检索结果-内蒙古大学图书馆

四膜虫基因表达数据库:四膜虫全基因组基因表达芯片和协同表达分析的数据资源

中国科学：生命科学 2010年第12期40卷 1087-1089页

作者：熊杰陆星亦陆钰明曾宏辉袁冬霞冯立芳畅悦 BOWEN Josephine GOROVSKY Martin 傅诚杰缪炜中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院研究生院北京100049 Department of Biology University of Rochester 中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室武汉430072

嗜热四膜虫是一种优良的真核模式生物,对其功能基因组学的分析将为研究细胞和分子生物学的基础性重大问题提供新的机遇.四膜虫基因表达数据库(TGED)是原生动物纤毛虫中第一个基因表达数据库,整个数据库包括了四膜虫3个重要的生理和发育... 详细信息

嗜热四膜虫是一种优良的真核模式生物,对其功能基因组学的分析将为研究细胞和分子生物学的基础性重大问题提供新的机遇.四膜虫基因表达数据库(TGED)是原生动物纤毛虫中第一个基因表达数据库,整个数据库包括了四膜虫3个重要的生理和发育阶段20个时间点的全基因组基因表达数据,提供了友好的网页界面(http://***)供用户获取这些数据.通过基因的标识号或描述信息,用户可以获取基因表达谱信息和协同表达基因.此外,TGED同时提供了制备四膜虫基因表达芯片的样品制备方法.欢迎研究者上传和分享其所有的基因芯片数据,以期为四膜虫或纤毛虫研究提供重要的功能基因组学资源.

关键词：嗜热四膜虫基因表达数据库协同表达

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南洞庭湖区软体动物物种多样性评估及保护对策

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生物多样性 2020年第2期28卷 155-165页

作者：刘振元孟星亮李正飞张君倩徐靖银森录谢志才中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与资源研究保护中心武汉430072 中国环境科学研究院国家环境保护区域生态过程与功能评估重点实验室北京100012 中国科学院大学北京100049

洞庭湖孕育和维持了较高和独特的软体动物多样性。尽管有关该湖软体动物的调查较多,但多分散于各文献中。本文结合文献调研和现场调查(2013–2018年),系统评估了南洞庭湖区软体动物物种多样性,解析驱动群落格局演变的关键因子,并提出合... 详细信息

洞庭湖孕育和维持了较高和独特的软体动物多样性。尽管有关该湖软体动物的调查较多,但多分散于各文献中。本文结合文献调研和现场调查(2013–2018年),系统评估了南洞庭湖区软体动物物种多样性,解析驱动群落格局演变的关键因子,并提出合理的保护对策。共记录2纲5目14科33属87种(腹足纲41种,双壳纲46种),其中本调查记录54种,隶属于2纲5目12科31属,包括腹足纲22种,双壳纲32种。评估结果显示处于近危和受威胁等级物种21种,包括腹足纲4种和双壳纲17种。调查区域软体动物平均密度和生物量分别为173.1 ind./m2和279.3 g/m2。优势种为河蚬(Corbicula fluminea)、大沼螺(Parafossarulus eximius)、铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa)、卵河螺(Rivularia ovum)。基于距离的冗余分析(distance-based redundancy analysis, dbRDA)结果显示,局域环境因子(底质类型、水深、pH、总溶解固体和总磷)制约软体动物的群落变异。另外,区域内的人类活动(如商业采砂、建坝和沿岸土地利用、过度捕捞和非法电捕等)亦深刻影响软体动物的生存。这些人类干扰已导致软体动物物种多样性显著下降,可能造成一些特有物种的局域性灭绝。为了恢复和保护软体动物物种多样性和资源,应采取一系列对策,包括管控合法的挖沙业和取缔非法挖沙业、禁止过度捕捞和非法电捕、维持水文的自然节律、恢复沿岸自然湖滨带和控制点源和面源污染物排入等。我们呼吁尽快在南洞庭湖区建立软体动物国家级自然保护区,以保护该湖区(可能是整个洞庭湖)残存的软体动物物种多样性和特有性。

