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分子植物育种 2023年

作者：马福仙余姣君原晓龙王毅张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定... 详细信息

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的滇紫草基因组大小约为880.20 Mbp；高通量测序获得原始数据64.09 Gb，处理后得到约59.72 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估滇紫草为复杂基因组，大小为848.08 Mbp，杂合度为0.3%，GC含量约为37.17%。分析滇紫草基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、基因资源利用和药用成分合成途径等提供科学依据。

关键词：滇紫草流式细胞术 K-mer分析基因组大小

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南滚河国家级自然保护区珍稀濒危植物的分布特征

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西部林业科学 2014年第3期43卷 99-109页

作者：关佳洁余奇王娟杜凡杨宇明西南林业大学云南昆明650224 国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南昆明650201

采用样地调查、线路调查的方法，对云南省南滚河国家级自然保护区珍稀濒危植物的资源状况及分布特征进行了研究。结果表明，（1）南滚河国家级自然保护区珍稀濒危植物共计206种，隶属于44科108属。其中，国家重点保护野生植物21种，云... 详细信息

采用样地调查、线路调查的方法，对云南省南滚河国家级自然保护区珍稀濒危植物的资源状况及分布特征进行了研究。结果表明，（1）南滚河国家级自然保护区珍稀濒危植物共计206种，隶属于44科108属。其中，国家重点保护野生植物21种，云南省重点保护野生植物36种， IUCN红色名录植物17种， CITES附录植物143种。（2）发现新分布种长蕊木兰、水青树和逸生种喜树。（3）珍稀濒危种子植物区系联系广泛，属级水平上具有极强的热带性质；种级水平上具有热带成分向温带成分过渡的特征，且特有现象突出，与滇西南、滇南分布联系密切。（4）海拔510～2977 m，珍稀濒危植物的丰富度随海拔的增加呈先增后减的趋势，集中分布在海拔1000～1500 m的季风常绿阔叶林中。该保护区珍稀濒危植物面临的主要威胁是人为破坏，并针对所受威胁提出了保护建议。

关键词：珍稀濒危植物南滚河国家级自然保护区区系成分垂直分布

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低温胁迫对8个核桃无性系抗寒生理指标的影响

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西北林学院学报 2012年第6期27卷 12-15,25页

作者：李小琴彭明俊段安安庞静王有兵张凤良云南省森林植物培育和开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省林业科学院云南昆明650204 西南林业大学林学院云南昆明650224

选用8个核桃无性系作为试验材料,经不同低温(4℃、-3℃、-6℃、-9℃、-12℃,4℃为对照)处理后,测定其叶片电导率、可溶性糖和丙二醛(MDA)含量,对核桃抗寒性进行研究。结果表明:随着胁迫温度的下降,叶片相对电导率呈现出"S"型... 详细信息

选用8个核桃无性系作为试验材料,经不同低温(4℃、-3℃、-6℃、-9℃、-12℃,4℃为对照)处理后,测定其叶片电导率、可溶性糖和丙二醛(MDA)含量,对核桃抗寒性进行研究。结果表明:随着胁迫温度的下降,叶片相对电导率呈现出"S"型上升趋势,核桃离体叶片半致死温度(LT50)在-5～12℃之间;可溶性糖与丙二醛含量的变化为先增加再下降,均在-6℃出现峰值,但抗寒性与可溶性糖含量呈正相关,而与丙二醛含量呈负相关。3种方法测定的核桃抗寒性基本一致,表明3个指标均可作为核桃抗寒性的鉴定方法。

关键词：核桃无性系低温胁迫抗寒性生理指标

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球孢白僵菌Bbpks1基因的序列分析及其最佳表达培养基的筛选

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第4期48卷 423-428页

作者：原晓龙李娟李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091

采用基因组挖掘的方法从球孢白僵菌基因组中获得了一条杂合PKS/NRPS基因(命名为Bbpks1),通过生物信息学分析预测了该基因的功能,检测了该基因在不同碳源、氮源培养基上的表达情况.结果显示:Bbpks1基因长度为11838bp,编码3945个氨基酸,... 详细信息

