大口黑鲈(Micropterussalmoides)生长性状是衡量品质与产量的重要标准,开发快长SNP标记与挖掘优势基因型及生长主效基因,有助于进一步解析其生长发育遗传机制,为选育优质高产新品系奠定基础。基于简化基因组测序技术(restriction-site associated DNA sequencing,RAD-seq),在大口黑鲈美国北方亚种F0生长性状极端群体(体重极大前1%和极小后1%)中,筛选了与生长性状存在潜在关联的SNP位点,利用一般线性模型(generalizedlinear model,GLM)将SNP位点基因型与230尾F0个体的体重、体长、体高和体厚进行相关性分析,此外通过基因注释信息预测生长候选基因,并结合优势基因型加性效应分析优势基因型聚合效果。在大口黑鲈23条染色体上发现了4196486个高质量SNPs,基于种群特异基因型频率阈值0.7,初步筛选出100个与生长性状潜在相关的SNP位点。关联性分析显示,有12个SNP标记存在显著关联,包括5个标记与体重显著关联,10个与体长显著关联,4个与体高显著关联,5个与体厚显著关联。其中标记SNP19140160、SNP24406191、SNP3355498和SNP9244620分别定位至生长候选基因fam174b、diaph2、kiaa1549lb和ppip5k1b上。富集6~10个优势基因型的群体较富集0~5个优势基因型的群体在平均体重、体长、体高和体厚上分别提高了32.07%、9.63%、9.96%和10.58%。本研究所鉴定的12个快长SNP标记和4个生长候选基因可助力大口黑鲈生长性状改良。
为探究红罗非鱼(Oreochromisspp.)对NaHCO3碱度胁迫的应激响应机制,本研究以初始体重为(73.43±1.62)g的红罗非鱼作为研究对象,进行40 d NaHCO3碱度胁迫,比较NaHCO3碱度胁迫组[CA,(35.51±0.17)mmol/L]和淡水对照组[Con,(1.75&#...
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为探究红罗非鱼(Oreochromisspp.)对NaHCO3碱度胁迫的应激响应机制,本研究以初始体重为(73.43±1.62)g的红罗非鱼作为研究对象,进行40 d NaHCO3碱度胁迫,比较NaHCO3碱度胁迫组[CA,(35.51±0.17)mmol/L]和淡水对照组[Con,(1.75±0.08)mmol/L]红罗非鱼血清生理参数、肠组织学和肠转录组差异。结果显示,红罗非鱼血清过氧化氢酶(CAT)活性与总抗氧化能力(TAOC)、丙二醛(MDA)、血氨和尿素氮(BUN)水平在碱度胁迫下显著增加(P<0.05);碱度胁迫导致红罗非鱼肠绒毛缩短和肠上皮损伤等现象的发生;肠转录组学分析共获得2853个差异表达基因,其中上调基因1674个,下调基因1179个。富集分析揭示了红罗非鱼肠组织响应碱胁迫的关键通路(内吞作用、氨基酸生物合成和IgA生成相关肠道免疫网络等),这些途径主要涉及物质跨膜运输、能量代谢和免疫响应等生物学过程。qRT-PCR检测验证12个碱应激响应关键基因转录水平的表达。结果表明,碱度胁迫会损伤红罗非鱼肠道组织结构,并造成其氧化应激;肠道运输、代谢和免疫响应关键基因表达的变化是红罗非鱼耐受高碱度环境的重要策略,本研究结果能够为阐释红罗非鱼对环境碱度的适应性调节机制提供理论参考。
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