检索结果-内蒙古大学图书馆

Ccr-lncRNA172145靶向miR-206在锦鲤体色调控中的作用初探

水产学报 2021年第12期45卷 1955-1964页

作者：罗明坤王兰梅朱文彬傅建军董在杰南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

为了解非编码RNA在锦鲤体色分化变异中的分子调控机制,在课题组前期对锦鲤皮肤组织转录组测序的基础上,筛选到4条在3种皮肤(黑色、红色、白色)组织中显著差异表达的lncRNA;基于RNAhybrid和TargetScan靶基因预测软件,发现lncRNA172145与... 详细信息

为了解非编码RNA在锦鲤体色分化变异中的分子调控机制,在课题组前期对锦鲤皮肤组织转录组测序的基础上,筛选到4条在3种皮肤(黑色、红色、白色)组织中显著差异表达的lncRNA;基于RNAhybrid和TargetScan靶基因预测软件,发现lncRNA172145与黑色素合成通路中miR-206之间存在靶向结合位点。借助CPC、CPAT及CNIT软件,对lncRNA172145编码能力进行分析,证实该序列为lncRNA,不具备编码蛋白的能力。然后,利用qRT-PCR技术对该序列时空表达水平进行了检测,发现在眼睛、黑色皮肤、鳍条及血液中表达量显著高于其他组织;自原肠胚时期表达量开始显著上升,高水平趋势一直持续到孵化后20 d。通过双荧光素酶报告实验,进一步证实lncRNA172145与miR-206之间存在靶向调控关系。最后,通过合成miR-206拮抗剂,对miR-206进行体内沉默,发现与注射阴性对照拮抗剂组和PBS组相比,miR-206拮抗剂组的lncRNA172145表达水平显著升高。研究表明,lncRNA172145可能通过靶向到miR-206,参与到黑色素合成通路的调控,这为后续深入挖掘二者在黑色素合成通路中具体的分子机制提供了基础资料。

关键词：锦鲤 Ccr-lncRNA172145 miR-206 体色

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大口黑鲈2群体双列杂交子代的生长比较及通径分析

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上海海洋大学学报 2022年第1期31卷 131-139页

作者：龚雅婷傅建军朱文彬张林兵王兰梅强俊郜灿胡桂飞洪斌董在杰南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 安徽张林渔业有限公司安徽铜陵224151 铜陵市义安区水产管理站安徽铜陵244151

为了加快大口黑鲈(Micropterus salmoides)的良种更新,以引进的大口黑鲈美国群体(US)和国内养殖群体(YZ)为基础群体,开展完全双列杂交试验,获得USUS、USYZ、YZUS和YZYZ共4个配对组合,并对子代个体1龄的生长性能进行比较。研究结果显示:U... 详细信息

为了加快大口黑鲈(Micropterus salmoides)的良种更新,以引进的大口黑鲈美国群体(US)和国内养殖群体(YZ)为基础群体,开展完全双列杂交试验,获得USUS、USYZ、YZUS和YZYZ共4个配对组合,并对子代个体1龄的生长性能进行比较。研究结果显示:USYZ杂交子代在体质量、体长和绝对增重率方面具有显著性优势(P<0.05),变异系数也最高;2组杂交子代的生长性状均具有中亲优势,USYZ杂交子代的体质量、体长、全长、头长和体高均具有超亲杂种优势,且在生长性状方面优于YZUS组合。通径分析结果显示:子代的全长、体宽、体高和体质量间均呈极显著正相关(P<0.01);区别于USUS,在USYZ、YZUS和YZYZ中体宽对体质量的决定系数要高于体高对体质量的决定系数。基于群体交配设计,从杂交子代的生长性状方面分析最佳的杂交组合,以期为中国大口黑鲈养殖群体种质改良和新品种培育提供基础。

关键词：大口黑鲈生长性状杂种优势通径分析

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基于离散SNP位点解析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)对水温和盐度的适应性