采用基因组挖掘的方法从球孢白僵菌基因组中获得了一条杂合PKS/NRPS基因(命名为Bbpks1),通过生物信息学分析预测了该基因的功能,检测了该基因在不同碳源、氮源培养基上的表达情况.结果显示:Bbpks1基因长度为11838bp,编码3945个氨基酸,其结构域顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR;BbPKS1蛋白与布氏虫草、半翅轮枝菌、塔宾曲霉等真菌中的杂合PKS/NRPS蛋白序列(GenBank登录号分别为OAA40809.1、CEJ94083.1、OJI88893.1)聚为一个分支,且与参与细胞松弛素和伊快霉素合成的蛋白的亲缘关系较近,可推测该基因在球孢白僵菌中参与2,4-吡咯酮型化合物的合成;Bbpks1基因在含有乳糖、肌醇碳源的培养基上表达量较高,在以麦芽糖作为碳源的培养基上不表达,在含不同氮源的培养基上均大量表达.

关键词：球孢白僵菌杂合PKS/NRPS 聚类分析基因表达

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西南桦基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：马福仙董洪进原晓龙耿云芬王毅丁淑金张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大... 详细信息

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大小约为1.00 Gb；高通量测序获得原始数据32.82 Gb，处理后得到约30.38 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估西南桦是复杂基因组，为四倍体植物，基因组大小为924.00 Mb，杂合度为3.3%，GC含量约为36.14%。分析西南桦基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、倍性水平和全基因组测序等提供科学依据。

关键词：西南桦流式细胞术数据约简法(K-mer)分析基因组大小

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基于SSR标记的黑老虎种质资源的遗传多样性和遗传结构

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中南林业科技大学学报 2024年第5期44卷 156-166页

作者：李思广陈少瑜付玉嫔尹艾萍司马永康祁荣频周云王绍昌云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 屏边苗族自治县林业和草原局云南屏边661299

【目的】揭示黑老虎5个群体70份种质资源的遗传多样性水平和遗传结构状况,为种质资源评价、保护及利用提供理论依据。【方法】用筛选出的17对引物进行所有样本SSR-PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳后采用GenAlex v6.502、Ntsys V2.2及Struc... 详细信息

【目的】揭示黑老虎5个群体70份种质资源的遗传多样性水平和遗传结构状况,为种质资源评价、保护及利用提供理论依据。【方法】用筛选出的17对引物进行所有样本SSR-PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳后采用GenAlex v6.502、Ntsys V2.2及Structure 2.3.4等软件进行遗传多样性和遗传结构分析。【结果】17对引物的70份样本中共检测到147个等位基因,平均每对引物扩增出8.647个等位基因。17个位点的Shannon信息指数(I)平均值为1.421,期望杂合度(He)平均值为0.648,多态信息指数(PIC)平均值为0.612。5个群体中马关群体(MGH)的遗传多样性最高,I和He分别为1.070和0.544。群体遗传分化系数(Fst)平均值为0.323,有32.3%的变异来源于群体间。分子方差分析(AMOVA)显示群体间方差分量比为28.8%,群体间的遗传变异占总变异量的28.8%。17个位点群体内近交系数(Fis)的平均值为0.161(Fis>0),黑老虎存在较强的近亲交配,5个群体中只有广西群体(GXH)Fis<0。基因流(Nm)为0.876,属中等水平。UPGMA聚类和STRUCTURE分析将70份黑老虎种质资源划分成了3个类群:类群Ⅰ由来自MGH的样本资源组成,类群Ⅱ主要由屏边群体(PBH)的样本资源组成,类群Ⅲ主要由GXH、贵州群体(GZH)及湖南群体(HNH)的样本资源组成。【结论】黑老虎种质资源具有丰富的遗传多样性,群体间存在极高的遗传分化,遗传变异主要来源于群体内的个体。大部分种质的遗传背景比较单一,同一群体的不同种质遗传组分基本相同。在黑老虎育种及资源保护和开发工作中,应在尽量涵盖全部群体类别的基础上,特别重视遗传多样性丰富的群体以及各群体内不同类型个体的选择、保存和利用。

