检索结果-内蒙古大学图书馆

热带海洋学报 2012年第2期31卷 110-117页

作者：彭鹏飞胡超群于宗赫李海鹏中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 中国科学院研究生院北京100049

通过2009年10月—2010年7月对深圳大亚湾大鹏澳网箱养殖区、网箱外0.5km(对照区1)和网箱外2km(对照区2)等3个区域的现场调查,阐明了海水中温度、盐度、pH、溶解氧(dissolved oxygen,DO),化学需氧量(chemical oxygen demand,CODMn)、叶绿... 详细信息

通过2009年10月—2010年7月对深圳大亚湾大鹏澳网箱养殖区、网箱外0.5km(对照区1)和网箱外2km(对照区2)等3个区域的现场调查,阐明了海水中温度、盐度、pH、溶解氧(dissolved oxygen,DO),化学需氧量(chemical oxygen demand,CODMn)、叶绿素a(Chl a)和营养盐等水质因子的时空分布特征及相关性,并评价了海区的营养状态。结果表明,与两个对照区域相比较,大鹏澳网箱养殖对海水中的CODMn、Chl a和SiO3-Si的影响不明显,对DO、pH、PO4-P、NO2-N、NH4-N、总氮(total nitrogen,TN)和总磷(total phosphorus,TP)的影响相对较大,其中对NH4-N的影响已经扩散到了网箱外0.5km区域。网箱养殖区在冬季和春季是中营养水平,而夏季则是富营养水平。总体来说,大鹏澳网箱养殖区水质有恶化的趋势,必须采取一定的有效措施对网箱区环境进行合理调控。

关键词：网箱养殖大鹏澳水环境营养状态营养盐

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糙刺参(Stichopus horrens)线粒体基因组及一种新的基因排列顺序

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中国科学：生命科学 2011年第4期41卷 281-288页

作者：范嗣刚胡超群文菁张吕平中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点研究室广东省应用海洋生物学重点实验室广州510301 中国科学院研究生院北京100049 湛江师范学院生物学系湛江524048

线粒体基因组序列在后口动物进化研究中有着重要的作用.本研究使用PCR方法获得糙刺参(Stichopus horrens)线粒体全基因组序列.该序列全长16257bp,包含13个蛋白编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因.除了一个蛋白编码基因(nad6)和5个tRNA... 详细信息

线粒体基因组序列在后口动物进化研究中有着重要的作用.本研究使用PCR方法获得糙刺参(Stichopus horrens)线粒体全基因组序列.该序列全长16257bp,包含13个蛋白编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因.除了一个蛋白编码基因(nad6)和5个tRNA基因(tRNASer(UCN),tRNAGln,tRNAAla,tRNAVal,tRNAAsp)在轻链上编码外,其余的基因都在重链上编码.糙刺参线粒体重链碱基有30.8%A,23.7%C,16.2%G,和29.3%T构成.假定的线粒体控制区长675bp.基因间间隔碱基长1～50bp,共227bp.11个基因间有重叠碱基,长1～10bp,共25bp.13个蛋白编码基因起始密码子均为ATG,终止密码子大多为TAA(nad3和nad4的为TAG).亮氨酸编码频率最高(16.29%),随后是丝氨酸(10.34%)和苯丙氨酸(8.37%).所有的22个tRNA基因均能折叠成三叶草结构.通过和其他4种海参的线粒体基因排列顺序比较,本研究发现糙刺参的线粒体基因排列顺序是一种新的排列方式.

