检索结果-内蒙古大学图书馆

中国预防医学杂志 2024年第12期25卷 1590-1596页

作者：卢克夏百成江洁王娜毛乃颖张燕山东第二医科大学公共卫生学院山东潍坊261053 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

病毒性传染病对全球公共卫生安全构成重大威胁。有效监测预警是防控传染病的基石,而病原体的及时和准确鉴定至关重要。本研究重点介绍了近年来在病毒性传染病病原检测和监测领域广泛应用的技术及其新进展,包括核酸检测、新一代基因测序... 详细信息

病毒性传染病对全球公共卫生安全构成重大威胁。有效监测预警是防控传染病的基石,而病原体的及时和准确鉴定至关重要。本研究重点介绍了近年来在病毒性传染病病原检测和监测领域广泛应用的技术及其新进展,包括核酸检测、新一代基因测序、新型免疫学检测以及采用类器官进行病毒分离培养技术。这些新技术在提高检测的灵敏度、特异性和时效性等方面具有显著优势,为传染病的早期诊断、流行病学调查和疫情监测预警提供了有力工具。同时,本研究对以上技术的未来发展和在传染病监测预警中的应用前景进行了展望。

关键词：病毒性传染病监测预警核酸检测基因测序免疫学检测病毒分离培养

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基于SFTS患者血清学指标与机器学习的轻重症分类模型研究

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病毒学报 2025年第3期 702-712页

作者：闻闫瀚田婷婷黄晓霞刘铁柱芜为孙丽娜李建东李德新梁米芳李阿茜王世文传染病溯源与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒学与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

近年来，发热伴血小板减少综合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS）传播范围不断扩大，给公众健康构成严重威胁。目前，尚无特异性治疗药物或已上市疫苗，主要靠对症支持治疗。早期识别重症患者并实施有针对性的... 详细信息

近年来，发热伴血小板减少综合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS）传播范围不断扩大，给公众健康构成严重威胁。目前，尚无特异性治疗药物或已上市疫苗，主要靠对症支持治疗。早期识别重症患者并实施有针对性的干预，往往是降低病死率的关键。我们将91例SFTS患者的急性期血清抗体、细胞因子和相关实验室指标联合分析，通过机器学习的方法，构建出多因素Logistic回归、随机森林、支持向量机和XGBoost四种早期患者轻重症分类模型。在变量筛选阶段，我们依次使用单因素Logistic回归，多重共线性诊断和LASSO回归筛选变量，得到IL-10、IFN-γ、IFN-α、IL-8、AST、IgM OD450、TP和LY%共8个建模变量。结果显示，在早期轻重症分类中表现最佳的是随机森林（AUC=0.889），接下来是多因素Logistic回归（AUC=0.822）以及XGBoost(AUC=0.811)，而表现相对较差的是支持向量机（AUC=0.744）。此外，我们借助多因素Logistic回归识别出IFN-γ、IL-8、IgM OD450和LY%四种SFTS重症化独立预测因子。随机森林和XGBoost的变量重要性分析均表明，IL-10可能是最重要的预测因子，且IFN-γ、IL-8和AST也有较高的重要性。本研究基于血清学指标与机器学习方法开展SFTS患者轻重症分类模型的研究，为SFTS早期风险评估提供了新思路。

关键词：发热伴血小板减少综合征多指标联合预测机器学习早期重症风险

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急性呼吸道感染病例中人冠状病毒229E感染情况及病毒基因特征分析

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病毒学报 2024年第1期40卷 13-26页

作者：李丰辰蒋豪然夏百成马洪滨朱汝南许晶黄艳智郜振国胡孔新李岩向星宇吴巨龙许红梅张凤王文慧张燕崔爱利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 解放军总医院第五医学中心北京100039 首都儿科研究所北京100020 陕西省疾病预防控制中心西安710054 长春市儿童医院长春130051 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心乌鲁木齐830002 中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所北京100123 河北省疾病预防控制中心石家庄050021 湖南省疾病预防控制中心长沙410005 山东省疾病预防控制中心济南250014 重庆医科大学附属儿童医院重庆400014 青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院青岛266000 河南省疾病预防控制中心郑州450016

