检索结果-内蒙古大学图书馆

国际病毒学杂志 2020年第3期27卷 242-246页

作者：段青霞李鑫娜何小周申辛欣张瑞卿白雪丁凡国豪高源王金荣陈子巍张金艳马学军河北医科大学研究生学院石家庄050017 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 河北医科大学第四医院检验科石家庄050011

目的建立一种实时荧光逆转录重组酶介导的等温扩增(reverse transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)技术检测寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)的方法,以实现ZIKV的现场快速筛查及诊断。方法通过基因组序列比对,选择ZIKV保守... 详细信息

目的建立一种实时荧光逆转录重组酶介导的等温扩增(reverse transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)技术检测寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)的方法,以实现ZIKV的现场快速筛查及诊断。方法通过基因组序列比对,选择ZIKV保守序列设计RT-RAA特异性引物和探针,并用系列稀释的ZIKV重组质粒与毒株核酸验证方法的灵敏性与重复性,通过检测登革病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等其他虫媒病毒验证方法的特异性。结果建立的RT-RAA方法可在39℃恒温条件下30 min内对ZIKV进行高效扩增,检测系列稀释的ZIKV重组质粒,其95%检测限可达到15拷贝/反应,特异性强,与登革病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒虫媒病毒无交叉反应,且重复性好。结论本研究建立的ZIKV的RT-RAA等温扩增方法,具有反应迅速,无需精密仪器,操作简单等优点,适合于应急快速检测。

关键词：寨卡病毒重组酶介导的等温扩增技术快速检测

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2017～2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析

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病毒学报 2019年第5期35卷 730-740页

作者：周杉杉毛乃颖姬奕昕张燕崔爱利许文波扈瑞平内蒙古医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室呼和浩特010110 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室(中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所) 世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206

严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起... 详细信息

严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起呼吸道感染的常见病原。为分析河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV-3)检出状况及血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因特征,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)方法对河南省漯河市中心医院于2017年10月10日至2018年12月27日送检的627份SARI病例咽拭子进行核酸检测,筛查HPIV-3阳性标本,对HPIV-3阳性标本用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增其HN基因,并对扩增产物进行序列测定,与GenBank数据库中的国内外HPIV-3 HN基因进行对比分析,绘制系统进化树,并分析基因特征。627份咽拭子标本中,HPIV-3阳性有27份,检出率为4.3%。59%的HPIV-3阳性病例分布于春夏季,发病人群中,6岁以下儿童占96.3%。通过RT-PCR方法共获得18株HPIV-3的HN基因,经过序列测定及对比分析可划分为两个基因亚型:C3a和C3b。C3a亚型有10株,C3b亚型有8株。18株HPIV-3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.1%~100.0%和98.8%~100%。与原型株Wash/47885/57相比,本次扩增18株HPIV-3 HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%~95.0%和97.0%~97.7%。与GenBank中国内外的HPIV-3 HN基因的代表株比较,其核苷酸及氨基酸同源性分别为94.1%~98.5%和96.8%~97.0%。本研究提示HPIV-3是河南省漯河市儿童SARI病例中检出的病原之一,2017年10月至2018年12月期间,至少有C3a、C3b两个基因亚型的HPIV-3毒株在漯河市共流行。

关键词：人副流感病毒(HPIVs) 血凝素-神经氨酸酶蛋白(HN)基因基因特征同源性分析

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2013～2017年中国大陆流行的A(H3N2)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性分析

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病毒学报 2018年第6期34卷 793-799页

作者：黄维娟谭敏菊李希妍成艳辉隗合江肖宁赵翔曾晓旭王大燕中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室

为了解我国大陆流行的A(H3N2)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性,本文对2013年至2017年分离自30个省(自治区/直辖市)的4907株流感病毒进行了生物学耐药检测。4907株A(H3N2)亚型流感毒株均对Oseltamivir敏感,检测到7株(0.14%)对Zan... 详细信息

