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2008～2017年安徽省手足口病重症病例流行病学及病原学分析

病毒学报 2019年第3期35卷 461-466页

作者：杨倩史永林葛盈露马婉婉陈国平吴家兵张勇张燕严冬梅冀天娇张曼许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 安徽省疾病预防控制中心合肥230601 潍坊医学院潍坊261053

手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)为自限性疾病,但部分病例会发展成重症,甚至死亡。目前部分省份已经针对HFMD重症病例展开研究。本研究基于2008～2017年安徽省HFMD重症病例的监测数据、人口数据和地理资料,采用描述性流行... 详细信息

手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)为自限性疾病,但部分病例会发展成重症,甚至死亡。目前部分省份已经针对HFMD重症病例展开研究。本研究基于2008～2017年安徽省HFMD重症病例的监测数据、人口数据和地理资料,采用描述性流行病学方法对安徽省HFMD重症病例的流行病学及病原学构成进行系统分析。结果显示:2008～2017年,安徽省累计报告HFMD重症病例共4 738例,在全国排名第11位,其中死亡病例147例,在全国排名第9位。2008～2017年,安徽省各个地市均有HFMD重症病例报道,尤其以皖北地区为重点高发地区。流行病学分析提示,夏季为发病主高峰,秋冬季为次高峰,2008～2017年安徽省HFMD重症病例最主要的发病人群为5岁以下散居儿童,且男性多于女性。肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)仍是引起HFMD重症病例的绝对优势病原体,占全部重症病例的84.09%。本研究提示安徽省HFMD重症病例发病分布呈现明显季节性和地区差异以及特定人群高发。今后应继续加强安徽省HFMD重症病例流行病学与实验室监测,在高发季节,针对HFMD重症病例高发人群,采取积极有效干预措施,以降低重症病死率。

关键词：手足口病(HFMD) 重症病例流行病学病原学

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3型腺病毒免提取核酸重组酶介导的等温扩增实时荧光检测方法的建立及应用

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第6期33卷 653-657页

作者：王瑞欢张益向星宇湛志飞李鑫娜申辛欣朱贞张瑞卿白雪丁段青霞凡国豪张红马学军湖南省疾病预防控制中心长沙410005 南华大学公共卫生学院衡阳421001 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的建立3型腺病毒(human adenovirus 3,HAdV-3)免提取核酸的重组酶介导的等温扩增(recmbinase acid amplification,RAA)实时荧光检测方法。方法根据HAdV-3基因保守序列分别设计1对引物和1条探针,通过对免提核酸的条件摸索和优化,建立... 详细信息

目的建立3型腺病毒(human adenovirus 3,HAdV-3)免提取核酸的重组酶介导的等温扩增(recmbinase acid amplification,RAA)实时荧光检测方法。方法根据HAdV-3基因保守序列分别设计1对引物和1条探针,通过对免提核酸的条件摸索和优化,建立1种免提取核酸,重组酶介导的等温扩增实时荧光检测方法;通过对培养的毒株进行系列稀释,免提取核酸分析该方法的灵敏度;通过检测其他呼吸道病毒的原始样本,评价该方法的特异性;并检测HAdV-3临床样本,与传统的提核酸实时荧光定量PCR方法进行比较。结果本研究建立的免提取核酸实时荧光RAA方法对10倍系列稀释的HAdV-3毒株进行检测,和实时荧光定量PCR方法相比,灵敏度相当,对应的最低浓度稀释样本的Ct值为36.87,对常见其他型别的呼吸道病毒检测无交叉反应。两种方法对56例HAdV-3阳性临床样本同时检测,结果完全一致。结论本文首次报道了免提取核酸的实时荧光RAA检测HAdV-3的方法,该方法具有较高的灵敏度和特异性,适合应用于临床实验室及基层单位快速检测HAdV-3。

关键词：腺病毒3型免提取核酸重组酶介导的等温扩增检测

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2012-2018年安徽省风疹病毒基因特征分析

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中国疫苗和免疫 2019年第3期25卷 248-252,256页

作者：周淑洁朱贞程晓东柴瑜陈霞唐继海张宁安徽省疾病预防控制中心安徽合肥230601 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的分析2012-2018年安徽省流行风疹病毒(Rubella virus,RV)的基因特征。方法从安徽省14个地市获得2012-2018年RV分离株,扩增和测定其基因序列(nt8731-9469),鉴定RV基因型,分析与WHO参考株、中国其他省份流行株、其他国家和地区流行株... 详细信息

