目的分析中国部分甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A Virus,HAV)流行株结构蛋白VP3-VP1编码区核苷酸及氨基酸序列特点,并比较与甲肝减毒活疫苗(Hepatitis A Attenuated Live Vaccine,Hep A-L)标本序列差别。方法收集39份甲肝病例急...
详细信息
目的分析中国部分甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A Virus,HAV)流行株结构蛋白VP3-VP1编码区核苷酸及氨基酸序列特点,并比较与甲肝减毒活疫苗(Hepatitis A Attenuated Live Vaccine,Hep A-L)标本序列差别。方法收集39份甲肝病例急性期血清样本及2份市售Hep A-L标本,经核酸提取、逆转录及巢式聚合酶链反应,测得结构-非结构蛋白VP3-VP1-2A编码区序列,进行基因亲缘关系、氨基酸序列同源性等分析。结果检测到的部分HAV流行株序列均为IA亚型,其在结构-非结构蛋白VP3-VP1-2A编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.8%-100%和99.3%-100%,与检测的2份Hep A-L标本的核苷酸和氨基酸序列同源性为90.6%-91.9%和99.1%-99.4%。其中的1条序列在VP3-56位,发生丝氨酸(Serine,Ser)→脯氨酸(Proline,Pro)替代;3条序列在VP1-112位,发生苏氨酸(Threonine,Thr)→异亮氨酸(Isoleucine,Ile)替代,靠近中和抗原位点VP1-114位;所有序列在已发表的中和抗原位点处氨基酸无变化。选择压力分析表明,检测到的部分HAV流行株序列在VP3-VP1编码区处于负向选择。检测的2份Hep A-L标本序列均为IB亚型,在已发表的中和抗原位点处氨基酸无变化。结论HAV的结构蛋白编码区核苷酸序列存在一定差异,但其氨基酸序列相对保守。检测到的3条HAV流行株序列在中和抗原位点附近发生氨基酸替代,值得进一步研究。
目的通过对中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2013年脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(Polio Laboratory Network,PLN)监测数据和各项监测指标的分析和评估,为维持我国无脊灰状态提供病毒学依据。方法对中国免疫规划监测信息管理系统数据库中,31个省(自治区、直辖市,下同)报告的急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例个案调查表和中国疾病预防控制中心(Center for Disease Control and Prevention,CDC)病毒病预防控制所国家脊灰实验室(National Polio Laboratory,NPL)的监测数据库进行统计分析,对PLN的各项运转指标进行评价。结果中国2013年PLN收集到5623例AFP病例的11 126份粪便标本,14天内双份粪便标本采集率为92.78%,合格粪便标本采集率为92.35%,鉴定结果 28天内反馈率为99.10%。2013年从5623例粪便标本中有111例分离到脊灰病毒(Poliovirus,PV),分离率为1.97%;606例粪便标本分离到非脊灰肠道病毒(Non-polio Enterovirus,NPEV),分离率为10.78%。2013年,NPL收到PLN送检的237份PV分离物,按单个血清型定型统计共计304株,其中19株为疫苗衍生(Vaccine-derived)PV(VDPV),1株来源于1例非AFP病例,另18株来源于1例免疫缺陷相关的(Immunodeficiency-associated)VDPV(i VDPV)病例;未发现野生型(Wild)PV(WPV)。2013年,NPL和31个省CDC脊灰实验室都通过了世界卫生组织(World Health Organization)粪便标本PV等EV的新检测流程的盲样标本考核,NPL和其中8个省CDC脊灰实验室接受并通过了WHO现场评估认证,其他省级CDC脊灰实验室通过信函认证表格认证。结论中国PLN 2013年运转正常,未发现WPV或WPV病例,为维持我国无脊灰状态,早期发现VDPV或VDPV病例,早期采取应对措施阻断其传播提供了重要的病毒学依据。
目的对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_(A71))的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链...
详细信息
目的对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_(A71))的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法进行筛查,对HEV_(A71)阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_(A71)各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_(A71)进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_(A71)代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_(A71)分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_(4a)进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_(A71)在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_(4a)亚型HEV_(A71)在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。
暂无评论