为了解我国大陆流行的A(H3N2)亚型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性,本文对2013年至2017年分离自30个省(自治区/直辖市)的4907株流感病毒进行了生物学耐药检测。4907株A(H3N2)亚型流感毒株均对Oseltamivir敏感,检测到7株(0.14%)对Zanamivir敏感性降低的毒株,其中2014年6株,检测的IC50值与参考IC50值(0.28nM)相比有24.03～49.21倍升高,序列分析发现6株毒株在NA基因上均有Q136K的变异;2017年1株,在NA基因上有Q136Q/K的混合变异,检测的IC50值与参考IC50值(0.31nM)相比有10.90倍的升高。上述检测毒株均来自MDCK细胞病毒分离培养物,由于未获得原始呼吸道咽拭子样本的序列,尚不能排除是细胞传代导致的Q136K位点突变。因此,上述监测数据表明2013～2017年我国大陆流行的A(H3N2)亚型流感毒株对神经氨酸酶抑制剂依然敏感,本研究为临床抗流感病毒药物的使用提供了科学依据。

关键词：流感病毒 A(H3N2)亚型神经氨酸酶抑制剂 IC50值敏感性

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第1期34卷 22-22页

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2017年5月至12月河北省儿童病毒性脑炎病原学研究

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第3期33卷 275-279页

作者：樊涛韩彦洁张瑞卿于盼辉赵莉齐菊菊李鑫娜王瑞欢孙一硕赵剑胡川泽王佶孙素真马学军河北医科大学附属河北省儿童医院石家庄050031 石家庄市第四医院输血科 050011 河北医科大学石家庄050017 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京 102206 南华大学衡阳421001

目的了解河北省儿童病毒性炎病原学特点。方法随机收集2017年5月2017年12月河北省儿童医院神经内科住院诊断为病毒性脑炎患儿的脑脊液样本399例,采用结合自动化工作站的实时荧光定量PCR方法和Sanger测序方法检测脑脊液中的病毒核酸。运... 详细信息

目的了解河北省儿童病毒性炎病原学特点。方法随机收集2017年5月2017年12月河北省儿童医院神经内科住院诊断为病毒性脑炎患儿的脑脊液样本399例,采用结合自动化工作站的实时荧光定量PCR方法和Sanger测序方法检测脑脊液中的病毒核酸。运用SPSS21. 0统计分析软件结合临床资料进行分析。不同月份EV引起的脑炎的感染率比较,采用行x列表卡方检验法进行分析。不同病毒引起的脑炎患者的MRI和脑电图阳性率比较采用Fisher确切概率检验法进行分析。不同病毒合并感染阳性率的比较采用Fisher确切概率进行分析。结果399例样本中80例阳性,检出阳性率20.05%,包括肠道病毒(Entervirus, EV ) 22例,甲型流感病毒(Influenza A virus, FluA )4 例,腮腺炎病毒(Mumps virus, MuV )3 例,单纯疱疹 1 型(Herpes simplex virus 1,HSV1)2 例,单纯疱疹 2 型(Herpes simplex virus 2, HSV2) 1 例,EB 病毒(Epstein - Barr virus, EBV ) 4 例,巨细胞病毒(Cytomegalovirus, CMV) 7 例,带状疱疹病毒(Varicella-zoster Virus, VZV) 7 例,腺病毒(Adenovirus,AdV)8例,人疱疹病毒6型(Human herpesvirus 6,HHV6)14例。阳性样本中8例为合并感染,分别为EV 合并 HHV6 3 例,EV 合并乙性脑炎病毒(Japanese encephalitis virus, JEV, HHV2 合并 AdV 1 例,FluA合并HHV6 1例,MuV合并HHV6 1例,HSV1合并VZV 1例。河北省儿童EV病毒性脑炎高发于5月、6月(P = 0.016)。 HHV6病毒脑炎较非HHV6病毒脑炎易合并感染(P = 0.016);不同病毒引起的脑炎患者的MRI和脑电图阳性率均无统计学差异(P>0.05)。结论 EV是河北省儿童病毒性脑炎最常见的病原。FluA引起的脑炎在临床不容被忽视。

关键词：病毒性脑炎病原谱自动化工作站实时荧光定量PCR

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2011—2017年威海市发热伴血小板减少综合征监测结果分析

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国际病毒学杂志 2019年第3期26卷 165-168页

作者：陈德颖吕涛黄晓霞山东省威海市疾病预防控制中心 264200 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的了解威海市发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)流行特征和监测现状。方法利用国家疾病监测信息管理系统数据,分析威海市2011—2017年SFTS流行特征。抽取SFTS监测病例中核酸检测阴性且住院... 详细信息

