检索结果-内蒙古大学图书馆

农业环境科学学报 2013年第7期32卷 1405-1412页

作者：刘绍雄王明月王娟杨宇明缪福俊王金华张敬宜熊智西南林业大学西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室昆明650224 云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物繁育和开发利用重点实验室昆明650204

为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析。结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤... 详细信息

为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析。结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤细菌多样性指数(H′)、丰度(S)和均匀度(J)均有所不同,根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均高于非根际,其中茭草根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均最高,说明植物群落类型与土壤微生物多样性的关系十分密切;不同植物群落根际土壤细菌群落结构相似性较高,非根际土壤细菌群落结构相似性较低,在82%的相似水平上聚为4大类群,根际土壤细菌和茭草非根际土壤细菌聚为一类,其余非根际土壤细菌各聚为一类,说明植物群落对微生物群落结构具有一定的影响。对DGGE的优势条带序列分析,同源性最高的微生物分别属于变形菌门(Proteobacteria)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、紫色杆菌属(Janthinobacte rium)、杜擀氏菌属(Duganella)、埃希氏菌属(Escherichia)和链球菌属(Streptococcus),它们均为未培养微生物。不同植物群落根际土壤氮磷含量均有所差异,其中茭草根际土壤氮磷含量最高,湿地土壤细菌多样性与土壤有机质、总N、总P的含量呈正相关关系,土壤细菌多样性与土壤pH值呈负相关关系。

关键词： PCR—DGGE 剑湖湿地根际微生物多样性

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橙黄硬皮马勃菌种的分离纯化及其菌根的人工合成

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中南林业科技大学学报 2022年第7期42卷 1-8,66页

作者：张珊珊杨文忠云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

【目的】为分离纯化菌根食用菌橙黄硬皮马勃的菌种,促进云南松无菌苗菌根的人工合成,实现云南松菌根化苗木的定向培育和菌根食用菌的人工驯化栽培。【方法】采用子实体组织分离法和综合PDA培养基对橙黄硬皮马勃子实体进行菌种分离,对其... 详细信息

【目的】为分离纯化菌根食用菌橙黄硬皮马勃的菌种,促进云南松无菌苗菌根的人工合成,实现云南松菌根化苗木的定向培育和菌根食用菌的人工驯化栽培。【方法】采用子实体组织分离法和综合PDA培养基对橙黄硬皮马勃子实体进行菌种分离,对其子实体、组织分离菌株和菌根菌的核糖体转录间隔区片段(ITS)进行分子鉴定,研究不同栽培基质条件下的接种处理对云南松菌根合成及其幼苗生长的影响。【结果】1)从邻接法构建的系统发育树上可以看出,采集的子实体、组织分离菌株和菌根菌确认为橙黄硬皮马勃。2)接种处理后的云南松幼苗生长指标显著高于未接种处理,而且在不同基质处理间差异显著,其中在蛭石和珍珠岩和泥炭土(质量比10:1:5)的混合基质中均表现最优。3)橙黄硬皮马勃在此混合基质中的菌根侵染率、菌根依赖性和菌根贡献率均最高,分别为92.66%、292.86%和65.85%,显著高于其他两种基质处理,可能是橙黄硬皮马勃菌丝更适宜生长在该混合基质,进而利于云南松无菌苗的菌根合成,也间接促进了云南松幼苗的生长。【结论】橙黄硬皮马勃菌种的分离纯化和菌根合成基质的筛选是云南松无菌苗菌根合成的关键。

关键词：菌根食用菌 ITS序列验证栽培基质菌根合成

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基于简化基因组测序的野生竹叶花椒遗传多样性分析

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分子植物育种 2023年

作者：尹庆丰王毅呼延丽郝佳波蒙进芳陆斌西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

为探究36份花椒资源间的遗传关系，本研究基于Illumina NovaSeq测序平台并利用ddRAD-seq (Double digest restriction site-associated DNA sequencing)技术对36分花椒资源进行了测序。结果显示，测序Q20值均值为98.00%，测序Q30值均值为93.72%，平均GC含量为36.01%；经过过滤和筛选共获得78 222 636个高质量SNP，其中纯合突变率平均值为91.17%；杂合突变率平均值为8.98%；SNP频谱分析显示碱基转换突变为主要SNP突变型。基于SNP进行的群体主成分分析、群体遗传结构分析以及群体发育树分析结果能够相互验证，可将36份花椒资源分为4个类群。在群体遗传多样性分析中发现，群体间的分化指数Fst在0.07～0.80之间，属于中等偏强且存在较大程度的遗传分化，遗传多样性差异较大。本研究利用ddRAD-seq技术解析的36份花椒资源群体遗传结构和群体遗传多样性，所筛选的SNP标记提供了丰富的信息，有助于完善花椒分子标记数据库，也为后续花椒遗传图谱构建、分子标记辅助选择育种、系统发育研究以及优良品种选育提供了基础。

