检索结果-内蒙古大学图书馆

2007年中国气象学会年会

作者：殷实王炜罡葛茂发北京分子科学国家实验室，北京，100080 中国科学院化学研究所，分子动态与稳态结构国家重点实验室

黑碳气溶胶由于其对大气辐射平衡及气候的影响而受到高度重视，碘化学则是大气化学中十分重要的研究领域。然而对于卤素化合物尤其含碘化合物与黑碳气溶胶表面相互作用的研究还少有报道。本文首次研究了烷基碘(CH3I、C2H5I、i-C3H7I)在... 详细信息

黑碳气溶胶由于其对大气辐射平衡及气候的影响而受到高度重视，碘化学则是大气化学中十分重要的研究领域。然而对于卤素化合物尤其含碘化合物与黑碳气溶胶表面相互作用的研究还少有报道。本文首次研究了烷基碘(CH3I、C2H5I、i-C3H7I)在黑碳表面的吸附，并得到298K下，CH3I(2-4 Torr)在黑碳表面的吸附系数为(1.03士0.15)×10<'-2：而C2H5I、i-C3H7I与黑碳表面相互作用使黑碳表面发生钝化，吸附系数与暴露时间相关，在黑碳表面的初始吸附系数分别为(2.3±0.9)×10<'-2，(9.5±3.8)×10<'-2。

关键词：烷基碘黑碳表面大气化学气溶胶

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以G-四链体为靶标的抗肿瘤药物虚拟筛选、分子机理及生物活性研究

以G-四链体为靶标的抗肿瘤药物虚拟筛选、分子机理及生物活性研究

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第三届国际理论化学、分子模拟和生命科学研讨会暨第三届北京宏剑公司用户大会

作者：李骞李旭东向俊峰孙红霞张虹刘岩周秋菊唐亚林徐筱杰北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所北京100080 北京大学化学与分子工程学院

真核生物染色体末端存在端粒结构,人体端粒DNA 由5'-TTAGGG-3'重复单元组成，在生理条件下可通过鸟嘌呤碱基间的Hoogsteen 氢键形成G-四链体。研究表明,正常体细胞中通常无端粒酶的表达,而85％以上的肿瘤细胞中端粒酶表达呈阳性... 详细信息

真核生物染色体末端存在端粒结构,人体端粒DNA 由5'-TTAGGG-3'重复单元组成，在生理条件下可通过鸟嘌呤碱基间的Hoogsteen 氢键形成G-四链体。研究表明,正常体细胞中通常无端粒酶的表达,而85％以上的肿瘤细胞中端粒酶表达呈阳性,这说明端粒酶与细胞的恶性转化及维持分裂增殖可能具有密切的关系。G-四链体结构能够有效抑制端粒酶的活性,由此,以G-四链体为靶点来寻求能够诱导、稳定或识别四链体结构的小分子是当前研究开发抗肿瘤药物的重要途径和热点研究领域之一。文献报道蒽醌类化合物能够通过稳定G-四链体结构从而抑制肿瘤细胞增值,本文根据已知分子结构与生物活性的38个1,4-二取代蒽醌类化合物的细胞活性数据,通过分子模拟技术,建立了以G-四链体为靶标的抗肿瘤药效团模型。模型中含有两个氢键受体,两个疏水中心和一个正电中心。此模型具有较好的相关性(训练集抗肿瘤细胞增值IC50 预测值与实验值线性相关系数为0.86)。我们应用此模型在中草药三维结构数据库中进行虚拟筛选(数据库中的每个分子最多有100个构象可供选择),在筛选结果中选择了15个化合物为研究对象,通过光谱/波谱学分析、端粒重复扩增实验和抗肿瘤细胞增殖实验进行了分子机理和生物活性研究,研究表明平面型分子主要作用在G-四链体顶部的平坦区域,而链状分子主要是镶嵌在G-四链体侧面的沟槽中,化合物能够显著稳定G-四链体结构,本研究工作基于生物靶分子的识别,发展了一种发现和设计抗肿瘤先导分子结构的方法:通过能识别和稳定G-四链体的分子及其衍生物的细胞活性数据,构建药效团模型,在化合物库中进行虚拟筛选,由分子对接初步确定结合模式,利用分子动力学模拟预测活性,再结合三维构效关系进一步提出分子结构的改造方案,从而可以获得高活性的抗肿瘤化合物的结构,为新型抗肿瘤药物的研发提供基础。

