目的构建共表达流感病毒基质蛋白1(matrix protein 1,M1)和基质蛋白2(M2)基因的重组杆状病毒。方法扩增流感病毒A/PR/8/34株的M1和M2全长基因,并将其分别插入到p Fast Bacdual(p FBD)载体的两个多克隆位点,筛选出阳性重组转座载体p FBD-...
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为了解中国埃可病毒6型(Echovirus type 6,ECHO6)的基因特征。通过对2009~2014年从湖南省手足口病病例监测中分离到的6株ECHO6病毒部分VP1序列测定,并与来自中国5个省和世界范围的138株ECHO6病毒进行序列对比和构建系统进化树。中国ECHO...
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为了解中国埃可病毒6型(Echovirus type 6,ECHO6)的基因特征。通过对2009~2014年从湖南省手足口病病例监测中分离到的6株ECHO6病毒部分VP1序列测定,并与来自中国5个省和世界范围的138株ECHO6病毒进行序列对比和构建系统进化树。中国ECHO6病毒形成2个彼此独立的进化分支,分支1和分支2。湖南省ECHO6病毒均聚集在2c亚分支中,可能具有共同的进化来源。分支2病毒在我国分布较广且流行时间较长,可能是我国的优势流行株。以核苷酸差异>30%为分组依据,可将ECHO6病毒划分为4个基因组A^D,以核苷酸差异在15%~30%之间分组,将D基因组再划分为10个基因亚组,D1~D10。湖南省ECHO6病毒均属于D7基因亚型。研究结果显示,2009~2014年期间,湖南省存在着具有共同进化来源的ECHO6病毒流行。中国至少存在4个不同进化分支的ECHO6病毒流行。
2010年世界卫生组织（World Health Organization,WHO）对Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎（脊灰）病毒（Vaccinederived Poliovirus,VDPV）定义进行了修订,为研究新定义的Ⅱ型VDPV的基因特征及进化,本研究对山西省2014年1例急性弛缓性麻痹（Acu...
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2010年世界卫生组织（World Health Organization,WHO）对Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎（脊灰）病毒（Vaccinederived Poliovirus,VDPV）定义进行了修订,为研究新定义的Ⅱ型VDPV的基因特征及进化,本研究对山西省2014年1例急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中分离到的1株Ⅱ型VDPV进行全基因组序列测定和分析。测序显示毒株的基因全长为7 439个碱基,共编码2207个氨基酸,与Sabin2疫苗株相比不存在碱基的插入和缺失。该毒株在已知的减毒位点5′非编码区nt481上发生了回复突变,而在另一个减毒位点VP1衣壳编码区nt2909位点上未发生核苷酸变异。毒株与Sabin1发生重组,重组位点位于3D非结构编码区的nt6 247～6 281之间。VP1编码区基因进化树分析表明山西Ⅱ型VDPV的进化独立于国内外至今发现的其它Ⅱ型VDPVs,按照脊灰已知的基因进化速率估算该毒株已在人群中循环约176d。本研究再次证明了中国脊灰实验室网络监测的敏感性,能够及时准确地发现VDPV,在中国维持无脊灰状态过程中发挥重要作用。
目的分析中国部分甲型肝炎（甲肝）病毒（Hepatitis A Virus,HAV）流行株结构蛋白VP3-VP1编码区核苷酸及氨基酸序列特点,并比较与甲肝减毒活疫苗（Hepatitis A Attenuated Live Vaccine,Hep A-L）标本序列差别。方法收集39份甲肝病例急...
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目的分析中国部分甲型肝炎（甲肝）病毒（Hepatitis A Virus,HAV）流行株结构蛋白VP3-VP1编码区核苷酸及氨基酸序列特点,并比较与甲肝减毒活疫苗（Hepatitis A Attenuated Live Vaccine,Hep A-L）标本序列差别。方法收集39份甲肝病例急性期血清样本及2份市售Hep A-L标本,经核酸提取、逆转录及巢式聚合酶链反应,测得结构-非结构蛋白VP3-VP1-2A编码区序列,进行基因亲缘关系、氨基酸序列同源性等分析。结果检测到的部分HAV流行株序列均为IA亚型,其在结构-非结构蛋白VP3-VP1-2A编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.8%-100%和99.3%-100%,与检测的2份Hep A-L标本的核苷酸和氨基酸序列同源性为90.6%-91.9%和99.1%-99.4%。其中的1条序列在VP3-56位,发生丝氨酸（Serine,Ser）→脯氨酸（Proline,Pro）替代;3条序列在VP1-112位,发生苏氨酸（Threonine,Thr）→异亮氨酸（Isoleucine,Ile）替代,靠近中和抗原位点VP1-114位;所有序列在已发表的中和抗原位点处氨基酸无变化。选择压力分析表明,检测到的部分HAV流行株序列在VP3-VP1编码区处于负向选择。检测的2份Hep A-L标本序列均为IB亚型,在已发表的中和抗原位点处氨基酸无变化。结论HAV的结构蛋白编码区核苷酸序列存在一定差异,但其氨基酸序列相对保守。检测到的3条HAV流行株序列在中和抗原位点附近发生氨基酸替代,值得进一步研究。
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