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2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006)

作者：宋刚蒋孟奇张云泉李玉成陈靖柳锴中国科学院软件研究所并行计算实验室北京100080 中国科学院研究生院北京100080 中国科学院计算机科学国家重点实验室北京100080 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京100080 中国科学院计算机科学国家重点实验室北京100080 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京100080 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京100080 微软亚洲工程院北京100080

随着峰值速度达280.6万亿次 IBM BlueGene/L 机群的投入使用,高性能计算机正面临着飞速发展,双核处理器的出现使得用户面临无处不在的并行.如何将已有的串行算法并行化并在并行计算机上实现成为高性能计算发展面临的迫切任务,本文尝试用... 详细信息

随着峰值速度达280.6万亿次 IBM BlueGene/L 机群的投入使用,高性能计算机正面临着飞速发展,双核处理器的出现使得用户面临无处不在的并行.如何将已有的串行算法并行化并在并行计算机上实现成为高性能计算发展面临的迫切任务,本文尝试用OpenMP并行化gzip, 在机群的一个SMP节点(双CPU)环境下测试表明,性能得到了大幅度的提升.

关键词：并行编程 OpenMP并行化 gzip 压缩算法并行解压缩

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循环语句存取复杂性模型及其应用

循环语句存取复杂性模型及其应用

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2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006)

作者：陆涵隽姚继锋张云泉上海复旦大学信息学院电子工程系上海200433 上海超级计算中心上海201203 上海超级计算中心上海201203 中科院软件所并行计算实验室北京100080 中科院计算机科学国家重点实验室北京100080

程序设计者,尤其是数值计算程序的设计者,不考虑程序实现平台的存储系统将很难得到高的性能.在处理器和存储器之间的速度差距日益加大的今天,要评价一段算法或程序的优劣,不应该仅仅用传统的计算复杂性加以分析,存储复杂性对程序性能的... 详细信息

程序设计者,尤其是数值计算程序的设计者,不考虑程序实现平台的存储系统将很难得到高的性能.在处理器和存储器之间的速度差距日益加大的今天,要评价一段算法或程序的优劣,不应该仅仅用传统的计算复杂性加以分析,存储复杂性对程序性能的影响同样重要.作为优化存储访问最典型的多级缓存技术无疑是研究的重点.另一方面,在数值计算上大量的数据存取操作均基于循环结构得以实现.本文试图建立一个基于多级缓存硬件结构的模型,对循环结构的复杂性,主要是存储复杂性进行分析,实现对循环结构程序性能的评价和预测,从而提出可能的改进方向.

关键词：存取复杂性循环语句多级缓存模型

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万亿次机群系统NPB性能和可扩展性研究

万亿次机群系统NPB性能和可扩展性研究

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第8届全国并行计算大会

作者：袁伟张云泉唐渊李玉成中国科学院软件所并行计算实验室北京 100080 中国科学院计算机科学重点实验室北京 100080 中国科学院研究生院北京100039 中国科学院软件所并行计算实验室北京 100080 中国科学院计算机科学重点实验室北京 100080 中国科学院软件所并行计算实验室北京 100080 中国科学院计算机科学重点实验室北京 100080 中国科学院研究生院北京100039 中国科学院软件所并行计算实验室北京 100080

本文对万亿次机群系统NPB性能和可扩展性进行了研究。高性能机群的性能评测和并行程序的性能是我们研究的重点。理论峰值以及Linpack测试性能都不能代表高性能计算机的实际性能,大规模并行处理时机器效率和应用程序性能较低,采用商品化... 详细信息

本文对万亿次机群系统NPB性能和可扩展性进行了研究。高性能机群的性能评测和并行程序的性能是我们研究的重点。理论峰值以及Linpack测试性能都不能代表高性能计算机的实际性能,大规模并行处理时机器效率和应用程序性能较低,采用商品化部件构造的高性能机群系统(Cluster)虽然有较高的性价比，但它的性能也受到置疑。我们采用NAS Parallel Benchmarks(NPB)在两个万亿次机群和一个千亿次机群上进行测试，研究影响机群系统性能的关键因素及NPB测试程序在大规模并行处理时的性能，并结合各个程序的性质做了扩展性分析。