关键词：线粒体DNA序列全长糙刺参基因排列海参纲

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16种商品海参16S rRNA的PCR-RFLP鉴定方法

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中国水产科学 2011年第2期18卷 451-457页

作者：文菁胡超群张吕平范嗣刚湛江师范学院生命科学与技术学院广东湛江524048 中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广东广州510301

基于570bp左右的线粒体16SrRNA基因片段,利用3种核酸内切酶(DdeI,Hae Ⅲ和Sty Ⅰ)对16种海参PCR产物进行酶切,分别产生10种、5种和5种单倍型,通过单倍型的组合,即能有效区分16种海参的种类。运用此方法对19种商品海参(包括冻品和干品)... 详细信息

基于570bp左右的线粒体16SrRNA基因片段,利用3种核酸内切酶(DdeI,Hae Ⅲ和Sty Ⅰ)对16种海参PCR产物进行酶切,分别产生10种、5种和5种单倍型,通过单倍型的组合,即能有效区分16种海参的种类。运用此方法对19种商品海参(包括冻品和干品)进行鉴定,结果表明,9种产品属于错误贴标。本研究建立的PCR-RFLP方法方便、有效,可靠,可为海参产品评估、进出口种类鉴定提供实用高效的方法。本研究旨在为市场海参产品贴标情况的评估提供技术支撑。

关键词：海参 16S rRNA基因 PCR-RFLP 鉴定方法

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中国15种海参的分子系统发育和骨片演化的分析

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海洋科学 2011年第5期35卷 66-72页

作者：文菁胡超群范嗣刚湛江师范学院生命科学与技术学院广东湛江524048 中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广东广州510301

基于线粒体16S rRNA基因部分序列,对我国15种海参的分子系统发育进行了分析。结果表明,片段长度约为570bp,A+T的平均含量为54.7%。15种海参的遗传距离在0.041(花刺参与糙刺参)至0.327(红腹海参与花刺参)之间,不同海参种类间的遗传距离... 详细信息

基于线粒体16S rRNA基因部分序列,对我国15种海参的分子系统发育进行了分析。结果表明,片段长度约为570bp,A+T的平均含量为54.7%。15种海参的遗传距离在0.041(花刺参与糙刺参)至0.327(红腹海参与花刺参)之间,不同海参种类间的遗传距离差别很大。NJ和MP聚类分析方法一致,符合传统的形态学分类结果。刺参科、海参科、刺参属、梅花参属和辐肛参属均呈单态性。利用系统发育方法对刺参科与海参科内骨片的进化关系进行了推断,发现桌形体和扣状体是较原始的骨片类型,随后进化为杆状体和花纹样体。

关键词：海参 16S rRNA基因系统发育骨片演化

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采用种间特异性PCR对海参产品的物种鉴定研究

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水产科学 2011年第12期30卷 768-773页

运用设计出的11个种特异性PCR反向引物,通过与通用正向引物16Sar进行PCR扩增,分别在11种海参中扩增得到大小为269～406bp的种特异性16SrRNA基因产物,而在非特异种类中扩增不出任何产物,即可有效鉴定这11种海参。此法成功检测出2种冷冻... 详细信息

运用设计出的11个种特异性PCR反向引物,通过与通用正向引物16Sar进行PCR扩增,分别在11种海参中扩增得到大小为269～406bp的种特异性16SrRNA基因产物,而在非特异种类中扩增不出任何产物,即可有效鉴定这11种海参。此法成功检测出2种冷冻海参替代产品,即用等刺参代替仿刺参,用玉足海参代替棘辐肛参,并且成功鉴定出10种海参干品盲样。本方法为海参种类鉴定、产品评估、保护生物多样性以及消费者权益提供了简单、快速、有效的手段。

关键词：海参种特异性PCR 16S rRNA基因鉴定

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香港巨牡蛎雌雄群体的数量性状通径分析

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南方水产科学 2011年第4期7卷 1-9页

作者：肖述符政君喻子牛中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301

随机选择性成熟的香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)不同性别组(雌95个、雄75个),对5个形态与产量性状进行测量,应用相关分析、多元逐步回归和通径分析等方法计算不同性状对全质量和肉质量的通径系数、决定系数及回归方程。结果表... 详细信息