关键词：软体动物南洞庭湖区物种多样性评估保护对策

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嗜热四膜虫减数分裂研究进展

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动物学杂志 2016年第1期51卷 126-136页

作者：张晶田苗冯立芳缪炜中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院大学北京100049 浙江工商大学食品与生物工程学院杭州310018

减数分裂是真核生物有性生殖过程的关键步骤,染色体的行为变化贯穿整个减数分裂的过程。近些年来,借助先进的分子生物学技术和细胞学实验手段,通过对突变细胞株的筛选和评价,单细胞真核模式生物原生动物嗜热四膜虫(Tetrahymena thermoph... 详细信息

减数分裂是真核生物有性生殖过程的关键步骤,染色体的行为变化贯穿整个减数分裂的过程。近些年来,借助先进的分子生物学技术和细胞学实验手段,通过对突变细胞株的筛选和评价,单细胞真核模式生物原生动物嗜热四膜虫(Tetrahymena thermophila)减数分裂方面的研究取得了长足的进展。本文主要介绍嗜热四膜虫减数分裂的过程,以及在此过程中伴随染色体行为变化的相关基因的功能,从而为进一步探讨嗜热四膜虫减数分裂的分子机制提供有效信息。

关键词：减数分裂染色体嗜热四膜虫

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水盾草—南四湖外来水生植物新记录及其生境特点

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水生生物学报 2012年第5期36卷 1005-1008页

作者：侯元同舒凤月董士香柳明谢松光曲阜师范大学生命科学学院曲阜273165 中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院水生生物研究所淮安研究中心淮安223002

外来生物入侵与生境改变被认为是导致全球生物多样性下降的两大主因[1]。其中入侵植物通过营养竞争、植被结构改变、化感作用等,影响土著植物种群和群落,进而影响生态系统结构和功能。水生植物的入侵已成为影响我国淡水水体景观和生物... 详细信息

外来生物入侵与生境改变被认为是导致全球生物多样性下降的两大主因[1]。其中入侵植物通过营养竞争、植被结构改变、化感作用等,影响土著植物种群和群落,进而影响生态系统结构和功能。水生植物的入侵已成为影响我国淡水水体景观和生物多样性的重要因素[2—4]。

关键词：水盾草新记录生物入侵南四湖

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黄河伊洛河中下游鱼类多样性及群落结构

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湖泊科学 2019年第2期31卷 482-492页

作者：林鹏程李淑贞秦祥朝程卫习刘焕章中国科学院水生生物研究所武汉430072 中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 黄河流域水资源保护局郑州450004 黄河流域水环境监测中心郑州450004 河南省洛阳水文水资源勘测局洛阳471000

为了解伊洛河中下游鱼类多样性、群落结构及其与环境因子的关系,于2016年2-12月对伊洛河中下游5个河段开展鱼类多样性及环境调查.共采集鱼类12361尾,43种,隶属于4目9科37属.伊洛河中下游鱼类群落的Shannon-Wiener多样性指数、Margalef... 详细信息

为了解伊洛河中下游鱼类多样性、群落结构及其与环境因子的关系,于2016年2-12月对伊洛河中下游5个河段开展鱼类多样性及环境调查.共采集鱼类12361尾,43种,隶属于4目9科37属.伊洛河中下游鱼类群落的Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数、Pielou均匀度指数和Simpson指数变化范围分别为1.75～2.38、2.44～3.63、0.59～0.76和0.73～0.86.各指数均以西草甸河段最高.各河段优势种以(Hemiculter leucisculus)、似鳊(Pseudobrama simoni)、鲫(Carassius auratus)、兴凯鱊(Acheilognathus chankaensis)和鳑鲏属(Rhodeus)等小型或广适性鱼类为主.丰度/生物量比较(ABC)曲线显示,除西草甸河段外,各河段优势鱼类群落均受到不同程度的干扰.其中七里铺和黑石关鱼类群落处于严重干扰状态,以小型鱼类或大型鱼类的幼鱼为主.采用冗余分析方法分析了鱼类群落结构与环境因子的关系,发现除了河床、水流、捕捞等因子以外,氨氮、总磷浓度与pH是导致伊洛河中下游鱼类群落结构差异的主要影响因子.针对伊洛河鱼类多样性现状,建议加强流域水质监管,恢复河流连通性,推进保护区全面禁渔,开展生态修复等以恢复伊洛河河流健康.

