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鸟分枝杆菌MAV_2043基因编码蛋白的生物信息学分析

中国病原生物学杂志 2022年第8期17卷 907-911页

作者：陈瑞枫马枫茜李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

目的预测鸟分枝杆菌MAV_2043基因编码蛋白的结构和功能。方法利用UniproKB数据库、PredictProtein服务、SWISS-MODEL服务、ProtParam蛋白分析工具、Protcale、TMHMM-2.0服务和SignalP-5.0服务、ProtCompB方法和IEDB数据库等生物信息学预测软件对MAV_2043编码蛋白的二级和三级结构、理化性质、疏水性分析、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及免疫表位进行分析预测;运用UniprotKB数据库的Blast工具对氨基酸序列进行比对,采用MEGA11软件构建进化树,进行系统进化分析。结果MAV_2043基因全长618 bp,共编码205个氨基酸。MAV_2043基因编码蛋白与鸟分枝杆菌亚种起源相同,该蛋白与结核分枝杆菌的[Cu-Zn]超氧化物歧化酶同源性较高。该蛋白为稳定的亲水性蛋白,无跨膜区、有信号肽;预测该蛋白亚细胞定位在细胞膜上,二级结构以β折叠为主;三级结构模型显示该蛋白可形成同源二聚体,有两个Cu~+配体的结合空间位置。结论生物信息学预测鸟分枝杆菌MAV_2043基因编码蛋白可能为[Cu-Zn]超氧化物歧化酶,是鸟分枝杆菌中的重要毒力因子,可为鸟分枝杆菌靶向治疗提供新思路。

关键词：鸟分枝杆菌 MAV_2043 [Cu-Zn]超氧化物歧化酶生物信息学

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巨噬细胞来源外泌体抗肿瘤作用的研究进展

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中国生物制品学杂志 2025年第4期38卷 496-501,507页

作者：杜文雅代禹美(综述) 吴利先(审校) 大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

肿瘤是一种高度异质性的疾病,肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophage,TAM)是肿瘤微环境中重要的免疫细胞,具有高度异质性及可塑性,肿瘤复发转移是导致癌症患者发病和死亡的重要原因。巨噬细胞来源的外泌体(macrophage-derived e... 详细信息

肿瘤是一种高度异质性的疾病,肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophage,TAM)是肿瘤微环境中重要的免疫细胞,具有高度异质性及可塑性,肿瘤复发转移是导致癌症患者发病和死亡的重要原因。巨噬细胞来源的外泌体(macrophage-derived exosome,MDE)作为细胞间信号传递的信使,携带有母细胞的多种成分。大量研究表明,巨噬细胞的极化状态对肿瘤的进展转归发挥着调控作用,MDE与肿瘤的进展和巨噬细胞极化密切相关。MDE作为一种新的抗肿瘤策略,为肿瘤治疗提供了新的思路。本文对近年来工程化MDE在抗肿瘤方面的研究,以及M1和M2 MDE如何介导肿瘤的发生发展作一综述,以期为肿瘤治疗提供参考。

关键词：肿瘤巨噬细胞外泌体微小RNA

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外泌体的抗感染作用研究进展

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中国比较医学杂志 2022年第12期32卷 115-119页

作者：马枫茜陈瑞枫丁寿鹏李祥芳吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

外泌体是由多种细胞分泌的纳米囊泡,能够传递蛋白质、脂质和核酸等生物活性大分子,在细胞间信息传递中起着重要作用。越来越多的研究表明,某些类型细胞如间充质干细胞、NK细胞和中性粒细胞等细胞来源的外泌体具有治疗潜力,参与调节免疫... 详细信息

