检索结果-内蒙古大学图书馆

海洋湖沼通报(中英文) 2025年

作者：赵金玲安磊任晓亮中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室中国科学院大学海洋生物与生物技术功能实验室(青岛)

海洋线虫因个体微小且培养困难而导致其分子生物学信息采集受到限制。文中以沉积物中分离得到的海洋线虫以及传统模式生物秀丽隐杆线虫为实验对象，首次尝试将线虫分子生物学鉴定与全基因组扩增测序技术进行结合，摸索了一套基于单条线... 详细信息

海洋线虫因个体微小且培养困难而导致其分子生物学信息采集受到限制。文中以沉积物中分离得到的海洋线虫以及传统模式生物秀丽隐杆线虫为实验对象，首次尝试将线虫分子生物学鉴定与全基因组扩增测序技术进行结合，摸索了一套基于单条线虫的物种鉴定与基因组分析的实验流程。对于从南海珊瑚礁区沉积物分离到的海洋线虫中，选择其中生物量丰富的色矛科（Chromadoridae）的5个不同属，进行单条线虫全基因组扩增，基于全基因组扩增产物首次实现这些海洋线虫的基因组调查分析。基因组调查结果显示，这些海洋线虫的基因组长度以及GC含量均超过秀丽隐杆线虫。实验中借助传统模式生物探索出适用于海洋线虫的实验体系，对于获取海洋线虫基因组学信息、厘清海洋线虫系统发育关系以及分类学地位具有重要意义。

关键词：全基因组扩增多重位点置换扩增海洋沉积物海洋线虫

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海山不同水层的八放珊瑚多样性分布格局及驱动因素研究

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海洋与湖沼 2024年第3期55卷 712-725页

作者：王婷婷韦杰鸿徐雨窦方坤徐奎栋赵峰中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室山东青岛266071 中国科学院大学北京100049

海山是深海生物多样性的集聚地,而八放珊瑚是其中多样性高且占优势的类群,是海山脆弱海洋生态系统的指标类群,但迄今对其在全球海山的分布格局及驱动因素尚未报道。研究整理分析了全球341座海山的24352条八放珊瑚记录,探讨了八放珊瑚在2... 详细信息

海山是深海生物多样性的集聚地,而八放珊瑚是其中多样性高且占优势的类群,是海山脆弱海洋生态系统的指标类群,但迄今对其在全球海山的分布格局及驱动因素尚未报道。研究整理分析了全球341座海山的24352条八放珊瑚记录,探讨了八放珊瑚在200~1000 m和1000 m以深的分布格局及驱动因素。研究表明,200~1000 m水层八放珊瑚属级记录最多的网格分布在夏威夷群岛海域,1000 m以深为夏威夷群岛海域和西北大西洋。使用层级聚类分析海山群落相似性与Infomap Bioregions网络分析,可将200~1000 m的八放珊瑚划分为9个生物地理区,且阿拉斯加-加利福尼亚州海域、夏威夷群岛海域与热带太平洋海域分区明显;1000 m以深的水层可划分为11个生物地理区,加利福尼亚海域、太平洋中部与东南海域分区明显。Mantel test分析显示200~1000 m水层温度与生物地理区内的生物组成差异显著相关,层级聚类和网络分析显示溶解氧含量和流速亦为显著因子。通过T检验和Wilcoxon秩和检验分析表明200~1000 m和1000 m以深的部分八放珊瑚属对温度、溶解氧含量、盐度及流速等特定环境因子存在显著偏好,这可能是导致不同生物地理区八放珊瑚组成差异的重要原因。

关键词：生物地理区层级聚类网络分析生物多样性热点大数据

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耳螺在中国海的北扩:三种耳螺在我国黄海的报道(腹足纲:耳螺科)

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海洋与湖沼 2024年第4期55卷 1048-1056页

作者：张树乾张素萍张均龙中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室、青岛市海洋生物多样性与保护重点实验室山东青岛266071

2020~2023年,作者在我国黄海沿岸潮间带进行软体动物多样性调查时获取到多个耳螺科标本,通过形态学比较和研究,鉴定为3属3种,分别为:中国耳螺Ellobium chinense(Pfeiffer,1855)、赛氏女教士螺Pythia cecillii(***,1847)和教徒肋耳螺Laem... 详细信息

