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上海海洋大学学报 2024年第3期33卷 552-561页

作者：李倩张琳琳中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室山东青岛266071 中国科学院海洋大科学研究中心山东青岛266071 海洋生物与生物技术实验室山东青岛266237 中国科学院大学北京100049

Wnt/β-catenin信号通路在涡虫等多种生物的再生中发挥重要作用,本研究以环节动物始初小头虫(Capitella teleta)为研究对象,初步探究Wnt/β-catenin信号通路对小头虫再生的影响。将截断损伤后的样本持续浸泡于30μmol/L浓度外源性Wnt/β... 详细信息

Wnt/β-catenin信号通路在涡虫等多种生物的再生中发挥重要作用,本研究以环节动物始初小头虫(Capitella teleta)为研究对象,初步探究Wnt/β-catenin信号通路对小头虫再生的影响。将截断损伤后的样本持续浸泡于30μmol/L浓度外源性Wnt/β-catenin信号通路小分子化合物抑制剂XAV-939中,发现小头虫的再生受到了抑制,与对照组相比再生速度明显减慢,且不能形成正常的再生芽基组织,通过神经和肌肉标记发现Wnt信号通路被抑制后,小头虫再生过程中的神经和肌肉生长也受到了影响。后续通过EdU(5-Ethynyl-2’-deoxyuridine)标记发现抑制剂处理组样本的增殖细胞数量显著少于正常组样本,表明Wnt/β-catenin信号通路被抑制后会影响小头虫再生过程中的增殖细胞产生,从而调控小头虫的再生过程。在几种典型物种中Wnt通路调控再生的比较研究表明Wnt信号通路在刺胞动物和冠轮动物全身再生中的功能相对保守。

关键词： Wnt/β-catenin信号通路环节动物小头虫 Wnt通路抑制剂再生增殖细胞

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基于RNA-seq数据分析长牡蛎(Crassostrea gigas)天然免疫的可变剪接事件

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海洋与湖沼 2024年第1期55卷 182-192页

作者：李若晖张琳琳中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室山东青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室山东青岛266237 中国科学院大学北京100049

大部分无脊椎动物缺乏基于经典抗体和记忆细胞的适应性免疫,因而天然免疫在无脊椎动物免疫防御中发挥不可或缺的作用。可变剪接正是产生天然免疫多样性和特异性的重要途径。牡蛎(Crassostrea)是全球范围内的大宗养殖贝类和我国产量最高... 详细信息

大部分无脊椎动物缺乏基于经典抗体和记忆细胞的适应性免疫,因而天然免疫在无脊椎动物免疫防御中发挥不可或缺的作用。可变剪接正是产生天然免疫多样性和特异性的重要途径。牡蛎(Crassostrea)是全球范围内的大宗养殖贝类和我国产量最高的海水养殖贝类,理解其天然免疫系统的多样性和特异性对牡蛎病害防治和养殖业健康可持续发展至关重要。通过对不同病原诱导以及诱导后不同时间的转录组进行生物信息分析,系统地研究了长牡蛎天然免疫应激反应的可变剪接事件。发现在弧菌诱导下可变剪接事件的总数显著增加,表明弧菌的感染会诱导长牡蛎可变剪接事件的产生。对病原诱导后可变剪接体的组成类型及表达量显著变化的基因的功能富集分析,表明免疫系统相关功能被显著富集,病原感染不同阶段以及不同病原感染后可变剪接体的组成类型和表达量均不一致,表明长牡蛎免疫系统可通过可变剪接产生免疫响应的特异性和多样性。研究结果为长牡蛎等无脊椎动物天然免疫多样性和特异性提供了典型实例,也为长牡蛎病害防御提供了理论支撑。

关键词：长牡蛎可变剪接病原体诱导天然免疫

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我国南海浮游动物生态学研究回顾与展望

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热带海洋学报 2025年

作者：李开枝黄良民尹健强连喜平柳原谭烨辉中国科学院南海海洋研究所广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院大学