为阐明我国全人群急性呼吸道感染(Acute respiratory infection,ARI)病例中人冠状病毒229E(Human coronavirus 229E,HCoV-229E)感染情况及病毒基因特征,本研究对2009-2021年间中国十一省份15,335例ARI监测病例中HCoV-229E核酸阳性病例进行描述性流行病学分析,同时对HCoV-229E阳性病例的临床标本进行S基因扩增和测序,阳性序列用于病毒系统发育和进化分析。本研究中共检测出316例HCoV阳性病例,其中38例为HCoV-229E阳性。HCoV-229E检出率在不同季节中差异无统计学意义(χ^(2)=2.345,P=0.504);男性检出率高于女性(χ^(2)=4.546,P<0.05);不同年龄组中,除了5~17岁青少年组未检测到HCoV-229E,其他年龄组间HCoV-229E检出率差异无统计学意义(χ^(2)=1.927,P=0.588)。在38例HCoV-229E阳性病例中有23例(60.53%)为混合感染病例,和HCoV-229E单一感染病例相比,包括肺炎病例在内的下呼吸道感染病例在混合感染病例中比例增高。本研究共获得9条2019-2021年HCoV-229E刺突蛋白(Spike protein,S)基因序列,结合从GenBank中下载的90条HCoV-229E S基因代表性序列共同构建系统发育树。结果表明,全球HCoV-229E序列可划分为Genogroup1~6共6个组,具有明显的时间聚集性。Genogroup 6是目前全球流行的主要优势谱系,位于HCoV-229E系统发育树的末端。本研究所获得的9条HCoV-229E序列均隶属于Genogroup 6,但位于不同分支。S基因分子进化速率约为7.32×10^(-4)替换/位点/年,S蛋白处于负向选择压力下(ω<1),但仍有个别正向选择位点存在,S蛋白多个位点上发生氨基酸突变和N-糖基化位点突变,其中部分突变发生在S蛋白受体结合结构域的3个受体结合环中。本研究通过开展中国内地部分地区ARI病例中HCoV-229E感染情况和病毒基因特征分析,阐述了我国HCoV-229E流行病学特征和病毒分子进化特点,为我国HCoV-229E感染的控制与预防提供基线数据。

关键词：人冠状病毒229E 流行特征系统发育分析分子进化

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基于慢病毒包装构建稳定表达Cas9蛋白的Caco-2细胞系

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中国生物制品学杂志 2025年第1期38卷 8-13,21页

作者：王铭月刘欣奕张锦华章青王宏孔翔羽孙晓曼庞立丽李丹地段招军甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃兰州730000 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 大连医科大学附属第二医院辽宁大连116023

目的采用成簇的规律性间隔短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)系统构建基因敲除细胞文库,以人结肠腺癌细胞Caco-2为研究对象构建稳定表达Cas9蛋白的细胞系。方法包装重组Cas9慢病毒并感染Caco-2细胞,经杀稻瘟菌素及2次有限稀释法筛选Caco-2/Cas9单克隆细胞,并进行PCR和Western blot鉴定。用同时表达GFP和带有GFP向导RNA(single guide RNA,sgRNA)的慢病毒感染Caco-2/Cas9单克隆细胞,经嘌呤霉素筛选后,采用流式细胞术检测结果计算Caco-2细胞株的敲除效率,CCK-8法检测其细胞增殖活性。结果共获得5株Caco-2/Cas9单克隆细胞系,分别命名为Caco-2/Cas9-2、Caco-2/Cas9-3、Caco-2/Cas9-4、Caco-2/Cas9-5和Caco-2/Cas9-6,均可扩增出392 bp的Cas9基因条带,Cas9蛋白在细胞中稳定表达,敲除效率分别为91.27%、20.30%、24.13%、11.33%、12.27%、8.89%;Caco-2/Cas9-4、Caco-2/Cas9-5、Caco-2/Cas9-63株单克隆细胞及未感染Caco-2细胞的增殖活性分别为2.07、1.75、1.46和1.40。Caco-2/Cas9-5、Caco-2/Cas9-6单克隆细胞与未感染Caco-2细胞比较,差异均无统计学意义(t分别为1.92和0.37,P均>0.05)。结论筛选出1株具有Cas9高酶切活性且细胞增殖活性较未感染Caco-2细胞无显著变化的Caco-2/Cas9单克隆细胞系,即Caco-2/Cas9-6单克隆细胞,为进一步构建高覆盖率敲除细胞文库奠定了基础,也为筛选病毒感染有关基因和其他特定功能基因提供了平台。

关键词： Cas9蛋白 Caco-2细胞基因敲除成簇的规律性间隔短回文重复序列

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肠杆菌目细菌碳青霉烯酶检测的研究进展

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新发传染病电子杂志 2024年第3期9卷 78-85页

作者：滑少为赵子今赵萌申辛欣冯志山河北北方学院河北张家口075000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 河北省人民医院检验科河北石家庄050051

近年来,细菌耐药已经成为公共卫生的一项重大挑战,其中碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)对抗生素的耐药形势尤为严峻。CRE的主要耐药机制是碳青霉烯酶的产生,不同菌株携带的耐药基因不同,产生... 详细信息

