检索结果-内蒙古大学图书馆

2010中国青年遗传学家论坛

作者：张振华樊叶杨朱玉君郭梁庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

应用密阳46作为共同父本构建的两套籼籼交重组自交系(RIL)群体,对水稻抽穗期和株高QTL进行了定位和比较。珍汕97B/密阳46(ZS97/MY46)RIL群体和协青早B/密阳46(XB/MY46)RIL群体分别由232和202个株系组成。于2000、2008和2009年在中国水... 详细信息

应用密阳46作为共同父本构建的两套籼籼交重组自交系(RIL)群体,对水稻抽穗期和株高QTL进行了定位和比较。珍汕97B/密阳46(ZS97/MY46)RIL群体和协青早B/密阳46(XB/MY46)RIL群体分别由232和202个株系组成。于2000、2008和2009年在中国水稻研究所富阳实验基地种植两套群体,3年均考察抽穗期,而株高仅在2008和2009年考察。

关键词：水稻抽穗期 QTL 重组自交系群体

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水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

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中国作物学会——2015年学术年会

作者：王琳琳郭梁张宏伟樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一。鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻... 详细信息

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一。鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻高产优质分子育种提供技术基础。在前期研究中,我们应用籼稻组合珍汕973/密阳46衍生的群体,在水稻第1染色体长臂上1个12.0 Mb的区间中分解出互斥连锁的2个千粒重QTL,分别称为qTGW1.1和qTGW1.2,进而又将qTGW1.2分解为互引连锁的2个QTL,其中,qTGW1.2a位于RM11730和RM11762之间934 kb的区域内,qTGW1.2b位于RM11800和RM11885之间2.1 Mb的区域内。本研究针对覆盖qTGW1.2a和qTGW1.2b、总物理距离为3.96Mb的RM11730-RM11885区间,发展分离区间更小且相互交叠的近等基因系(NIL)和NIL-F2群体,提高了qTGW1.2a和qTGW1.2b的定位精度,并在这2个QTL之间检测到1个控制粒长的QTL qGL.1.2。主要结果如下所述。从珍汕973/密阳46的BC2F8群体中筛选到1个在水稻第1染色体长臂上RM212-RM265区间呈杂合的单株,应用SSR标记检测其衍生的BC2F9群体,筛选出在RM212-RM11787和RM11787-RM265区间呈杂合的单株各1个,其杂合区间分别覆盖前期定位的千粒重QTLqTGW1.2a和qTGW1.2b。种植2个BC2F10群体,筛选出杂合区间相互交叠的单株各3个,自交后获得6个BC2F11群体。应用10个SSR和1个InDe1标记检测这6个群体的基因型,在RM11781-RM11800区间检测到1个控制粒长的QTL,并将qTGW1.2a和qTGW1.2b的位置分别缩小至580 kb的RM1 1730-Wn33304和2.0 Mb的RM11807-RM11885区间内。同时,针对qGL1.2区间,增加了2个InDe1标记,筛选出5个杂合区间相互交叠的单株,衍生了5个BC2F12群体,采用Windows QTL Cartographer 2.5对其进行QTL分析;结果表明,5个群体均检测到粒长QTL,加性效应为0.03～0.06 mm,增效等位基因均来自密阳46。经比较各个群体的分离区间,将控制粒长的QTL qGL1.2界定在RM11781和Wn34526之间372 kb的区间内;该QTL呈加性作用,可能同时控制粒重、粒长和粒宽。为进一步验证qTGW1.2a、qGL1.2和qTGW1.2b,从上述BC2F9群体中筛选出在RM212-RM265区间呈交叠排列的6个单株,自交后获得6个BC2F10群体,从这些群体中筛选出珍汕97纯合型、密阳46纯合型和杂合型材料,自交收获种子,产生6套BC2F10:11近等基因系。各套近等基因系表型变异的双因素方差分析结果表明,每套近等基因系均存在千粒重QTL的分离,加性效应为0.11～0.31g,增效等位基因均来自密阳46;这些QTL同时对粒长和(或)粒宽具显著作用。经比较各套近等基因系的分离区间,分解出3个QTL,分别对应于qTGW1.2a、qGL1.2和qTGW1.2b,其中,qTGW1.2a和qTGW1.2b表现为加性作用,qGL1.2表现为正向完全显性。

