区生态系统稳定性对比中,人工鱼礁区生态系统稳定性最佳,海藻增殖区生态系统稳定性较差。

关键词：海洋牧场食物网营养级稳定同位素 SIBER

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不同养殖方式方格星虫的营养组成比较

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南方水产科学 2018年第4期14卷 80-87页

作者：李俊伟郭永坚胡瑞萍陈素文颉晓勇朱长波李婷中国水产科学研究院南海水产研究所中国水产科学研究院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室广东省渔业生态环境重点实验室广东广州510300 广州市海威水产科技有限公司广东广州510300

为研究相同海域滩涂和池塘养殖方格星虫(Sipunculus nudus Linnaeus)营养组成的异同,比较了2种养殖方式下的方格星虫体壁脂肪酸、氨基酸、矿物元素和基本营养物质组成。结果显示,滩涂和池塘养殖方格星虫体壁的粗蛋白、粗脂肪、灰分、脂... 详细信息

为研究相同海域滩涂和池塘养殖方格星虫(Sipunculus nudus Linnaeus)营养组成的异同,比较了2种养殖方式下的方格星虫体壁脂肪酸、氨基酸、矿物元素和基本营养物质组成。结果显示,滩涂和池塘养殖方格星虫体壁的粗蛋白、粗脂肪、灰分、脂肪酸总量相近(P>0.05)。滩涂和池塘养殖星虫的C22:0、C20:3(n-3)、C16:1、C18:2(n-6)、C23:0含量差异显著(P<0.05),且作为硅藻脂肪酸特征的C16:1(n-7)/C16:0比值和C20:5(n-3)也具有显著差异(P<0.05)。池塘养殖的方格星虫谷氨酸(Glu)、总氨基酸含量显著高于滩涂养殖(P<0.05),而必需氨基酸之间无显著差异(P>0.05)。池塘养殖方格星虫体壁和沉积物中的钾(K)、钠(Na)、镁(Mg)、钙(Ca)、硒(Se)含量均高于滩涂养殖方格星虫相应体壁和沉积物中的含量(P<0.05),而且2种养殖方式下的方格星虫体壁K、Se含量均显著高于相应沉积物中的含量(P<0.05)。综合分析表明,相同海域不同养殖方式并不会显著影响方格星虫的基本营养组成(粗蛋白、粗脂肪、灰分),但是对于Glu、总氨基酸以及C22:0、C20:3(n-3)、C16:1、C16:1(n-7)/C16:0比值和C20:5(n-3)等具有影响。方格星虫对K、Na、Mg、Ca、Se具有一定程度的富集作用,而对于铁(Fe)、锌(Zn)、锰(Mn)、铜(Cu)、铅(Pb)、铬(Cr)、镉(Cd)、钴(Co)等元素无明显富集作用。

关键词：方格星虫养殖方式脂肪酸氨基酸矿物元素

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斜带石斑鱼神经坏死病毒CP基因shRNA干扰载体的构建及效果评价

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水产学报 2012年第3期36卷 343-349页

作者：黄桂菊陈健光喻达辉曾令兵龙华中国水产科学研究院南海水产研究所农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点开放实验室中国水产科学研究院长江水产研究所淡水生态与健康养殖重点开放实验室

利用Invitrogen公司的在线生物学软件分析斜带石斑鱼神经坏死病毒CP基因,设计针对CP基因不同位置的小发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)干扰序列[其结构特征为正链(19 nt)-环(4 nt)-负链(19 nt)]。化学合成这些序列,并退火连接为双链干... 详细信息

利用Invitrogen公司的在线生物学软件分析斜带石斑鱼神经坏死病毒CP基因,设计针对CP基因不同位置的小发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)干扰序列[其结构特征为正链(19 nt)-环(4 nt)-负链(19 nt)]。化学合成这些序列,并退火连接为双链干扰片段,将双链干扰片段定向克隆到干扰载体pENTRTM/U6中,构建shRNA干扰载体pshRNA-124、pshRNA-896和pshRNA-NNV。然后,用脂质体转染法分别将3种shRNA干扰载体和pEGFP-CP基因共转染导入黑头呆鱼(FHM)肌肉细胞,荧光显微镜观察细胞荧光强度,分析荧光抑制效率,Real-time RT-PCR检测CP基因mRNA的表达水平变化。结果表明,在pEGFP-CP与shRNA干扰载体共转染组,pshRNA-124、pshRNA-896、pshRNA-NNV的荧光抑制效率分别为47%、68%、51%。3种shRNA干扰载体都有干扰效果,均能干扰绿色荧光蛋白的表达,其中pshRNA-896干扰效率最好。Real-time RT-PCR检测表明,干扰质粒pshRNA-124、pshRNA-896、pshRNA-NNV对pEGFP-CP基因的沉默效率分别约为60%、96%和55%,与对照组相比差异显著(P<0.05)。研究表明,靶向斜带石斑鱼神经坏死病毒CP基因的shRNA干扰载体构建成功,为进一步运用RNA干扰技术进行CP基因的功能研究奠定了基础。

关键词：斜带石斑鱼神经坏死病毒 CP基因 shRNA干扰载体

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