目的分析2012-2018年安徽省流行风疹病毒(Rubella virus,RV)的基因特征。方法从安徽省14个地市获得2012-2018年RV分离株,扩增和测定其基因序列(nt8731-9469),鉴定RV基因型,分析与WHO参考株、中国其他省份流行株、其他国家和地区流行株的基因亲缘性关系和序列差异。结果获得安徽省2012-2018年RV分离株127株,经鉴定,1E基因型21株、2B基因型106株。1E基因型RV毒株流行于2012-2013年,属于中国本土流行的1E-ClusterA优势基因亚型,2014-2018年未检测到该基因型,2018年检测到输入型1E基因型毒株。2012-2018年多数2B基因型毒株与中国其他省份同期流行的2B基因型毒株一致,同属于2B-ClusterC基因亚型,2012年同时检测到输入型2B基因型毒株。安徽省流行的1E和2B基因型RV在E1基因的重要功能区域均高度保守。结论 2012-2018年安徽省流行RV基因型发生了新的变化,呈现多样性特点。

关键词：风疹病毒基因型

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2009—2017年浙江省手足口病流行病学特征及病原学监测分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第1期33卷 1-5页

作者：王笑笑蔡剑韩桃利王琦梅曹艳丽葛琼冀天娇浙江省疾病预防控制中心传染病预防控制所杭州310051 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 绍兴市疾病预防控制中心 312088 浙江省疾病预防控制中心微生物所杭州310051

目的分析浙江省2009-2017年手足口病流行病学特征和病原学监测结果,为手足口病的防控提供科学依据。方法运用描述流行病学方法分析手足口病在浙江省的三间分布特征,运用荧光定量逆转录聚合酶链反应的方法对标本进行检测。结果2009-2017... 详细信息

目的分析浙江省2009-2017年手足口病流行病学特征和病原学监测结果,为手足口病的防控提供科学依据。方法运用描述流行病学方法分析手足口病在浙江省的三间分布特征,运用荧光定量逆转录聚合酶链反应的方法对标本进行检测。结果2009-2017年,浙江省共累计报告手足口病病例1108093例,年平均发病率226.24/10万。浙江省手足口病呈周期性流行,2010、2012,2014和2016年的发病水平高于其他年份。4~7月份呈现发病主高峰.秋冬呈现次高峰。温州、台州和宁波等地市的手足口病发病水平高于其他地市。1~3岁儿童发病占65.67%,散居儿童占69.27%。病原学监测数据显示轻症手足口病病例肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)所占比例呈下降趋势,非EV-A71、非柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)的其他肠道病毒明显升高,重症和死亡病例仍以EV-A71为主(56.3%)。结论浙江省手足口病的地区、季节和人群特征明显,近年来轻症病例以非EV-A71、非CV-A16的其他肠道病毒为主,重症和死亡病例以EVA71病原为主。持续的病原学监测有助于掌握优势病原型别,从而为防控提供依据。

关键词：手足口病流行病学特征病原学监测

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五株人冠状病毒NL63的基因型鉴定及S1 domain基因特征分析撤回

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病毒学报 2019年

作者：何佩崔爱利徐瑾高立冬余鹏博孙凯旋许文波许晓光大连医科大学国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室（中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所）世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室河南省疾病预防控制中心湖南省疾病预防控制中心陕西省疾病预防控制中心

为阐明我国部分地区人冠状病毒（Human coronavirus,HCoV）NL63基因特征,本研究对2013年陕西省、2018年河南省和湖南省送检的5株HCoV-NL63核酸检测阳性的呼吸道样本进行HCoV-NL63基因型别鉴定及S1 domain基因特征分析。通过对HCoV-NL63... 详细信息

为阐明我国部分地区人冠状病毒（Human coronavirus,HCoV）NL63基因特征,本研究对2013年陕西省、2018年河南省和湖南省送检的5株HCoV-NL63核酸检测阳性的呼吸道样本进行HCoV-NL63基因型别鉴定及S1 domain基因特征分析。通过对HCoV-NL63棘突蛋白（Spike glycoprotein,S）基因的S1 domain区域进行基因扩增和序列测定,同时结合GenBank数据库下载的1983～2018年其他国家74条HCoV-NL63代表株序列和2007～2010年中国流行的12条HCoV-NL63代表株序列,构建基因亲缘性关系树,并对S蛋白的S1 domain区域进行核苷酸序列比对分析。结果提示全球HCoV-NL63流行株可划分为A和B两个基因型;A基因型可进一步划分为A0,A1,A2和A3四个基因亚型,其中本研究将GenBank中2008年中国流行的2株HCoV-NL63毒株划分为新基因亚型（A3）;B基因型可进一步划分为B0,B1和B2三个基因亚型。A和B基因型的HCoV-NL63代表株序列在地域分布上无明显差异,但A基因型不同基因亚型的HCoV-NL63序列在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。在我国A和B基因型HCoV-NL63均已被检测到,但主要以A基因型流行为主,且主要集中在A1和A2基因亚型。不同基因型HCoV-NL63序列在S1 domain区域核苷酸和氨基酸序列上存在特征性差异。本研究通过对五株HCoV-NL63基因型鉴定及S1 domain基因特征分析,初步阐明了我国部分地区流行的HCoV-NL63基因型/基因亚型分布情况及基因特征,丰富了我国本土流行的HCoV-NL63基因数据库,为我国HCoV-NL63分子流行病学研究及分子检测和监测技术的改进和验证提供了基础基因数据。