关键词： G-四链体分子模拟抗肿瘤药物虚拟筛选生物活性

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单分子FRET技术研究蛋白质折叠过程

单分子FRET技术研究蛋白质折叠过程

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第五届全国化学生物学学术会议

作者：孟祥兰刘鹏程曲鹏王志珍赵新生北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学与分子工程学院化学生物学系中国科学院生物物理研究所北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学与分子工程学院化学生物学系中国科学院生物物理研究所北京大学分子动态与稳态结构国家重点实验室及化学与分子工程学院化学生物学系

＜正＞金黄色葡萄球菌核酸酶（Staphylococcal Nuclease）含有149个氨基酸,由α和β两个亚结构域组成,变性复性过程可逆,很早就作为酶学和蛋白质折叠研究的模型蛋白之一。我们采用半胱氨酸突变技术分别对α和β亚结构域的两个位点特异... 详细信息

＜正＞金黄色葡萄球菌核酸酶（Staphylococcal Nuclease）含有149个氨基酸,由α和β两个亚结构域组成,变性复性过程可逆,很早就作为酶学和蛋白质折叠研究的模型蛋白之一。我们采用半胱氨酸突变技术分别对α和β亚结构域的两个位点特异性地标记 Alexa 555和 Alexa 647染料,利用单分子荧光共振能量传递（FRET）技术研究了不同盐酸胍浓度下金黄色葡萄球菌

关键词：单分子检测荧光共振能量传递金黄色葡萄球菌核酸酶蛋白质折叠中间体

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ClNO和NSCl离子解离过程研究

ClNO和NSCl离子解离过程研究

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第十四届全国分子光谱学学术会议

作者：姚立葛茂发中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

结合紫外光电子能谱-飞行时间质谱和量子化学计算研究了NXCl(X=O,S)离子的解离.在紫外光辐射电离后,ClNO+直接发生Cl-N键的断裂;而NSCl+除了发生S-Cl键的直接断裂,还发生异构化反应,生成更稳定的异构体SNCl+.实验结果表明,作者研制的紫... 详细信息

结合紫外光电子能谱-飞行时间质谱和量子化学计算研究了NXCl(X=O,S)离子的解离.在紫外光辐射电离后,ClNO+直接发生Cl-N键的断裂;而NSCl+除了发生S-Cl键的直接断裂,还发生异构化反应,生成更稳定的异构体SNCl+.实验结果表明,作者研制的紫外光电子能谱-飞行时间质谱可以作为研究气相瞬态物种的有力手段。

关键词： ClNO NSCl 紫外光电子能谱飞行时间质谱离子解离过程量子化学计算

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寡聚酰胺PyPyPyβDp与DNA相互作用的荧光动力学

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中国科学（B辑） 2005年第4期35卷 275-279页

作者：张慧娟王津吴义室袁谷艾希成汪力张建平中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080 北京大学化学与分子工程学院北京100871 中国科学院物理研究所凝聚态物理中心北京100080

通过稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱对寡聚酰胺分子PyPyPyβDp(简称PPP)的光物理性质进行了详细研究.发现PPP的激发态性质受溶剂环境影响较大,在TKMC缓冲液中,PPP有较弱的荧光,其荧光寿命为16ps;随着溶剂极性逐渐降低,荧光... 详细信息

通过稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱对寡聚酰胺分子PyPyPyβDp(简称PPP)的光物理性质进行了详细研究.发现PPP的激发态性质受溶剂环境影响较大,在TKMC缓冲液中,PPP有较弱的荧光,其荧光寿命为16ps;随着溶剂极性逐渐降低,荧光光谱蓝移,荧光强度增加,相应荧光寿命增长.通过对PPP与DNA双螺旋分子相互作用的荧光动力学研究表明,PPP与DNA相互作用后,荧光强度增强,荧光寿命从16ps增加到32ps,证实了存在PPP与双螺旋DNA的结合相互作用.

