检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2020年第5期39卷 2134-2140页

作者：李云琴陈中华原晓龙王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

FAD2是亚油酸合成的关键酶,是控制高油酸特性的重要基因。本研究采用RT-PCR技术在蒜头果中成功克隆得到一个FAD2基因,命名为MoFAD2,GenBank登录号为MK210593。其含有1329 bp开放阅读框,编码442个氨基酸。序列比对分析显示MoFAD2拥有FAD... 详细信息

FAD2是亚油酸合成的关键酶,是控制高油酸特性的重要基因。本研究采用RT-PCR技术在蒜头果中成功克隆得到一个FAD2基因,命名为MoFAD2,GenBank登录号为MK210593。其含有1329 bp开放阅读框,编码442个氨基酸。序列比对分析显示MoFAD2拥有FAD2家族特有的3个保守的组氨酸中心位点,蒜头果FAD2与中粒咖啡(Coffea canephora)FAD2的蛋白序列同源性为80.00%。系统进化树分析显示MoFAD2与石榴(Punica granatum)、珙桐(Davidia involucrata)聚为一支。荧光定量PCR分析表明MoFAD2在果实和叶中均有表达,但在蒜头果果实膨大期的表达量最高。研究为将来更好地开发利用蒜头果油用价值和进一步开展FAD2在不饱和脂肪酸生物合成过程中的调控作用研究奠定基础。

关键词：蒜头果 FAD2 基因克隆功能分析

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铁核桃叶绿体基因组密码子偏好性分析

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分子植物育种 2020年第20期18卷 6671-6677页

作者：原晓龙郝佳波王毅陆斌云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

为了分析铁核桃基因组密码子使用模式及其主要影响因素,本研究利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP对源自铁核桃叶绿体基因组中的52个基因的密码子碱基组成规律进行分析,并作中性绘图、ENC-plot和偏倚性分析,通过计算高、低表达基因库间的... 详细信息

为了分析铁核桃基因组密码子使用模式及其主要影响因素,本研究利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP对源自铁核桃叶绿体基因组中的52个基因的密码子碱基组成规律进行分析,并作中性绘图、ENC-plot和偏倚性分析,通过计算高、低表达基因库间的ΔRSCU值来确定最优密码子。结果显示,密码子不同位置的GC含量存在差异,表现为GC1(46.59%)>GC2(39.03%)>GC3(27.47%);ENC值在37.68~58.08之间,且ENC值>45的有36个,占比69.23%;中性绘图分析显示GC12在0.306~0.543之间,GC3在0.300~0.365之间,GC12和GC3的相关系数为0.182,相关性不显著,回归系数为0.261 2;ENC-plot分析显示大部分基因位于标准曲线附近;偏倚性显示位于平面图的右下方位置的基因数量最多;最优密码子分别为UUU、UUA、GUA、AGU、ACU、UAU、CAA、AAA、GAA、UGU、AUU和GCA。以上结果说明铁核桃叶绿体基因组密码子偏好以A/T结尾,影响偏好性的主要因素为选择。本研究为以后通过外源基因密码子改造后以铁核桃叶绿体为载体进行异源表达及种源鉴定提供科学根据。

关键词：铁核桃(Juglans sigillata Dode) 叶绿体基因组密码子偏好性

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印度紫檀DXS基因的克隆及表达分析

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分子植物育种 2020年第24期18卷 8055-8060页

作者：康洪梅原晓龙李云琴王毅张劲峰云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了探讨印度紫檀(Pterocarpus indicus)萜类化合物的生物合成,本研究通过对合成萜类物质的MEP途径的第一个限速酶(1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶, DXS)基因进行克隆,获得了印度紫檀DXS的全长cDNA PiDXS基因(NCBI登录号:MK959226),并对其... 详细信息

