轮状病毒减毒活疫苗自2009年由世界卫生组织(World Health Organization,WHO)推荐纳入国家免疫规划,多个国家先后将轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq和Rotarix纳入国家免疫规划,然而轮状病毒减毒活疫苗大面积接种后在多个国家发现轮状病毒优...
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轮状病毒减毒活疫苗自2009年由世界卫生组织(World Health Organization,WHO)推荐纳入国家免疫规划,多个国家先后将轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq和Rotarix纳入国家免疫规划,然而轮状病毒减毒活疫苗大面积接种后在多个国家发现轮状病毒优势基因型发生改变的情况,但在不同地区出现变化趋势不同的情况。本文通过收集不同地区大面积接种轮状病毒减毒活疫苗前后轮状病毒流行的变化来探讨轮状病毒减毒活疫苗是否对轮状病毒基因型变化存在影响。
目的建立甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)数字芯片式RT-PCR(dRT-PCR)方法并与real time RT-PCR(RT-qPCR)方法进行比较,选出适用于检测草莓中HAV的最佳方法。方法提取HAV疫苗RNA,优化dRT-PCR的反应条件,评价其特异性;碱性洗脱-PEG...
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目的建立甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)数字芯片式RT-PCR(dRT-PCR)方法并与real time RT-PCR(RT-qPCR)方法进行比较,选出适用于检测草莓中HAV的最佳方法。方法提取HAV疫苗RNA,优化dRT-PCR的反应条件,评价其特异性;碱性洗脱-PEG浓缩法对草莓标本进行前处理后提取核酸,同时采用dRT-PCR与RT-qPCR方法,检测纯水或草莓基质中HAV疫苗RNA的敏感性、抑制率;比较人工污染草莓中HAV的回收率,并应用于市售标本中的检测。结果确立了dRT-PCR反应的最适退火温度为60℃,最佳引物、探针浓度为0.4μmol/L、0.4μmol/L、0.2μmol/L,特异度良好;两种检测方法检测HAV疫苗RNA在纯水或草莓基质中的敏感性没有明显差异,dRT-PCR的抑制率较低。dRT-PCR与RT-qRCR在检测较高浓度HAV污染草莓标本时的回收率分别为12.90±0.006%、30.12±0.02%;在检测较低浓度HAV污染草莓标本时的回收率分别为18.27±0.07%、10.85±0.03%,差异均具有统计学意义(P<0.05)。对市售标本进行检测,两种方法检测结果均为阴性。结论本研究建立的dRT-PCR法,与RT-qPCR检测不同基质中的HAV RNA敏感性没有明显差异,但dRT-PCR对PCR反应抑制物有较好的耐受能力,在检测低浓度HAV时回收率较高。两种检测方法均可用于草莓中甲型肝炎病毒的定量检测,可根据具体实际情况进行选择。
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