近年来,细菌耐药已经成为公共卫生的一项重大挑战,其中碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)对抗生素的耐药形势尤为严峻。CRE的主要耐药机制是碳青霉烯酶的产生,不同菌株携带的耐药基因不同,产生的碳青霉烯酶也不同,因此,碳青霉烯酶和耐药基因的早期检测对于控制耐药菌的传播起到重要作用。目前对于碳青霉烯酶的表型检测方法有改良Hodge实验、改良碳青霉烯灭活试验、Carba NP试验、免疫学技术、质谱技术,对于耐药基因型的检测方法有实时荧光定量PCR技术、微阵列技术、等温扩增技术、测序技术,这些方法在碳青霉烯酶的检测中均具有广泛应用。了解各检测技术的优缺点对于在实际应用中选择最适检测方法是非常重要的。本文主要对CRE碳青霉烯酶检测方法的研究进展和各方法的优缺点进行综述,为CRE的检测、预防以及院内感染控制提供数据支持。

关键词：碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌碳青霉烯酶诊断检测

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鼻病毒与呼吸道疾病关系研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2025年第2期39卷 254-258页

作者：赵若涵夏百成谢智博徐希柱张燕山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院济南中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室北京

鼻病毒(Rhinovirus, RV)是人类呼吸道感染的重要病原体之一, 与呼吸道疾病的密切相关。RV不仅能引起普通感冒, 还与毛细支气管炎、肺炎、哮喘等下呼吸道疾病相关, 特别是在哮喘的发生与加重中发挥了重要作用。本文系统归纳了现有文献中R... 详细信息

鼻病毒(Rhinovirus, RV)是人类呼吸道感染的重要病原体之一, 与呼吸道疾病的密切相关。RV不仅能引起普通感冒, 还与毛细支气管炎、肺炎、哮喘等下呼吸道疾病相关, 特别是在哮喘的发生与加重中发挥了重要作用。本文系统归纳了现有文献中RV相关的多种呼吸道疾病。虽然目前尚无针对RV的特效治疗药物和疫苗, 但针对RV的多价疫苗和抗病毒药物的研发为未来RV的感染防控提供了更多的参考。明确RV与疾病之间的关系, 将为优化治疗策略、预防和控制呼吸道疾病提供有力支持。

关键词：鼻病毒呼吸道感染流行病学

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2019—2022年长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染病例中肠道病毒流行病学与基因特征分析

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中国病毒病杂志 2024年第2期14卷 145-151页

作者：张瑶田玉玲王慧玲王娜王利武谢智博李汶霞王雅各宋金华夏百成孙馨张燕纪龙山东第一医科大学(山东省医学科学院) 山东济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室、传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 长春市儿童医院吉林长春130061

目的了解2019—2022年吉林省长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infections,ARIs)病例中肠道病毒的流行情况及型别组成。方法采集2019年6月—2022年12月长春市儿童医院ARIs患儿的咽拭子样本,并收集患儿临床信息,用... 详细信息

目的了解2019—2022年吉林省长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infections,ARIs)病例中肠道病毒的流行情况及型别组成。方法采集2019年6月—2022年12月长春市儿童医院ARIs患儿的咽拭子样本,并收集患儿临床信息,用描述性分析方法对肠道病毒感染病例的性别、年龄和季节分布情况进行分析。采用实时荧光反转录聚合酶链反应(real-time quantitative reverse transcription PCR,real-time qRT-PCR)技术检测肠道病毒,使用反转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)技术扩增肠道病毒VP1全长并进行系统进化分析。结果共采集2707例ARIs病例的咽拭子样本,检出肠道病毒阳性样本65例,检出率为2.40%。65份阳性样本中,32.31%(21/65)为混合感染,以肠道病毒和鼻病毒的双重混合感染最为常见,占肠道病毒阳性病例的10.77%(7/65)。2019—2022年春季、夏季、秋季和冬季肠道病毒的检出率分别为0、6.91%(40/579)、2.90%(21/725)和0.45%(4/894),不同季节肠道病毒检出率差异有统计学意义(χ^(2)=78.036,P<0.01),夏季检出率最高,秋季次之。本研究共鉴定出10种型别肠道病毒,分别为CVA2、CVA4、CVA5、CVA6、CVA10、CVA16、CVB3、E11、E18和EV-D68,其中CVA4检出最多,占比为44.82%(26/58),其余型别检出占比为1.72%~12.07%。结论2019—2022年长春市儿童ARIs病例中肠道病毒夏秋季检出率较高,肠道病毒感染以EV-A组为主。

关键词：急性呼吸道感染肠道病毒基因分型流行病学住院病例

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等温扩增技术检测人乳头瘤病毒的研究进展

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新发传染病电子杂志 2024年第6期9卷 68-73页

作者：李泓熠马学军帖彦清申辛欣河北北方学院研究生学院河北张家口075000 河北省人民医院检验科河北石家庄0500512 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

