检索结果-内蒙古大学图书馆

中国水产科学 2012年第3期19卷 390-398页

作者：俞菊华李红霞李建林唐永凯董在杰中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

GHS-R基因在哺乳类为候选的肥胖和生长数量性状位点。本实验使用RT-PCR及PCR的方法,从建鲤(Cyprinus carpio ***)分离到2个jlGHS-R1s,称为jlGHS-R1a和jlGHS-R1b(分别简称1a和1b)。jlGHS-R1s的阅读框编码360个氨基酸,两者间相似性高达96%;另外还存在2个jlGHS-R1s的转录变体(分别简称1a'和1b'),选择性切割了翻译起始碱基后第490-680 nt的191 bp片段,该片段两端碱基分别为gt-ag,这种选择性切割导致翻译提前终止,仅翻译184个氨基酸,包括前面3个半跨膜区,这与已报道的罗非鱼等的保留内含子的转录变体不同。jlGHS-R1s的阅读框被1个内含子分隔,该内含子位于第260个氨基酸密码子的第1和第2个碱基之间,1a和1b的内含子长度分别为676 bp和885 bp。使用分段PCR在建鲤群体的1a和1b基因上共找到32个SNP位点,构建PCR-RFLP法对其中9个SNPs进行基因型检测,结果发现各种基因型在322尾建鲤中均有出现,但存在着明显的偏分布。与增重的相关分析表明,位点1a-I_C386T和1b-E1_G159T与雌雄鱼鱼种和成鱼阶段增重分别呈极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,CC型和GG型个体增重最快,另外有5个位点则与其中的某阶段或者某性别的增重相关,为了确定上述所得标记的适用性,选取其中4个标记在另外7个家系共610尾鱼中检测,结果 C386T和G159T还是与增重呈极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,可用于建鲤分子育种。

关键词：建鲤生长激素促泌素受体单核苷酸多态位点生长相关分子标记

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洪湖碘泡虫在发病和隐性感染异育银鲫组织器官中的分布

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水产学报 2022年第6期46卷 1085-1093页

作者：杨坤翟凯旋习丙文陈凯谢骏南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

为探究洪湖碘泡虫在被感染异育银鲫不同组织器官中的分布及不同感染阶段的差异，实验采用显微镜镜检、PCR检测及组织病理切片相结合手段，对发病及隐性感染异育银鲫的肌肉、伪鳃、鳃、头肾等11个组织器官进行了广泛检测分析。显微镜镜... 详细信息

为探究洪湖碘泡虫在被感染异育银鲫不同组织器官中的分布及不同感染阶段的差异，实验采用显微镜镜检、PCR检测及组织病理切片相结合手段，对发病及隐性感染异育银鲫的肌肉、伪鳃、鳃、头肾等11个组织器官进行了广泛检测分析。显微镜镜检发现，在发病鱼的咽、伪鳃和鳃能观察到孢囊或成熟孢子；在隐性感染异育银鲫的咽上壁与副蝶骨间结缔组织、伪鳃及其血管周边观察到大量棕黄色结节，并含有洪湖碘泡虫的成熟孢子。不同组织器官DNA样品PCR检测发现，在发病鱼除肌肉外的其他10个组织器官中均检测到洪湖碘泡虫存在，其中伪鳃检出率最高(100%)；隐性感染异育银鲫在咽上壁组织、伪鳃、头肾、体肾、脾脏及卵巢中检出洪湖碘泡虫，伪鳃检出率也为最高(26.7%)。组织病理切片显示，发病鱼咽上壁内分布着大量蜂巢状孢囊及成熟孢子，伪鳃被严重侵占和破坏；残存伪鳃鳃丝周边能观察到增殖和发育阶段的孢子生成细胞。综上所述，本研究首次报道了洪湖碘泡虫在发病和隐性感染异育银鲫不同组织器官中的分布差异，发现伪鳃可能是洪湖碘泡虫寄生和发育成熟的重要器官。结果为洪湖碘泡虫病的准确检验检疫和进一步开展致病机制研究奠定基础。

关键词：异育银鲫洪湖碘泡虫喉孢子虫病伪鳃单管半巢式PCR法组织分布

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建鲤基因组中一个ty3-gypsy反转录转座子的发现与分析

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中国水产科学 2016年第2期23卷 284-296页

作者：丁炜东曹丽萍曹哲明邴旭文农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081

转座子是动植物基因组的重要组成部分,在前期研究中发现建鲤(Cyprinus carpio ***)基因组中存在一个ty3-gypsy反转录转座子类型的转座子,并将其命名为JRE转座子(Jian carp Retrotransposon,JRE)。为了研究JRE反转录转座子在建鲤基因组... 详细信息