关键词：简化基因组竹叶花椒 SNP 系统发育树遗传多样性分析

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思茅松1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)基因的克隆及功能分析

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林业科学研究 2015年第6期28卷 833-838页

作者：王毅周旭毕玮杨宇明李江王娟云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 西南林业大学云南昆明650224

1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)是甲基–D–赤藓醇–4–磷酸(MEP)途径中的第一个酶,也是限速酶。本文根据思茅松(Pinus kesiya ***(***.)Gaussen)树皮转录组数据分析结果,获得思茅松DXS基因片段,然后根据获得的基因片段设计特异引物,... 详细信息

1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)是甲基–D–赤藓醇–4–磷酸(MEP)途径中的第一个酶,也是限速酶。本文根据思茅松(Pinus kesiya ***(***.)Gaussen)树皮转录组数据分析结果,获得思茅松DXS基因片段,然后根据获得的基因片段设计特异引物,运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的DXS基因(Pk DXS1)。Pk DXS1基因的c DNA全长序列2 888 bp,含有1个2 223 bp的开放阅读框(ORF),编码740个氨基酸,该基因推断的蛋白与赤松(Pinus densiflora Siebold&Zucc)DXS蛋白的相似性为99%,与欧洲云杉(Picea abies(L.)***.)DXS的相似性为97%;经氨基酸序列比对,推断思茅松DXS具有高等植物DXS酶特有的叶绿体转运肽,二磷酸硫胺结合位点和转酮醇酶结构域。半定量RT-PCR检测表明树皮的创伤促进DXS基因的表达。

关键词：思茅松 DXS cDNA克隆基因功能分析

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黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

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华中农业大学学报 2016年第4期35卷 42-48页

作者：韩长志王娟西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 云南省林业科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸... 详细信息

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。

关键词： Xanthomonas campestris pv.raphani 756C Ⅵ型分泌系统 Ⅵ型分泌蛋白黄单胞菌属

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利用GC-MS技术分析油橄榄叶挥发油化学成分

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天然产物研究与开发 2012年第7期24卷 920-923页

作者：马惠芬闫争亮泽桑梓李勇杰宁德鲁余珍云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省森林植物培育与开发利用重点实验室中国科学院昆明植物研究所植物化学开放研究实验室昆明650204

本文采用同时蒸馏萃取法(SDE)提取油橄榄叶挥发油化学成分,利用气相色谱-质谱(GC-MS)联用方法分析并用峰面积归一化法得出各化学成分在挥发油中的百分含量。结果从油橄榄叶挥发油中分离出62各色谱峰,鉴定出56个化合物,占挥发性组分总量... 详细信息

本文采用同时蒸馏萃取法(SDE)提取油橄榄叶挥发油化学成分,利用气相色谱-质谱(GC-MS)联用方法分析并用峰面积归一化法得出各化学成分在挥发油中的百分含量。结果从油橄榄叶挥发油中分离出62各色谱峰,鉴定出56个化合物,占挥发性组分总量的95.6%。其中主要成分为α-芹子烯(13.13%)、β-芹子烯(10.15%)、β-石竹烯(14.29%)、橙花叔醇(6.72%)、α-石竹烯(6.60%)、3-己烯-1-醇(5.03%)、苯乙醛(5.61%)等。

关键词：油橄榄挥发性成分气相色谱-质谱技术同时蒸馏萃取

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滇牡丹类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶基因的鉴定及表达分析

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基因组学与应用生物学 2017年第4期36卷 1556-1562页

作者：王毅赵能原晓龙陈中华杨宇明王娟云南林业学科院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 云南林业学科院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室昆明650201 西南林业大学昆明650224

在植物中,类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶(F3GT)将不稳定的花色素转变为稳定的花色素苷,是花色素苷形成的关键酶。本研究采样RT-PCR技术从滇牡丹中成功克隆获得一个完整的F3GT基因(Pd F3GT1),其含有1 371 bp的开放阅读框(ORF),编码456个氨基... 详细信息

在植物中,类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶(F3GT)将不稳定的花色素转变为稳定的花色素苷,是花色素苷形成的关键酶。本研究采样RT-PCR技术从滇牡丹中成功克隆获得一个完整的F3GT基因(Pd F3GT1),其含有1 371 bp的开放阅读框(ORF),编码456个氨基酸。该基因推断的蛋白与葡萄(Vitis vinifera)3GT蛋白的相似性为64%;与已知功能的3GT基因进行系统进化分析,结果显示Pd3GT1与葡萄3GT聚类到同一个分支。氨基酸比对显示Pd3GT1蛋白序列还有糖基转移酶家族特有的PSPG-box结构域。半定量PCR结果显示:Pd3GT1在花蕾,花开时期的花瓣中大量表达,在叶和花芽中有微弱表达;在根和茎中没有表达。说明Pd3GT基因表达具有组织表达特异性。该研究将为研究滇牡丹花色素形成机理,以及对滇牡丹类黄酮糖基转移酶的功能鉴定和利用基因工程手段改良花卉品质提供理论依据。