关键词：寡聚酰胺(PPP) 小牛胸腺DNA(ctDNA) 时间分辨荧光光谱识别动力学分子相互作用 DNA双螺旋荧光动力学寡聚酰胺 Dp 光物理性质

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N-溴代琥珀酰亚胺修饰菌紫质中色氨酸的光谱学研究

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生物物理学报 2005年第6期21卷 404-408页

作者：王哲琛钟声张建平胡坤生山东大学生命科学学院中国科学院生物物理研究所北京100101 中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

采用紫外-可见吸收光谱和荧光光谱方法研究了菌紫质(Bacteriorhodopsin,bR)中的8个色氨酸(Tryptophan,Trp)残基在被N-溴代琥珀酰亚胺(N-bromosuccinimide,NBS)修饰过程中的残基数目及对应的光谱变化。研究结果显示:随着NBS/bR摩尔比例... 详细信息

采用紫外-可见吸收光谱和荧光光谱方法研究了菌紫质(Bacteriorhodopsin,bR)中的8个色氨酸(Tryptophan,Trp)残基在被N-溴代琥珀酰亚胺(N-bromosuccinimide,NBS)修饰过程中的残基数目及对应的光谱变化。研究结果显示:随着NBS/bR摩尔比例增加逐渐被修饰的Trp残基有4个左右,如果NBS过量,则Trp残基的修饰个数最终可达6～7个;伴随化学修饰出现Trp残基特征荧光峰值下降及峰位蓝移。研究结果揭示了bR中Trp残基可能的三种结构分布,对于进一步弄清bR中Trp-视黄醛(Retinal)偶联能量传递、单独Trp残基的荧光寿命和Trp残基在膜蛋白结构和功能中的作用具有积极而重要的意义。

关键词：菌紫质(bR) Trp残基 N-溴代琥珀酰亚胺(NBS) 紫外-可见吸收荧光

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筛选抗白内障中草药的初步研究

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眼科 2005年第z1期14卷 65-67页

作者：陈翠真董冰宋旭东陈中伟陆道惠刘扬 100730 首都医科大学附属北京同仁医院眼科中心北京市眼科研究所 100730首都医科大学附属北京同仁医院眼科中心北京市眼科研究所 100730首都医科大学附属北京同仁医院眼科中心北京市眼科研究所中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室

目的探讨三种中草药对体外反应系统中的羟自由基和超氧自由基的清除作用.设计实验研究.研究对象三种中草药.方法用电子顺磁共振(electron spin resonance,ESR)技术分别研究中草药水煎液的三种不同剂量对体外反应体系产生的羟自由基和超... 详细信息

目的探讨三种中草药对体外反应系统中的羟自由基和超氧自由基的清除作用.设计实验研究.研究对象三种中草药.方法用电子顺磁共振(electron spin resonance,ESR)技术分别研究中草药水煎液的三种不同剂量对体外反应体系产生的羟自由基和超氧自由基的清除作用.主要指标 ESR信号强度反映的羟自由基和超氧自由基的含量.结果分别加入三种编号(NO.1、NO.2、NO.3)的中草药水煎液样品后,NO.2能非常显著降低ESR的信号强度,即使在反应体系中仅含5 μl或1 μl样品,仍然能明显清除羟自由基和超氧自由基.但NO.1和NO.3样品只能清除超氧自由基,其作用强度较NO.2低,NO.3较NO.1作用强.结论应用对体外系统的羟自由基和超氧自由基的清除方法筛选出一种具有较强抗氧化特性的中草药(NO.2),为进一步应用动物模型筛选抗白内障中草药提供了依据.

