检索结果-内蒙古大学图书馆

病毒学报 2020年第4期36卷 600-609页

作者：冯兆民朱闻斐周丽娟李希妍刘佳高荣保王大燕舒跃龙中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织全球流感参比和研究合作中心感染性疾病诊治协同创新中心国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中山大学公共卫生学院(深圳) 广州510006

目前,欧亚类禽猪流感病毒(Eurasian avian-like H1N1 swine influenza viruses,EA H1N1 SIVs)在我国猪群中广泛流行,同时可跨越种属屏障感染人。PB2-T271A是H5N1、H7N9和2009年甲型H1N1流感病毒中关键的分子标记,可增加病毒在小鼠中的... 详细信息

目前,欧亚类禽猪流感病毒(Eurasian avian-like H1N1 swine influenza viruses,EA H1N1 SIVs)在我国猪群中广泛流行,同时可跨越种属屏障感染人。PB2-T271A是H5N1、H7N9和2009年甲型H1N1流感病毒中关键的分子标记,可增加病毒在小鼠中的致病力。但是,PB2-T271A对EA H1N1 SIVs的影响尚不清楚。在本研究中,我们分析了PB2-T271A突变对EA H1N1 SIVs在细胞和小鼠中复制能力的影响。本研究发现,PB2-T271A突变增加了EA H1N1 SIVs在哺乳动物细胞和禽细胞中的复制能力,增加了EA H1N1 SIVs在小鼠中的致病力。此外,PB2-T271A突变增加了EA H1N1 SIVs的聚合酶活性。因此,我们应该加强对EA H1N1 SIVs中PB2-T271A位点的监测。

关键词：欧亚类禽猪流感病毒 PB2-T271A 复制致病力

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啮齿类动物中汉坦病毒感染血清学和病原学检测方法比较研究

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病毒学报 2019年第2期35卷 196-201页

作者：殷强玲谢昀张全福芜为李阿茜孙丽娜尚翠李川王世文梁米芳李德新李建东中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 江西省疾病预防控制中心南昌330029

致病性汉坦病毒的宿主主要为啮齿类动物,其病毒感染状况是人间疫情发生的关键影响因素,可通过检测宿主动物标本中病毒基因组RNA、蛋白抗原及特异性抗体而进行监测。本研究利用367份鼠肺及鼠血标本,对双抗原夹心ELISA(ELISA)、实时荧光RT... 详细信息

致病性汉坦病毒的宿主主要为啮齿类动物,其病毒感染状况是人间疫情发生的关键影响因素,可通过检测宿主动物标本中病毒基因组RNA、蛋白抗原及特异性抗体而进行监测。本研究利用367份鼠肺及鼠血标本,对双抗原夹心ELISA(ELISA)、实时荧光RT-PCR(RT-PCR)和免疫荧光(IFA)等三种分别检测抗体、核酸和抗原的方法进行比较评估。ELISA法检出抗体阳性鼠血标本46份,阳性率为12.53%;RT-PCR法检出病毒RNA阳性鼠肺标本28份,阳性率为7.63%;IFA检出抗原阳性鼠肺标本24份,阳性率为6.54%。宿主动物组织标本中检出汉坦病毒RNA和(或)结构蛋白抗原的标本,对应的血液标本中可检出病毒特异性抗体,100%(24/24)IFA检测阳性标本和89.3%(25/28)RT-PCR检测阳性标本对应血标本ELISA抗体检测阳性,反之亦然,检出抗体的标本基本包含了可检出抗原和RNA的标本。RT-PCR与IFA检测结果差异无显著性(χa2=0.64,P>0.05),一致性检验Kappa系数为0.71,一致性高(Z=13.66,P<0.05),首先对血标本开展基于ELISA的特异性抗体检测,可显著缩小RT-PCR或IFA法检测病毒RNA或抗原的范围(χb2=12.04,χc2=20.05,P<0.05)。本研究为宿主动物汉坦病毒感染实验室监测方案优化提供了有益的依据。

关键词：汉坦病毒宿主动物监测双抗原夹心ELISA 实时荧光RT-PCR 免疫荧光法

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热力及紫外线对轮状病毒的消毒作用分析

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国际病毒学杂志 2021年第2期28卷 108-110页

作者：李伯阳李慧莹章青王萌璇孙晓曼孔翔羽王宏李丹地庞立丽裴银辉华北理工大学基础医学院河北省慢性疾病基础医学重点实验室唐山063000 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的检验热力及紫外线(ultraviolet,UV)辐照对轮状病毒(rotavirus,RV)的消毒效果,为环境消毒RV提供技术支撑。方法通过计算半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在热力及紫外线处理后RV的滴度变化,... 详细信息