外泌体是由多种细胞分泌的纳米囊泡,能够传递蛋白质、脂质和核酸等生物活性大分子,在细胞间信息传递中起着重要作用。越来越多的研究表明,某些类型细胞如间充质干细胞、NK细胞和中性粒细胞等细胞来源的外泌体具有治疗潜力,参与调节免疫系统,能够增强免疫细胞的杀伤能力;另外从感染细胞释放的外泌体也能促进抗原提呈和免疫细胞活化,激活多种细胞免疫因子,介导细胞免疫反应。本文就外泌体在抗病毒感染、细菌感染和真菌感染中的直接或间接作用进行了综述,为临床应用提供依据。

关键词：外泌体病毒细菌真菌

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结核分枝杆菌DosS/DosR双组分调控系统与宿主免疫细胞的相互作用及其在新型疫苗研制中的研究进展

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解放军医学杂志 2025年

作者：杨雨婷龚丽坤王艳段晓娟杨国平楚雄彝族自治州中医医院检验科楚雄彝族自治州彝族医药研究院楚雄彝族自治州中医医院内五科大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室

结核分枝杆菌(Mtb)在宿主体内以休眠状态长期存活，处于潜伏感染状态时对大多数抗结核药物无明显反应，临床中无法进行检测，在机体缺氧、氧化应激或免疫系统功能受损等情况下可重新被激活，引起活动性结核病(aTB)，对结核病的防控造成... 详细信息

结核分枝杆菌(Mtb)在宿主体内以休眠状态长期存活，处于潜伏感染状态时对大多数抗结核药物无明显反应，临床中无法进行检测，在机体缺氧、氧化应激或免疫系统功能受损等情况下可重新被激活，引起活动性结核病(aTB)，对结核病的防控造成巨大困扰。休眠氧传感器组氨酸激酶调节子(DosS)/休眠生存调节子(DosR)双组分调控系统(TCSs)是介导Mtb潜伏感染的重要调节系统，其调控的蛋白在研发针对Mtb潜伏感染的诊断试剂和研制新型结核疫苗中具有广阔的应用前景。本文对Mtb DosS/DosR 双组分调控系统的结构、生物学功能、与宿主免疫细胞间的相互作用及其在新型疫苗研制中的潜力作一综述。

关键词：结核分枝杆菌 DosS/DosR双组分调控系统潜伏感染免疫细胞疫苗

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Nrf2/HO-1通路在氧化应激和炎性反应中的作用

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医学研究杂志 2023年第7期52卷 19-22页

作者：于馨雅申元英郭乐大理大学基础医学院医学微生物学与免疫学教研室 671000

氧化应激是指体内氧化与抗氧化作用失衡,倾向于氧化,导致中性粒细胞炎性浸润、蛋白酶分泌增加、产生高活性分子,如活性氧自由基(reactive oxygen species,ROS)和活性氮自由基(reactive nitrogen species,RNS)以及大量氧化中间产物,如白... 详细信息

氧化应激是指体内氧化与抗氧化作用失衡,倾向于氧化,导致中性粒细胞炎性浸润、蛋白酶分泌增加、产生高活性分子,如活性氧自由基(reactive oxygen species,ROS)和活性氮自由基(reactive nitrogen species,RNS)以及大量氧化中间产物,如白三烯、血栓素A 2等促炎介质,从而引起细胞凋亡和炎性反应。近年来研究表明,核转录因子红系2相关因子2/血红素加氧酶-1(nuclear factor erythroid-2-related factor 2/heme oxygenase 1,Nrf2/HO-1)通路可以通过抗炎、抗氧化等作用抵抗氧化应激损伤。因此,有效调控Nrf2/HO-1通路可成为治疗氧化应激性疾病和炎性疾病的重要靶点。

关键词：核转录因子红系2相关因子2/血红素加氧酶-1 氧化应激炎性反应

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MicroRNAs在黏膜屏障及炎症反应中的作用

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中国免疫学杂志 2021年第19期37卷 2405-2410页

作者：谭仕廉郭乐申元英大理大学基础医学院医学微生物学与免疫学教研室大理671000

黏膜屏障是机体直接接触外源性异物的主要界面,同时也是病原体入侵机体的重要位点。因此,黏膜表面需要严格的调节以维持黏膜屏障功能或平衡黏膜炎症反应。近年来研究表明,MicroRNAs(miRNAs)在调节黏膜屏障功能和黏膜炎症反应过程中起到... 详细信息