关键词：筛选中草药白内障

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以2-氨基嘌呤为荧光探针研究双链DNA分子内电荷传递机理

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中国科学（B辑） 2004年第4期34卷 295-299页

作者：张慧娟王鹏王雪飞冯娟徐四川艾希成张兴康张建平分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所北京100080

2-氨基嘌呤(2Ap)是腺嘌呤的结构类似物,经常作为荧光探针分子用以研究DNA分子内电荷传递过程.设计并合成了一系列2-氨基嘌呤和鸟嘌呤核苷酸重复序列GGG之间不同距离的双链DNA分子,利用时间分辨荧光光谱手段研究了2Ap的荧光衰减动力学以... 详细信息

2-氨基嘌呤(2Ap)是腺嘌呤的结构类似物,经常作为荧光探针分子用以研究DNA分子内电荷传递过程.设计并合成了一系列2-氨基嘌呤和鸟嘌呤核苷酸重复序列GGG之间不同距离的双链DNA分子,利用时间分辨荧光光谱手段研究了2Ap的荧光衰减动力学以及给体(…GGG…)与受体(2Ap)间的桥体(Ⅰ,次黄嘌呤)长度变化对双链DNA电荷传递过程的影响.结果表明,DNA分子的荧光探针分子2-氨基嘌呤的荧光动力学呈三指数衰减.其中几百皮秒的组分来源于2-氨基嘌呤和鸟嘌呤之间的电荷转移反应,当两者间的距离不大于2.4nm时,衰减速率随距离的指数函数而减小,衰减因子β值为1.3 nm-1;当两者间的距离大于2.4 nm时,荧光衰减速率随距离增加而加快,说明电荷转移过程还与桥体次黄嘌呤Ⅰ的多重复序列能量匹配有关.

关键词： 2-氨基嘌呤荧光探针双链DNA分子电荷转移氧化还原电位

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光核酸酶维生素K3三重态与鸟嘌呤核苷酸相互作用动力学

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科学通报 2004年第19期49卷 1983-1986页

作者：张慧娟李满宇王鹏冯娟汪力艾希成张兴康张建平中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080 中国科学院物理研究所凝聚态物理中心北京100080

采用紫外光纳秒闪光光解手段研究了光核酸酶维生素K3(VK3)的激发态性质, 发现了VK3三重态在285 nm处新的吸收峰. 通过对VK3氧化损伤鸟嘌呤核苷酸(dGMP)动力学过程的研究, 证实了二者之间发生了基于激发态VK3分子的电荷转移氧化反应, 获... 详细信息

采用紫外光纳秒闪光光解手段研究了光核酸酶维生素K3(VK3)的激发态性质, 发现了VK3三重态在285 nm处新的吸收峰. 通过对VK3氧化损伤鸟嘌呤核苷酸(dGMP)动力学过程的研究, 证实了二者之间发生了基于激发态VK3分子的电荷转移氧化反应, 获得了电荷转移反应产物阴阳离子自由基生成的动态光谱学证据.

关键词：鸟嘌呤维生素K3 核苷酸 VK 氧化损伤自由基核酸酶三重态激发态电荷转移

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卟啉-组氨酸二元体系及其金属锌配合物的光物理性质

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科学通报 2003年第10期48卷 1030-1034页

作者：张慧娟冯娟艾希成张兴康虞忠衡张建平中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

采用稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱手段研究了不同氯原子取代位置的四苯基卟啉-组氨酸二元体系及其金属锌配合物的光谱性质. 结果表明, 苯环上氯原子取代位置的不同对卟啉的光物理性质有很大影响, 组氨酸的引入对卟啉的激... 详细信息

采用稳态吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光光谱手段研究了不同氯原子取代位置的四苯基卟啉-组氨酸二元体系及其金属锌配合物的光谱性质. 结果表明, 苯环上氯原子取代位置的不同对卟啉的光物理性质有很大影响, 组氨酸的引入对卟啉的激发态性质影响不大. 氯原子间位、对位取代化合物的荧光量子产率和荧光寿命相差不大, 但其邻位取代自由碱卟啉荧光量子产率和荧光寿命比间位、对位化合物低得多, 而对于锌卟啉其结果恰恰相反, 这种特殊性质主要归因于氯原子的空间效应.

关键词：卟啉-组氨酸金属锌配合物取代基位置荧光光谱吸收光谱荧光光谱时间分辨荧光光谱荧光寿命

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