检索结果-内蒙古大学图书馆

2012全国高性能计算学术年会

作者：武林平 Wu Linping 魏勇 Wei Yong 刘旭 Liu Xu 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京 100094 Institute of Applied Physics and Computational Mathematics Beijing 100094 China 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京 100094 计算机体系结构国家重点实验室中国科学院计算技术研究所北京100190 Institute of Applied Physics and Computational Mathematics Beijing 100094 China State Key Laborato

并行程序在运行过程中,位于计算节点上的进程经常由于CPU要处理来自硬件、固件、节点操作系统、系统管理软件等部件的干扰而被迫中断,这些由于系统部件所引起的计算进程中断被称之为“系统噪音”.相关研究表明,噪音的叠加对大规模并行... 详细信息

并行程序在运行过程中,位于计算节点上的进程经常由于CPU要处理来自硬件、固件、节点操作系统、系统管理软件等部件的干扰而被迫中断,这些由于系统部件所引起的计算进程中断被称之为“系统噪音”.相关研究表明,噪音的叠加对大规模并行程序的性能有较大影响,特别是当前的大规模集群系统,单节点数十核、全系统数万核,需要对系统噪音进行精确的量化分析.本文在总结相关研究的基础上,实现了一个低开销、可扩展性好的噪音测量软件NoiseProfiler.该软件实现固定工作量、固定时间量、噪音序列三种噪音测量方法,能够从不同视角刻画系统的噪音特征;实现单核、单CPU、全节点三种测量流程,分别针对多核集群系统的多种使用模式;低时间开销,在2000个节点上测量时间最长1458秒;具有良好的可扩展性,节点数量从125增加到2000,其测量总时间仅增加3.9％.应用到某单位生产系统P上,检测到P内存在两类较大噪音源,通过改进系统、消除噪音源,实际并行程序的测试性能分别提升38.5％、48％.

关键词：并行程序多核集群系统噪音测量性能优化

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DISC1 Ser704Cys基因型与脑白质完整性无显著性相关:一项中国较大样本的影像遗传学研究(英文)

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转化医学研究(电子版) 2012年第1期2卷 77-80页

作者：刘冰李永辉侯冰于春水蒋田仔中国科学院自动化研究所模式识别国家重点实验室LIAMA计算医学中心中国科学院自动化研究所模式识别国家重点实验室LLAMA计算医学中心中国科学院计算机技术研究所国家高性能计算技术研究中心天津医科大学总医院放射科电子科技大学生命科学与技术学院神经信息教育部重点实验室澳大利亚昆士兰大学昆士兰脑研究所

近来一项87例英国健康人群的影像遗传学研究,报告了DISC1 Ser704Cys显著调控脑内的大范围的白质完整性。然而,此类研究的结果在独立样本中的可重复性尤其重要。我们用一组较大样本的健康中国汉族人群,同时采集了遗传学资料和弥散磁共振... 详细信息

近来一项87例英国健康人群的影像遗传学研究,报告了DISC1 Ser704Cys显著调控脑内的大范围的白质完整性。然而,此类研究的结果在独立样本中的可重复性尤其重要。我们用一组较大样本的健康中国汉族人群,同时采集了遗传学资料和弥散磁共振影像学数据,然后开展了同样的基于纤维束骨架的空间统计分析(TBSS分析)研究,然后在我们的样本中没有发现DISC1 Ser704Cys与白质完整性的任何显著性相关。我们的研究结果不支持在中国汉族人群中的DISC1 Ser704Cys与脑白质完整型的显著性关联。因此,此相关很有必要在更进一步独立样本中的验证。

关键词：精神分裂症弥散磁共振影像 Disrupted-in-Schizophrenia-1(DISCI) 基于纤维束骨架的空间统计分析白质完整性

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一种空间矩形剖分的负载平衡算法

一种空间矩形剖分的负载平衡算法

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2012全国高性能计算学术年会

作者： Liu Xu 刘旭 Zhang Aiqing 张爱清 Institute of Applied Physics and Computational Mathematics Beijing 100094 State Key Laboratory of C 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100094 计算机体系结构国家重点实验室中国科学院计算技术研究所北京100190 Institute of Applied Physics and Computational Mathematics Beijing 100094 计算机体系结构国家重点实验室中国科学院计算技术研究所北京100190

在一些复杂的结构网格应用中，计算区域由处于不同索引空间中的多个矩形区域拼接构成。传统的负载平衡方法无法解决这些应用中的空间矩形剖分的负载平衡问题。为了解决这种负载平衡问题，推广了递归对分法。理论分析表明，新方法具有线... 详细信息

在一些复杂的结构网格应用中，计算区域由处于不同索引空间中的多个矩形区域拼接构成。传统的负载平衡方法无法解决这些应用中的空间矩形剖分的负载平衡问题。为了解决这种负载平衡问题，推广了递归对分法。理论分析表明，新方法具有线性时间复杂度。模型问题和实际问题的测试结果表明，针对数千路的剖分问题，该算法能够计算出具有较高负载平衡效率和较好面体比的剖分。