2020~2023年,作者在我国黄海沿岸潮间带进行软体动物多样性调查时获取到多个耳螺科标本,通过形态学比较和研究,鉴定为3属3种,分别为:中国耳螺Ellobium chinense(Pfeiffer,1855)、赛氏女教士螺Pythia cecillii(***,1847)和教徒肋耳螺Laemodonta exaratoides Kawabe,1992。中国耳螺和赛氏女教士螺采自江苏盐城,教徒肋耳螺采自青岛和大连。作者对这3种耳螺进行了分类学描述和报道,其中教徒肋耳螺在我国沿海系首次报道,为中国新记录种。作者基于COⅠ、16S rRNA和H3基因对教徒肋耳螺进行了系统发育分析,确定了该种在耳螺科中的分类地位。耳螺科是典型的暖水性类群,在我国主要见于热带和亚热带海域,之前仅有中国耳螺可向北扩散至黄海南部。该研究中3种耳螺在黄海的发现表明该海域内的耳螺种类在不断增多,且出现了明显的北扩现象。这种现象很可能与全球变暖导致的黄海水温持续升高有关。研究结果不仅丰富了中国海软体动物多样性研究内容,也为更好地理解气候变化背景下软体动物的扩布提供了新的数据和资料。

关键词：耳螺科肋耳螺属黄海印太交汇区新记录气候变化

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珊瑚骨骼形成的生物机制研究进展

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海洋与湖沼 2024年

作者：梁延硕徐奎栋中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室青岛海洋科技中心海洋生物学与生物技术功能实验室中国科学院大学

珊瑚碳酸钙骨骼作为珊瑚礁或珊瑚林的结构基础，在维持海洋生物多性和全球碳循环中发挥着重要作用。珊瑚生物矿化是一个复杂的过程，受到体内有机基质、晶体自身生长调控，以及外界环境等多方面的综合调控作用，迄今对珊瑚骨骼钙化过程... 详细信息

珊瑚碳酸钙骨骼作为珊瑚礁或珊瑚林的结构基础，在维持海洋生物多性和全球碳循环中发挥着重要作用。珊瑚生物矿化是一个复杂的过程，受到体内有机基质、晶体自身生长调控，以及外界环境等多方面的综合调控作用，迄今对珊瑚骨骼钙化过程中生物调控的认识仍相当有限。文章从不同珊瑚类群的骨骼结构特征及演化历史、有机基质的调控机制、珊瑚钙化模型和环境因素对珊瑚钙化的影响等方面，综述了八放珊瑚与六放珊瑚的造礁石珊瑚钙化过程的研究进展，重点阐述了组织-骨骼界面的钙化细胞结构和离子运输途径，并梳理出了初步的珊瑚钙化模型。从不同碳酸钙晶型的骨骼结构、有机基质蛋白组成上的低共有率和生物控制下的钙化过程差异性表明八放珊瑚与造礁石珊瑚可能采用了不同的珊瑚钙化策略。未来珊瑚生物矿化研究需融合多学科技术进一步探究骨骼形成机制，结合海洋环境变化记录，揭示驱动珊瑚骨骼形成的环境因素，为理解珊瑚如何应对当今全球变暖和海洋酸化事件提供理论基础。

关键词：八放珊瑚石珊瑚珊瑚生物矿化骨骼有机基质钙化模型

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珊瑚骨骼形成的生物机制研究进展

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海洋与湖沼 2024年第4期55卷 787-801页

作者：徐奎栋梁延硕中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室山东青岛266071 青岛海洋科技中心海洋生物学与生物技术功能实验室山东青岛266237 中国科学院大学北京100049

珊瑚碳酸钙骨骼作为珊瑚礁或珊瑚林的结构基础,在维持海洋生物多样性和全球碳循环中发挥着重要作用。珊瑚生物矿化是一个复杂的过程,受到体内有机基质、晶体自身生长调控,以及外界环境等多方面的综合调控作用,迄今对珊瑚骨骼钙化过程中... 详细信息