转座子是动植物基因组的重要组成部分,在前期研究中发现建鲤(Cyprinus carpio ***)基因组中存在一个ty3-gypsy反转录转座子类型的转座子,并将其命名为JRE转座子(Jian carp Retrotransposon,JRE)。为了研究JRE反转录转座子在建鲤基因组中的功能,采用PCR扩增、荧光定量PCR和原位杂交等方法对JRE转座子的特性进行了研究。JRE反转录转座子全长5126 bp,具有5?端470 bp和3?端453 bp长末端重复片段(long terminal repeat end,LTR),中间的开放阅读框(ORF)包括核心蛋白基因(gag)和酶基因区域(pol),其长度为4203 bp。pol基因具有典型的ty3-gypsy反转录转座子结构,基因顺序为PR-RT-RH-IN基因。对pol基因的同源分析表明,其与虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Azumapecten farreri)、大堡礁海绵(Xiphophorus maculates)和斑剑尾鱼(Xiphophorus maculates)pol基因相似性分别为40.7%、40.0%、32.8%和30.1%,因此JRE可能属于JULE反转录转座子家族。采用实时定量PCR对JRE转座子在建鲤基因组内的拷贝数进行了测定,结果表明其拷贝数为124,同时对不同组织中的m RNA表达量的研究表明,JRE转座子在建鲤肝、肾、血、肌肉、性腺5种组织中均有表达,在肾和肝中表达量略高。染色体原位杂交结果表明,JRE转座子在建鲤的染色体上随机分布,没有明显的规律性。本研究表明,JRE转座子具有典型的反转录转座子结构,属于JULE转座子的分枝,在染色体上的分布不多,其转录活性并不是很高,对我们了解建鲤基因组构成和特点增加了知识储备,同时为利用转座子的活性进行转基因研究提供了一种新的途径和工具。

关键词：建鲤反转录转座子拷贝数原位杂交

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长江下游四大家鱼仔稚鱼时空分布特征及影响因子分析

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长江流域资源与环境 2023年第3期32卷 478-486页

作者：丁隆强黎加胜徐东坡方弟安任鹏中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081

为探究长江下游安庆-南通江段四大家鱼仔稚鱼资源的时空分布特征,于2019年4至8月在长江下游安庆、南京和南通江段逐月开展四大家鱼仔稚鱼的空间分布和动态资源调查。结果显示,共采集产漂流性卵鱼类仔稚鱼107990尾,隶属于2目2科19种,其... 详细信息

为探究长江下游安庆-南通江段四大家鱼仔稚鱼资源的时空分布特征,于2019年4至8月在长江下游安庆、南京和南通江段逐月开展四大家鱼仔稚鱼的空间分布和动态资源调查。结果显示,共采集产漂流性卵鱼类仔稚鱼107990尾,隶属于2目2科19种,其中四大家鱼972尾,以鲢(Hypophthalmichthys molitrix)为主,占家鱼捕获量67.28%。各江段四大家鱼仔稚鱼平均丰度依次为2.57、0.90和0.60 ind./100 m^(3),家鱼仔稚鱼资源自安庆向南通方向逐渐减少;安庆江段5月和7月仔稚鱼平均密度显著高于其他月份,南京和南通江段高峰期发生在6月。Kruskal-Wallis检验表明各江段四大家鱼仔稚鱼的水平分布存在差异,具体表现为近岸仔稚鱼密度显著高于江心。Pearson检验分析显示,调查期间安庆江段四大家鱼仔稚鱼日丰度与水温和水位日上涨率呈显著正相关(P<0.05);南京江段家鱼仔稚鱼日丰度与水温和水流量日上涨率均呈显著正相关(P<0.05);南通江段家鱼仔稚鱼日丰度与水位和水流量日上涨率呈显著正相关(P<0.05)。研究结果揭示了长江下游四大家鱼仔稚鱼的时空格局及与水文环境因子的相关性,阐明江湖连通系统对家鱼早期资源补充具有重要作用,研究结果可为保护长江家鱼补充群体和修复洲滩和沿江岸线等鱼类重要栖息地提供支撑。

关键词：长江下游四大家鱼仔稚鱼时空分布影响因子

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奥利亚罗非鱼髓样分化因子(MyD88)的克隆及其在组织中的表达