关键词：水稻(Oryza sativa L.) 千粒重微效作用数量性状座位分解

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水稻微效千粒重QTL qTGW1.2a的验证

水稻微效千粒重QTL qTGW1.2a的验证

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2017年中国作物学会学术年会

作者：王文慧王琳琳樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

【研究背景】水稻是全球重要的粮食作物,粒重是水稻产量的构成因子之一,增加粒重对提高水稻产量具有重要作用。粒重是由多基因控制的复杂数量性状,已有多个控制粒重的QTL通过图位克隆的方法得以克隆。这些已克隆的QTL均具有效应大、贡... 详细信息

【研究背景】水稻是全球重要的粮食作物,粒重是水稻产量的构成因子之一,增加粒重对提高水稻产量具有重要作用。粒重是由多基因控制的复杂数量性状,已有多个控制粒重的QTL通过图位克隆的方法得以克隆。这些已克隆的QTL均具有效应大、贡献率高和能稳定遗传等特点。近年来水稻品种产量变化情况反映出微效QTL对于水稻品种产量的提高上发挥着不可或缺的作用。但是由于微效QTL效应小易受环境影响等特点,迄今为止仍未有关于粒重微效QTL被克隆的报道。目标区间分离、遗传背景基本一致的近等基因系（NIL）群体,可以有效消除遗传背景的干扰。并且这样的群体遗传结构稳定,能够在不同年份和环境重复开展试验,有效减少环境的干扰,更客观地评价目标QTL的效应。本实验室利用剩余杂合体构建目标区间分离、遗传背景基本一致的近等基因系群体,有效消除了遗传背景的干扰。能够在多年、多地稳定检测到微效千粒重QTL。前期我们在第1染色体上检测到1个控制千粒重的微效QTL qTGW1.2a,将其定位到RM11730-RM11762区间内。本研究继续对其进行验证并提高其定位精度。【材料与方法】从ZS97～3/MY46 BCF群体中筛选到分离区间为RM11730-Wn33304的交换单株1个,RM212-RM11800区间分离的交换单株1个。自交后获得对应的F2群体并进行标记检测。从中挑选出分离区间仍为RM11730-Wn33304的杂合单株2个,和分离区间为RM212-RM11762的交换单株1个,用于构建近等基因系。该3套NIL与BCF群体中检测到的分离区间为RM11730-Wn33304的交换单株构建的NIL共同种植于浙江杭州。采用随机区组设计,2个重复,每个株系10株。在RM11730-RM11762区间发展3对双亲呈多态性的Indel标记,对4套NIL群体进行标记检测。3对Indel标记分别为Wn32886,Wn33186和Wn33252。成熟后各株系混收中间5株,挑选600粒饱谷,采用SC-A型种子数粒仪测定千粒重、粒长和粒宽。通过SAS软件对同一群体不同基因型间的表型变异进行方差分析。【结果与分析】分析结果显示,分离区间为Wn32886-Wn33304的3套NIL均存在控制千粒重的QTL且增效等位基因均来自密阳46,加性效应分别为0.22g,0.23g和0.36g,贡献率为23.35%,26.15%和41.33%。在控制粒形的2个性状上,3套近等基因系在粒宽上均存在极显著差异（p<0.0001）,加性效应分别为0.02g,0.01g和0.03g,贡献率分别为23.35%,26.15%和41.33%。而且对粒宽的增效等位基因均来自密阳46。这些结果表明,qTGWl.2a对千粒重的作用是由粒宽决定的。而另1套NIL仅检测到粒宽的显著效应,且效应方向与其他3套相反,增效等位基因来在于珍汕97。【结论】应用4套近等基因系对水稻第1染色体长臂上微效千粒重QTL qTGW1.2a进行了遗传学验证,并通过比较每套近等基因系的QTL定位结果和分离区间的基因组位置,将其进一步界定在Wn32886和Wn33186之间的366kb的区间内。