关键词：黑老虎种质资源 SSR标记遗传多样性遗传结构

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独龙江地区竹类植物研究

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西部林业科学 2013年第1期42卷 1-9页

作者：杨宇明杜凡石明赵一鹤徐田王娟云南省林业科学院云南昆明650201 西南林业大学云南昆明650224 国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

独龙江地区由于特殊的地理位置和高山峡谷半封闭的地势,植物区系地理的组成极为复杂和多样化,作为植物界中进化水平较高的单子叶竹类植物也表现出了异常的区系组成和类型结构的多样性。通过对独龙江地区竹类植物系统调查研究,结果表明,... 详细信息

独龙江地区由于特殊的地理位置和高山峡谷半封闭的地势,植物区系地理的组成极为复杂和多样化,作为植物界中进化水平较高的单子叶竹类植物也表现出了异常的区系组成和类型结构的多样性。通过对独龙江地区竹类植物系统调查研究,结果表明,该地区有竹类植物10属27种1变种,其中发现贡山竹属新属1个,为高黎贡山特有属,该属仅有贡山竹一个种,为竹类中唯一具有附生习性的竹种;发现毒空竹、独龙江牡竹、巴坡藤竹、高山箭竹、毛环箭竹、阔叶箭竹6个新种。独龙江地区竹类属组成以热带亚洲起源为主,包括箣竹属、空竹属、藤竹属、牡竹属和玉山竹属,共有5属;东亚属4个,为方竹属、箭竹属、新小竹属和刚竹属。种的组成以暖温带至寒温带分布的箭竹属最为丰富,共计13种,占该区竹种数的48%。独龙江地区特有种共12种,占该区竹种数的44%。根据组成竹子群落的优势竹种的不同,将该区范围内的寒温性竹林划分为马亨箭竹林、黑穗箭竹林、高山箭竹林、尖削箭竹林、皱壳箭竹林及独龙江玉山竹林6个类型。独龙江地区汇集了多种区系成分的竹类,并在这里得到分化与扩散。是典型的东南亚成分分布的北限,东亚成分分布的西限,印度—缅北成分的东限,而寒温性高山竹类在本地区得到最大程度的分化与繁衍。

关键词：独龙江竹类植物区系独有类群多样性资源分布

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不同干扰条件下纳帕海湿地土壤种子库的特征研究

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西部林业科学 2013年第6期42卷 45-50页

作者：谭芮杜凡李伟黄维胜杨宇明栗宏林王娟国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南昆明650201 西南林业大学云南昆明650224

对不同干扰条件下纳帕海湿地植物土壤种子库物种组成、密度、多样性进行了研究,分析了地上植被与土壤种子库间的相似性关系。结果表明,纳帕海湖滨湿地土壤种子库物种在返青期有26个物种,在枯黄期有7个物种,蕨类植物仅在返青期生长。为旅... 详细信息

对不同干扰条件下纳帕海湿地植物土壤种子库物种组成、密度、多样性进行了研究,分析了地上植被与土壤种子库间的相似性关系。结果表明,纳帕海湖滨湿地土壤种子库物种在返青期有26个物种,在枯黄期有7个物种,蕨类植物仅在返青期生长。为旅游+放牧干扰(TT);人工取草皮干扰(AR)和猪拱干扰(PF)3种干扰类型的土壤种子库中的植物物种数在返青期分别为21种、12种和12种;在枯黄期分别为2种、2种和6种。在返青期,TT和PF方式下土壤种子库的物种里多年生植物均高于1年生植物,只有AR方式下土壤种子库的物种为1年生植物高于多年生植物;在枯黄期,不同干扰方式下土壤种子库的物种1年生植物都均高于多年生植物,这是由于枯黄期的土壤中以当年产生的种子植物为主。不同时期和干扰方式下土壤种子库的物种为双子叶植物比例均明显高于单子叶植物,说明不同的干扰方式都使得单子叶植物减少。返青期和枯黄期种子库的总密度是PF﹥TT﹥AR;物种多样性在返青期是TT﹥AR﹥PF,在枯黄期为AR﹥PF﹥TT。在返青期,TT、AR、PF 3种干扰下地上植被与土壤种子库物种组成相似性指数分别为0.53、0.30、0.44。因此,可以预测3种干扰后植物群落的恢复潜力是TT﹥AR﹥PF。故在植被恢复的时候不仅要重视TT后的生态恢复,还要更加重视AR和TT后的生态恢复。

