检索结果-内蒙古大学图书馆

2019—2022年长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染病例中肠道病毒流行病学与基因特征分析

中国病毒病杂志 2024年第2期14卷 145-151页

作者：张瑶田玉玲王慧玲王娜王利武谢智博李汶霞王雅各宋金华夏百成孙馨张燕纪龙山东第一医科大学(山东省医学科学院) 山东济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室、传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 长春市儿童医院吉林长春130061

目的了解2019—2022年吉林省长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infections,ARIs)病例中肠道病毒的流行情况及型别组成。方法采集2019年6月—2022年12月长春市儿童医院ARIs患儿的咽拭子样本,并收集患儿临床信息,用... 详细信息

目的了解2019—2022年吉林省长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infections,ARIs)病例中肠道病毒的流行情况及型别组成。方法采集2019年6月—2022年12月长春市儿童医院ARIs患儿的咽拭子样本,并收集患儿临床信息,用描述性分析方法对肠道病毒感染病例的性别、年龄和季节分布情况进行分析。采用实时荧光反转录聚合酶链反应(real-time quantitative reverse transcription PCR,real-time qRT-PCR)技术检测肠道病毒,使用反转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)技术扩增肠道病毒VP1全长并进行系统进化分析。结果共采集2707例ARIs病例的咽拭子样本,检出肠道病毒阳性样本65例,检出率为2.40%。65份阳性样本中,32.31%(21/65)为混合感染,以肠道病毒和鼻病毒的双重混合感染最为常见,占肠道病毒阳性病例的10.77%(7/65)。2019—2022年春季、夏季、秋季和冬季肠道病毒的检出率分别为0、6.91%(40/579)、2.90%(21/725)和0.45%(4/894),不同季节肠道病毒检出率差异有统计学意义(χ^(2)=78.036,P<0.01),夏季检出率最高,秋季次之。本研究共鉴定出10种型别肠道病毒,分别为CVA2、CVA4、CVA5、CVA6、CVA10、CVA16、CVB3、E11、E18和EV-D68,其中CVA4检出最多,占比为44.82%(26/58),其余型别检出占比为1.72%~12.07%。结论2019—2022年长春市儿童ARIs病例中肠道病毒夏秋季检出率较高,肠道病毒感染以EV-A组为主。

关键词：急性呼吸道感染肠道病毒基因分型流行病学住院病例

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我国人副流感病毒3型HN基因的遗传变异及进化特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2022年第2期36卷 141-149页

作者：江洁赵林清穆敏王文洋徐瑾蔡亮谢正德朱贞张燕周杉杉冯意毛乃颖国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所麻疹室北京102206 首都儿科研究所病毒研究室北京100020 安徽理工大学医学院免疫学教研室淮南232001 河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所郑州450016 湖南省疾病预防控制中心微生物检验科长沙410005 首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所感染与病毒研究室北京100045

目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、... 详细信息

目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查,对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定,与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对,应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列,核苷酸同源性在96.6%~100%之间,其中48株为C3基因亚型,1株为C5基因亚型。系统进化分析显示,我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行,毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%,其中C3是我国的优势流行基因亚型,分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支,以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示,其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年,有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳;C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10^(-4)~5.82×10^(-4)替换/位点/年之间;C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点,选择压力以负向选择为主。结论C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别,形成了广泛传播和持续流行态势,并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

关键词：人副流感病毒3型血凝素-神经氨酸酶蛋白基因特征贝叶斯进化分析

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鼻病毒与呼吸道疾病关系研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2025年第2期39卷 254-258页

作者：赵若涵夏百成谢智博徐希柱张燕山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院济南中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室北京

鼻病毒(Rhinovirus, RV)是人类呼吸道感染的重要病原体之一, 与呼吸道疾病的密切相关。RV不仅能引起普通感冒, 还与毛细支气管炎、肺炎、哮喘等下呼吸道疾病相关, 特别是在哮喘的发生与加重中发挥了重要作用。本文系统归纳了现有文献中R... 详细信息

鼻病毒(Rhinovirus, RV)是人类呼吸道感染的重要病原体之一, 与呼吸道疾病的密切相关。RV不仅能引起普通感冒, 还与毛细支气管炎、肺炎、哮喘等下呼吸道疾病相关, 特别是在哮喘的发生与加重中发挥了重要作用。本文系统归纳了现有文献中RV相关的多种呼吸道疾病。虽然目前尚无针对RV的特效治疗药物和疫苗, 但针对RV的多价疫苗和抗病毒药物的研发为未来RV的感染防控提供了更多的参考。明确RV与疾病之间的关系, 将为优化治疗策略、预防和控制呼吸道疾病提供有力支持。