关键词：并行计算结构网格负载平衡算法空间矩形剖

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miR-139在肺鳞癌组织中的表达及临床意义

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肿瘤预防与治疗 2018年第5期31卷 313-317页

作者：阮红莲叶芷璇杨磊王书强施昌宏广州医科大学公共卫生学院应用统计系广州511436 广州医科大学公共卫生学院预防医学系广州511436 中国科学院深圳先进研究院高性能计算技术研究中心广东深圳518055

目的:分析miR-139在肺鳞癌组织中的表达及临床意义,预测与肺鳞癌预后相关的miR-139的靶基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集肺鳞癌数据集,下载患者临床特征、基因表达谱及预后随访信息。分析miR-139表达与肺鳞癌临床特征的相... 详细信息

目的:分析miR-139在肺鳞癌组织中的表达及临床意义,预测与肺鳞癌预后相关的miR-139的靶基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集肺鳞癌数据集,下载患者临床特征、基因表达谱及预后随访信息。分析miR-139表达与肺鳞癌临床特征的相关性及对预后的影响。利用生物信息学方法预测miR-139的靶基因并进行生存分析。结果:在45对肺鳞癌和配对癌旁正常组织中,癌组织miR-139表达低于正常组织,且差异具有统计学意义(P <0. 001)。在Ⅰ/Ⅱ期肺鳞癌组织中,miR-139相对高表达组的总生存情况不如miR-139相对低表达组,其中位生存期分别为1713日和3253日,差异具有统计学意义(P <0. 001)。多因素Cox回归分析发现,miR-139是肺鳞癌的独立预后因子,高表达患者的死亡风险是低表达患者的2. 768倍(P <0. 001)。结论:在肺鳞癌组织中,miR-139相对高表达是一种预后不良因素,经独立验证之后有望作为预测肺鳞癌患者预后的生物标志物。

关键词：肺鳞癌 TCGA miR-139 预后

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基于多目标遗传算法的单指令集异构多核系统静态任务调度

基于多目标遗传算法的单指令集异构多核系统静态任务调度

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2012中国计算机大会

作者：徐远超张志敏蒋毅飞首都师范大学信息工程学院北京100048 中国科学院计算技术研究所计算机体系结构国家重点实验室北京100190 中国科学院计算技术研究所计算机体系结构国家重点实验室北京100190 上海高性能集成电路设计中心上海201204

与同构多核处理器相比，单指令集异构多核处理器能够更好的匹配程序行为的多样性，从而具有更好的性能功耗比。异构多核处理器的能效优势依赖于操作系统合理而有效的调度，追求性能与功耗的统一，是典型的多目标优化问题。提出将多目标... 详细信息

与同构多核处理器相比，单指令集异构多核处理器能够更好的匹配程序行为的多样性，从而具有更好的性能功耗比。异构多核处理器的能效优势依赖于操作系统合理而有效的调度，追求性能与功耗的统一，是典型的多目标优化问题。提出将多目标优化遗传算法应用于寻找异构多核环境下最优的静态任务调度方案，提出表征任务相对顺序的染色体编码结构，使种群初始化时的有效个体所占比例变为100％。提出使用先序关系矩阵来确定任务的执行顺序，克服了高度值方法存在的严重不足。仿真结果表明，先序关系矩阵方法能扩大搜索范围，在种群规模足够大时，可以找到高度值方法漏掉的部分最优解。

关键词：异构多核任务调度多目标优化遗传算法性能功耗比

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欢迎订阅2019年《计算机科学与探索》《计算机工程与应用》

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计算机科学与探索 2019年第1期13卷 127页

作者：管志斌肖俊敏季统凯洪学海谭光明马岩中国矿业大学(北京)机电与信息工程学院中国科学院计算技术研究所高性能计算机研究中心

《计算机科学与探索》为月刊,大16开,单价50元,全年12期总价600元,邮发代号:82-560。邮局汇款地址:北京619信箱26分箱《计算机科学与探索》编辑部(收)邮编:100083《计算机工程与应用》为半月刊,大16开,每月1日、15日出版,单价45元,全年2... 详细信息

《计算机科学与探索》为月刊,大16开,单价50元,全年12期总价600元,邮发代号:82-560。邮局汇款地址:北京619信箱26分箱《计算机科学与探索》编辑部(收)邮编:100083《计算机工程与应用》为半月刊,大16开,每月1日、15日出版,单价45元,全年24期总价1080元,邮发代号:82-605。

关键词：《计算机工程与应用》计算机科学

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信息技术应用创新信息产品成熟度评估体系第2部分:芯片

信息技术应用创新信息产品成熟度评估体系第2部分:芯片

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