珊瑚碳酸钙骨骼作为珊瑚礁或珊瑚林的结构基础,在维持海洋生物多样性和全球碳循环中发挥着重要作用。珊瑚生物矿化是一个复杂的过程,受到体内有机基质、晶体自身生长调控,以及外界环境等多方面的综合调控作用,迄今对珊瑚骨骼钙化过程中生物调控的认识仍相当有限。文章从不同珊瑚类群的骨骼结构特征及演化历史、有机基质的调控机制、珊瑚钙化模型和环境因素对珊瑚钙化的影响等方面,综述了八放珊瑚与六放珊瑚的造礁石珊瑚钙化过程的研究进展,重点阐述了组织-骨骼界面的钙化细胞结构和离子运输途径,并梳理出了初步的珊瑚钙化模型。从不同碳酸钙晶型的骨骼结构、有机基质蛋白组成上的低共有率和生物控制下的钙化过程差异性表明八放珊瑚与造礁石珊瑚可能采用了不同的珊瑚钙化策略。未来珊瑚生物矿化研究需融合多学科技术进一步探究骨骼形成机制,结合海洋环境变化记录,揭示驱动珊瑚骨骼形成的环境因素,为理解珊瑚如何应对当今全球变暖和海洋酸化事件提供理论基础。

关键词：八放珊瑚石珊瑚珊瑚生物矿化骨骼有机基质钙化模型

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基于环境RNA研究海山效应对浮游细菌多样性和分布的影响

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水生生物学报 2024年第7期48卷 1111-1119页

作者：尹婷婷赵峰刘巍岳徐奎栋青岛农业大学青岛266109 中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室青岛266071 中国科学院大学北京100049

研究采用环境RNA技术探究西太平洋M4海山区细菌多样性,并与基于环境DNA技术的研究结果进行比较,解析细菌代谢活性特征。结果表明基于环境RNA和DNA技术检获的物种构成相似,但真光层中蓝细菌在RNA中的占比明显高于DNA,显示其高代谢活性;... 详细信息

研究采用环境RNA技术探究西太平洋M4海山区细菌多样性,并与基于环境DNA技术的研究结果进行比较,解析细菌代谢活性特征。结果表明基于环境RNA和DNA技术检获的物种构成相似,但真光层中蓝细菌在RNA中的占比明显高于DNA,显示其高代谢活性;而α变形菌在RNA中的占比明显小于DNA,代谢活性低;γ变形菌在RNA中占比更大且随水层加深而增加。物种间关系网络复杂度随着水深的增加呈先升高后下降的趋势。基于RNA数据构建的网络较DNA数据网络简单,且随着水深增加变化趋势更加显著,去除蓝细菌后网络变化剧烈,而去除α变形菌对网络影响小。综上,研究基于环境RNA技术提供了海山区浮游细菌多样性及分布更加完整的认知,α变形菌在海山区多样性占比和其在群落中作用可能被高估。

关键词：深海环境RNA 细菌微生物多样性海山效应

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物种分布模型在海洋大型底栖动物分布预测中的应用

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应用生态学报 2024年第9期35卷 2392-2400页

作者：丛佳仪李新正徐勇中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室山东青岛266071 中国科学院大学北京100049 中国科学院海洋大科学研究中心山东青岛266071 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物与生物技术功能实验室山东青岛266237

物种分布模型是一种基于环境条件和物种分布数据预测物种在不同环境中的分布范围和适宜生境的模型工具,主要包括关联模型、机理模型和机理-关联混合模型。在海洋领域,物种分布模型已被广泛应用于预测鱼类、哺乳类和藻类等海洋生物的分布... 详细信息

物种分布模型是一种基于环境条件和物种分布数据预测物种在不同环境中的分布范围和适宜生境的模型工具,主要包括关联模型、机理模型和机理-关联混合模型。在海洋领域,物种分布模型已被广泛应用于预测鱼类、哺乳类和藻类等海洋生物的分布,但在大型底栖动物中的应用还比较匮乏。大型底栖动物作为海洋生态系统的重要组成部分,研究其分布规律对生态保护和资源管理具有重要意义。本文对物种分布模型的常用方法进行了总结,介绍了不同模型在预测海洋大型底栖动物分布中的研究案例,重点介绍了关联模型和机理模型在分析气候变化对海洋大型底栖动物分布影响中的应用,阐述了物种分布模型面临的挑战以及发展前景。随着遥感技术和建模方法的不断进步,物种分布模型将在海洋生态学研究中发挥更加重要的作用,为应对气候变化和保护海洋生物多样性提供科学依据。

关键词：物种分布模型大型底栖动物气候变化关联模型机理模型

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中国海角蓑海牛属(腹足纲,裸鳃目,蓑海牛科)一新记录种

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海洋与湖沼 2024年第5期55卷 1268-1272页