随机选择性成熟的香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)不同性别组(雌95个、雄75个),对5个形态与产量性状进行测量,应用相关分析、多元逐步回归和通径分析等方法计算不同性状对全质量和肉质量的通径系数、决定系数及回归方程。结果表明,雌性群体中高与长、宽相关不显著,其他均显著相关(P<0.05);对全质量而言,雄性组肉质量直接影响最大,其次是体高,而雌性组体高直接影响最大,其次是体长;对肉质量是雄性组全质量的直接影响最大,其次是体宽,而雌性组体宽影响最大,其次为全质量;依据逐步回归分析,对2种产量性状分别建立了不同性别组的4个回归方程。该研究结果为选择育种的具体应用提供了重要参考依据。

关键词：香港巨牡蛎数量性状相关系数决定系数通径分析

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糙刺参(Stichopus horrens)线粒体基因组及一种新的基因排列顺序

糙刺参(Stichopus horrens)线粒体基因组及一种新的基因排列顺序

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培育生物产业，发展绿色经济——第五届中国生物产业大会·2011基因科学与产业发展论坛

作者：范嗣刚胡超群文菁张吕平中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点研究室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院研究生院湛江师范学院生物学系

线粒体基因组序列在后口动物进化研究中有着重要的作用.本研究使用PCR方法获得糙刺参（Stichopus horrens）线粒体全基因组序列.该序列全长16257 bp,包含13个蛋白编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因.除了一个蛋白编码基因（nad6）和5个... 详细信息

线粒体基因组序列在后口动物进化研究中有着重要的作用.本研究使用PCR方法获得糙刺参（Stichopus horrens）线粒体全基因组序列.该序列全长16257 bp,包含13个蛋白编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因.除了一个蛋白编码基因（nad6）和5个tRNA基因(tRNA,tRNA,tRNA,tRNA,tRNA在轻链上编码外,其余的基因都在重链上编码.糙刺参线粒体重链碱基有30.8%A,23.7%C,16.2%G,和29.3%T构成.假定的线粒体控制区长675 bp.基因间间隔碱基长1～50bp,共227 bp.11个基因间有重叠碱基,长1～10 bp,共25 bp.13个蛋白编码基因起始密码子均为ATG,终止密码子大多为TAA（nad3和nad4的为TAG）.亮氨酸编码频率最高（16.29%）,随后是丝氨酸（10.34%）和苯丙氨酸（8.37%）.所有的22个tRNA基因均能折叠成三叶草结构.通过和其他4种海参的线粒体基因排列顺序比较,本研究发现糙刺参的线粒体基因排列顺序是一种新的排列方式.

关键词：线粒体DNA序列全长糙刺参基因排列海参纲

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溶藻弧菌质粒pVAE259全序列测定与分子生物学特征分析

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微生物学报 2010年第2期50卷 162-168页

作者：苏婷罗鹏任春华胡超群中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广州510301

【目的】获得溶藻弧菌环状质粒pVAE259全序列,分析其分子生物学特征并探索该质粒可能具备的功能。【方法】使用酶切、克隆测序的方法获得pVAE259的全序列,利用软件分析DNA序列和可能的编码蛋白,推测质粒的生物学信息。【结果】pVAE259... 详细信息

【目的】获得溶藻弧菌环状质粒pVAE259全序列,分析其分子生物学特征并探索该质粒可能具备的功能。【方法】使用酶切、克隆测序的方法获得pVAE259的全序列,利用软件分析DNA序列和可能的编码蛋白,推测质粒的生物学信息。【结果】pVAE259为闭合环状质粒,全长6,075 bp,GC含量为42.16%。在NCBI中比对发现pVAE259与Vibriosp.41隐蔽性质粒pPS41具有较高的相似性。我们在序列中找到一个oriT位点,另外全序列的4118-5494 bp推测为质粒复制区域。pVAE259中存在7个氨基酸序列长度大于100的开放式阅读框(ORF):ORF1-ORF7。其中ORF1编码蛋白属于释放酶超级家族(Relaxase Super-family)蛋白,在NCBI数据库中它与大肠杆菌(Escherichia coli)的MobA-like蛋白最相似;ORF2编码蛋白属于复制酶超级家族(Replicase Super-family),它与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的复制蛋白RepA最相似;ORF5与伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)质粒pHE1的转移蛋白MobC相似。【结论】根据上述结果及相关文献分析,pVAE259可能是具有转移能力的质粒,该质粒是否影响宿主菌的表型性状还不清楚。