浮游动物是海洋生态系统中重要的次级生产者，同时也是海洋食物网和生物地球化学循环的关键环节。因其个体小、代谢快、随波逐流的生活方式等特点，多数浮游动物可对海洋环境变动快速响应并能指示环境变化，因此，历来受到学界的广泛关... 详细信息

浮游动物是海洋生态系统中重要的次级生产者，同时也是海洋食物网和生物地球化学循环的关键环节。因其个体小、代谢快、随波逐流的生活方式等特点，多数浮游动物可对海洋环境变动快速响应并能指示环境变化，因此，历来受到学界的广泛关注。本文在回顾南海浮游动物科学考察的基础上，概括了南海浮游动物的物种组成，总结了南海典型生态区（珠江口、大亚湾、岛礁和深海）以及南海北部和南部海域的浮游动物群落特征，阐释了季风及其驱动的海流、水团以及生境异质性等因素对浮游动物群落结构的影响。结合当前气候变化和人类活动影响背景下浮游动物研究的热点和难点，针对性地指出了南海浮游动物研究存在的不足之处并提出相关研究展望，以期为南海生物多样性保护、海洋生物地球化学循环研究以及海洋生物资源可持续利用等方面奠定坚实基础，也为预测南海海洋生态系统应对气候变化的适应能力提供科学依据。

关键词：浮游动物生物多样性群落结构生态功能南海

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中国海域双锥芋螺属Conasprella(Gastropoda,Conidae)近似种的比较研究

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热带海洋学报 2025年

作者：何晨王佳宁陈志云谭烨辉中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室南海海洋生物标本馆广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院大学

本研究比较了双锥芋螺属Conasprella Thiele, 1929的欧氏芋螺Conasprella orbignyi (Audouin, 1831)与其近似种龙王芋螺Conasprella ichinoseana (Kuroda, 1956)、昏芋螺Conasprella comatosa (Pilsbry, 1904),郝伍德芋螺Conasprella hopwoodi (Tomlin, 1936)、柳斑芋螺Conasprella longurionis (Kiener, 1847)和南方芋螺Conus australis Holten, 1802之间的形态差异,报道了郝伍德芋螺和柳斑芋螺在国内的新分布地点。通过几何形态学对这些易混淆种进行分析,对欧氏芋螺、柳斑芋螺、郝伍德芋螺和南方芋螺的外轮廓的几何形态数据进行主成分分析,揭示了这4种芋螺在外轮廓上的差异;典型变量分析的结果进一步显示,外轮廓的几何形态对欧氏芋螺和南方芋螺有良好的判别效果,南方芋螺和欧氏芋螺的判别正确率分别为100.00%和92.86%。对柳斑芋螺和郝伍德芋螺的体螺层螺肋几何形态进行主成分分析,发现前者螺旋部更高、体螺层更宽、基部距离更短、体螺层各个螺肋之间距离更宽,而后者螺旋部低、体螺层更窄、基部距离更长、体螺层上各个螺肋之间距离更窄;典型变量分析的进一步结果显示体螺层的地标点对极易混淆的柳斑芋螺和郝伍德芋螺具有良好的判别效果,正确率分别是87.50%和88.89%。对柳斑芋螺和郝伍德芋螺的螺旋部几何形态进行主成分分析,二者未明显分离;典型变量分析的进一步结果显示对二者判别与基于体螺层螺肋几何形态的判别结果一致。对柳斑芋螺和郝伍德芋螺的壳口几何形态进行主成分分析,二者未明显分离;典型变量分析的进一步结果显示对二者判别正确率分别是62.50%和77.78%,壳口并不是区分鉴定柳斑芋螺和郝伍德芋螺这一对易混淆种的有效依据。本研究为芋螺近似种和易混淆种的区分提供了新的鉴别方法。

关键词：分类学腹足纲芋螺科双锥芋螺属几何形态测量学

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近海沉积物有机氮的分子组成和矿化机理及其对环境变化的响应综述

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生态学杂志 2024年

作者：杨佳吴云超李进隆李鹏举江志坚刘松林黄小平中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院大学

有机氮是近海沉积物中氮的主要存在形式之一，在元素生物地球化学循环过程中扮演着重要角色。沉积物有机氮的分子组成及矿化过程对近海富营养化和主要温室气体(如N2O)的排放有着重要影响。本文对近海沉积物有机氮的分子组成、来源及矿... 详细信息