作者：郑舒桤张均龙张树乾中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室青岛市海洋生物多样性与保护重点实验室山东青岛266071 中国科学院大学北京100049 中国科学院海洋生物标本馆山东青岛266071

通过整理中国科学院海洋生物标本馆馆藏的采自三亚潮间带的裸鳃类标本,鉴定出角蓑海牛属1种:斐济角蓑海牛Anteaeolidiella fijensis Carmona,Bhave,Salunkhe,Pola,Gosliner&Cervera,2014,该种在我国为首次发现,系中国新记录种。利... 详细信息

通过整理中国科学院海洋生物标本馆馆藏的采自三亚潮间带的裸鳃类标本,鉴定出角蓑海牛属1种:斐济角蓑海牛Anteaeolidiella fijensis Carmona,Bhave,Salunkhe,Pola,Gosliner&Cervera,2014,该种在我国为首次发现,系中国新记录种。利用体式显微镜对其外部形态进行了观察,利用扫描电子显微镜对其颚片和齿舌进行了拍照,基于COI、16S rRNA和H3基因序列构建了角蓑海牛属的系统发育树,并利用ABGD和bPTP物种界定方法对该属种类进行了界定。斐济角蓑海牛之前仅在斐济和印度海域有过报道,其在中国海的发现进一步表明该种在印度-西太平洋海域有非常广的分布范围,因此对研究印度-西太平洋海域内物种的扩布和演化研究具有重要价值。

关键词：角蓑海牛属斐济角蓑海牛新记录种印度-西太平洋

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eDNA技术监测陆地生物多样性:技术要点、难点与进展

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应用生态学报 2025年第3期36卷 927-942页

作者：刘明倩张政王尚冯凯顾松松李春格邓晔中国科学院生态环境研究中心环境生物技术重点实验室北京100085 中国科学院大学资源与环境学院北京100049 中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室山东青岛266071

生物多样性构成了人类生存的基础,是地球生态系统不可或缺的组成部分。联合国可持续发展目标15(SDG 15)强调了陆地生物多样性保护的重要性,旨在促进陆地生态系统的可持续利用。为了实现此目标,建立一个全面的生物多样性监测体系显得尤... 详细信息

生物多样性构成了人类生存的基础,是地球生态系统不可或缺的组成部分。联合国可持续发展目标15(SDG 15)强调了陆地生物多样性保护的重要性,旨在促进陆地生态系统的可持续利用。为了实现此目标,建立一个全面的生物多样性监测体系显得尤为关键。环境DNA(environmental DNA,eDNA)宏条形码技术作为一种新兴的监测手段,具有不依赖于物种形态特征、快速、经济和高准确性等优势,为陆地生物多样性的监测提供了一种有效方法。本文首先总结了应用eDNA宏条形码技术进行陆地生态系统生物多样性监测的技术要点,重点探讨了当前eDNA宏条形码技术在生物多样性研究中面临的挑战及应对策略,同时梳理了不同来源eDNA在陆地生态系统生物多样性监测中的研究进展,最后对未来的研究方向进行了展望。

关键词：陆地生态系统 eDNA来源跨域生物多样性特定生物类群宏条形码引物

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单细胞转录组测序技术及其在秀丽隐杆线虫中的应用

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生物技术通报 2023年第6期39卷 158-170页

作者：赵金玲安磊任晓亮中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室青岛266237 中国科学院大学北京100049

单细胞转录组测序技术使人们摆脱了细胞异质性问题的干扰,从而在单个细胞水平实现对基因表达及转录调控机制的探索,以及对不同细胞亚群和特殊细胞类型的识别,对系统发育领域的研究具有重要意义。传统模式生物秀丽隐杆线虫(Caenorhabditi... 详细信息

单细胞转录组测序技术使人们摆脱了细胞异质性问题的干扰,从而在单个细胞水平实现对基因表达及转录调控机制的探索,以及对不同细胞亚群和特殊细胞类型的识别,对系统发育领域的研究具有重要意义。传统模式生物秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)由于体细胞数目固定、细胞分化路径清晰等特点,近年来成为了单细胞转录组学研究的重要模型。本文对目前单细胞转录组测序技术的发展现状进行综述,总结其在秀丽隐杆线虫的细胞谱系分析、单细胞轨迹推断以及神经元细胞图谱等研究工作中的应用情况,并对未来的研究方向作进一步展望。

关键词：单细胞转录组测序秀丽隐杆线虫细胞谱系

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