本研究利用线粒体COI基因片段序列分析比较了尼罗罗非鱼(Oreochromis. niloticus)、奥利亚罗非鱼(O. aureus)、莫桑比克罗非鱼(O. mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT strain of O. niloticus)及3种红罗非鱼品系(Oeochromis ssp.)(台湾红罗...
详细信息
本研究利用线粒体COI基因片段序列分析比较了尼罗罗非鱼(Oreochromis. niloticus)、奥利亚罗非鱼(O. aureus)、莫桑比克罗非鱼(O. mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT strain of O. niloticus)及3种红罗非鱼品系(Oeochromis ssp.)(台湾红罗非鱼、马来西亚红罗非鱼、以色列红罗非鱼)共336个样本的遗传多样性和系统进化关系。实验最终获得了基因序列片段1596bp,多态性位点180个,单倍型98个。在所有的COI序列中,A、T、G和C碱基的平均含量分别为28.7%、28.6%、25.1%和17.6%。7个群体的平均单倍型多样性为0.944,核苷酸多样性为0.036,平均核苷酸差异数为57.35。中性检验显示,尼罗罗非鱼群体达到显著水平(P<0.05),吉富罗非鱼和马来西亚罗非鱼群体达到极显著水平(P<0.01)。两两群体间遗传分化系数Fst分析显示:除了马来西亚红罗非鱼和以色列红罗非鱼群体,其他群体的遗传分化均到达了极显著水平(P<0.01)。基于群体间K2P遗传距离(0.000-0.071)的UPGMA聚类树显示:3种红罗非鱼先聚类,再与吉富罗非鱼和尼罗罗非鱼聚类,最终与莫桑比克罗非鱼和奥利亚罗非鱼依此聚类。AMOVA分析结果显示:所述群体存在显著的遗传变异和分化(P<0.01),主要变异来源于群体间(70.78%)。研究表明:本实验中的奥利亚罗非鱼的遗传多样性最低,其他6种罗非鱼的遗传多样性丰富,可为今后罗非鱼的种质资源利用提供必要的科学依据。
暂无评论