关键词：水稻微效 QTL 验证

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应用水稻重组自交系及衍生群体定位抽穗期QTL

应用水稻重组自交系及衍生群体定位抽穗期QTL

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2017年中国作物学会学术年会

作者：孙志超陈俊宇朱玉君张振华樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

【研究背景】抽穗期是决定水稻品种地区和季节适应性的关键因素,属于受多基因控制的数量性状,表现为连续分布,控制其遗传的位点称为数量性状座位（QTL）。一般地,对抽穗期和产量性状同时具有较大效应的QTL,可用于选育长生长季的高产品种... 详细信息

【研究背景】抽穗期是决定水稻品种地区和季节适应性的关键因素,属于受多基因控制的数量性状,表现为连续分布,控制其遗传的位点称为数量性状座位（QTL）。一般地,对抽穗期和产量性状同时具有较大效应的QTL,可用于选育长生长季的高产品种,而一些效应小的多效性QTL能够用于微调抽穗期以实现水稻光温资源利用最大化。水稻抽穗期是发展最快的性状之一,抽穗期QTL经历了初定位到克隆的过程,目前,已经克隆的抽穗期QTL有15个,包括11个主效QTL,分是Hd1、Hd6、Hd3a、Ehd1、Ghd7、DTH3、DTH8/Ghd8、Ehd4、DTH7/OsPRR37/Ghd7.1、Hd16和RFT1,还有4个微效QTL,分别是dth3、Hd17、DTH2和Hd18;【材料与方法】本研究应用了1套重组自交系群体,由中籼品种特青/IRBB配组衍生,包含204个株系,IRBB是以IR24为背景、携带不同抗白叶枯病基因的近等基因系,特青和IR24均为三系恢复系。首先,3年同地种植重组自交系群体,考察抽穗期,应用QTLNetwork 2.0对3年数据联合分析;接着,通过标记检测,从重组自交系群体中筛选出2个剩余杂合体,自交获得2个F群体,分别包含251和250个株系,种植于浙江杭州和海南陵水,应用Windows QTL Ca rtographe r2.5对两季数据分别分析;【结果与分析】应用重组自交系群体检测到4个抽穗期QTL,分布于染色体3、5、10、12,QTL的平均加性效应为0.61d,平均贡献率为4.11%;抽穗期QTL加性效应小,可能是因为抽穗期分离小,另一方面,尽管这些QTL加性效应小,但能解释较高的表型变异,并且在3年试验中表现稳定,说明主效QTL不分离能促进微效QTL的检测。应用2个F群体共检测到12个抽穗期QTL,分布于染色体3、5、6、7、9、10、11、12,QTL的平均加性效应为0.64 d,平均贡献率为7.81%。比较发现,F群体检测到的QTL个数明显增多,能够解释的表型变异明显变大,说明利用遗传背景更加同质的次级群体,可以进一步提高微效抽穗期QTL的检测效率,而且重组自交系群体中控制抽穗期的QTL区间在F群体中均得到验证,但第10染色体长臂上的QTL区间在重组自交系群体和F群体中加性效应方向相反,可能存在2个不同的QTL;通过与已验证或克隆的抽穗期位点比较,发现本研究检测到的QTL中,有3个与已克隆位点重叠,2个与已精细定位的位点重叠,其它区间未见精细定位或克隆报道;【结论】结果表明,利用生态适应性相似的水稻品种配组构建定位群体,能够在固定主效抽穗期位点的基础上减小抽穗期变异,提高微效抽穗期QTL的检测效率,同时为一些容易受环境影响的性状QTL的检测提供新思路。

关键词：水稻(Oryza sativa L.) 抽穗期数量性状座位(QTL) 生态适应性剩余杂合体

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表达细菌阿特拉津氯水解酶基因的转基因烟草对土壤中阿特拉津的生物降解