目的了解威海市发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)流行特征和监测现状。方法利用国家疾病监测信息管理系统数据,分析威海市2011—2017年SFTS流行特征。抽取SFTS监测病例中核酸检测阴性且住院期间有发热和血小板减少的病例,进行回顾性调查和抗体检测。结果2011─2017年威海市共报告SFTS病例446例,病死率为6.5%(29/446);病例集中在5—10月,以农民(342/446,76.7%)为主,98.4%(439/446)病例年龄≥40岁;死亡病例年龄中位数(71岁)高于存活病例(62岁)。病例早期核酸检测阴性标本SFTS病毒IgM抗体阳性率较高(9/11,81.8%),回顾性调查采集标本IgG抗体阳性率、抗体滴度均较高。81.8%病例的双份标本IgG抗体呈阳转或4倍及以上升高。结论威海市SFTS年发病数呈波动性变化,病例以中老年农民为主。病例双份标本中高SFTS病毒抗体检出率,提示核酸检测阴性SFTS疑似病例应慎重排除。

关键词：发热伴血小板减少综合征流行特征抗体检测监测

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风疹病毒核酸检测在风疹消除阶段应用的必要性

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病毒学报 2019年第2期35卷 343-350页

作者：赵培蓓任虎朱贞曹蕾扈瑞平内蒙古医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室呼和浩特010110 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室(中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所)世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 安徽理工大学淮南232001

风疹是由风疹病毒(Rubella virus,RV)引起的一种以发热、出疹为主要表现的急性呼吸道传染病,孕早期感染RV可引起先天性风疹综合征(Congenital rubella syndrome,CRS)。风疹是疫苗可预防性传染病,2008年我国将风疹疫苗纳入国家扩大免疫规... 详细信息

风疹是由风疹病毒(Rubella virus,RV)引起的一种以发热、出疹为主要表现的急性呼吸道传染病,孕早期感染RV可引起先天性风疹综合征(Congenital rubella syndrome,CRS)。风疹是疫苗可预防性传染病,2008年我国将风疹疫苗纳入国家扩大免疫规划,通过连续10年免疫规划的实施,风疹发病率迅速下降,2014～2017年已接近风疹消除的目标(风疹发病率为0.8/10万～0.12/10万)。加强对风疹可疑病例的报告和实验室鉴别诊断,对隔离传染源、指导疫苗使用以及阻断RV传播具有重要的作用。《麻疹和风疹病毒感染实验室诊断手册》要求在风疹暴发流行阶段,只针对每起暴发采集5～10份血标本,检测风疹IgM是风疹病例确诊的金标准;而在消除风疹和CRS阶段要求对每一例散发疑似病例采集血清标本和鼻咽拭子,分别进行IgM抗体和RV核酸的检测。本文对我国在消除风疹和CRS阶段将RV核酸检测应用于风疹病例早期诊断的必要性进行了阐述。

关键词：先天性风疹综合征(CRS) 风疹病毒(RV) 核酸检测消除风疹

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2008～2014年中国6省市流行的人呼吸道合胞病毒B亚型G蛋白编码基因特征分析

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病毒学报 2019年第2期35卷 211-219页

作者：宋金华王慧玲石晶崔爱利杜佳杨子峰孙利伟张蕾张红张燕许文波国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 北京市大兴区亦庄医院北京102600 广州医科大学第一附属医院呼吸疾病国家重点实验室广州呼吸疾病研究所广州510120 长春市儿童医院长春130061 陕西省疾病预防控制中心西安710054 湖南省疾病预防控制中心长沙410005 安徽理工大学医学院淮南232001

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是引起婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体之一。HRSV粘附蛋白(Attachment glycoprotein,G)是病毒膜表面糖蛋白,介导保护性免疫,是抗HRSV抗体和疫苗等的研究热点之一。为研究2008... 详细信息

