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2023年河南省急性弛缓性麻痹病例中非脊髓灰质炎肠道病毒病原学及流行病学分析

病毒学报 2025年第03期 634-644页

作者：杨建辉张明瑜张璐豆巧华白祎然马雅婷郭永豪张勇河南省疾病预防控制中心河南省免疫预防医学重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室

为了解2023年河南省急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中非脊髓灰质炎肠道病毒（Nonpolio enterovirus,NPEV）的病原学及流行病学特征，为AFP的防控以及治疗提供理论支持。本研究采集2023年报告的AFP病例双份粪便标本... 详细信息

为了解2023年河南省急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中非脊髓灰质炎肠道病毒（Nonpolio enterovirus,NPEV）的病原学及流行病学特征，为AFP的防控以及治疗提供理论支持。本研究采集2023年报告的AFP病例双份粪便标本进行病毒分离培养，对检出的NPEV毒株VP1区进行核苷酸序列测定和分析，使用mafft v7.526和MEGA 5.1软件对序列进行比对和遗传进化分析。使用SPSS 26软件对数据进行统计分析。结果显示2023年河南省报告706例AFP病例，报告发病率为3.13/10万，共检出25株NPEV，检出率为3.54%(25/706），其中20株为A组肠道病毒（Enterovirus A,EV-A），占比为80%,5株为B组肠道病毒（Enterovirus B,EV-B），占比为20.00%，未检出C组和D组肠道病毒。EV-A中共有6个血清型，其中柯萨奇病毒A4(Coxsackievirus,CVA4）检出数最多（均为C基因型），检出率为35.00%(7/20），其次为CVA10（均为C基因型），检出率为30.00%(6/20),EV-B均为CVB2（均为D基因型），三种血清型均与手足口病例中检出的的毒株关系较近。不同人群之中，3～5岁组AFP病例报告率最高，为30.45%(215/706),0～2岁组中NPEV检出率最高，为5.46%(10/183），男女发病数比为1.37:1，不同性别之间NPEV检出率差异无统计学意义（P>0.05）。在地区分布上，EV-A分布最为广泛，其中CVA4主要分布在豫北、豫中和豫西，CVA10主要分布在豫北、豫中和豫南，EV-B主要分布在豫东和豫南。在时间分布上，夏秋两季检出率较高，冬春季检出率相对较低，其中EV-A呈现双峰，最高峰出现在10月份，EV-B主要发生在6-8月份。以上结果表明，2023年河南省分离的NPEV以EV-A中的CVA4和CVA10为主要血清型，且分布最为广泛，相比往年以EV-B为主要血清型发生了显著变化，后期应继续对NPEV进行监测，为NPEV可能引起的疾病的暴发流行预测预警提供基线数据。

关键词：急性弛缓性麻痹非脊髓灰质炎肠道病毒病原学特征

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中国两株罕见G9P-N1基因型轮状病毒重配株全基因组序列分析

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病毒学报 2025年第2期 462-472页

作者：唐晓苹范佳欣熊光萍魏宇航董梦洁车如意张无敌李楚楚沙比热木·托合塔木王宏章青孔翔羽庞立丽李丹地甘肃中医药大学公共卫生学院传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京市通州区卫生健康监督所江苏省疾病预防控制中心新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心病原检定所

为研究中国两株罕见G9P[4]-N1型RVA重配株的全基因组特征，采用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）方法，对2022年收集的两份G9P[4]-N1型RVA标本进行全基因组扩增。应用MEGA11.0、Geneious Prime2023.2.1、Geneious9.0.2和DNASTAR等软件对RVA毒株进行全序列及遗传变异和进化分析，成功获取两株G9P[4]-N1型RVA的全基因组序列。结果显示两株RVA毒株的全基因组基因型均为G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2，两株RVA毒株所有节段核苷酸序列的相似性为：98.5%～99.5%。系统进化树显示VP7、VP4和NSP2基因分别为G9-Ⅲ、P[4]-Ⅴ、NSP2-N1。中国两株G9P[4]型RVA毒株为罕见的G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2型，VP7、VP4、NSP2等关键基因节段与美国、俄罗斯、捷克等国外G9P[4]型RVA相似度高，且与本国G9型流行株亲缘关系相对较远，推测该罕见G9P[4]-N1型RVA重配株可能由境外输入。中国两株G9P[4]基因型JS97、XJ1109毒株与疫苗株RotaTeqTM（G1～G4、P[8]）和疫苗株RotarixTM、疫苗Rotavac原始株116E及LLR原始毒株核苷酸相似性为81.2%～91.3%，在关键中和抗原表位存在较多氨基酸位点差异，该差异是否会影响疫苗针对中国G9P[4]-N1基因型的保护效果需要进一步研究。