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农业环境科学学报 2008年第2期27卷 596-601页

作者：斯华敏朱丽牟仁祥刘文真胡国成付亚萍陈铭学蔡宝立孙宗修中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室浙江杭州310006 中国水稻研究所农业部稻米及制品质量监督及检验测试中心浙江杭州310006 南开大学微生物学系天津300071

植物修复(Phytoremediation)技术是消除或减少土壤环境中有机污染物的重要手段,本研究采用植物转基因技术对土壤中除草剂阿特拉津的降解进行了探索。通过农杆菌介导将阿特拉津氯水解酶基因AD1-atzA转入烟草中,获得了转基因植株。T1代植... 详细信息

植物修复(Phytoremediation)技术是消除或减少土壤环境中有机污染物的重要手段,本研究采用植物转基因技术对土壤中除草剂阿特拉津的降解进行了探索。通过农杆菌介导将阿特拉津氯水解酶基因AD1-atzA转入烟草中,获得了转基因植株。T1代植株在浇灌了20mg·L-1阿特拉津溶液的模拟污染土壤条件下生长45d,抗性植株的RT-PCR结果证实叶片中阿特拉津氯水解酶基因得到正常转录,液相色谱质谱分析在叶片中检出阿特拉津的水解产物羟基阿特拉津。结果表明,用转基因植物修复阿特拉津污染土壤是值得进一步探索的途径。

关键词：阿特拉津生物降解阿特拉津氯水解酶基因转基因烟草植物修复环境生物技术

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应用三套籼稻重组自交系群体分析水稻粒形QTLs

应用三套籼稻重组自交系群体分析水稻粒形QTLs

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中国作物学会2013年学术年会

作者：朱玉君应杰政樊叶杨黄得润庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

粒长(grain length,GL)、粒宽(grain width,GW)和长宽比(length-width ratio,LWR)是衡量稻米外观品质的重要指标,也是影响水稻产量的重要因素之一。弄清粒形性状的遗传基础对有效改良稻米外观品质具有重要意义。本研究所用群体为3套籼... 详细信息

粒长(grain length,GL)、粒宽(grain width,GW)和长宽比(length-width ratio,LWR)是衡量稻米外观品质的重要指标,也是影响水稻产量的重要因素之一。弄清粒形性状的遗传基础对有效改良稻米外观品质具有重要意义。本研究所用群体为3套籼籼交重组自交系(RIL)群体,分别为协青早B/密阳46(XM)、珍汕97B/密阳46(ZM)和特青/IRBB品系(TI),其中,TI群体抽穗期变异很小,而另2套群体抽穗期变异较大。各群体在浙江省富阳市中国水稻研究所试验基地于水稻生产正季分别种植两年,测定粒长、粒宽和长宽比,应用前期构建的遗传连锁图谱(XM遗传图谱含240个分子标记,覆盖基因组2080.4cM、ZM图谱含256个分子标记,覆盖1814.7cM、TI图谱含127个分子标记,覆盖基因组1197.7 cM),采用QTLNetwork 2.0进行QTL分析,共检测到47个QTLs。在XM群体中共检测到8个QTLs,其中,4个控制粒长,2个控制粒宽,2个控制长宽比:在ZM群体中共检测到19个QTLs,其中,8个控制粒长,4个控制粒宽,7个控制长宽比;在TI群体中共检测到20个QTLs,其中,6个控制粒长,7个控制粒宽,7个控制长宽比。这些QTLs没有1个同时在3个群体中检测到,但有10个在2个群体中同时检测到,其中,TI和XM中同时检测到的有3个,均位于已克隆的粒重基因所处区间;TI和ZM中同时检测到的有3个,包括位于已克隆粒重基因区间2个和无粒重基因克隆区间1个:XM和ZM中同时检测到的有4个,均不处于已克隆粒重基因区间。所有检测到的QTLs位于12条染色体的26个区间中,其中7个区间在同1个群体对2个以上性状呈显著作用。在TI群体中,第3染色体的RM15139-RM15303区间和第5染色体的RM18038-RM18189区间同时控制3个性状,第2染色体的RM71-RM327区间同时控制粒长和长宽比;在ZM群体中,第3染色体的RM218-RM232区间和RZ403-RM168区间分别同时控制粒长、长宽比和粒宽、长宽比;在XM群体中,第5染色体的CDO82-RG182区间同时控制粒宽和长宽比。比较3套RILs的定位结果,发现贡献率最大4个的QTLs均已被克隆,包括GS3和GS5基因。不过,还是有一些效应较小的QTL能在2个以上的群体中检测到,包括位于第6染色体RM204-RM197区间、控制粒长的qGL6,以及位于第10染色体RM3773-RM3123区间、控制粒宽的qGW10.2,它们是我们下一步研究的重要目标。