关键词：黄河中下游伊洛河多样性格局鱼类群落冗余分析河流健康

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赤水河半的遗传多样性和种群历史动态分析

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水生生物学报 2018年第1期42卷 106-113页

作者：李文静王环珊刘焕章曹文宣王小明于江朱昕中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院大学北京100049 中国三峡建设管理有限公司成都610041

在赤水河的水潦、茅台、二合、太平、赤水市5个样点共采集了168尾半Hemiculterella sauvagei,通过线粒体DNA的细胞色素b(Cyt b)基因序列分析了半种群遗传多样性和种群历史动态。获得序列长度为1137 bp,其中包含42个变异位点,13个单... 详细信息

在赤水河的水潦、茅台、二合、太平、赤水市5个样点共采集了168尾半Hemiculterella sauvagei,通过线粒体DNA的细胞色素b(Cyt b)基因序列分析了半种群遗传多样性和种群历史动态。获得序列长度为1137 bp,其中包含42个变异位点,13个单突变位点,29个简约信息位点。168条序列共检测到38种单倍型,单倍型多样性(H_d)和核苷酸多样性(P_i)分别为0.895±0.012和0.00487±0.00695。分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)显示:遗传变异主要来源于种群内部(80.95%)。F_(st)值统计表明,赤水市种群与茅台、二合、水潦种群之间存在高度分化,与太平镇种群之间存在中度分化,其他种群之间无显著差异,这表明分布在赤水市和其他4个地理种群的半应作为不同的管理单元(MU)进行保护。Mega 6.0软件计算5个种群之间的平均净遗传距离范围为0.004—0.006。中性检验结果为水潦、太平和赤水市的F_s值为负值,表明这3个地理种群的半曾发生过种群扩张。采用1%per Myr的突变速率推算出半水潦种群扩张时间大约在0.43百万年前,太平镇种群大约在0.40百万年前,赤水市种群大约在0.37百万年前。

关键词：赤水河半 遗传多样性种群历史动态遗传分化

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高体鰟鮍在加入个体数不同的群体时的选择

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四川动物 2013年第1期32卷 1-6页

作者：陈明罗芸芷唐琼英刘焕章中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院大学北京100049 华中师范大学心理学院武汉430072

集群给动物带来安全、接触配偶机会等利益的同时,也存在增加竞争的风险。不同的物种以及生活史不同的阶段,动物会采取不同的集群策略。本研究设计实验,检验在繁殖期个体大小不同的高体鰟鮍对由同性个体组成的个体数不同的群体的偏好。... 详细信息

集群给动物带来安全、接触配偶机会等利益的同时,也存在增加竞争的风险。不同的物种以及生活史不同的阶段,动物会采取不同的集群策略。本研究设计实验,检验在繁殖期个体大小不同的高体鰟鮍对由同性个体组成的个体数不同的群体的偏好。结果显示,大个体雄性显著偏好于大的群体(第一次选择:V=72,n=12,P=0.0054;第二次选择:V=65,n=12,P=0.022),大个体雌性对不同大小的群体则无显著偏好(第一次选择:V=54,n=12,P=0.13;第二次选择:V=41.5,n=12,P=0.44);小个体雄性(第一次选择:V=59,n=12,P=0.0012;第二次选择:V=78,n=12,P=0.0013)与小个体雌性(第一次选择:V=75,n=12,P=0.0026;第二次选择:V=70,n=12,P=0.0083)均显著偏好于大的群体。这说明在选择加入某一群体时,大型和小型的雄性个体均主要考虑安全因素;而小型的雌性个体主要考虑安全因素,大型的雌性个体则同时考虑安全因素和繁殖竞争。