有机氮是近海沉积物中氮的主要存在形式之一，在元素生物地球化学循环过程中扮演着重要角色。沉积物有机氮的分子组成及矿化过程对近海富营养化和主要温室气体(如N2O)的排放有着重要影响。本文对近海沉积物有机氮的分子组成、来源及矿化过程进行综述，并总结了其对环境变化（人类活动和气候变化）的响应。近海沉积物有机氮分子组成复杂，传统方法只能对其进行初步解析，无法获得其分子组成信息，追踪其转化过程，目前只对蛋白质和核酸代谢过程有所了解；超高分辨率质谱如FTICR-MS能为解析沉积物有机氮的分子组成提供技术支持；富营养化、升温和酸化等因素影响近海沉积物有机氮的矿化过程（矿化相关微生物群落），进而改变近海沉积物有机氮的特征（如分子组成和含量）。基于目前存在的不足，本文提出未来近海沉积物有机氮相关重点研究方向：（1）利用新技术新方法加强沉积物有机氮的分子组成和来源研究；（2）结合基因组学、转录组学等方法深入研究沉积物有机氮的矿化过程及路径；（3）探究人类活动和气候变化影响下，沉积物有机氮矿化过程的响应及其对主要温室气体(如N2O)释放的影响。

关键词：海洋沉积物有机氮分子组成矿化机理环境变化

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文蛤浮游期发病幼虫细菌群落分析和致病菌的分离鉴定

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水产学报 2023年第6期47卷 156-164页

作者：隋炜金王鸿霞刘保忠中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室中国科学院大学

为研究文蛤育苗过程中幼虫病害及其主要致病菌，实验通过构建细菌16S rDNA克隆文库、病原菌分离纯化、人工感染和药敏实验等方法对育苗场发病的浮游期文蛤壳顶幼虫样品进行了系统分析。结果显示，发病的文蛤壳顶幼虫细菌群落多样性低，... 详细信息

为研究文蛤育苗过程中幼虫病害及其主要致病菌，实验通过构建细菌16S rDNA克隆文库、病原菌分离纯化、人工感染和药敏实验等方法对育苗场发病的浮游期文蛤壳顶幼虫样品进行了系统分析。结果显示，发病的文蛤壳顶幼虫细菌群落多样性低，地中海弧菌占比高达75%以上，推断其可能为引发此次幼虫发病的主要致病菌。从发病幼虫的匀浆组织中分离获得该优势菌株，测序及系统发育鉴定为地中海弧菌。人工感染实验确定了其致病性，菌株US2-01在1.0×10～6 CFU/mL的菌液浓度下浸泡感染文蛤浮游幼虫，96 h累计死亡率为84%。药敏实验表明，地中海弧菌菌株US2-01在12种抗生素的测试中对常用的青霉素、氨苄西林、红霉素等抗生素具有一定的耐药性，对四环素和多西环素中度敏感，对头孢他啶、庆大霉素、卡那霉素等其余7种抗生素呈现高度敏感。本研究首次报道了地中海弧菌为文蛤浮游期幼虫致病的一种潜在病原，研究结果可为文蛤幼虫疾病研究及贝类苗种培育过程中的病害防控提供科学依据。

关键词：文蛤幼虫地中海弧菌 16S rDNA克隆文库药敏实验

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牙鲆(Paralichthys olivaceus)抗缪勒氏管激素Ⅱ型受体基因(amhr2)表达特征分析及功能初探

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热带海洋学报 2024年第1期43卷 94-106页

作者：李泽王丽娟邹聪聪舒畅吴志昊邹玉霞尤锋中国科学院实验海洋生物学重点实验室海洋大科学中心(中国科学院海洋研究所)山东省实验海洋生物学重点实验室山东青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术实验室山东青岛266237 中国科学院大学北京100049