为了探讨印度紫檀(Pterocarpus indicus)萜类化合物的生物合成,本研究通过对合成萜类物质的MEP途径的第一个限速酶(1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶, DXS)基因进行克隆,获得了印度紫檀DXS的全长cDNA PiDXS基因(NCBI登录号:MK959226),并对其进行生物信息学和组织表达特异性分析。结果显示:PiDXS基因cDNA开放阅读框长2 025 bp,编码674个氨基酸,Blast比对发现,PiDXS具有一个二磷酸硫胺结合位点和一个转酮醇酶结构域;系统进化分析显示,PiDXS基因与大豆DXS和狭叶羽扇豆DXS聚为一类;组织表达特异分析结果显示PiDXS在茎、叶、树皮和根中均能表达,主要在幼嫩的组织中表达。研究结果为确定印度紫檀中DXS的基因功能以及揭示印度紫檀萜类化合物的生物合成提供了基础。

关键词：印度紫檀(Pterocarpus indicus) DXS cDNA 荧光定量PCR 基因功能分析

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中国哥纳香属(番荔枝科)植物新资料

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广西植物 2022年第10期42卷 1772-1779页

作者：杨斌王立彦周仕顺李剑武肖春芬谭运洪中国科学院东南亚生物多样性研究中心中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心云南勐腊666303 国家林业和草原局珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 中国科学院核心植物园保护生物学协同中心云南勐腊666303 云南铜壁关省级自然保护区管护局云南德宏678400 中国科学院西双版纳热带植物园园林园艺中心云南勐腊666303

番荔枝科(Annonaceae)是基部被子植物木兰目(Magnoliales)中较进化且物种数最多的科。目前的系统发育研究将番荔枝科划分为4个亚科,即蒙蒿子亚科(Anaxagoreoideae)、澄光木亚科(Ambavioideae)、番荔枝亚科(Annonoideae)和排石木亚科(Mal... 详细信息

番荔枝科(Annonaceae)是基部被子植物木兰目(Magnoliales)中较进化且物种数最多的科。目前的系统发育研究将番荔枝科划分为4个亚科,即蒙蒿子亚科(Anaxagoreoideae)、澄光木亚科(Ambavioideae)、番荔枝亚科(Annonoideae)和排石木亚科(Malmeoideae),有107属,2400多种,中国原产21属约110种。番荔枝科泛热带分布,是热带植物区系的优势类群,中国云南盈江位于云南省最西部边境,与缅甸东北部接壤,并与印度的东阿萨姆较近,植物区系处于东南亚(印度—马来西亚)热带生物区系向东亚亚热带-温带生物区系的过渡地带,属典型热带北缘性质,在植被地理和生物地理上十分重要,成为生物多样性保护的关键和热点地区。该区的热带雨林是印度阿萨姆和缅甸北部的热带雨林向东和向北扩散分布的边缘类型,是东南亚热带雨林在纬度和海拔分布上的极限类型。该文报道了采自中国云南省盈江县,引种保存于中国科学院西双版纳热带植物园的番荔枝科哥纳香属2个中国新记录种,即皱叶哥纳香[Goniothalamus sesquipedalis(*** Wall.)Hook.f.&Thomson]和长梗哥纳香(*** King&Prain)。Flora of China将盈江哥纳香(*** ***&***)处理为云南哥纳香(*** ***)的异名,基于活植物观察、馆藏标本和文献研究,该文对盈江哥纳香的分类地位进行了澄清,将其处理为长梗哥纳香的异名。皱叶哥纳香原记载产于印度、孟加拉国和缅甸等地,长梗哥纳香仅产于缅甸,该文对它们进行了补充描述,并提供彩色图版以便于鉴别。凭证标本存放于中国科学院西双版纳热带植物园标本馆(HITBC)。哥纳香属2个新记录的发现,丰富了中国番荔枝科植物多样性的认识,为中国云南热带植物区系属于热带亚洲(印度—马来西亚)植物区系,以及与缅甸北部、印度东北部植物区系的关系增加了例证。

关键词：哥纳香属番荔枝科新记录盈江县分类学

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乳油木幼苗对不同水分胁迫强度的生理响应

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西部林业科学 2020年第6期49卷 21-27页

作者：罗婷裴艳辉云南省林业和草原科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

为了探明不同的水分胁迫强度下乳油木幼苗的生理响应机制,以及其生长发育过程中的需水关键期和适宜的浇水量,以乳油木幼苗为试验材料,设置两组不同的盆栽水分胁迫试验进行研究。结果表明,不同强度干旱胁迫试验中,叶片SOD酶活性变化幅度... 详细信息