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是引起婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体之一。HRSV粘附蛋白(Attachment glycoprotein,G)是病毒膜表面糖蛋白,介导保护性免疫,是抗HRSV抗体和疫苗等的研究热点之一。为研究2008～2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因的基因特征,于2008～2014年收集的363份HRSV阳性临床标本或病毒株中挑选89份代表株进行G蛋白编码基因全长核苷酸序列的扩增和测序,使用Sequencher 5.0进行序列的编辑,使用MEGA 5.0进行序列比对和亲缘关系进化树构建以及氨基酸变异分析。89份代表株分别挑选自中国北京、吉林、广东、河北、湖南、陕西6省市发热呼吸道感染患者鼻咽拭子或病毒分离株,基因型包括BA9、BA10、BAc、BA、CB1及SAB4,覆盖我国近年流行的优势基因型。亲缘关系分析显示,89株代表株可以分为6个分支,同一基因型G蛋白编码基因核苷酸序列荟聚为一个分支;89份代表株之间的核苷酸(氨基酸)遗传距离为0.03(0.04),与原型株CH-18537株的核苷酸(氨基酸)遗传距离为0.08～0.10(0.14～0.18),其中B5分支与原型株的核苷酸(氨基酸)遗传距离最远为0.10(0.18);氨基酸变异主要在第二高变区,其次为第一高变区。在中心保守区(aa164～176)以及CX3C模序区,89条HRSV B亚型G蛋白编码基因氨基酸序列与原型株CH-18537株一致。本研究表明2008～2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因变异较多,但在中心保守区和CX3C模序区保守,本研究为我国HRSV的病毒学研究提供了基础科学数据。

关键词：人呼吸道合胞病毒B亚型(HRSV B) G蛋白氨基酸变异

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海南省2014-2017年手足口病病原构成及柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

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中国病毒病杂志 2019年第4期9卷 249-255页

作者：韩桃利李丹丹冀天娇郭悦马焱潘正帆宋洋陈海云许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206 海南省疾病预防控制中心海南海口570203

目的分析海南省2014-2017年手足口病(HFMD)流行特征及病原谱构成,阐明海南省流行的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)基因特征。方法采用描述性流行病学方法分析手足口病流行特征及病原构成变化,利用Sequencher、Bioedit和MEGA软件,结合GenBan... 详细信息

目的分析海南省2014-2017年手足口病(HFMD)流行特征及病原谱构成,阐明海南省流行的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)基因特征。方法采用描述性流行病学方法分析手足口病流行特征及病原构成变化,利用Sequencher、Bioedit和MEGA软件,结合GenBank数据库中1949-2017年CV-A6序列和本研究的海南省CV-A6毒株序列,构建亲缘性进化树揭示其基因特征。结果病原监测结果显示:2014-2017年,海南省HFMD实验室诊断2 520例HFMD病例,其中肠道病毒A组71型(EV-A71)895例(35.52%)、柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)463例(18.37%)和其他肠道病毒(EV)1 162例(46.11%)。但不同年份和不同月份的优势病原呈现动态变化,除2014年EV-A71为优势病原(占56.00%)外,其余年份均以其他EV为主,各年占比分别为59.04%、33.69%、67.72%;不同病例类型病原构成有明显差异,轻症病例优势病原除2014年为EV-A71 (58.84%)外,其余年份均为其他EV (分别占59.77%、44.66%和78.81%);重症病例中2014和2016年EV-A71为优势病原(分别占85.92%、48.72%),2015和2017年其他EV为优势病原(分别占51.87%、100.00%);死亡病例病原全部为EV-A71。2014-2016年送检标本中未检出CV-A6,故仅分析2017年CV-A6的基因特征:2017年84株肠道病毒阳性标本,经血清型鉴定CV-A640例(占47.62%),提示CV-A6为海南省2017年HFMD中的主要优势病原;海南省CV-A6序列均属于国内流行的D3a进化分支,并与我国其他省份CV-A6毒株共同进化。结论本研究揭示了2014-2017年海南省HFMD病原谱构成及流行的CV-A6基因型和基因亚型,为海南省HFMD防控策略制定以及是否研制多价手足口病疫苗提供了科学数据。应继续加强海南省HFMD病原谱动态监测。

关键词：手足口病病原构成柯萨奇病毒A组6型基因特征基因型

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柯萨奇病毒A组2型江苏分离株(JS16-80)全基因组序列分析

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病毒学报 2018年第5期34卷 512-518页

作者：杨倩严冬梅张勇樊欢嵇红冀天娇宋洋许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206 江苏省疾病预防控制中心南京210009

柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS... 详细信息

柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS16-80在非结构蛋白P2和P3多区段均有出现重组现象,并且多个A组肠道病毒血清型参与了非结构蛋白的重组。本研究可帮助了解CV-A2的全基因组特征和重组特点,进一步为CV-A2重组对其进化和潜在致病力的影响提供基础数据。

关键词：手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组2型(CV-A2) 全基因组序列基因重组

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