关键词：高体鰟鮍个体大小群体大小群体选择偏好

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微山湖发现中国淡水蛏

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动物学杂志 2013年第2期48卷 278-280页

作者：舒凤月朱庆超张念伟张希金谢松光曲阜师范大学山东省南四湖湿地生态与环境保护高校重点实验室曲阜273165 中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院水生生物研究所淮安研究中心淮安223002

2010年10月23日在山东省微山县韩庄附近的微山湖京杭运河入湖口航道采集到淡水蛏标本32个,经鉴定为中国淡水蛏(Novaculina chinensis),微山湖为该种在我国的最北分布,表明其分布区已延伸至古北界。

关键词：中国淡水蛏软体动物微山湖古北界

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长江江豚种群衰退机理研究进展

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生命科学 2011年第5期23卷 519-524页

作者：梅志刚郝玉江郑劲松王克雄李松海王丁中国科学院水生生物研究所武汉430072 中国科学院研究生院北京100039 中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072

长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)是生活于我国长江中下游的一种独特的淡水小型鲸类,1996年被收录为IUCN濒危物种。在过去的三十年间,其种群数量呈快速下降趋势。数据显示,20世纪90年代以来,其种群下降速率约为每年6... 详细信息

长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)是生活于我国长江中下游的一种独特的淡水小型鲸类,1996年被收录为IUCN濒危物种。在过去的三十年间,其种群数量呈快速下降趋势。数据显示,20世纪90年代以来,其种群下降速率约为每年6.3%。2006年考察发现长江干流中其种群数量少于1 200头,与15年前相比减少了50%以上。为了深入了解造成长江江豚种群快速衰退的机理,课题组从种群生态学、生物声学和种群遗传学三个方面开展研究工作。综述了该项目的研究进展,并对下一步的研究计划进行了展望。相关研究不仅能促进长江江豚保护生物学理论的发展,也有助于深化对白鱀豚衰退和灭绝过程的反思,并为其他长江水生生物资源的保护提供理论借鉴。

关键词：长江江豚衰退机理种群生态学生物声学种群遗传学

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有污染物二氯二苯三氯乙烷、三丁锡和2,3,7,8-四氯二苯并二噁英暴露下的四膜虫毒理因组学研究

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中国科学：生命科学 2011年第6期41卷 502-511页

作者：畅悦冯立芳缪炜中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉430072 中国科学院研究生院北京100049 浙江工商大学食品与生物工程学院杭州310012

有污染物二氯二三氯乙烷(DDT)、三丁锡(TBT)和2,3,7,8-四氯二并二噁英(TCDD)因对水生生态系统的害以对人体健康造成的重伤害而受到重视.实验以生物原生动物嗜热四虫为究对象,利用microarray技筛选了在上3种污染物下分别露24h后差异表达... 详细信息

有污染物二氯二三氯乙烷(DDT)、三丁锡(TBT)和2,3,7,8-四氯二并二噁英(TCDD)因对水生生态系统的害以对人体健康造成的重伤害而受到重视.实验以生物原生动物嗜热四虫为究对象,利用microarray技筛选了在上3种污染物下分别露24h后差异表达2倍以上的因,并在gene ontology功能注释的础上,通过富分析考察了这些因涉的主要功能,其中许多功能和多细胞生物中的道相一致.随后,以TCDD中富功能注释的因为核心,通过CLR算法构建了TCDD相关因的相互作用网络,依照功能将其划分为2个亚网络,并在此础上推测了TCDD在四虫中的作用制型.结果显,四虫有成为在因组水平究毒物作用制的单细胞生物型的大潜力.

关键词：微阵列富集分析基因间相互作用污染物

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