关键词：鼻病毒呼吸道感染流行病学

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等温扩增技术检测人乳头瘤病毒的研究进展

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新发传染病电子杂志 2024年第6期9卷 68-73页

作者：李泓熠马学军帖彦清申辛欣河北北方学院研究生学院河北张家口075000 河北省人民医院检验科河北石家庄0500512 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

宫颈癌是全球第四大女性癌症,几乎所有宫颈癌病例都与人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染有关,因此,HPV感染的早期发现对预防宫颈癌至关重要。WHO建议将HPV DNA检测作为主要筛查方法,等温扩增技术相较于变温扩增技术操作更简... 详细信息

宫颈癌是全球第四大女性癌症,几乎所有宫颈癌病例都与人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染有关,因此,HPV感染的早期发现对预防宫颈癌至关重要。WHO建议将HPV DNA检测作为主要筛查方法,等温扩增技术相较于变温扩增技术操作更简便,反应更高效,对实验条件,操作人员的要求更低,且经济成本更低,因此,更适用于HPV的检测。本文比对分析了用于HPV检测的等温扩增技术方法,常用的扩增产物判读方法及等温扩增技术与其他技术(如微流控芯片技术、CRISPR-Cas技术、智能手机检测和横向流动试纸条)结合检测的应用现状。对这些方法和技术进行优缺点分析,对其所适合的应用场景进行阐述,总结等温扩增技术存在的不足并对其发展前景进行展望。

关键词：等温扩增技术人乳头瘤病毒研究进展

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一种快速检测人腺病毒的免疫层析分析方法的建立

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中华实验和临床病毒学杂志 2021年第1期35卷 101-105页

作者：刘淑慧雷娜宋敬东郑丽舒葛菁蓝雨秦堃周剑芳中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206 北京市朝阳区疾病预防控制中心微生物检验科北京100021

目的建立一种基于免疫层析法(Immunochromatographic assay,ICA)的快速简便的人腺病毒(Human adenoviruses,HAdVs)检测方法。方法利用抗原结合和病毒斑点实验检测发现单克隆抗体3C11和7E6能特异性结合所有测试的人腺病毒,以这两个抗体建... 详细信息

目的建立一种基于免疫层析法(Immunochromatographic assay,ICA)的快速简便的人腺病毒(Human adenoviruses,HAdVs)检测方法。方法利用抗原结合和病毒斑点实验检测发现单克隆抗体3C11和7E6能特异性结合所有测试的人腺病毒,以这两个抗体建立ICA方法。使用培养病毒及10份临床咽拭标本检测了该方法的特异性及灵敏性。结果该ICA能特异性结合HAdV-1、2、3、4、5、6、7、10及胃肠型HAdV-41,极限范围为0.16~10^(3)TCID_(50)/ml,所有成功分离出病毒的临床样本也显示阳性。结论ICA检测方法是一种灵敏度高、特异性强、方便快速检测HAdVs的方法。

关键词：人腺病毒免疫层析法六邻体单克隆抗体

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肉及肉制品中6种致病菌的GeXP多重PCR检测

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食品研究与开发 2021年第13期42卷 168-173页

作者：杨梦婕徐玲丽马学军武桂珍国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 上海爱博才思分析仪器贸易有限公司上海200335

利用多重基因表达(GenomeLabTM eXpress Profiling,GeXP)遗传分析系统建立一种可单管一次同时检测大肠杆菌O157∶H7、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特菌和沙门氏菌6种肉及肉制品中致病菌的多重聚合酶链式反... 详细信息

利用多重基因表达(GenomeLabTM eXpress Profiling,GeXP)遗传分析系统建立一种可单管一次同时检测大肠杆菌O157∶H7、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特菌和沙门氏菌6种肉及肉制品中致病菌的多重聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测方法。评价此方法特异性和灵敏性,并初步应用于市场随机购买的肉类样品的检测。结果显示,该方法可在短时间内实现同时对上述6种致病菌进行检测,且检测灵敏度低至103 CFU/mL,为食源性致病菌高通量快速有效检测提供新的方法技术支持,具有较强的实际应用价值。