黏膜屏障是机体直接接触外源性异物的主要界面,同时也是病原体入侵机体的重要位点。因此,黏膜表面需要严格的调节以维持黏膜屏障功能或平衡黏膜炎症反应。近年来研究表明,MicroRNAs(miRNAs)在调节黏膜屏障功能和黏膜炎症反应过程中起到重要的作用。本文综述了相关miRNAs与黏膜炎症的研究,进一步理解miRNAs参与黏膜生理和炎症过程中的作用,找到具有防治黏膜炎症的新作用靶点。

关键词： MicroRNAs 黏膜炎症屏障功能

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结核分枝杆菌Rv0081基因编码蛋白的生物信息学分析

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微生物学杂志 2023年第5期43卷 81-90页

作者：杨雨婷杨国平大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室云南大理671000 大理大学云南省昆虫生物医药研发重点实验室云南大理671000

运用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv0081蛋白的生物学特征及筛选潜在的优势抗原表位。从NCBI数据库获取Mtb Rv0081蛋白的氨基酸序列,利用生物信息学分析软件ProtParam、ProtScale及TMPRED分析Rv... 详细信息

运用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv0081蛋白的生物学特征及筛选潜在的优势抗原表位。从NCBI数据库获取Mtb Rv0081蛋白的氨基酸序列,利用生物信息学分析软件ProtParam、ProtScale及TMPRED分析Rv0081蛋白的理化性质及亲疏水性;TMHMM、SignalP-5.0 Server预测蛋白的跨膜区及信号肽;NetNGlyc-1.0 Server、NetPhos 3.1 Server分别预测蛋白的糖基化位点及磷酸化位点;STRING预测能与Rv0081相互作用的蛋白;分别运用SOPMA、SWISS-MODEL预测蛋白的二、三级结构;综合运用softberry、WoLF PSORT预测蛋白的亚细胞定位;运用DNAStar预测蛋白的B细胞抗原表位;综合运用SYFPEITHI、NetCTL 1.2 Server、Net MHC pan 4.1 server预测蛋白的CTL细胞抗原表位;综合运用SYFPEITHI、Net MHCII pan 4.0 server预测蛋白的Th细胞抗原表位。结果表明,Rv0081蛋白由114个氨基酸组成,相对分子质量为12356.32,亚细胞定位于细胞质中,为稳定的疏水性蛋白,无跨膜区和信号肽,含有1个糖基化位点及9个磷酸化位点;二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,结构较松散;与hycE、hycP、Rv0088、Rv0083、hycD、hycQ、Rv0082、devR、Rv0080及Rv0079蛋白存在相互作用关系;综合分析各软件预测结果筛选出6个优势B细胞抗原表位、6个优势CTL细胞抗原表位及7个优势Th细胞抗原表位。Mtb Rv0081蛋白具有较多潜在的候选B、T细胞抗原表位,可作为研发新型结核疫苗的候选抗原。

关键词：结核分枝杆菌 Rv0081蛋白生物信息学抗原表位疫苗

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细胞因子在非结核分枝杆菌(NTM)病中的作用研究进展

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中国病原生物学杂志 2021年第3期16卷 368-370页

作者：高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

非结核分枝杆菌(Non-tuberculous Mycobacteria)进入机体后,机体免疫功能的一系列变化导致不同细胞因子的改变,从而在NTM病的发病机制中发挥重要作用。本文就不同细胞因子在NTM病中的作用做一综述,为细胞因子变化在非结核分枝杆菌感染... 详细信息

非结核分枝杆菌(Non-tuberculous Mycobacteria)进入机体后,机体免疫功能的一系列变化导致不同细胞因子的改变,从而在NTM病的发病机制中发挥重要作用。本文就不同细胞因子在NTM病中的作用做一综述,为细胞因子变化在非结核分枝杆菌感染中的预测、诊断、疗效观察、预后评估等提供依据。