宫颈癌是全球第四大女性癌症,几乎所有宫颈癌病例都与人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染有关,因此,HPV感染的早期发现对预防宫颈癌至关重要。WHO建议将HPV DNA检测作为主要筛查方法,等温扩增技术相较于变温扩增技术操作更简... 详细信息

宫颈癌是全球第四大女性癌症,几乎所有宫颈癌病例都与人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染有关,因此,HPV感染的早期发现对预防宫颈癌至关重要。WHO建议将HPV DNA检测作为主要筛查方法,等温扩增技术相较于变温扩增技术操作更简便,反应更高效,对实验条件,操作人员的要求更低,且经济成本更低,因此,更适用于HPV的检测。本文比对分析了用于HPV检测的等温扩增技术方法,常用的扩增产物判读方法及等温扩增技术与其他技术(如微流控芯片技术、CRISPR-Cas技术、智能手机检测和横向流动试纸条)结合检测的应用现状。对这些方法和技术进行优缺点分析,对其所适合的应用场景进行阐述,总结等温扩增技术存在的不足并对其发展前景进行展望。

关键词：等温扩增技术人乳头瘤病毒研究进展

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全球新型冠状病毒主要流行株变异变迁研究进展

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病毒学报 2025年第3期 889-900页

作者：杨馥荧冯晔囡陈操传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所中国疾病预防控制中心-中国科学院武汉病毒研究所新发传染病与生物安全联合研究中心中国科学院生物安全大科学研究中心

新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）（简称新冠病毒）全球大流行期间，通过不断积累有利于自身传播和免疫逃逸的突变而持续进化，导致其在全球范围内持续流行。世界卫生组织（World Health O... 详细信息

新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）（简称新冠病毒）全球大流行期间，通过不断积累有利于自身传播和免疫逃逸的突变而持续进化，导致其在全球范围内持续流行。世界卫生组织（World Health Organization, WHO）根据潜在的公共卫生风险程度，将新冠病毒变异株划分为关切变异株（Variantof concern,VOC）、关注变异株（Variant of interest, VOI）以及监测中的变异株（Variant under monitoring, VUM）三类。WHO在12月2日更新数据表明，当前重点监测的1种VOI和6种VUMs均源自BA.2.86进化分支。本文旨在对当前全球新冠病毒主要流行株的变异变迁最新研究进展进行综述，以期为未来新冠病毒变异株的监测预警工作提供数据支撑。

关键词：新型冠状病毒变异株刺突蛋白传播免疫逃逸

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基于GenBank分析2000—2023年间中国大陆地区人轮状病毒基因序列变迁

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中国病毒病杂志 2025年

作者：陈燕谢迪姜慧敏李利利薛垂召李金松段招军甘肃中医药大学公共卫生学院中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室成都康华生物制品股份有限公司华北理工大学基础医学院河北省慢性疾病基础医学重点实验室中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心科技部国家级热带病国际研究中心

目的利用GenBank中国大陆地区的人轮状病毒（human rotavirus）基因序列，了解2000—2023年间中国大陆地区hRV型别分布特征和变迁过程。方法从GenBank中下载2000—2023年中国大陆地区hRV VP4和VP7序列，对序列进行分型，并根据上传作... 详细信息

目的利用GenBank中国大陆地区的人轮状病毒（human rotavirus）基因序列，了解2000—2023年间中国大陆地区hRV型别分布特征和变迁过程。方法从GenBank中下载2000—2023年中国大陆地区hRV VP4和VP7序列，对序列进行分型，并根据上传作者、时间、标本号等将VP4和VP7关联为同一株病毒；统计分析各年的VP4(P)、VP7(G)的型别及构成比和各毒株（VP4和VP7属于同一株）的型别（G/P）及其构成比和在各年份的分布。结果从GenBank中共下载到2000—2023年中国大陆地区hRV序列4 600条，其中4 124条人轮状病毒VP4和VP7序列用于分析，VP4序列中有8种P基因型，VP7序列中有9种G基因型，关联后获得19种不同G/P型别的毒株。在研究时间范围内，最主要的VP4优势型别为P [8]；而VP7经历了多个优势型别的变迁，从2002年的G3,2012年变迁为G9,2021—2022年出现G8。优势毒株型别最初主要为G3P [8],G1P [8]、G2P [4]次之；自2014年，G9P [8]基因型逐渐出现并成为主要流行基因型；2021年起，G8P [8]开始出现。结论中国大陆地区人轮状病毒流行优势型别发生多次转换，主要体现在G基因型的转换，P基因型长期以P [8]为优势基因型；应当持续监测其型别转换及引起的流行特征变化。

关键词：轮状病毒序列基因型变迁

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