关键词：水稻重组自交系粒长粒宽长宽比

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RFT1与Hd1所在区间对水稻抽穗期、株高和千粒重的作用

RFT1与Hd1所在区间对水稻抽穗期、株高和千粒重的作用

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2012年中国作物学会学术年会

作者：陈俊宇王凯龚俊义樊叶杨黄得润庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

抽穗期是决定水稻品种适应地区和季节的关键性状,其遗传受数量性状基因(QTL)控制。经过近20年的发展,水稻QTL研究已进入精细定位和基因克隆阶段,其中,以抽穗期方面的研究最系统、进展最快。这些研究不仅揭示了水稻抽穗期调控的主要途径... 详细信息

抽穗期是决定水稻品种适应地区和季节的关键性状,其遗传受数量性状基因(QTL)控制。经过近20年的发展,水稻QTL研究已进入精细定位和基因克隆阶段,其中,以抽穗期方面的研究最系统、进展最快。这些研究不仅揭示了水稻抽穗期调控的主要途径,还为分析水稻抽穗期和产量性状遗传控

关键词：水稻抽穗期千粒重 Hd1

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水稻第1染色体长臂上微效千粒重QTLqTGW1.2的验证与分解

水稻第1染色体长臂上微效千粒重QTLqTGW1.2的验证与分解

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中国作物学会2013年学术年会

作者：陈玉宇张宏伟陈俊宇朱玉君黄得润应杰政樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

本研究针对前期qFGW1.2初定位结果,应用SSR标记检测,从籼籼交组合珍汕97～3/密阳46衍生的215个单株组成的BCF分离群体中,筛选到杂合区间分別为RM11621-RM297和RM212-RM265的2个单株,分别自交构建了2套BCF近等基因系,每套近等基因系分别... 详细信息