为了探明不同的水分胁迫强度下乳油木幼苗的生理响应机制,以及其生长发育过程中的需水关键期和适宜的浇水量,以乳油木幼苗为试验材料,设置两组不同的盆栽水分胁迫试验进行研究。结果表明,不同强度干旱胁迫试验中,叶片SOD酶活性变化幅度较大,土壤相对含水量从26%下降到15%时,酶活性显著降低了74.6%;POD、CAT酶活性无明显变化趋势。不同土壤水分胁迫试验中,叶片的SOD酶活性变化差异性显著,在土壤相对含水量达到40%时活性最大;POD、CAT酶活性变化不显著;叶片MDA含量在土壤相对含水量40%时最低。到胁迫后期,两组试验乳油木幼苗叶片的脯氨酸含量显著增加,说明脯氨酸积累对干旱胁迫反应较可溶性糖和可溶性蛋白更为强烈和敏感。研究表明,在土壤相对含水量40%左右时较适宜乳油木幼苗生长,土壤相对含水量26%左右是乳油木幼苗生长的需水关键期。

关键词：乳油木水分胁迫干旱胁迫生理变化

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云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征

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西部林业科学 2020年第6期49卷 35-42,53页

作者：张珊珊毛云玲冯志伟杨文忠云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

干巴菌是我国西南地区常见的菌根食用菌,目前无法进行人工栽培,因此确定云南松林下干巴菌生长的土壤环境对于其人工栽培的实现极为关键。为了解云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征,本研究以云南松林下干巴菌生长... 详细信息

干巴菌是我国西南地区常见的菌根食用菌,目前无法进行人工栽培,因此确定云南松林下干巴菌生长的土壤环境对于其人工栽培的实现极为关键。为了解云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征,本研究以云南松林下干巴菌生长土壤为研究对象,通过野外调查与室内分析相结合的手段,对云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质与有效态微量元素特征进行了测定分析;并根据综合得分模型计算出所有样地的综合主成分值,将其按综合主成分值进行了排序。结果表明:云南松林下干巴菌生长土壤的pH为4.69~5.70,有机质含量为35.85~129.59 g/kg,全氮含量为1.33~3.29 g/kg,全磷含量为0.38~0.63 g/kg,全钾含量为4.81~22.42 g/kg,水解性氮含量为104.24~285.17 mg/kg,有效磷含量为2.76~16.07 mg/kg,速效钾含量为74.33~368.80 mg/kg,有效锌含量为1.08~15.68 mg/kg,有效锰含量为8.74~39.37 mg/kg,有效铜含量为0.42~1.60 mg/kg,有效铁含量为53.44~232.36 mg/kg,有效硼含量为0.39~0.97 mg/kg。pH值与其他指标均不相关,全钾与其他指标间呈负相关或不相关,其余11个指标之间的相关性都是显著或极显著。综合评价得分表明,样地E和H的综合得分较高。因此,适宜干巴菌生长的土壤环境为弱酸性,有机质、全氮、全磷、全钾、水解性氮、有效磷和速效钾含量较高,有效态微量元素含量较丰富;有效锌、有效锰、有效铁和有效硼含量,均与有机质、碱解氮、有效磷、速效钾、全氮和全磷含量分别呈显著正相关,且有效态微量元素间关系也呈显著正相关。研究结果明确了干巴菌适宜栽培的土壤环境,可为其人工种植提供理论基础。

关键词：云南松干巴菌土壤环境微量元素

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基于SSR标记的云南省核桃种质资源遗传多样性及核心种质构建

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植物遗传资源学报 2020年第3期21卷 767-774页