关键词：食品安全肉及肉制品 GeXP多重聚合酶链式反应致病菌快速检测

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2020年我国风疹流行病学和病毒基因特征分析

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病毒学报 2021年第3期37卷 638-647页

作者：刘莹崔爱利郭晋源邓丽丽范丽霞魏欢刘李丛艳丽唐小敏雷玥周淑洁彭晓放周珺冯燕张燕毛乃颖许文波朱贞中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206 广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530028 青海省疾病预防控制中心南宁810007 甘肃省疾病预防控制中心兰州730000 四川省疾病预防控制中心成都610041 河北省疾病预防控制中心石家庄050021 贵州省疾病预防控制中心贵阳550004 天津市疾病预防控制中心天津300011 安徽省疾病预防控制中心合肥230601 广东省疾病预防控制中心广州511430 江西省疾病预防控制中心南昌330029 浙江省疾病预防控制中心杭州310051

为了解2020年我国风疹流行病学特征以及流行风疹病毒(Rubella virus,RV)的基因特征,本研究收集整理全国麻疹/风疹监测信息报告管理系统中2020年中国风疹发病数据,分析其流行病学特征;同时,依托全国麻疹/风疹实验室网络获得RV分离株,经... 详细信息

为了解2020年我国风疹流行病学特征以及流行风疹病毒(Rubella virus,RV)的基因特征,本研究收集整理全国麻疹/风疹监测信息报告管理系统中2020年中国风疹发病数据,分析其流行病学特征;同时,依托全国麻疹/风疹实验室网络获得RV分离株,经鉴定后扩增并测定阳性RV分离株的靶基因序列——E1基因的739个核苷酸片段,并与WHO推荐的基因型参考株序列以及已发表的基因亚型参考株序列进行比对确定基因型和亚型,同时与我国2000-2019年间流行的RV进行亲缘性关系分析。结果显示,2020年中国风疹报告发病率为0.18/10万,继2018-2019年风疹的复发和暴发后出现大幅下降,发病人群年龄组主要为10-29岁无免疫史的青少年和成人;2020年我国RV流行的主要基因亚型为1E-L2与2B-L2c,为2018-2019年间检测到的境外输入性病毒。因此,在实施有效的风疹疫苗免疫后,我国本土流行的病毒逐渐被阻断,然而由于我国风疹易感人群的累积和输入性病毒的持续传播导致了我国近些年风疹疫情的回升。鉴于此,我国应根据现状制定更加切实有效的风疹疫苗免疫策略,消除青少年和成年人中的易感人群;同时应进一步加强风疹流行病学和病毒学监测,从而科学地阻断输入病毒的传播。

关键词：风疹流行病学基因特征

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2017-2020年河南省漯河市呼吸道合胞病毒流行特征研究

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病毒学报 2021年第3期37卷 554-560页

作者：谢智博段晓健郭晋源徐瑾宋金华宋晶晶夏百成王慧玲崔爱利朱贞毛乃颖许文波张燕国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 河南省疾病预防控制中心郑州450016 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000

呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)是引起严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)的一个重要病原,尤其以5岁以下儿童为主。为了解河南省漯河市SARI住院患者中RSV感染的流行病学和临床特征,为RSV... 详细信息

呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)是引起严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)的一个重要病原,尤其以5岁以下儿童为主。为了解河南省漯河市SARI住院患者中RSV感染的流行病学和临床特征,为RSV预防控制及临床诊疗提供科学数据,本研究采集2017年10月至2020年8月河南省漯河市SARI住院病例的咽拭子,并收集流行病学和临床信息。采用荧光定量PCR方法鉴定RSV A/B阳性病例,分析其流行病学和临床特征。结果显示,本研究共入组1335例SARI病例,其中220例(16.48%)为RSV阳性,A和B亚型分别占64.55%和30.45%。RSV感染以5岁以下儿童为主(占91.36%),2岁以下婴幼儿占RSV感染病例的一半以上(占55.37%)。RSV流行高峰出现在11月-次年1月,不同年份流行季可前后相差一个月。A、B亚型在不同月份可单独流行也可共流行。受新型冠状病毒肺炎疫情影响,2020年2-8月SARI病例数较往年同期减少60%以上,RSV阳性率在2020年2-8月降低为0。与非RSV感染组相比,RSV更易感染2岁以下儿童,下呼吸道感染占比更高(以支气管肺炎为主)。本研究通过近3年SARI病例监测,揭示河南省漯河市RSV感染以冬春季常见,以下呼吸道感染为主,主要感染5岁以下儿童,其中2岁以下婴幼儿是防控重点人群。新型冠状病毒肺炎流行期间,由于限制性防控措施的干预,RSV感染大大降低。本研究将为RSV疫苗和单克隆抗体等预防性干预手段的使用策略提供基础数据。