目的检验热力及紫外线(ultraviolet,UV)辐照对轮状病毒(rotavirus,RV)的消毒效果,为环境消毒RV提供技术支撑。方法通过计算半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在热力及紫外线处理后RV的滴度变化,判断消毒效果。结果RV在37℃下24 h内病毒活性无明显变化。在56℃及以上温度下对RV作用10 min即可达到消毒效果。在距离紫外光源15 cm、30 cm处辐射7 min均可对RV产生消毒作用,分别辐射10 min、15 min可达灭活效果。在距离紫外光源1 m处辐射30 min或距离紫外光源2 m处辐射60 min以上均可以达到消毒作用。结论通过56℃及以上温度、近距离UV辐射可对RV进行有效消毒,但距离UV光源较远时则需更长时间的辐射达到消毒作用,为消毒和灭活RV提供了参考方法。

关键词：轮状病毒物理消毒紫外线热力

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尼帕病毒检测方法研究进展

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病毒学报 2019年第6期35卷 948-955页

作者：王浩郑丽舒中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室

尼帕病毒(Nipah virus,NiV)是一种烈性人畜共患病原体,该病毒自从1998年在马来西亚暴发后,相继在新加坡、印度、孟加拉等国多次出现,引发人类重症呼吸道和神经系统疾病,病死率较高。由于NiV的高致病性、具有大流行的潜在威胁以及缺乏有... 详细信息

尼帕病毒(Nipah virus,NiV)是一种烈性人畜共患病原体,该病毒自从1998年在马来西亚暴发后,相继在新加坡、印度、孟加拉等国多次出现,引发人类重症呼吸道和神经系统疾病,病死率较高。由于NiV的高致病性、具有大流行的潜在威胁以及缺乏有效的抗病毒药物和疫苗,因此建立灵敏、快速、特异的检测和诊断方法对于防控未来的NiV疫情尤为重要。本文就NiV检测方法的研究进展进行概述。

关键词：尼帕病毒(NiV) 病毒分离分子诊断血清学检测

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滤膜吸附洗脱法富集模拟水样中甲型肝炎病毒的研究

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第5期33卷 522-525页

作者：赵霖王鑫英邱丰曹经瑗毕胜利国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的优化滤膜吸附洗脱法,富集检测模拟水样中的甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)。方法制备含有HAV的模拟水样,经阴、阳离子两种滤膜吸附之后分别采用摇床、涡流、超声及直接裂解法进行病毒的富集和洗脱,通过Taqman实时荧光定量PCR... 详细信息

目的优化滤膜吸附洗脱法,富集检测模拟水样中的甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)。方法制备含有HAV的模拟水样,经阴、阳离子两种滤膜吸附之后分别采用摇床、涡流、超声及直接裂解法进行病毒的富集和洗脱,通过Taqman实时荧光定量PCR检测洗脱液中的HAV核酸,并对实验数据进行统计分析。结果当模拟水样中含有的病毒总量为300 TCID50时,阴、阳离子滤膜富集HAV的效果未发现显著差异(P=0.825>0.05),但是当模拟水样中的病毒含量提高至1500 TCID50和7500 TCID50时,阴离子滤膜富集后的病毒回收率高于阳离子滤膜(P<0.01)。另外,本研究还发现采用直接裂解的方式进行洗脱后,病毒的回收率达到(68.17±16.79)%,显著高于摇床、涡流和超声等方式(P<0.0001)。结论无论采用阴离子或阳离子滤膜吸附,之后的洗脱过程对HAV的富集有至关重要的影响,通过直接裂解的方式洗脱病毒能够达到较好的回收效果。

关键词：甲型肝炎病毒富集模拟水样荧光定量PCR

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2017~2018年河北省重症手足口病的主要致病病原体为柯萨奇病毒A组6型

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病毒学报 2020年第2期36卷 192-200页

作者：肖金波于秋丽张勇宋洋张曼路环环韩振志刘莹莹冀天娇严冬梅祝双利许文波李琦国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000 河北省疾病预防控制中心石家庄050000

肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手... 详细信息

肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手足口病的病原谱提供了帮助。为了明确河北省2017~2018年重症手足口病的病原谱,本研究采集2017~2018年河北省重症HFMD病例的50份标本(2017年29份,2018年21份)进行病毒分离,从23份标本中分离到病毒,采用一代测序方法获得其全长VP1区序列,而其余27份标本未能直接分离到病毒,其中17份采用高通量测序的方法获得了部分或者全长基因组序列。序列分析结果显示,近年来河北省重症HFMD的肠道病毒病原谱发生了较大变化,2017年重症HFMD标本中,10份检出肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71),1份检出柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16),10份检出柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)(其中高通量测序检出5份),还有3份检出其他肠道病毒;2018年重症HFMD标本中,1份检出CV-A16,7份CV-A6通过高通量测序检出,5份检出柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)(其中高通量测序检出3份),还有3份检出其他肠道病毒。通过高通量测序,可检出病原体的重症标本由原来的23份上升到40份,可检出CV-A6的标本由5份上升到17份,CV-A10由2份上升到5份;重症病例病原谱中CV-A6所占的比例由21.7%(5/23)上升到42.5%(17/40),CV-A10由8.7%(2/23)上升到12.5%(5/40),而EV-A71由于病毒分离比较敏感,含有EV-A71的标本病毒分离全部是阳性,高通量测序并没有多检出,在病原谱中的比例由43.5%(10/23)下降到25.0%(10/40)。RAxML构建的CV-A6和CV-A10的VP1区的系统发育树显示,CV-A6属于中国流行的优势基因亚型D3a,CV-A10属于中国流行的优势基因型C。河北重症HFMD标本检测到的两株CV-A6与其余中国CV-A6序列的3D区的核苷酸相似度为76.4%~98.9%,氨基酸相似度为92.7%~99.7%,两株CV-A10与其余中国CVA10序列的3D区的核苷酸相似度为93.2%~97.1%,氨基酸相似度为97.4%~99.7%。本研究揭示,引起河北重症HFMD的CV-A6和CV-A10均是中国目前流行的优势基因型,与中国流行株相比,并未发生新的重组事件。CVA6和CV-A10在引起河北重症HFMD的病原谱中所占比例逐渐增高,CV-A6超过EV-A71,已成为引起HFMD重症病例的优势型别,提示应该加强对CV-A6和CV-A10的监测,积极研制这两种病毒的疫苗,这将有助于进一步减少重症HFMD病例数,并减轻重症HFMD疾病负担。

关键词：重症手足口病(HFMD) 高通量测序(HTS) 病原谱柯萨奇病毒A组6型(CV-A6) 柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)

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杜贝病毒、盖勒尤卜病毒、蒂亚福拉病毒等三种内罗病毒实时荧光RT-PCR检测方法研究

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国际病毒学杂志 2020年第5期27卷 412-416页

作者：杜珊珊赖丽金李阿茜黄晓霞王芹李川梁米芳李德新李建东中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的建立可检测杜贝病毒(dugbe virus,DUGV)、盖勒尤卜病毒(qalyub virus,QALV)和蒂亚福拉病毒(thiafora virus,TFAV)等三种内罗病毒基因组的实时荧光RT-PCR检测方法。方法收集、整理,比对、分析在公共数据库发布的三种病毒基因组S节段... 详细信息

目的建立可检测杜贝病毒(dugbe virus,DUGV)、盖勒尤卜病毒(qalyub virus,QALV)和蒂亚福拉病毒(thiafora virus,TFAV)等三种内罗病毒基因组的实时荧光RT-PCR检测方法。方法收集、整理,比对、分析在公共数据库发布的三种病毒基因组S节段核苷酸序列,确定检测靶标,利用生物信息软件设计特异性引物、探针,优化检测程序,建立实时荧光定量RT-PCR检测方法,利用体外转录技术制备的模拟样本、其他病毒感染标本、病毒株和正常人血标本比较评价所建方法的检测限、特异性、重复性特征。结果所建实时荧光定量RT-PCR检测方法均可有效扩增检测病毒靶标RNA,检测限分别为160 copies/μL,20 copies/μL和10 copies/μL,检测科萨努尔森林病病毒、乙型流感病毒BV和BY型、甲型流感病毒H3N2、黄热病毒、乙型脑炎病毒、克里米亚-刚果出血热病毒和塔西那病毒样本无非特异性扩增,三种内罗病毒相互间无交叉反应,重复性分析显示变异系数均在2%以内。结论本研究建立的检测DUGV、QALV和TFAV的实时荧光RT-PCR方法,可用于相关临床样本、媒介、宿主动物标本以及进出口物品筛查检测。

关键词：内罗病毒杜贝病毒盖勒尤卜病毒蒂亚福拉病毒实时荧光RT-PCR

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2017～2018监测年度中国大陆A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和基因特性分析

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病毒学报 2019年第3期35卷 431-439页

作者：成艳辉刘佳谭敏菊隗合江肖宁李希妍赵翔杨磊黄维娟王大燕中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

甲型流感病毒易发生基因的突变或重配,曾多次引起世界性大流行,导致严重的疾病负担。为分析2017～2018监测年度我国大陆流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性变异情况以及与疫苗株的匹配性,用免疫雪貂后的抗血清进行红细... 详细信息