关键词：轮状病毒 G9P[4]基因型分子特征全基因组

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2018-2021年中国发热伴血小板减少综合征流行特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第1期45卷 112-116页

作者：黄晓霞杜珊珊李阿茜李川田婷婷刘铁柱王芹梁米芳王世文李建东李德新中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的分析我国发热伴血小板减少综合征(SFTS)流行现状及趋势。方法采集中国疾病预防控制信息系统2018-2021年全国SFTS病例数据,采用Excel 2016、Joinpoint 5.0.2、SPSS 26.0和GraphPad Prism 8.0等软件进行统计学和描述流行病学分析,尤... 详细信息

目的分析我国发热伴血小板减少综合征(SFTS)流行现状及趋势。方法采集中国疾病预防控制信息系统2018-2021年全国SFTS病例数据,采用Excel 2016、Joinpoint 5.0.2、SPSS 26.0和GraphPad Prism 8.0等软件进行统计学和描述流行病学分析,尤其重点省份按月报告SFTS病例情况。结果2018-2021年,全国共有25个省份累计报告病例8835例,年报告发病率呈上升趋势,病例具有一定的区域聚集性,但以散发为主,报告病例数自3月开始逐渐增多,主要集中在4-10月(96.79%,8551/8835),一般在5-7月达高峰;人群分布以中老年农民为主,女性略多于男性,平均病死率为5.38%,不同地区差异较大,病死率随年龄增长而增加。结论2018-2021年,我国SFTS流行特征虽维持稳定,但报告病例数逐渐增多,分布范围呈扩大趋势,应予以关注。

关键词：发热伴血小板减少综合征流行特征监测

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2018—2019流感监测年度中国大陆A(H1N1)pdm09流感病毒的抗原和基因特性分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第6期34卷 610-615页

作者：谭敏菊成艳辉李希妍隗合江刘佳赵翔肖宁王大燕黄维娟中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的分析2018—2019流感监测年度中国大陆分离的A(H1N1)pdm09流感病毒的抗原和基因特性。方法用红细胞凝集抑制试验对2018—2019流感监测年度的2 958株A(H1N1)pdm09流感病毒进行抗原分析,对其中的279株A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hem... 详细信息

目的分析2018—2019流感监测年度中国大陆分离的A(H1N1)pdm09流感病毒的抗原和基因特性。方法用红细胞凝集抑制试验对2018—2019流感监测年度的2 958株A(H1N1)pdm09流感病毒进行抗原分析,对其中的279株A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA基)因进行了序列测定和分析,并选取流行优势分支的代表株与免疫疫苗后的人血清进行抗原分析。结果检测的2 861株(97%,2 861/2 958)A(H1N1)pdm09流感病毒与疫苗株A/Michigan/45/2015抗原性类似,测序毒株的HA基因均属于6B.1分支,其中269株(96%,269/279)属于6B.1A分支,与疫苗株相比具有S74R、S164T、I295V氨基酸位点的共同变异,6B.1A分支中存在多个有共同氨基酸位点变异的小分支,并且具有S183P氨基酸位点变异的毒株占测序毒株的51%。用免疫疫苗后的人血清进行抗原分析的结果显示血清能抑制绝大部分的流行代表株。结论 2018—2019流感监测年度中国大陆流行的A(H1N1)pdm09流感病毒与同期的疫苗株抗原性匹配,但HA基因存在多样性的特点。