关键词：高性能计算并行计算机计算机扩展

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硬件因素对LogP模型参数影响的研究

硬件因素对LogP模型参数影响的研究

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国际并行算法与计算环境专题讨论会

作者：唐渊张云泉李玉成中国科学院软件研究所并行中心(北京) 中科院计算机科学重点实验室(北京) 中国科学院软件研究所并行中心(北京)

有关并行计算的通讯模型已经有很多了,其中比较著名的,并且又适合于机群系统(PC-Cluster)这种目前比较流行的并行计算环境的主要有:LogP,LogGP.在[参考文献4]所做的工作中详细地比较并分析了LogP模型各个参数对实际应用程序的影响.但是... 详细信息

有关并行计算的通讯模型已经有很多了,其中比较著名的,并且又适合于机群系统(PC-Cluster)这种目前比较流行的并行计算环境的主要有:LogP,LogGP.在[参考文献4]所做的工作中详细地比较并分析了LogP模型各个参数对实际应用程序的影响.但是,大多数的实验者与研究者限于条件,往往只是对一个给定的系统环境做各种各样的测试,无法考虑不同的硬件组合对LogP模型或者LogGP模型的参数产生的影响.而本文在对许多由不同硬件配置的系统的测试过程中,初步比较并分析了这些不同的硬件因素对LogP,LogGP通讯模型各个参数所造成的影响.希望能够对配置机群系统时需要考虑的硬件因素提供有用的参考.软件因素的影响分析是我们将来的工作.

关键词：机群系统并行计算通讯模型计算机硬件

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硬件因素对LogP模型参数影响的研究

硬件因素对LogP模型参数影响的研究

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中国科学院计算技术研究所第七届计算机科学与技术研究生学术讨论会

作者：唐渊张云泉中国科学院软件研究所并行中心北京100080 中科院计算机科学重点实验室北京100080 中国科学院软件研究所并行中心北京100080

关键词：机群系统硬件因素通讯性能 MPI LogP模型

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硬件因素对LogP 模型参数影响的研究

硬件因素对LogP 模型参数影响的研究

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第七届全国并行计算学术交流会

作者：唐渊张云泉李玉成中国科学院软件研究所并行中心北京100080 中科院计算机科学重点实验室北京 100080 中国科学院软件研究所并行中心北京100080

本文在对许多由不同硬件配置的系统的测试过程中,初步比较并分析了这些不同的硬件因素对LogP,LogGP通讯模型各个参数所造成的影响.希望能够对配置机群系统时需要考虑的硬件因素提供有用的参考.软件因素的影响分析是我们将来的工作.

关键词：机群系统硬件因素通讯性能 MPI LogP模型并行计算

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深腾7000天体大规模数值模拟软件性能测试与分析

深腾7000天体大规模数值模拟软件性能测试与分析

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2009中国计算机大会

作者：王婷孙相征张云泉杨超李力刚刘芳芳管文华中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100190 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100190 中国科学院软件研究所计算机科学国家重点实验室北京 100190 中国科学院研究生院北京 100190 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100190 中国科学院软件研究所计算机科学国家重点实验室北京 100190 中国科学院上海天文台上海 200030

在百万亿次超级计算机深腾7000上进行了80×80×50和160×160×100两种网格规模，基于Aztec库和PETSc库的天体大规模数值模拟软件的性能和可扩展性测试，并对性能测试结果进行了深入分析，详细解释了某些情况下出现超... 详细信息

在百万亿次超级计算机深腾7000上进行了80×80×50和160×160×100两种网格规模，基于Aztec库和PETSc库的天体大规模数值模拟软件的性能和可扩展性测试，并对性能测试结果进行了深入分析，详细解释了某些情况下出现超线性加速比的原因。实验结果表明，程序在1024个处理器核时，每种测试组合仍具有加速比的提升，其中某些测试组合在2048核上仍具有加速比。在测试过程中，我们还观察到一个比较有趣的现象，同样的问题规模和处理器核数，每节点采用4个处理嚣核比每节点采用8个处理器核时的运行时间，基于Aztec软件包的平均下降29％，基于PETSc软件包的平均下降36％。试验体现了深腾7000提供的有效支持，此结果对软件下一步的优化研究有重要的指导意义。