关键词：纳帕海湿地干扰季节土壤种子库特征恢复

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不同枝采时间对竹叶花椒结果枝生长量、产量和品质的影响

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西部林业科学 2024年第2期53卷 81-86页

作者：呼延丽郝佳波杜春花郭永清铁筱睿陆斌云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 昆明市海口林场云南昆明650114

为探明竹叶花椒枝采最佳时间,开展不同带枝采收时间(6月、7月、8月)对竹叶花椒结果枝生长量、产量和品质影响的研究。结果显示:(1)不同带枝采收时间,鲜果感官等级评价,7月>8月>6月;椒果干鲜比6.8︰1、5.2︰1、4.5︰1。(2)不同带... 详细信息

为探明竹叶花椒枝采最佳时间,开展不同带枝采收时间(6月、7月、8月)对竹叶花椒结果枝生长量、产量和品质影响的研究。结果显示:(1)不同带枝采收时间,鲜果感官等级评价,7月>8月>6月;椒果干鲜比6.8︰1、5.2︰1、4.5︰1。(2)不同带枝采收时间,年末树冠投影面积新梢(结果枝)数量、鲜果产量、冠幅方差分析结果显示,6月、7月差异不显著(P>0.05),8月差异显著(P<0.05)。(3)展开多重比较分析结果显示,结果枝单枝产量在6月、7月差异不显著(P>0.05),8月的长果枝产量差异达极显著(P<0.01);结果枝单枝长在6月、7月差异不显著(P>0.05),8月的短果枝差异显著(P<0.05)。结果表明:6月中旬至7月中旬是竹叶花椒带枝采收最佳时间,采收后当年花椒商品性质量能得到保证,萌生的新梢生长量能够保证次年结果量。研究结果为竹叶花椒枝采轻简化栽培提供理论依据。

关键词：竹叶花椒带枝采收时间生长量产量品质

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西南桦4CL基因的克隆及表达分析

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分子植物育种 2021年第1期19卷 118-122页

作者：李云琴原晓龙王毅张劲峰云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为研究西南桦(Betula alnoides)中木质素生物合成途径的关键酶4-香豆酸:辅酶A连接酶的调控机制,本研究采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到一个具有完整开放阅读框的4-香豆酸:辅酶A连接酶基因(Ba4CL, NCBI登录号为MK959316),该基因全长1 6... 详细信息

为研究西南桦(Betula alnoides)中木质素生物合成途径的关键酶4-香豆酸:辅酶A连接酶的调控机制,本研究采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到一个具有完整开放阅读框的4-香豆酸:辅酶A连接酶基因(Ba4CL, NCBI登录号为MK959316),该基因全长1 629 bp,共编码542个氨基酸。西南桦Ba4CL与光皮桦(Betula luminifera, ACJ38668.1) 4CL的蛋白序列同源性为99.63%,与白桦(Betula platyphylla, AAV65114.1)4CL同源性为99.45%;Ba4CL基因拥有4CL基因家族的保守域及具有保守序列SSGTTGLPKGV和GEICIRG,Ba4CL与桦木属植物白桦和光皮桦聚在一起。Ba4CL基因在西南桦的根、小枝、树皮和叶片中均有表达,且在小枝中表达量最高,树皮次之。本研究为培育西南桦优良用材品种提供参考。

关键词：西南桦(Betula alnoides) 4-香豆酸:辅酶A连接酶荧光定量PCR 基因功能分析

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