目的分析2019年青岛市从3例有摩洛哥旅行史甲型肝炎(甲肝)病例中检测到的甲肝病毒(Hepatitis A virus,HAV)株基因特征和感染来源。方法对甲肝病例进行流行病学调查,采集急性期血清标本并提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增和/或拼接HAV VP1...
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目的分析2019年青岛市从3例有摩洛哥旅行史甲型肝炎(甲肝)病例中检测到的甲肝病毒(Hepatitis A virus,HAV)株基因特征和感染来源。方法对甲肝病例进行流行病学调查,采集急性期血清标本并提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增和/或拼接HAV VP1-2A区和近全基因组核苷酸序列并构建系统进化树,分析本研究HAV与GenBank中参考株的核苷酸和氨基酸同源性以确定基因型,分析主要中和抗原表位关键氨基酸位点突变和基因重组。结果3例甲肝病例在发病潜伏期内有摩洛哥旅行史和半生食贝类海产品史,并检测到HAV核酸。3株HAV均位于系统进化树的ⅠA基因亚型欧洲分支,且在VP1-2A区与ⅠA亚型参考株的核苷酸和氨基酸差异分别仅为0.29%-7.45%和0.00%-2.59%;病例1感染的HAV与2018年爱尔兰分离株18IRL89195近全基因组的核苷酸序列同源性最高(98.41%),仅在编码区的3D区第80位(V/L)和第372位(K/R)氨基酸不同。病例2和病例3感染的HAV近全基因组序列完全相同,与2016年法国污水分离株G22-029的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为99.85%和100%。未发现3株HAV存在主要中和抗原表位关键氨基酸位点突变和基因重组。结论本研究HAV毒株属于ⅠA基因亚型,推测为境外感染且可能与半生食贝类海产品有关。
目的本研究旨在开发一种快速、准确的流感病毒一体化核酸检测方法。方法设计了针对近年来国内流感病毒主要流行株的特异性引物和探针,将其与提取、扩增试剂和即时检测(point of care test,POCT)系统整合,实现针对流感病毒的核酸提取、...
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目的本研究旨在开发一种快速、准确的流感病毒一体化核酸检测方法。方法设计了针对近年来国内流感病毒主要流行株的特异性引物和探针,将其与提取、扩增试剂和即时检测(point of care test,POCT)系统整合,实现针对流感病毒的核酸提取、反应体系配制、扩增反应和结果判读功能的快速一体化病毒核酸检测流程。使用培养的流感病毒对检测体系进行检测下限测试,并对检测体系进行特异性测试。结果成功设计了甲型和乙型流感病毒的二重扩增引物和探针,实现了500拷贝/ml的检测下限,并通过特异性测试验证了检测试剂对腺病毒、呼吸道合胞病毒等其他呼吸道病原体无交叉反应。本研究建立的基于POCT技术的流感病毒核酸快速检测方法,可以实现在50 min内完成核酸提取、扩增和结果判读检测全流程,同时可以实现检测数据的实时上传。结论开发的基于POCT技术的流感病毒快速检测试剂盒,实现了"样品进、结果出"的便捷操作,适合在基层医疗机构中快速检测流感病毒,具有重要的临床应用价值。
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