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基因组学与应用生物学 2023年第1期42卷 25-33页

作者：罗慧匡箴罗颖祁洪芳方弟安中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 青海湖裸鲤救护中心青海省青海湖裸鲤繁育与保护重点实验室西宁810016

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态... 详细信息

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点筛选,探讨其可能受到自然选择作用的相关SNP位点,并对离散SNP位点所在contigs进行序列比对及功能注释。研究共得到1 566个高度变异的适应性离散SNP位点。NR(non-redundant protein sequences)注释显示,相似比例序列所占比例最高的前两个物种分别是鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)和鲤(Cyprinus carpio)。GO注释分析发现,注释到细胞过程、代谢过程和结合的contigs较多。KEGG注释分析显示,注释到代谢通路和神经活性配体-受体相互作用通路的contigs最多,其中,注释到代谢通路的基因包括ctu1、cps1、gba2、fasn和plcg1等,推测这些基因与青海湖裸鲤的本地适应性相关。研究结果证明青海湖裸鲤可能形成了与温度、盐度等环境因子相关的本地适应性机制,研究结果为进一步深入探讨青海湖裸鲤的本地适应性机制提供了技术方法和数据支撑。

关键词：青海湖裸鲤基因分型测序离散SNP位点功能注释本地适应性

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套养池塘主要养殖阶段浮游生物的群落结构特征

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水产学杂志 2024年第1期37卷 104-112页

作者：傅建军安睿朱文彬王兰梅罗明坤董在杰中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214128

为探究长江中下游地区套养池塘主要养殖阶段浮游生物群落结构特征及其影响因素,于2019年5—9月,在中国水产科学研究院淡水渔业研究中心宜兴屺亭科研实验基地主养鲤(Cyprinus carpio,“福瑞鲤2号”)和尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus,... 详细信息

为探究长江中下游地区套养池塘主要养殖阶段浮游生物群落结构特征及其影响因素,于2019年5—9月,在中国水产科学研究院淡水渔业研究中心宜兴屺亭科研实验基地主养鲤(Cyprinus carpio,“福瑞鲤2号”)和尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus,“中威1号”)、套养鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙(***),采用人工投喂的常规鱼种培育池塘中,每间隔15~25 d测定水体理化指标及浮游生物种类和数量。结果显示,主要养殖阶段池塘总氮和氨氮浓度呈上升趋势,并逐渐趋于稳定;亚硝酸氮含量在养殖周期内浓度均较低,总磷先上升、后下降。实验中共检测到浮游植物8门77属,以绿藻门和蓝藻门为主;浮游动物5类72种,以原生动物和轮虫类为主。基于浮游生物密度的主成分分析(PCA)和热图显示,实验期间浮游生物群落结构具有明显的时序性变化,优势种及其密度变化明显。冗余分析(RDA)表明,总氮和亚硝酸氮浓度显著影响浮游植物丰度(P<0.05);水温、p H和亚硝酸氮浓度显著影响浮游动物丰度(P<0.05)。14个浮游生物优势种的密度与水体理化指标间存在显著线性相关(P<0.05)。结果表明,长江中下游地区套养池塘主要养殖阶段浮游生物群落结构时序性变化明显,水体理化指标存在差异。本研究结果可为套养模式下池塘的水质监测和调控及养殖管理提供参考数据。

关键词：浮游生物群落结构环境因子 RDA分析

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低剂量糖蜜添加对吉富罗非鱼养殖水质和微生物代谢多样性的影响

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淡水渔业 2022年第6期52卷 36-43页

作者：杨泳王新池尹统统宋超孟顺龙范立民南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

为研究低剂量糖蜜添加对吉富罗非鱼(GIFT Oreochromis niloticus)养殖水体水质指标、水体微生物代谢多样性的影响。本实验选取初始体质量为(10±0.13)g的健康吉富罗非鱼,随机分为对照组(C)、10%糖蜜添加组(10S)、20%糖蜜添加组(20S)... 详细信息