抗缪勒氏管激素Ⅱ型受体(anti-Müllerian hormone receptorⅡ,Amhr2)是抗缪勒氏管激素(anti-Müllerian hormone,Amh)的特异受体。amhr2基因在鱼类性腺分化和发育中发挥重要作用,更决定了有的鱼种的性别,然而,相关功能研究较... 详细信息

抗缪勒氏管激素Ⅱ型受体(anti-Müllerian hormone receptorⅡ,Amhr2)是抗缪勒氏管激素(anti-Müllerian hormone,Amh)的特异受体。amhr2基因在鱼类性腺分化和发育中发挥重要作用,更决定了有的鱼种的性别,然而,相关功能研究较为有限。本研究旨在明晰amhr2在我国重要海水养殖鱼类—牙鲆(Paralichthys olivaceus)性腺分化和发育过程中的表达特征,并初步探究其功能。首先,克隆了牙鲆amhr2-CDS序列,共1536bp,编码511个氨基酸。系统发育分析显示牙鲆Amhr2近C端较为保守,与其他硬骨鱼类聚为一枝,并与上游sp1以及下游的prr13和PCBP2在基因组中共定位。蛋白结构分析显示,牙鲆Amhr2包含信号肽、跨膜结构域和保守的酪氨酸蛋白激酶结构域。进而,利用实时荧光定量PCR(q PCR)分析表明,牙鲆amhr2主要表达于性腺,且在精巢中的表达极显著高于卵巢(P<0.01),其在I-V期精巢中持续高表达,而在卵巢中仅在I期高表达,后显著下降(P<0.05)。性腺分化期基因的表达,是对雌核发育组(对照组,20±0.5℃,100%雌性)与雌核发育高温诱导组(HT组,28±0.5℃,100%雄性)鱼苗进行检测的,amhr2在对照组全长(totallength,TL)2cm的实验鱼性腺中表达最高,后逐渐下降;而HT组实验鱼性腺中的表达呈现先上升后下降的趋势,并在精巢开始分化的6cm TL时表达最高。利用Hela细胞进行亚细胞定位分析发现,Amhr2与其配体Amh均定位于细胞质。同时,通过原核表达重组牙鲆Amh,并用其孵育离体性腺组织,q PCR分析显示精巢中amhr2的表达没有显著变化,但卵巢中表达显著上升(P<0.05)。进一步通过双荧光素酶报告分析表明,Amh和Amhr2共转染能够显著抑制雌激素合成的关键芳香化酶基因cyp19a的表达(P<0.01)。综上所述,牙鲆amhr2主要表达于精巢,但在不同性腺发育时期表达不同,且其可能与Amh共同影响cyp19a的转录,对雄性表型形成的启动和性腺发育起作用。

关键词：牙鲆(Paralichthys olivaceus) amhr2 性腺分化和发育基因表达功能

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热带海洋特色生态系统恢复重构与保护思考

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热带海洋学报 2024年第6期43卷 1-12页

作者：黄良民林强谭烨辉黄小平周林滨黄晖中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室广东广州510301 中国科学院大学北京100049

热带海洋特色生态系统是指珊瑚礁、红树林、海草床等由独特生境与生物共同构成的生态系统,主要分布于全球热带亚热带海区;其特点是物质循环效率高,生态功能独特,具有丰富的生物多样性和极高生产力,历来是海洋科学研究和资源利用与保护... 详细信息

热带海洋特色生态系统是指珊瑚礁、红树林、海草床等由独特生境与生物共同构成的生态系统,主要分布于全球热带亚热带海区;其特点是物质循环效率高,生态功能独特,具有丰富的生物多样性和极高生产力,历来是海洋科学研究和资源利用与保护的重点对象。然而,受人类活动和全球气候变化等多重压力影响,这些生态系统的退化趋势日益凸显。如何恢复热带海洋特色生态系统的功能,促进它们的可持续发展并造福人类,引起了学界和国际社会的高度关注。本文阐述了世界热带海洋特色生态系统的分布格局、退化趋势及其影响因素,分析了我国珊瑚礁、红树林、海草床生态系统的分布现状和生物多样性特点,并以珊瑚礁生态系统为重点,探讨了热带海洋特色生态系统退化的原因,以及目前我国开展修复和保护的有关行动措施。根据全球生物多样性保护行动计划,结合我国的实际情况,提出热带海洋特色生态系统恢复重构与保护的对策建议:1)建议国家组建南海特色生态系统研究中心、智能监测监控系统、专项数据库和专家智库;2)设立热带海洋特色生态系统恢复与保护示范区,组织多学科领域专家联合开展研究—试验—示范—评估—推广—监控;3)健全政策法规,加强执法管理,重视科普教育,提高公众环保意识,形成社会自觉行动。这些将为加强热带海洋特色生态系统及其生物多样性的保护和管理,维护其可持续发展和落实《昆明–蒙特利尔全球生物多样性框架》提出的30×30目标提供参考。