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动物学杂志 2013年第6期48卷 894-904页

作者：邹芝英王倩杨弘李大宇祝璟琳肖炜中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

髓样分化因子（myeloid differentiation factor88，MyD88）是TLR（toll-like receptor）信号通路的关键接头蛋白，在先天性免疫中具有重要作用。通过RACE-RCR技术克隆了奥利亚罗非鱼（Oreochromis aureus）MyD88基因cDNA全长序列（GenBank登录号：JN032017）。序列分析表明，奥利亚罗非鱼MyD88基因全长为1611bp，其中包括155bp的5’非编码区，589bp的3’非编码区和867bp的编码区，编码288个氨基酸残基。MyD88蛋白N端具有死亡结构域，C端具有TIR结构域。同源性分析表明，奥利亚罗非鱼MyD88氨基酸序列与鳜鱼（Siniperca chuats）相似性最高，为85．8％，与其他鱼类相似性为70％～82％，与哺乳动物相似性为63％～66％；系统进化树分析表明，奥利亚罗非鱼MyD88与同属鲈形目的鳜鱼、大黄鱼（Larimichthys crocea）聚在一起。采用实时定量PCR方法检测MyD88在奥利亚罗非鱼各组织中的表达情况。结果显示，MyD88在所有被测组织中都有表达，其中表达最最高的是卵巢，其次在小肠、脾、肝、肾、鳃和血液中有较高的表达量，肌肉、精巢组织中表达量最低。本研究可为进一步探讨MyD88在奥利亚罗非鱼TLR信号通路中的作用奠定一定的基础。

关键词：奥利亚罗非鱼实时定量PCR MyD88 基因表达

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两种不同低温应激方法对吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)死亡率、血清皮质醇和天然免疫因子的影响

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海洋与湖沼 2013年第4期44卷 919-925页

作者：何杰强俊朱志祥徐跑中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

采用两种不同降温方法,进行吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)(60.13g)低温应激比较(水温从26℃降至致死温度8℃)。急性低温应激组以9℃/h的降温速度,2h后水温降至8℃;慢性低温应激组以3℃/d的降温速度,6d后水温降至8℃。以水温到达8... 详细信息

采用两种不同降温方法,进行吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)(60.13g)低温应激比较(水温从26℃降至致死温度8℃)。急性低温应激组以9℃/h的降温速度,2h后水温降至8℃;慢性低温应激组以3℃/d的降温速度,6d后水温降至8℃。以水温到达8℃时的时间为0h,比较致死温度下两种低温处理对吉富罗非鱼48h内累积死亡率、血清皮质醇与天然免疫指标的变化。结果表明,致死温度下48h时,急性低温应激组的累积死亡率为53.33%,显著高于慢性低温应激组的26.67%(P<0.05);慢性低温应激组血清皮质醇水平低于急性低温应激组,血清溶菌酶、C3和IgM活力以及头肾中C型溶菌酶和抗菌肽基因相对表达水平显著高于急性应激组(P<0.05)。急性低温应激组相对较高的血清皮质醇水平抑制了机体天然免疫活性,降低了鱼体的抵抗力。因此,在实际养殖生产中,通过适当的低温驯化过程可以有效地提高吉富罗非鱼的低温耐受性。

关键词：吉富罗非鱼低温应激死亡率皮质醇天然免疫因子

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福瑞鲤2号不同生长速率个体肌肉组织转录组分析

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水产学报 2021年第1期45卷 79-87页

作者：王兰梅朱文彬傅建军董在杰中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室南京农业大学无锡渔业学院

鱼类通过选育获得优良生长性状的遗传分子机制目前尚不清楚。实验分析比较了2种不同生长速率福瑞鲤2号肌肉组织的转录组文库。组装后共获得392 238条测序序列(contigs)。其中可比对上斑马鱼、弓斑东方鲀、青鳉、三刺鱼、尼罗罗非鱼和松... 详细信息

鱼类通过选育获得优良生长性状的遗传分子机制目前尚不清楚。实验分析比较了2种不同生长速率福瑞鲤2号肌肉组织的转录组文库。组装后共获得392 238条测序序列(contigs)。其中可比对上斑马鱼、弓斑东方鲀、青鳉、三刺鱼、尼罗罗非鱼和松浦镜鲤的蛋白序列的比例为56.01%～77.71%。2种不同生长速率福瑞鲤2号肌肉转录组比较,获得749个差异表达基因,包括348个上调基因和401个下调基因。鉴定出了与肌肉生长相关关键基因,如mb、myl2b、tnni1、fhl1、lamb3和pdk2等。研究结果为后续基因功能的研究以及鱼类新品种优良生长性状的分子机制解析奠定了基础。

关键词：鲤转录组肌肉生长差异表达基因

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四种杂交组合奥尼罗非鱼及其亲本的生长对比研究

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水生生物学报 2012年第5期36卷 905-912页

作者：肖炜李大宇邹芝英祝璟琳卫程亮杨弘单航宇韩珏中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

通过RFID电子标记注射、跟踪和生长性状测量,对2个奥利亚罗非鱼品系(ZZ、AA)、2个尼罗罗非鱼品系(XX、EE)自交群体及其杂交奥尼罗非鱼4个群体(XZ、XA、EZ、EA)进行生长对比研究,罗非鱼亲本来自国家罗非鱼产业技术体系研发中心。结果表明... 详细信息