关键词：天体数值模拟性能测试可扩展性

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一种改进的OpenMP Guided 调度策略研究

一种改进的OpenMP Guided 调度策略研究

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2008年全国高性能计算机学术年会

作者：刘胜飞张云泉中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100190 中国科学院研究生院北京 100190 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100190 中国科学院软件研究所计算机科学国家重点实验室北京 100190 bigbigfei@*** zyq@mail.rdcps.ac.c

在科学计算中，循环结构是最重要的行对象之一。本文在考虑负载平衡、调度开销等多面因素的基础上，OpenMP标准制定了静态调度动态调度、指数调度和运行时调度等不同策略针对指数调度策略不适合递减型循环结构的点，提出一种改进的new_g... 详细信息

在科学计算中，循环结构是最重要的行对象之一。本文在考虑负载平衡、调度开销等多面因素的基础上，OpenMP标准制定了静态调度动态调度、指数调度和运行时调度等不同策略针对指数调度策略不适合递减型循环结构的点，提出一种改进的new_guided 指数调度略，并在OMPi 编译器上加以实现。new_guided调度策略的主要思想是对前半部分的循环采静态调度，后半部分的循环采用指数调度。

关键词：科学计算负载平衡静态调度指数调度

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几何定理机器证明三十年

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系统科学与数学 2009年第9期29卷 1155-1168页

作者：张景中李永彬电子科技大学与中科院成都计算所自动推理联合实验室成都610054 中国科学院成都计算机应用研究所成都610041 广州大学计算机与教育软件学院广州510006 电子科技大学应用数学学院成都610054

由于传统的兴趣和多种原因,几何定理的机器证明在自动推理的研究中占有重要的地位.自吴法发表至今30年,几何定理机器证明的研究和实践有了很大的进展.对无序几何命题而言,代数方法、数值方法均能有效地判定其真假,面积法(消点法)、搜索... 详细信息

由于传统的兴趣和多种原因,几何定理的机器证明在自动推理的研究中占有重要的地位.自吴法发表至今30年,几何定理机器证明的研究和实践有了很大的进展.对无序几何命题而言,代数方法、数值方法均能有效地判定其真假,面积法(消点法)、搜索法更能生成其可读的证明.几何不等式机器证明的研究,由于多项式完全判别系统的建立,也有了突破.研究领域已由机器证明扩展为包括几何作图在内的一般几何问题的机器求解,并有了实际的应用.

关键词：几何定理机器证明可读证明代数方法面积法基于数据库的搜索法.

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基于网络划分的最优路径并行算法分析与实现

基于网络划分的最优路径并行算法分析与实现

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2007年全国高性能计算学术年会

作者：陈虎唐雨新张云泉中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100080 中国科学院计算机科学国家重点实验室北京 100080 中国科学院研究生院北京 100080 中国科学院软件研究所并行计算实验室北京 100080 中国科学院计算机科学国家重点实验室北京 100080

最优路径问题是资源分配,线路设计等优化问题的基础,很多问题都可以归结为最优路径问题。求解网络中最优路径的方法可以分为两大类。一种是标号设定算法(label setting, LS),另一种是标号改变算法(label correcting, LC)。由于网络路径... 详细信息

最优路径问题是资源分配,线路设计等优化问题的基础,很多问题都可以归结为最优路径问题。求解网络中最优路径的方法可以分为两大类。一种是标号设定算法(label setting, LS),另一种是标号改变算法(label correcting, LC)。由于网络路径算法的应用越来越强调动态性和及时性,因此高效的求解最优路径问题变得越来越重要。在这里,利用一种高效的网络划分方法,实现了基于网络划分的LS/LC并行算法。实验结果表明,基于这种网络划分的并行算法对于求解最优路径有很好的加速比和扩展比。

关键词：并行算法最优路径问题网络划分

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