本研究针对前期qFGW1.2初定位结果,应用SSR标记检测,从籼籼交组合珍汕97～3/密阳46衍生的215个单株组成的BCF分离群体中,筛选到杂合区间分別为RM11621-RM297和RM212-RM265的2个单株,分别自交构建了2套BCF近等基因系,每套近等基因系分别包含珍汕97纯合型株系30个和密阳46纯合型株系30个,分别称之为C1和C2。2012年夏于水稻生长季节在中国水稻研究所富阳试验基地种植2套近等基因系,完全随机区组设计,2个重复,每个株系每个重复8个单株,株行距20 cm×23 cm,正常田间管理。记载各单株的抽穗期,成熟后每株系取中间的5株混收,考察千粒重、粒长、粒宽和单株产量,运用SAS软件的一般线性模型对表型差异进行双因素方差分析。结果表明,C1的2种不同基因型材料在千粒重、粒长、粒宽、单株产量和抽穗期这5个性状上呈现出显著的差异,且增效的等位基因均来源于密阳46。C2的2种不同基因型材料在粒长、粒宽和抽穗期这3个性状上呈现出显著的差异,粒宽和抽穗期增效的等位基因均来源于珍汕97,而粒长增效的等位基因来自密阳46。因此将qTGW1.2进一步界定在RM212-RM265及其两侧交换区间的区域内,其对千粒重、粒长、粒宽、单株产量和抽穗期的加性效应分别为0.4g、0.035 mm、0.035 mm、0.85 g和0.7 d,贡献率分别为44.37%、20.78%、46.54%、12.5%和24.83%。在此基础上,进一步筛选出了5个在目标区间内分离片段缩小且呈阶梯状排列的单株,衍生了5套BCF分离群体,分别称之为CZ1、CZ2、CZ3、CZ4和CZ5,各群体均含300个单株。2012年冬于水稻生长季节在中国水稻研究所陵水试验基地种植5套分离,株行距20cm×23cm,正常田间管理。记载各单株的抽穗期,成熟后单株收种,考察千粒重。应用WinQTLCart 2.5进行QTL检测,以LOD=2.0为阈值。检测结果显示,每套群体均检测到千粒重QTL,LOD值最小的为2.21,最大的为11.66,加性效应为0.13 g-0.38g,来自密阳46的等位基因提高千粒重;经比较各个群体的分离区间,将qTGW1.2分解为2个,其中,qTGW1.2a位于RM11730和RM11762之间934 kb的区域内,其在CZ1、CZ2和CZ3中被检测到,加性效应分别为0.27g、0.15 g和0.38 g,显性效应分别为-0.02 g、-0.08 g和-0.05 g,贡献率分别为10.60%、3.50%和13.40%;该QTL呈加性作用。qTGW1.2b位于RM11800和RM11885之间2.3 Mb的区域内,其在CZ4和CZ5中被检测到,加性效应分别为0.25 g和0.13 g,显性效应分别为0.31 g和0.13 g,贡献率分别为16.60%和7.54%;该QTL呈正向超显性。相反地,每套群体均没有检测到对抽穗期的显著作用。综上所述,将qTGW1.2分解出2个微效千粒重QTL qTGW1.2a和qTGW1.2b,且都对水稻抽穗期无显著的影响,对水稻分子设计育种有重要的参考价值。我们已构建了分离区间进一步缩小的群体,以开展这2个千粒重QTL精细定位。

关键词：水稻近等基因系数量性状座位(QTL) 千粒重抽穗期

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水稻抽穗期基因RFT1和Ghd7功能标记的开发

水稻抽穗期基因RFT1和Ghd7功能标记的开发

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中国作物学会2013年学术年会

作者：樊叶杨朱玉君应杰政庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

RFT1和Ghd7是水稻在长日照条件下控制抽穗期的关键基因,其功能标记的开发将有助于2个基因在水稻分子育种中的应用。我们首先对RFT1的珍汕97(ZS)和密阳46(MY)等位基因进行了测序。序列比较表明,和MY等位基因相比,ZS等位基因在第1外显子上... 详细信息