关键词：滇牡丹 3GT c DNA克隆基因表达分析

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长松萝中一个聚酮合酶基因簇的克隆和鉴定

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微生物学报 2014年第7期54卷 770-777页

作者：王毅周旭许宰铣王娟云南省林业科学院、国家林业局重点开放性实验室、云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室云南昆明650204 韩国国立顺天大学韩国地衣研究所韩国顺天540742

【目的】探索药用地衣长松萝(Usnea longissima Ach)聚酮化合物的生物合成基因簇,克隆聚酮合酶(PKS)基因并分析其功能。【方法】以长松萝地衣型真菌为材料,通过巢氏PCR获得聚酮合酶基因片段和原位杂交筛选基因组文库获得聚酮合酶基因及... 详细信息

【目的】探索药用地衣长松萝(Usnea longissima Ach)聚酮化合物的生物合成基因簇,克隆聚酮合酶(PKS)基因并分析其功能。【方法】以长松萝地衣型真菌为材料,通过巢氏PCR获得聚酮合酶基因片段和原位杂交筛选基因组文库获得聚酮合酶基因及相邻基因簇。并对获得聚酮合酶进行分子系统进化分析和基因表达分析。【结果】获得药用地衣长松萝中的编码聚酮合酶基因UlPKS5的全长序列以及相邻修饰基因β-内酰胺酶和脱水酶。聚酮合酶UlPKS5含有酮体合成酶(KS),酰基转移酶(AT),产物模板(PT)以及酰基载体蛋白(ACP)结构域。分子系统进化分析显示UlPKS5属于非还原型聚酮合酶中第五组,与蒽醌类化合物生物合成相关。通过半定量RT-PCR分析表明山梨醇(10%)和蔗糖(2%和10%)能够强烈诱导UlPKS5基因表达。【结论】聚酮合酶(UlPKS5)及相邻修饰基因β-内酰胺酶和脱水酶与长松萝中蒽醌类化合物生物合成相关。

关键词：地衣型真菌长松萝聚酮合酶半定量PCR

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福贡龙竹种子无菌诱导植株再生及快速繁殖

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西部林业科学 2018年第3期47卷 118-122页

作者：呼延丽毕玮李灿雯李丹王娟王毅王四海杨宇明云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以福贡龙竹种子为外植体,开展组培快繁技术研究。结果表明,用75%酒精消毒60s,再用0.1%的Hg Cl2溶液消毒30min的效果最好;适宜诱导形成丛生芽的培养基为MS+6-BA 2mg/L+IBA 0.5mg/L+KT 0.2mg/L;最佳继代增殖培养基为MS+6-BA 3mg/L+NAA 0.2... 详细信息

以福贡龙竹种子为外植体,开展组培快繁技术研究。结果表明,用75%酒精消毒60s,再用0.1%的Hg Cl2溶液消毒30min的效果最好;适宜诱导形成丛生芽的培养基为MS+6-BA 2mg/L+IBA 0.5mg/L+KT 0.2mg/L;最佳继代增殖培养基为MS+6-BA 3mg/L+NAA 0.2mg/L;以MS+IBA 1mg/L+NAA 0.5mg/L为最佳生根培养基;将生根组培苗炼苗移栽,90d后成活率达81%以上。

关键词：福贡龙竹组织培养丛芽诱导快速繁殖

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短柄草基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：杨跃仙段利武马山俊曾昭朝原晓龙王毅云南林业职业技术学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

短柄草(Brachypodium sylvaticum (Huds.) Beauv.)是禾本科中一种体型较小的可自花结实的二倍体多年生植物，是多年生草本植物中优秀的候选模式植物。为大规模全基因组测序及其组装策略提供研究基础、确定其基因组大小及复杂程度提供信... 详细信息

短柄草(Brachypodium sylvaticum (Huds.) Beauv.)是禾本科中一种体型较小的可自花结实的二倍体多年生植物，是多年生草本植物中优秀的候选模式植物。为大规模全基因组测序及其组装策略提供研究基础、确定其基因组大小及复杂程度提供信息，本研究采用流式细胞术和二代测序技术的数据约简法(Ken-monomeric unit， K-mer)分析评估短柄草基因组大小，并分析其基因组的特征信息。研究结果显示，(1)以玉米作为内参，流式细胞测定短柄草基因组大小约为349.35 Mb；(2)高通量测序获得原始数据23.85 Gb，处理后得到约21.41 Gb的Clean data，数据质量良好；(3) K-mer分析显示短柄草基因组大小约为385.45 Mb，杂合度较低(0.3%)，GC含量为45.85%；(4) NT数据库比对发现二穗短柄草(B. distachyon)、安第斯短柄草(B. andinum)、大麦(Hordeum vulgare)亲缘关系较近。本研究为短柄草的全基因组de novo测序策略提供有效依据，也为未来短柄草分子育种及高效牧草培育奠定基础。

关键词：短柄草流式细胞术全基因组Survey分析基因组大小(C值)

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