关键词： A(H1N1)pdm09流感病毒抗原性基因特性

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尼帕病毒检测方法研究进展

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病毒学报 2019年第6期35卷 948-955页

作者：王浩郑丽舒中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室

尼帕病毒(Nipah virus,NiV)是一种烈性人畜共患病原体,该病毒自从1998年在马来西亚暴发后,相继在新加坡、印度、孟加拉等国多次出现,引发人类重症呼吸道和神经系统疾病,病死率较高。由于NiV的高致病性、具有大流行的潜在威胁以及缺乏有... 详细信息

尼帕病毒(Nipah virus,NiV)是一种烈性人畜共患病原体,该病毒自从1998年在马来西亚暴发后,相继在新加坡、印度、孟加拉等国多次出现,引发人类重症呼吸道和神经系统疾病,病死率较高。由于NiV的高致病性、具有大流行的潜在威胁以及缺乏有效的抗病毒药物和疫苗,因此建立灵敏、快速、特异的检测和诊断方法对于防控未来的NiV疫情尤为重要。本文就NiV检测方法的研究进展进行概述。

关键词：尼帕病毒(NiV) 病毒分离分子诊断血清学检测

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2013～2017年中国大陆流行的A(H3N2)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性分析

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病毒学报 2018年第6期34卷 793-799页

作者：黄维娟谭敏菊李希妍成艳辉隗合江肖宁赵翔曾晓旭王大燕中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室

为了解我国大陆流行的A(H3N2)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性,本文对2013年至2017年分离自30个省(自治区/直辖市)的4907株流感病毒进行了生物学耐药检测。4907株A(H3N2)亚型流感毒株均对Oseltamivir敏感,检测到7株(0.14%)对Zan... 详细信息

为了解我国大陆流行的A(H3N2)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性,本文对2013年至2017年分离自30个省(自治区/直辖市)的4907株流感病毒进行了生物学耐药检测。4907株A(H3N2)亚型流感毒株均对Oseltamivir敏感,检测到7株(0.14%)对Zanamivir敏感性降低的毒株,其中2014年6株,检测的IC50值与参考IC50值(0.28nM)相比有24.03～49.21倍升高,序列分析发现6株毒株在NA基因上均有Q136K的变异;2017年1株,在NA基因上有Q136Q/K的混合变异,检测的IC50值与参考IC50值(0.31nM)相比有10.90倍的升高。上述检测毒株均来自MDCK细胞病毒分离培养物,由于未获得原始呼吸道咽拭子样本的序列,尚不能排除是细胞传代导致的Q136K位点突变。因此,上述监测数据表明2013～2017年我国大陆流行的A(H3N2)亚型流感毒株对神经氨酸酶抑制剂依然敏感,本研究为临床抗流感病毒药物的使用提供了科学依据。

关键词：流感病毒 A(H3N2)亚型神经氨酸酶抑制剂 IC50值敏感性

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尼帕病毒Taqman qRT-PCR检测方法的建立

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病毒学报 2020年第3期36卷 371-376页

作者：王浩麻粉莲王超黄益曼郭琼郑丽舒中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京100052

尼帕病毒(NiV)是一种高致病性人畜共患病原体,可引起人类致死性脑炎和严重的呼吸系统疾病,目前尚无有效的抗NiV药物和疫苗,建立NiV检测方法十分必要。建立针对尼帕病毒N基因的Taqman qRT-PCR检测方法,应用于样本尼帕病毒检测及定量。针... 详细信息

尼帕病毒(NiV)是一种高致病性人畜共患病原体,可引起人类致死性脑炎和严重的呼吸系统疾病,目前尚无有效的抗NiV药物和疫苗,建立NiV检测方法十分必要。建立针对尼帕病毒N基因的Taqman qRT-PCR检测方法,应用于样本尼帕病毒检测及定量。针对尼帕病毒N基因保守区域设计引物和探针,建立Taqman qRT-PCR检测方法,评价该检测方法灵敏度、特异性和可重复性,并应用此方法进行样本检测。本研究建立的Taqman qRT-PCR检测方法可以特异性的检测尼帕病毒,检测灵敏度为10~2拷贝/μL,标准曲线线性范围为1.0×10~9~1.0×10~2拷贝/μL,可重复性较好,能够有效检出尼帕病毒马来西亚病毒株和孟加拉病毒株,可用于样本尼帕病毒的检测及定量。