关键词：呼吸道合胞病毒(RSV) 新型冠状病毒肺炎严重急性呼吸道感染(SARI) 流行病学特征临床特征

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2018—2019流感监测年度中国大陆A(H1N1)pdm09流感病毒的抗原和基因特性分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第6期34卷 610-615页

作者：谭敏菊成艳辉李希妍隗合江刘佳赵翔肖宁王大燕黄维娟中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的分析2018—2019流感监测年度中国大陆分离的A(H1N1)pdm09流感病毒的抗原和基因特性。方法用红细胞凝集抑制试验对2018—2019流感监测年度的2 958株A(H1N1)pdm09流感病毒进行抗原分析,对其中的279株A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hem... 详细信息

目的分析2018—2019流感监测年度中国大陆分离的A(H1N1)pdm09流感病毒的抗原和基因特性。方法用红细胞凝集抑制试验对2018—2019流感监测年度的2 958株A(H1N1)pdm09流感病毒进行抗原分析,对其中的279株A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA基)因进行了序列测定和分析,并选取流行优势分支的代表株与免疫疫苗后的人血清进行抗原分析。结果检测的2 861株(97%,2 861/2 958)A(H1N1)pdm09流感病毒与疫苗株A/Michigan/45/2015抗原性类似,测序毒株的HA基因均属于6B.1分支,其中269株(96%,269/279)属于6B.1A分支,与疫苗株相比具有S74R、S164T、I295V氨基酸位点的共同变异,6B.1A分支中存在多个有共同氨基酸位点变异的小分支,并且具有S183P氨基酸位点变异的毒株占测序毒株的51%。用免疫疫苗后的人血清进行抗原分析的结果显示血清能抑制绝大部分的流行代表株。结论 2018—2019流感监测年度中国大陆流行的A(H1N1)pdm09流感病毒与同期的疫苗株抗原性匹配,但HA基因存在多样性的特点。

关键词： A(H1N1)pdm09流感病毒抗原性基因特性

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山东省嘉祥县鼠类肠道病毒组分析

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病毒学报 2021年第2期37卷 332-340页

作者：李利利刘蒙蒙王志强林琳徐亚陇段招军国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京100052 青岛大学医学部基础医学院病原生物学系青岛266021 山东省疾病预防控制中心济南250014 陕西中医药大学公共卫生学院西安712046

鼠类是重要的病毒储存库和多种病毒的自然宿主,是对人类病毒传播极具威胁的野生动物之一,因此对鼠类携带病毒进行研究并挖掘其携带新病毒对于病毒病的防治具有重要意义。本研究于2016年在山东省嘉祥县采集99只褐家鼠、仓鼠和黑线姬鼠肠... 详细信息

鼠类是重要的病毒储存库和多种病毒的自然宿主,是对人类病毒传播极具威胁的野生动物之一,因此对鼠类携带病毒进行研究并挖掘其携带新病毒对于病毒病的防治具有重要意义。本研究于2016年在山东省嘉祥县采集99只褐家鼠、仓鼠和黑线姬鼠肠道内容物,通过高通量测序对其病毒组成进行研究。分析结果显示,采集的鼠类样本携带病毒主要包括冠状病毒科、呼肠孤病毒科、星状病毒科、小RNA病毒科、小双节病毒科、圆环病毒科、细小病毒科等。挑选可能与疾病相关的病毒进行进一步的序列分析和进化分析。分析结果显示,本研究中发现的冠状病毒为甲型冠状病毒属,与中国浙江发现的Lucheng-19病毒株和英国UKRn3病毒株具有共同祖先;本研究还发现包括Rosavirus、Rabovirus和Kobuvirus三个种在内的6株小RNA病毒科病毒,其中Rabovirus包含4株序列差异较大的病毒株,表明小RNA病毒在鼠类中具有丰富的基因多样性。研究发现该地区鼠类中同时流行多株星状病毒,表明极其丰富的基因多样性,系统发育分析显示,其中1株与猪的星状病毒4型聚在一起,提示可能的跨种传播。此外,样本中发现一株G3P[3]型A组轮状病毒,其VP4和VP7基因与猴的病毒株具有90%左右核苷酸同源性,而其余片段与鼠类的片段同源性最高,说明该病毒株可能是一株猴-鼠重配病毒株。本研究的鼠类病毒组数据为我国提供更丰富的本底资料,为我国应对相关的新发传染病提供了基础数据支持。

关键词：病毒组啮齿类跨种传播基因多样性新病毒

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