为研究低剂量糖蜜添加对吉富罗非鱼(GIFT Oreochromis niloticus)养殖水体水质指标、水体微生物代谢多样性的影响。本实验选取初始体质量为(10±0.13)g的健康吉富罗非鱼,随机分为对照组(C)、10%糖蜜添加组(10S)、20%糖蜜添加组(20S)、40%糖蜜添加组(40S)4个组进行养殖实验,实验周期60 d,每7 d进行一次水质指标检测。运用Biolog-ECO法探究养殖水体微生物代谢多样性。实验结果显示:添加低剂量糖蜜可以有效降低罗非鱼养殖水体中无机氮的含量,对不同形态氮的去除率NO_(3)^(-)-N>NO_(2)^(-)-N>NH_(3)-N且实验组平均去除率显著高于对照组。通过Biolog微平板分析养殖水体微生物群落对31种碳源利用能力,AWCD值结果表明不同微生物对碳源的利用能力随时间增加而增加;低剂量糖蜜添加组的微生物活性明显高于对照组。进行主成分分析后发现微生物群落主要利用的碳源类型为氨基酸类、酯类和酸类。低剂量糖蜜添加组与对照组间微生物群落碳源代谢差异主要体现在对聚合糖类、氨基酸类和酸类碳源的利用,致使微生物利用碳源能力与偏好不同的主要原因是微生物群落结构的差异。实验结果表明,当低剂量糖蜜添加比例为20%时,可有效兼顾成本与效用,降低水体中氨氮、硝态氮和亚硝态氮的含量并改变养殖水体微生物代谢多样性。

关键词：吉富罗非鱼(GIFT Oreochromis niloticus) 低剂量糖蜜水质 Biolog-ECO

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长江安庆段刀鲚的线虫感染现状及时间特征

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大连海洋大学学报 2022年第3期37卷 464-470页

作者：代培郭琦田佳丽马凤娇王银平刘凯中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 江苏省淡水水产研究所江苏南京210017 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081

为掌握长江刀鲚Coilia nasus感染线虫的现状,于2018年4—7月在长江安庆段进行72 d的调查,共采集1658尾样本。结果表明:刀鲚的线虫感染率为96.32%,平均感染强度为(10.69±9.67)条/尾,平均感染丰度为(10.16±9.67)条/尾;感染的刀... 详细信息

为掌握长江刀鲚Coilia nasus感染线虫的现状,于2018年4—7月在长江安庆段进行72 d的调查,共采集1658尾样本。结果表明:刀鲚的线虫感染率为96.32%,平均感染强度为(10.69±9.67)条/尾,平均感染丰度为(10.16±9.67)条/尾;感染的刀鲚中,52.53%的个体感染线虫数量为1~9条,感染数量大于30条的个体较少,仅占3.93%;线虫寄生于刀鲚腹腔内壁及各脏器,胃、幽门盲囊和肠道内及表面均有寄生,性腺和肝脏表面有附着或嵌入组织内,各部位线虫寄生数量以肠道和幽门盲囊最多,占比分别为41.26%和31.15%;线虫抽样鉴定结果显示,刀鲚共感染线虫2属6种,其中异尖属线虫2种,宫脂属4种,优势种为派氏异尖线虫Anisakis simples;不同规格刀鲚的感染强度有所差异,感染强度随刀鲚体长增加呈先升高后降低的趋势,其中,280~300 mm体长组感染率最高,260~279 mm体长组平均感染强度和感染丰度最高;调查期间,随着时间的推移,刀鲚的线虫感染指标呈先升高后降低趋势,其中6月上半月感染情况最严重。研究表明,刀鲚感染的线虫均为海水性寄生虫,感染情况较为严重,线虫的寄生对刀鲚肝脏等寄生部位产生了机械损伤,刀鲚感染线虫的情况与其规格和洄游时间有一定的相关性。