关键词：溶藻弧菌质粒复制区域开放性阅读框

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海水鱼类共附生细菌群落研究进展

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生态学报 2010年第10期30卷 2722-2734页

作者：冯敬宾胡超群中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广州510301 中国科学院研究生院北京100049

与海水鱼类处于共生、共栖、寄生或附生关系的细菌群落,称之为海水鱼类共附生细菌群落。这类细菌群落生活在海水鱼体表(皮肤、鳃)以及体内(消化道和血液、肌肉、肝脏、肾脏等内部组织器官),它们彼此之间以及与宿主之间存在着极其密切的... 详细信息

与海水鱼类处于共生、共栖、寄生或附生关系的细菌群落,称之为海水鱼类共附生细菌群落。这类细菌群落生活在海水鱼体表(皮肤、鳃)以及体内(消化道和血液、肌肉、肝脏、肾脏等内部组织器官),它们彼此之间以及与宿主之间存在着极其密切的关系,并且对于宿主的健康生长具有重要作用。然而,由于目前对养殖系统中的微生物群落中的致病微生物缺乏有效控制措施,处于迅速发展中的养殖产业经受着相当严重的疾病问题。因而,生态健康养殖被提到议事日程上来,并且日益受到重视,其中微生物生态调控是极其重要的一个环节。由于目前相关的基础微生物生态学资料比较缺乏,尤其是在国内作为微生物生态的基本组成部分,与微生物病害发生有着直接关系的大多数海水养殖鱼类的共附生细菌群落研究资料相当缺乏。因此,很有必要开展海水养殖鱼类共附生细菌群落相关研究。在此背景下,从研究的目的和意义以及国内外研究现状包括宿主海水鱼类种类、共附生细菌群落类别、共附生细菌群落的影响因素、共附生细菌群落对宿主的作用等方面综述了海水鱼类共附生细菌群落的研究进展,并对此类研究趋势进行了展望,为开展相关研究提供一定的参考。

关键词：共附生细菌群落海水鱼类鱼卵仔稚鱼成鱼

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凡纳滨对虾精子发生的超微结构研究

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热带海洋学报 2010年第4期29卷 89-93页

作者：许尤厚刘学东张吕平胡超群中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广东广州510301

对凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei精子发生的过程进行了透射电镜的观察。结果表明,成熟凡纳滨对虾精巢为指状,分16叶。凡纳滨对虾精子发生分为精原细胞、初级精母细胞、次级精母细胞、精子细胞和精子5个时期。染色质经历了从以异染色... 详细信息

对凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei精子发生的过程进行了透射电镜的观察。结果表明,成熟凡纳滨对虾精巢为指状,分16叶。凡纳滨对虾精子发生分为精原细胞、初级精母细胞、次级精母细胞、精子细胞和精子5个时期。染色质经历了从以异染色质为主变为高度凝聚状态,再经解聚为弥散絮状的变化过程。核膜由完整转变为不完整。凡纳滨对虾精子发生过程中仅见线粒体、内质网、核糖体细胞器的参与,未见有典型的高尔基体结构的出现。顶体由内质网囊泡团和线粒体囊泡共同转变而来。精子的棘突以及亚顶体区需在输精管的中后端形成,而非在精巢中形成。纳精囊内精子比储精囊内精子的棘突细长。

关键词：凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei 精子发生顶体超微结构

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