关键词：尼帕病毒逆转录实时荧光定量PCR 核酸检测

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世界卫生组织轮状病毒疫苗立场文件—2021年7月

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中国疫苗和免疫 2022年第1期28卷 128-134页

作者：毛彤瑶(编译) 段招军(审校) 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

依据为成员国提供卫生政策指导意见的职责,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)定期发布预防具有全球公共卫生影响疾病的疫苗的立场文件。这些文件重点关注疫苗在大规模免疫规划中的使用,总结疾病和疫苗的基本背景信息。本文... 详细信息

依据为成员国提供卫生政策指导意见的职责,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)定期发布预防具有全球公共卫生影响疾病的疫苗的立场文件。这些文件重点关注疫苗在大规模免疫规划中的使用,总结疾病和疫苗的基本背景信息。本文件表明了WHO对如何在全球使用轮状病毒疫苗目前的立场。立场文件经外部专家和WHO工作人员审阅,并由WHO免疫策略咨询专家组(Strategic Advisory Group of Experts on Immunization,SAGE)审核和认可(https://***/groups/strategic-advisory-group-of-experts-on-immunization/)。

关键词：轮状病毒疫苗外部专家卫生政策免疫规划免疫策略全球公共卫生

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滤膜吸附洗脱法富集模拟水样中甲型肝炎病毒的研究

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第5期33卷 522-525页

作者：赵霖王鑫英邱丰曹经瑗毕胜利国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的优化滤膜吸附洗脱法,富集检测模拟水样中的甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)。方法制备含有HAV的模拟水样,经阴、阳离子两种滤膜吸附之后分别采用摇床、涡流、超声及直接裂解法进行病毒的富集和洗脱,通过Taqman实时荧光定量PCR... 详细信息

目的优化滤膜吸附洗脱法,富集检测模拟水样中的甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)。方法制备含有HAV的模拟水样,经阴、阳离子两种滤膜吸附之后分别采用摇床、涡流、超声及直接裂解法进行病毒的富集和洗脱,通过Taqman实时荧光定量PCR检测洗脱液中的HAV核酸,并对实验数据进行统计分析。结果当模拟水样中含有的病毒总量为300 TCID50时,阴、阳离子滤膜富集HAV的效果未发现显著差异(P=0.825>0.05),但是当模拟水样中的病毒含量提高至1500 TCID50和7500 TCID50时,阴离子滤膜富集后的病毒回收率高于阳离子滤膜(P<0.01)。另外,本研究还发现采用直接裂解的方式进行洗脱后,病毒的回收率达到(68.17±16.79)%,显著高于摇床、涡流和超声等方式(P<0.0001)。结论无论采用阴离子或阳离子滤膜吸附,之后的洗脱过程对HAV的富集有至关重要的影响,通过直接裂解的方式洗脱病毒能够达到较好的回收效果。

关键词：甲型肝炎病毒富集模拟水样荧光定量PCR

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2016-2019年我国诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

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疾病监测 2021年第8期36卷 774-779页

作者：朱曦孔翔羽章青李静欣李慧莹靳淼段招军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的了解中国诺如病毒监测网络(CaliciNet China)的发展及2016—2019年中国诺如病毒分子流行特征。方法收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应(real-time,RT-PCR)进行诺如... 详细信息

目的了解中国诺如病毒监测网络(CaliciNet China)的发展及2016—2019年中国诺如病毒分子流行特征。方法收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应(real-time,RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序,将数据录入CaliciNet China数据库并进行基因分型。结果2016年10月至2019年9月,共报告诺如病毒疫情1153起,对其中776起疫情(67.3%)的阳性样本进行了基因分型。94.9%的暴发疫情与人–人传播有关,发生在托幼机构或学校(94.4%),每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰(65.0%)。57.6%的诺如病毒暴发由GⅡ.2[P16]引起。结论GⅡ.2[P16]是2016年10月至2019年9月引起我国诺如病毒暴发的主要基因型,主要发生在托幼机构或或学校,CaliciNet China正在进行的监测提供了有关毒株基因分型和暴发特征的信息。

关键词：诺如病毒胃肠炎暴发监测网络基因型

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