关键词：刀鲚线虫感染现状长江

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壳聚糖和纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果

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湖南农业大学学报（自然科学版） 2022年第2期48卷 242-250页

作者：周春妙肖锦程于俊杰张明胤宋长友唐永凯南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214128 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

选取0.5、1.0、2.0 mg/L的壳聚糖和25、50、100 mg/L的纳米碳铜分别加至铜绿微囊藻液中,检测藻液中藻细胞浓度和叶绿素a质量浓度,探讨壳聚糖和纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果;比较100 mg/L纳米碳铜与100、500 mg/L硫酸铜在除藻过程中... 详细信息

选取0.5、1.0、2.0 mg/L的壳聚糖和25、50、100 mg/L的纳米碳铜分别加至铜绿微囊藻液中,检测藻液中藻细胞浓度和叶绿素a质量浓度,探讨壳聚糖和纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果;比较100 mg/L纳米碳铜与100、500 mg/L硫酸铜在除藻过程中藻液的pH值、溶解氧、铜离子的残留量,进一步验证纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果。结果表明:壳聚糖抑藻效果不明显;质量浓度为100 mg/L的纳米碳铜则具有明显的抑藻效果,144、360、480 h时,添加100 mg/L纳米碳铜组的藻细胞浓度显著低于其他组的,且72~480 h时,其藻细胞浓度随培养时间的增加而显著降低;48~240 h时,添加100 mg/L纳米碳铜组的藻液叶绿素a质量浓度和铜离子残留量均显著低于添加100、500 mg/L硫酸铜组的,且pH值变动小。这表明100 mg/L纳米碳铜可有效抑制铜绿微囊藻,且水体中铜离子的残留量较少,pH值变动小,可广泛用于水产养殖中。

关键词：铜绿微囊藻壳聚糖纳米碳铜硫酸铜叶绿素a 抑制效果铜离子残留 pH值溶解氧

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氧化应激对鲤抗氧化状态和免疫功能的影响

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水产学报 2021年第1期45卷 33-43页

作者：何勤贾睿曹丽萍杜金梁顾郑琰 JENEY Galina 徐跑殷国俊南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室中国水产科学研究院淡水渔业研究中心鱼类免疫药理国际联合实验室匈牙利水产与渔业研究所国家农业研究中心匈牙利

为探讨氧化应激对鲤抗氧化状态和免疫功能的影响,本实验以H2O2作为活性氧自由基(ROS),将鲤暴露于不同浓度的H2O2(0、0.25、0.50和1.00 mmol/L)中,诱导鲤产生氧化应激反应。连续暴露7 d后,采集鲤血液和肝组织,以检测相关生化指标以及基... 详细信息

为探讨氧化应激对鲤抗氧化状态和免疫功能的影响,本实验以H2O2作为活性氧自由基(ROS),将鲤暴露于不同浓度的H2O2(0、0.25、0.50和1.00 mmol/L)中,诱导鲤产生氧化应激反应。连续暴露7 d后,采集鲤血液和肝组织,以检测相关生化指标以及基因表达量的变化。结果显示,与空白对照组(0 mmol/L)相比,随着H2O2浓度的升高,血清葡萄糖(GLU)、皮质醇(cortisol)和乳酸(LA)含量显著升高;而碱性磷酸酶(AKP)和酸性磷酸酶(ACP)活性仅在1.00 mmol/L H2O2处理组中显著高于其他实验组。氧化应激参数显示,与空白对照组(0 mmol/L)相比,0.50和1.00 mmol/L H2O2处理显著降低血清过氧化氢酶(CAT)活性,而提高还原型谷胱甘肽(GSH)、丙二醛(MDA)和总抗氧化能力(T-AOC)水平;在肝脏组织中,1.00 mmol/L H2O2处理显著降低了GSH含量,促进了MDA生成。基因表达结果显示,与空白对照组相比,1.00 mmol/L H2O2处理组显著上调了肝脏组织中cyp1a表达,而下调了cyp1b表达;同时0.50和1.00 mmol/L H2O2处理显著上调了hsp70、hsp90、c3、c-lyz和hep的表达。研究表明,氧化应激暴露可诱导鲤产生明显应激反应和脂质过氧化,降低机体抗氧化能力并激发免疫应答反应。