甲型流感病毒易发生基因的突变或重配,曾多次引起世界性大流行,导致严重的疾病负担。为分析2017～2018监测年度我国大陆流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性变异情况以及与疫苗株的匹配性,用免疫雪貂后的抗血清进行红细胞凝集抑制试验,对1 079株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原分析,用深度测序法对其中121株流感病毒进行序列测定。抗原分析结果显示,2017～2018年检测的95%以上的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与疫苗株A/Michigan/45/2015抗原性类似。序列分析结果显示,2017～2018年流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的血凝素(Hemagglutinin,HA)基因分为6B.1和6B.2两个分支,绝大部分毒株属于6B.1分支,少数毒株属于6B.2分支,两个分支间毒株的抗原性无明显差异。因此,上述监测结果表明,2017～2018年我国大陆流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与WHO推荐的北半球的疫苗组分匹配。

关键词： A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性基因特性

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2017-2018重庆市手足口病病原谱及主要病原体基因特征分析

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国际病毒学杂志 2023年第5期30卷 393-399页

作者：王雯慧王江峡许红梅张勇孙强何云郭琴王晓艺路环环肖金波赵鹤鹤韩振志严冬梅许文波冀天娇张乐山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 重庆医科大学附属儿童医院感染科、国家儿童健康与疾病临床医学研究中心儿童发育疾病研究教育部重点实验室、儿科学重庆市重点实验室、儿童感染免疫重庆市重点实验室、认知发育与学习记忆障碍转化医学重庆市重点实验室、重庆市干细胞治疗工程技术研究中心、儿童营养与健康重庆市重点实验室 400014 安徽理工大学医学院淮南232001

目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清... 详细信息

目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清型待鉴定,另有86份肠道病毒为阴性。通过病毒分离、核酸浓缩及基因测序等方法对上述261份样本进行鉴定,获得该地区手足口病完整的病原谱。使用MEGA 7.0软件构建四种主要病原体的系统进化树,进行基因特征的研究。结果通过改良的鉴定方法,261份标本中,除3份被鉴定为人副肠孤病毒(Human parechovirus,HPeV)外,其余258份样本均为肠道病毒阳性。其中CVA6(coxsackievirus A6)血清型占比最多,其次为EV-A71(enterovirus A71)另有CVA16(coxsackievirus A16)和CVA10(coxsackievirus A10)以及其他肠道病毒共计13种血清型。系统进化结果显示,重庆市CVA6血清型均为D3a基因亚型,EV-A71、CVA10和CVA16的优势基因亚型分别为C4a,C2b和B1b,这四种优势基因型与全国其他地区的基因型共同循环进化。结论本研究通过优化鉴定方法,提高了肠道病毒的检出率,进一步明确了重庆地区手足口病病原谱构成,CVA6是该地区2017—2018年手足口病的主要病原体,其次是EV-A71,同时这两种血清型也是导致重庆地区重症手足口病主要的病原体。

关键词：手足口病病原谱 VP1基因

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鼻病毒A21基因型的划分及全基因组特征分析

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病毒学报 2020年第1期36卷 1-13页

作者：张强张燕胡满丽谢智博王慧玲宋金华许文波安徽理工大学医学院淮南232001 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室(中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所) 世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430071

人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一。最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染。本研究将2013~2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前... 详细信息

人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一。最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染。本研究将2013~2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前的研究已获得VP4/2区序列),结合从GenBank数据库下载的全球98株HRV-A21代表株,基于VP4/2区构建亲缘性关系树。本研究首次将HRV-A21划分为A、B、C、D、E五个基因型,其中E基因型进一步划分为E1、E2和E3亚型,并发现E1、E2和E3亚型在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。我国流行的HRV-A21以C和E基因型为主。基于VP1区划分基因型的结果与VP4/2区相似。本研究进而对这一株HRV-A21进行了全基因组序列测定,并结合GenBank数据库下载的HRV-A21全基因组序列,对HRV-A21进行基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。结果显示VP2区、VP3区、VP1区和3D区都属于高变区,但变异程度VP1区>VP2区>VP3区>3D区,同时发现了保守的14个N-糖基化位点和26个O-糖基化位点,和新增的5个N-糖基化位点和5个O-糖基化位点。本研究在GenBank数据库的基础上结合本课题组获得的一株HRV-A21序列,对HRV-A21进行基因型和基因亚型的划分,对HRV-A21在全球和我国部分地区的分布情况和流行特点进行了初步的分析,并对HRV-A21全基因组序列特征进行了分析,丰富了HRV-A21基因数据库,为HRV-A21诊断、分子流行病学等的研究以及疾病的防控和治疗提供了基础数据。

关键词：人鼻病毒A21型(HRV-A21) 基因型基因特征全基因组分子流行病学糖基化

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