关键词：细胞因子非结核分枝杆菌发病机制综述

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鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2021年第2期16卷 150-154页

作者：高婧华陈晓文陈越吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

目的应用生物信息学分析软件预测鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的结构和功能。方法利用在线uniprot蛋白数据库、ProtParam蛋白分析网站、在线Protcale、TMHMM(TMHMM Server V 2.0)和SignalP 5.0、Softberry和PSORTⅡ Server,以及SOPMA和SWISS-MODEL等生物信息学预测软件对MAV-2052蛋白的理化性质、疏水性分析、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及二级结构进行分析预测并对其三级结构进行模型构建;登录网站http://***/services/netrhos/对蛋白磷酸化位点进行预测,运用uniprot蛋白数据库的Blast工具对氨基酸进行比对,采用MEGA-X软件构建进化树。结果MAV-2052基因全长933 bp,编码310个氨基酸的蛋白质。该蛋白与鸟分枝杆菌亚型起源于同一物种,与结核分枝杆菌的半胱氨酸合酶k1同源性较高。MAV-2052为稳定的疏水性蛋白,无跨膜区、无信号肽;预测该蛋白亚细胞定位在细胞质中,蛋白序列中存在13个丝氨酸磷酸化位点,二级结构以α-螺旋为主且有两个结构域;三级结构模型显示该蛋白可形成同源二聚体,但无其他配体结合空间位置。MAV-2052蛋白为半胱氨酸合酶,属于半胱氨酸合酶/半胱氨酸β合成酶家族,是调控鸟分枝杆菌生长中的重要蛋白之一。结论生物信息学预测鸟分枝杆菌MAV-2052为半胱氨酸合成酶,是调控细菌生长的重要蛋白,可为鸟分枝杆菌的靶向治疗提供新思路。

关键词：鸟分枝杆菌结构功能生物信息学分析

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表皮葡萄球菌VraSR生物信息学分析及VraR蛋白的原核表达

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中国病原生物学杂志 2021年第10期16卷 1158-1162页

作者：乾莲陈红玲孟媛媛陈晓婷孙士正武有聪大理大学基础医学院病原生物学综合实验室云南大理671000 大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室

目的对表皮葡萄球菌VraSR进行生物信息学分析并原核表达VraR蛋白,为表皮葡萄球菌VraSR系统功能研究奠定基础。方法 PCR扩增表皮葡萄球菌SE1457菌株vraR基因,PCR片段经酶切后连入载体pET28a,构建重组表达质粒pET28a-vraR,并转化至大肠埃... 详细信息

目的对表皮葡萄球菌VraSR进行生物信息学分析并原核表达VraR蛋白,为表皮葡萄球菌VraSR系统功能研究奠定基础。方法 PCR扩增表皮葡萄球菌SE1457菌株vraR基因,PCR片段经酶切后连入载体pET28a,构建重组表达质粒pET28a-vraR,并转化至大肠埃希菌BL21(DE3)中诱导表达。重组蛋白His;-VraR经Western blot鉴定后采用Ni-NTA柱纯化。采用DNAMAN、SMART、Megalign等软件对VraSR系统进行生物信息学分析。结果成功构建重组表达质粒pET28a-vraR,在22℃、0.5 mmol/L IPTG诱导12 h高效表达重组蛋白His;-VraR。分析重组His;-VraR序列,与金黄色葡萄球菌VraS/VraR核苷酸同源性皆为82%,氨基酸同源性分别为92%/94%,氨基酸组成差异主要存在VraS的胞外区和VraR的CheY结构域。结论成功表达并纯化表皮葡萄球菌VraR蛋白,生物信息学分析表皮葡萄球菌VraSR的功能,可能不同于金黄色葡萄球菌。

关键词：表皮葡萄球菌 VraSR 生物信息原核表达

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