通过RFID电子标记注射、跟踪和生长性状测量,对2个奥利亚罗非鱼品系(ZZ、AA)、2个尼罗罗非鱼品系(XX、EE)自交群体及其杂交奥尼罗非鱼4个群体(XZ、XA、EZ、EA)进行生长对比研究,罗非鱼亲本来自国家罗非鱼产业技术体系研发中心。结果表明:XZ、XA、EZ、EA四个奥尼罗非鱼群体雄性率均达94%以上,全长、体长、头长、体高等性状特征值显著高于亲本品系(P<0.05),奥尼罗非鱼的生长速率相对其亲本品系具有一定的优势,同时4个奥尼群体间生长性状特征值也存在显著差异(P<0.05);生长性状相关分析显示罗非鱼各配组群体的体质量与尾柄长相关性较低(0.690—0.846),与全长、体长、体高、体厚相关性较高;对罗非鱼各配组群体的比例性状进行主成分分析,第1主成分主要代表BS、HS、CDS、BWS性状特征,第2主成分主要代表TS、HS、CLS性状特征,通过第1、第2主成分作图可将AA与其他6个罗非鱼配组群体有效区分。

关键词：奥尼罗非鱼 RFID电子标记亲本品系相关分析主成分分析

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团头鲂全产业链健康养殖技术研究进展及展望

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水产学报 2023年第11期47卷 70-83页

作者：戈贤平刘波缪凌鸿赵永锋林艳路思悦姜文强钱琳洁中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室南京农业大学无锡渔业学院

团头鲂是我国主要的淡水养殖鱼类之一，其具有食性广、养殖成本低、生长快、成活率高、易捕捞、易繁殖等特点，且具有味美、头小、含肉率高、体形好、规格适中等优点，深受消费者欢迎，在增加优质水产动物蛋白供应、提高全民营养健康水... 详细信息

团头鲂是我国主要的淡水养殖鱼类之一，其具有食性广、养殖成本低、生长快、成活率高、易捕捞、易繁殖等特点，且具有味美、头小、含肉率高、体形好、规格适中等优点，深受消费者欢迎，在增加优质水产动物蛋白供应、提高全民营养健康水平、保障我国食物安全等方面做出了重要贡献。本文综述了团头鲂全产业链技术研究进展，包括新品种培育及育种技术、饲料营养需求调控及投喂技术、养殖应激与病害的生态防控技术、新型养殖模式、营养品质及加工技术等，提出了具有生产性能优、抗病抗逆性强和适于加工的团头鲂种质资源的挖掘，集约化健康养殖模式建立及精准营养供给、生态防控和高品质加工调理技术的研发等产业发展需求和研究方向，以期为团头鲂全产业链的绿色高质量可持续发展提供参考。

关键词：团头鲂全产业育种技术饲料营养健康养殖高品质加工

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建鲤ODC1基因型与增重的相关性分析

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水生生物学报 2014年第3期38卷 414-421页

作者：李红霞李建林唐永凯俞菊华中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

构建了建鲤(Cyprinus carpio ***)鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase,ODC)jlODC1a基因上6个和jlODC1b基因上4个SNP位点的PCR-RFLP方法,检测了这10个位点在12个家系约900尾建鲤选育群体中的基因型,各位点的基因型频率存在差异,最小... 详细信息

构建了建鲤(Cyprinus carpio ***)鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase,ODC)jlODC1a基因上6个和jlODC1b基因上4个SNP位点的PCR-RFLP方法,检测了这10个位点在12个家系约900尾建鲤选育群体中的基因型,各位点的基因型频率存在差异,最小等位基因频率(MAF)为0.14—0.48。各位点不同基因型与增重相关分析结果,其中7个SNPs与建鲤增重显性相关的位点,ODC1s基因上与雌鱼增重相关的SNP位点(7个)较雄鱼(4个)多。标记富集结果表明富集与建鲤增重相关的优势基因型的SNP个数越多的个体增重速度越快SNP个数越多的个体增重速度越快,富集4个的平均增重显著快于富集0—3的个体增重,且比0标记的快约14%,这反映出生长为数量性状。进一步对所检测位点进行双倍型分析,结果显示具有四个优势基因型且全部杂合优势基因型的4567(XXXXXXACCTCTCT)组的增重最快,比0优势基因型的增重快达26.6%,可以考虑用于今后的快增长建鲤的选育计划中。此外,双倍型分析结果还表明,不同位点之间可能存在或颉抗或协同的互作,如1和4之间存在拮抗关系,因此在今后的选育计划中,在考虑标记富集的情况下还应考虑标记之间的关系。宜在选择互为协同作用优势基因型的前提下,富集尽可能多的SNP标记。

关键词：建鲤鸟氨酸脱羧酶基因型 SNP-增重相关分析

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