关键词：人冠状病毒NL63（HCoV-NL63）基因型基因特征分子流行病学

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北京地区住院患儿WU多瘤病毒感染的流行病学研究

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病毒学报 2019年第1期35卷 64-70页

作者：王超麻粉莲高寒春姚立红王浩魏田力郑丽舒国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京100052 首都医科大学附属北京友谊医院儿科北京100050

自2007年Gaynor A M等人通过高通量测序在肺炎患儿呼吸道样本中发现了WU多瘤病毒(Washington University polyomavirus,WUPyV)以来,WUPyV在世界各地被广泛检出。为了解北京地区急性呼吸道感染住院儿童中WUPyV感染情况及其临床特征,收集... 详细信息

自2007年Gaynor A M等人通过高通量测序在肺炎患儿呼吸道样本中发现了WU多瘤病毒(Washington University polyomavirus,WUPyV)以来,WUPyV在世界各地被广泛检出。为了解北京地区急性呼吸道感染住院儿童中WUPyV感染情况及其临床特征,收集北京地区2017年4月至2018年3月共1 276份呼吸道感染住院患儿的鼻咽抽吸物样本,使用real time PCR方法对样本进行WUPyV检测,同时对WUPyV阳性样本进行17种常见呼吸道病毒筛查。共检出WUPyV阳性样本76份(5.96%,76/1 276),4岁以下儿童居多(92.11%,70/76);WUPyV感染全年可见,无显著季节性;多伴随其他呼吸道病毒混合感染(60.53%,46/76),最常见混合感染为鼻病毒和A型流感病毒;WUPyV单一感染者与混合感染者病毒载量无显著性差异,临床诊断和表现基本一致;WUPyV感染患儿的常见诊断为支气管炎(68.42%,52/76)和肺炎(30.26%,23/76);临床症状主要表现为高热、咳嗽、咳痰。研究结果提示WUPyV是北京地区急性呼吸道感染住院患儿呼吸道样本中常见病毒之一,多见于4岁以下儿童。

关键词：急性呼吸道感染(ARTI) WU多瘤病毒(WUPyV) 流行病学

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一株引起严重急性呼吸道感染病例的A亚型人呼吸道合胞病毒全基因组基因特征分析

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病毒学报 2019年第1期35卷 27-36页

作者：杜佳徐瑾崔爱利许文波张燕国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室(中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所)世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 河南省疾病预防控制中心郑州450016

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是导致儿童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根据对单克隆抗体的反应,HRSV分为A、B两个亚型。为探讨严重急性呼吸道感染(Severe acute respi-ratory infection,SARI... 详细信息

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是导致儿童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根据对单克隆抗体的反应,HRSV分为A、B两个亚型。为探讨严重急性呼吸道感染(Severe acute respi-ratory infection,SARI)病例中HRSV全基因组基因特征,本研究对2017年河南省漯河市住院SARI病例中检测到的1株HRSV A亚型病毒通过Sanger测序方法对其全基因组序列进行了测定和分析。通过Sequencher 5.4.5、MEGA 5.05、BioEdit 7.0.5等生物信息学软件进行序列拼接和比对,进行了基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。基于HRSV全基因组序列和11个单个蛋白基因序列构建的亲缘性关系分析结果提示本研究中检测到的这株HRSVA病毒(RSVAs/***/CHN/42.17)属于ON1基因型,该型是我国近年流行的优势基因型。该病毒全基因组序列与35条全球代表株的核苷酸和氨基酸同源性分别为92.69%～99.82%和93.63%～99.67%;G蛋白编码区氨基酸变异最高,而F蛋白相对保守。糖基化位点分析发现,该病毒的F蛋白有6个N-糖基化位点,未发现O-糖基化位点,此结果与原型株long株相同;G蛋白N-糖基化位点有6个,O-糖基化位点为82个,而原型株long株有11个N-糖基化位点,15个O-糖基化位点。本研究对2017年河南省漯河市SARI病例中一株HRSVA病毒全基因组序列进行了测定,与世界其他地区报道的HRSVA亚型病毒全基因组序列进行了对比分析,揭示了SARI病例中我国HRSV优势流行ON1基因型病毒全基因组的核苷酸和氨基酸变异特征,以及G蛋白和F蛋白编码区糖基化情况,丰富了我国HRSV基因数据库,也为HRSV的核酸检测方法的建立、疫苗研发和预防性单克隆抗体的评价提供了核苷酸和氨基酸的基础数据。