关键词：特色生态系统分布格局生态系统退化恢复与保护珊瑚礁红树林海草床

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文蛤(Meretrix petechialis)多种游离氨基酸含量的综合评价

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海洋科学 2024年第7期48卷 90-98页

作者：田砚敏王鸿霞刘保忠中国科学院海洋研究所中国科学院实验海洋生物学重点实验室山东青岛266071 中国科学院大学北京100049

为了明确文蛤游离氨基酸的组成、含量及其风味特性,本研究以文蛤的11个全同胞家系为研究对象,利用氨基酸自动分析仪测定文蛤足组织中游离氨基酸的种类和含量,通过主成分分析、TOPSIS分析进行综合评价。结果显示,文蛤家系游离氨基酸总量... 详细信息

为了明确文蛤游离氨基酸的组成、含量及其风味特性,本研究以文蛤的11个全同胞家系为研究对象,利用氨基酸自动分析仪测定文蛤足组织中游离氨基酸的种类和含量,通过主成分分析、TOPSIS分析进行综合评价。结果显示,文蛤家系游离氨基酸总量均在473~816mg/100g,均值为638mg/100g。呈鲜味氨基酸含量为270~570 mg/100g,占总含量的56.0%~70.8%,是最主要的呈味氨基酸。15种游离氨基酸通过主成分分析提取到2个主成分,其累积方差贡献率为89.54%,可代表文蛤中游离氨基酸的综合信息。游离氨基酸T值较高的家系依次是22A8、22A5、22A1和22A6,与TOPSIS分析结果一致。结果表明上述4个文蛤家系可作为游离氨基酸含量综合性状突出的优良种质资源用于文蛤的选育工作。

关键词：文蛤(Meretrix petechialis) 游离氨基酸含量主成分分析 TOPSIS分析

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eDNA技术监测陆地生物多样性:技术要点、难点与进展

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应用生态学报 2025年第3期36卷 927-942页

作者：刘明倩张政王尚冯凯顾松松李春格邓晔中国科学院生态环境研究中心环境生物技术重点实验室北京100085 中国科学院大学资源与环境学院北京100049 中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室山东青岛266071

生物多样性构成了人类生存的基础,是地球生态系统不可或缺的组成部分。联合国可持续发展目标15(SDG 15)强调了陆地生物多样性保护的重要性,旨在促进陆地生态系统的可持续利用。为了实现此目标,建立一个全面的生物多样性监测体系显得尤... 详细信息

生物多样性构成了人类生存的基础,是地球生态系统不可或缺的组成部分。联合国可持续发展目标15(SDG 15)强调了陆地生物多样性保护的重要性,旨在促进陆地生态系统的可持续利用。为了实现此目标,建立一个全面的生物多样性监测体系显得尤为关键。环境DNA(environmental DNA,eDNA)宏条形码技术作为一种新兴的监测手段,具有不依赖于物种形态特征、快速、经济和高准确性等优势,为陆地生物多样性的监测提供了一种有效方法。本文首先总结了应用eDNA宏条形码技术进行陆地生态系统生物多样性监测的技术要点,重点探讨了当前eDNA宏条形码技术在生物多样性研究中面临的挑战及应对策略,同时梳理了不同来源eDNA在陆地生态系统生物多样性监测中的研究进展,最后对未来的研究方向进行了展望。

关键词：陆地生态系统 eDNA来源跨域生物多样性特定生物类群宏条形码引物

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