关键词：鲤过氧化氢氧化应激抗氧化能力免疫应答基因表达

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鱼类雷帕霉素靶蛋白信号通路生物学功能的研究进展

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动物营养学报 2021年第10期33卷 5486-5496页

作者：吴龙华梁化亮戈贤平任鸣春南京农业大学无锡渔业学院无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

雷帕霉素靶蛋白(TOR)信号通路是营养、化学和运动等因素导致细胞生长和分化的一个关键信号通路。本文介绍了到目前为止TOR信号通路的生物学功能以及其在水产动物中的研究进展,主要包括TOR信号通路对蛋白质合成代谢、糖代谢、脂代谢、摄... 详细信息

雷帕霉素靶蛋白(TOR)信号通路是营养、化学和运动等因素导致细胞生长和分化的一个关键信号通路。本文介绍了到目前为止TOR信号通路的生物学功能以及其在水产动物中的研究进展,主要包括TOR信号通路对蛋白质合成代谢、糖代谢、脂代谢、摄食调控以及机体免疫、抗氧化调控的影响,同时阐述了胰岛素抵抗机制及精氨酸对团头鲂免疫与抗氧化信号通路的调控机制,以为进一步全面研究TOR信号通路在水产动物中的应用提供参考。

关键词：鱼类 TOR 雷帕霉素免疫代谢摄食调控

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哈尼梯田稻鲤共作与单养模式下福瑞鲤肠道菌群结构比较研究

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微生物学报 2022年第4期62卷 1473-1484页

作者：聂志娟徐钢春邵乃麟王保战高建操徐跑何健南京农业大学生命科学学院农业农村部农业环境微生物工程重点开放实验室江苏南京210095 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214128

【目的】分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征。【方法】通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异。【结果】梯田稻鲤组(RCIC)、传... 详细信息

【目的】分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征。【方法】通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异。【结果】梯田稻鲤组(RCIC)、传统池鲤组(YPIC)和水泥池鲤组(HPIC)分别获得了2345、238和118个OTU。RCIC组的Sobs指数及PD指数最高,显著高于YPIC组(P<0.05),极其显著高于HPIC组(P<0.01);池塘单养模式下,两组之间多样性指数也存在显著差异,YPIC组大于HPIC组(P<0.05)。含量大于10%优势菌门:RCIC组主要为变形菌门(39.39%)、梭杆菌门(38.55%)和厚壁菌门(15.4%);YPIC组为变形菌门(21.87%)、梭杆菌门(58.27%);HPIC组为变形菌门(46.63%)、梭杆菌门(53.14%)。变形菌和梭杆菌为3组福瑞鲤肠道样品的优势菌群,其中的鲸杆菌属(Cetobacterium)、气单胞菌属(Aeromonas)为核心优势菌属。LEfSe线性判别分析(LDA>3)显示17个具有差异的标记菌属,其中Romboutsia、Clostridium_sensu_stricto_1、Enterobacter、Paraclostridium、Methylobacterium、norank_f__norank_o__Chloroplast、Edwardsiella、Epulopiscium为RCIC组具有的差异标记菌属。【结论】不同养殖模式的福瑞鲤既有固有菌群,也塑造差异显著的肠道菌群组成结构。稻梯田鲤肠道菌群丰富度和多样性显著增加,且具有更多的有益差异标记菌属,获得更健康的肠道菌群群落特征。

关键词：哈尼梯田稻-鲤综合种养菌群结构肠道高通量测序

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