作者：吴涛陈少瑜肖良俊宁德鲁潘莉贺娜朱云凤云南省林业和草原科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 云南省林业和草原科学院经济林研究所昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon信息指数(I)平均为1.3375,期望杂合度(He)平均为0.6040,Nei′s遗传多样性指数(Nei)平均为0.6043,数据表明云南核桃种质资源具有较为丰富的遗传多样性。遗传多样性在各州市分布不均,其中,迪庆州核桃资源的遗传多样性相对最高,最低的是临沧地区。基于遗传距离的UPGMA聚类结果,以5%~30%的取样比例分别构建初级种质(PC)、次级种质(SC)、核心种质-1(CC-1)、核心种质-2(CC-2)等4个核心种质,经遗传多样性分析及t检验,最终确定10.84%取样比例、115份样本量的核心种质-1(CC-1)为云南核桃资源的核心种质。

关键词：核桃 SSR分子标记种质资源遗传多样性核心种质

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竹叶花椒肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与表达分析

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基因组学与应用生物学 2020年第11期39卷 5201-5206页

作者：关淑文王毅郝佳波原晓龙陆斌西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)在木质素生物合成途径中起着关键作用。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CCR基因的全长c DNA序列,命名为ZaCCR... 详细信息

肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)在木质素生物合成途径中起着关键作用。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CCR基因的全长c DNA序列,命名为ZaCCR。序列分析结果表明,ZaCCR包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由990 bp组成,编码329个氨基酸。Blast比对结果显示该蛋白质属于CCR家族蛋白;系统进化树结果显示竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)与芸香科植物甜橙(Sweet orange,Citrus sinensis)、蜜柑(Satsuma mandarin,Citrus unshiu)等亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaCCR在竹叶花椒中的表达量从大到小分别为:嫁接树的茎、实生树的茎、嫁接树的叶、实生树的叶。

关键词：竹叶花椒(Zanthoxylum armatum) 肉桂酰辅酶A还原酶生物信息学分析

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文山兜兰种子非共生萌发成苗的研究

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西部林业科学 2020年第3期49卷 56-59,73页

作者：华梅孔继君向振勇赵黎明蒋宏云南省林业和草原科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

采用液体悬浮培养的方法对文山兜兰种子进行萌发培养,以花宝1号(1g/L)+C(0.5g/L)+椰子粉(10g/L)+琼脂(8g/L)+蔗糖(20g/L)+6-BA(1.0mg/L)+NAA(2.0mg/L)和花宝1号(1g/L)+C(0.5g/L)+椰子粉(10g/L)+琼脂(8g/L)+蔗糖(20g/L)+6-BA(2.0mg/L)+NAA(1.0mg/L)分别作为壮苗和生根培养基对文山兜兰幼苗进行培养。结果表明,采用液体悬浮培养的方式,文山兜兰种子萌发的时间为(59±2.67)d,平均萌发率为(66.33±6.22)%。采用该壮苗和生根培养基,文山兜兰幼苗生长健壮,并且根系发达、粗壮,成活率高。通过炼苗方法操作,在水苔基质中,移栽后的幼苗成活率高达90%以上。

关键词：文山兜兰非共生萌发无菌苗

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乳油木叶绿体基因组密码子偏好性分析

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分子植物育种 2020年第17期18卷 5658-5664页

作者：原晓龙李云琴张劲峰王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了解乳油木叶绿体基因组密码子的使用模式,该研究以从乳油木叶绿体基因组中筛选得到53条长度大于300 bp且非重复的CDS(Coding DNA sequence)序列为材料,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP分析其密码子偏好性。结果显示,密码子第3位GC... 详细信息

为了解乳油木叶绿体基因组密码子的使用模式,该研究以从乳油木叶绿体基因组中筛选得到53条长度大于300 bp且非重复的CDS(Coding DNA sequence)序列为材料,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP分析其密码子偏好性。结果显示,密码子第3位GC含量为27.47%,ENC范围在36.31~56.88,平均值为42.98。RSCU值大于1的密码子有28个,其中27个以A或U为结尾。中性绘图分析、ENC-plot分析和PR2-plot分析的结果显示乳油木叶绿体基因密码子偏好性主要受突变的影响。最优密码子为GGA、GAU、CAU和UUG。本研究结果为提高异源基因表达水平、改良乳油木重要经济性状等提供参考依据。

关键词：乳油木(Vitellaria paradoxa) 叶绿体基因组密码子偏好性突变

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