关键词：人呼吸道合胞病毒(HRSV) 全基因组基因特征糖基化

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人诺如病毒NS6蛋白的表达、纯化及活性验证

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第6期33卷 646-649页

作者：袁越新燕庞立丽段招军内蒙古医科大学基础医学院呼和浩特010000 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的在大肠埃希菌中表达人诺如病毒(norovirus,NoV)NS6非结构蛋白,为了获得高纯度且具有酶活性的人诺如病毒NS6蛋白。方法将NoV NS6蛋白基因克隆至原核表达载体pDE1中,转化至*** BL21感受态细胞中进行表达,产物经亲和及分子筛层析纯化... 详细信息

目的在大肠埃希菌中表达人诺如病毒(norovirus,NoV)NS6非结构蛋白,为了获得高纯度且具有酶活性的人诺如病毒NS6蛋白。方法将NoV NS6蛋白基因克隆至原核表达载体pDE1中,转化至*** BL21感受态细胞中进行表达,产物经亲和及分子筛层析纯化。NS6蛋白在37 ℃条件下,酶切融合蛋白15VP1-6P,检测其酶切活性。结果 NS6蛋白在大肠埃希菌中获得了稳定、高效表达,纯化后纯度可达95%以上。NS6蛋白能够切割含3C酶切位点的融合蛋白。结论在大肠埃希菌中成功表达了具有酶切活性的NoV非结构蛋白NS6,为进一步研究NoV的致病机制奠定了基础。

关键词：人诺如病毒非结构蛋白NS6 亲和层析分子筛酶切

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2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒分子特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第4期33卷 342-346页

作者：闵小雨王爽吴秋华从宪玲周剑惠许松涛许文波安徽理工大学淮南232001 吉林省疾病预防控制中心长春130000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 吉林大学中日联谊医院长春130000

目的分析2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒(varicella zoster virus,VZV)基因型别,区分疫苗株与野毒株。方法2017年1~3月在吉林省收集到的10份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本,采用实时荧光定量PCR方法检测病毒核酸,用普通PCR扩增病毒的... 详细信息

目的分析2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒(varicella zoster virus,VZV)基因型别,区分疫苗株与野毒株。方法2017年1~3月在吉林省收集到的10份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本,采用实时荧光定量PCR方法检测病毒核酸,用普通PCR扩增病毒的ORF22、ORF38和ORF62的特定区域。用ORF22的5个SNPs确定病毒株的基因型别,用ORF38和ORF62的4个SNPs区分疫苗株与野毒株。使用MEGA5和BioEdit软件分析序列结果。结果10份疑似样本均为VZV阳性,Clade 2遗传支。其中JL17-7样本在38 048位发生了C→T的同义突变。ORF22核苷酸的亲缘性关系树分析发现,10份样本均和Clade 2代表株在同一个分支上,与Clade 2代表株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.5%~100%和99.3%~100%。10份样本的ORF38和ORF62的4个特异SNPs均为A-T-T-T,与野毒株一致。结论2017年吉林省流行的VZV均属Clade 2遗传支,且均为野毒株。

关键词：水痘-带状疱疹病毒基因型疫苗株野毒株

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热力及紫外线对鼠诺如病毒的消毒作用分析

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国际病毒学杂志 2020年第6期27卷 466-468页

作者：李伯阳李慧莹章青孔翔羽庞立丽裴银辉段招军华北理工大学基础医学院唐山063000 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的检验热力及紫外线对鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)的消毒效果,完善预防人诺如病毒(human norovirus,HuNV)感染的消毒措施。方法通过半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在不同温度、不同作... 详细信息

目的检验热力及紫外线对鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)的消毒效果,完善预防人诺如病毒(human norovirus,HuNV)感染的消毒措施。方法通过半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在不同温度、不同作用时间等条件下热力及紫外线对MNV的消毒效果。结果MNV在4℃、25℃下可以稳定存在14 d,在37℃下可以维持5 d。在56℃下30 min、58℃下5 min、60℃下1 min作用MNV均可达到消毒效果。在距离紫外光源15 cm或30 cm处辐射7.5 min,以及在距离紫外光源1 m或2 m处辐射60 min,均可对MNV产生消毒效果。结论通过热力及紫外线均可对MNV进行有效消毒,为消毒和灭活HuNV提供了参考方法和依据。

关键词：诺如病毒物理消毒紫外线热力

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