RFT1和Ghd7是水稻在长日照条件下控制抽穗期的关键基因,其功能标记的开发将有助于2个基因在水稻分子育种中的应用。我们首先对RFT1的珍汕97(ZS)和密阳46(MY)等位基因进行了测序。序列比较表明,和MY等位基因相比,ZS等位基因在第1外显子上有17个单核苷酸多态(SNP)和1个22bp的插入,在第4外显子上有9个SNP,最终预测蛋白序列存在6个氨基酸置换。根据22 bp的插入/缺失变异,我们设计和发展了1个序标位标记,ZS和MY的PCR扩增产物大小分别为274 bp和252 bp,可轻易地在2%琼脂糖凝胶上分辨开来。同时,根据第1外显子上导致第31位氨基酸变异(A-V)的1个SNP(C-T)以及第4外显子上导致第146位氨基酸变异(K-R)的1个SNP(A-G),分别发展了1个衍生的dCAPS标记和CAPS标记。前者可以特异识别ZS等位基因,即ZS等位基因的PCR产物可以被Hha I酶切为135 bp和20 bp,而MY等位基因产物不能被酶切;后者可以特异识别MY等位基因,即MY等位基因的PCR产物可以被BciT130 I酶切为574 bp和174 bp,而ZS等位基因的扩增产物仍为748 bp。根据已报道的4个Ghd7蛋白的序列差异,我们从NBCI数据库中下载了Ghd7的合江19,明恢63和日本晴等位基因(分别代表Ghd7-0a、Ghd7-1和Ghd7-2)的基因序列,并进行比对。根据Ghd7-0a等位基因上1个引起翻译提前终止的SNP(G-T),设计和开发了1个CAPS标记,可以特异识别Ghd7-0a等位基因,其PCR产物可以被Spe1酶切为379 and 58 bp。根据第122位氨基酸上的变异(G-E),发展了1个CAPS标记,Ghd7-0a和Ghd7-2等位基因的182 bp产物均可被BsrB I特异酶切为158 bp和24 bp。根据第233位氨基酸上的变异(A-P),发展了1个dCAPS标记,能够特异识别Ghd7-1等位基因,其PCR产物可被HindIII酶切为160 bp和25 bp。此外,Ghd7-0等位基因由于完全缺失,故所有引物对均不能扩增出产物,而3个PCR产物都不能被酶切的,则可归类为Ghd7-3等位基因。因此,应用这一套3个标记组合,可以有效地鉴别各个Ghd7等位基因。为验证和应用上述功能标记,我们选用了80份籼型水稻品种,包括43和23份三系杂交稻父、母本,2和4份两系杂交稻父、母本以及8份常规籼稻,进行基因型检测。结果显示,在RFT1座位上,3个标记的检测结果完全一致,其中63份材料(包括95.6%的杂交稻父本)携带MY等位基因:在Ghd7座位上,没有材料携带Ghd7-0a等位基因;30份材料(包括77.8%的杂交稻母本)携带无功能型的Ghd7-0等位基因,仅2份材料携带不完全功能型的Ghd7-2等位基因,而其它48份材料则携带完全功能型的Ghd7-1和Ghd7-3等位基因。

关键词：水稻 RFT1 Ghd7 功能标记

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稻第6染色体短臂上产量性状QTL的分解

稻第6染色体短臂上产量性状QTL的分解

引用

中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会

作者：庄杰云樊叶杨杜景红龚俊义中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

稻谷产量及其构成因子一直是水稻数量性状座位(QTL)定位的主要对象,且其研究重心正逐步从初定位转为精细定位。在应用水稻籼籼交组合珍汕97B/密阳46和协青早 B/密阳 46衍生群体定位产量性状 QTL 的基础上,以珍汕97B/密阳46的 F7群体为材... 详细信息

稻谷产量及其构成因子一直是水稻数量性状座位(QTL)定位的主要对象,且其研究重心正逐步从初定位转为精细定位。在应用水稻籼籼交组合珍汕97B/密阳46和协青早 B/密阳 46衍生群体定位产量性状 QTL 的基础上,以珍汕97B/密阳46的 F7群体为材料,经208个多态性 SSR 标记检测,以第6染色体短臂 RM4923-RM19784区间(约7.3 Mb)为目标,筛选到目标区间呈杂合、其他区间基本呈纯合的1个单株(即剩余杂合体,RHL),自交建立 F2:3群体,应用海南和浙江两地性状鉴定结果检测 QTL,发现目标区间有3个以上不同的区间对产量性状具有显著作用。以 SSR 标记为基础,从该群体筛选出杂合区间缩小、不同杂合区间相互交叠并完全覆盖整个目标区间的 RHL,分别建立分离群体和近等基因系,开展 QTL 效应的验证和 QTL 的进一步分解,初步判断目标区间含有5个控制水稻产量性状的不同区间,其中3个得到多群体多环境试验的验证,并通过杂合片段的逐步缩小和 RHL 衍生群体的交叉验证,将1 个 QTL 定位在62.1 kb 的区间中,正筛选材料以进一步验证其他 QTL 并提高其定位精度。

关键词：水稻 QTL 分解产量性状第6染色体短臂

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