检索结果-内蒙古大学图书馆

青头菌(Russula virescens)聚酮合酶基因的克隆及碳源对该基因表达的影响

福建农林大学学报（自然科学版） 2021年第2期50卷 250-256页

作者：原晓龙王毅杨文忠云南省林业和草原科学院云南省森林培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了解青头菌中具体的聚酮合酶基因,从青头菌(Russula virescens)基因组挖掘并克隆到一个聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因(RvPKS),通过生物信息学分析预期其功能,并检测了不同浓度碳源添加物对该基因表达的影响.结果表明:RvPKS基... 详细信息

为了解青头菌中具体的聚酮合酶基因,从青头菌(Russula virescens)基因组挖掘并克隆到一个聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因(RvPKS),通过生物信息学分析预期其功能,并检测了不同浓度碳源添加物对该基因表达的影响.结果表明:RvPKS基因(GenBank登录号:MT655136)的cDNA长度为6039 bp,编码2012个氨基酸,结构域组织顺序为SAT-KS-AT-ACP-TE,各结构域的保守活性氨基酸序列为SAT(GIIGFSSGII)、KS(DTACSSSL)、AT(NVVEAHGTGTQ)、ACP(VVGHSLGEYVA)和TE(LGGWSLGGIIA);预测的RvPKS编码蛋白与火丝菌(Pyronema omphalodes)、鸡枞菌属(Termitomyces sp.)、白环菇属(Leucoagaricus sp.)、乌氏曲霉(Aspergillus udagawae)、丝曲霉(Aspergillus lentulus)、Penicillium subrubescens等相关聚酮合酶蛋白聚为一支,该蛋白可能催化合成一种新型的分生孢子色素.此外,2%山梨醇和10%蔗糖能强烈诱导RvPKS基因的表达.

关键词：青头菌聚酮合酶聚类分析基因表达

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牛樟芝MYB转录因子的全基因组鉴定与分析

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分子植物育种 2022年第14期20卷 4634-4641页

作者：张璋王毅罗玛妮娅王娟杨宇明郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 西南林业大学绿色发展研究院昆明650233

MYB转录因子在真菌的生长发育和胁迫响应中发挥多种作用。为了解牛樟芝MYB的功能,本研究利用本地BLAST对牛樟芝基因组进行比对分析,获得了9个牛樟芝MYB基因序列,并对牛樟芝MYB转录因子进行功能预测分析,利用转录组测序分析MYB基因在不... 详细信息

MYB转录因子在真菌的生长发育和胁迫响应中发挥多种作用。为了解牛樟芝MYB的功能,本研究利用本地BLAST对牛樟芝基因组进行比对分析,获得了9个牛樟芝MYB基因序列,并对牛樟芝MYB转录因子进行功能预测分析,利用转录组测序分析MYB基因在不同段木培养条件下子实体和菌丝体中的表达情况。蛋白理化性质分析发现,9个牛樟芝MYB转录因子多为不稳定蛋白,理论等电点介于4.92~8.51;亚细胞定位预测结果显示有1个转录因子(ACMYB1)定位在细胞质中,推测其可能参与细胞质基因的转录调控;有8个定位在细胞核中,占总蛋白的88.9%。二级结构预测发现以无规则卷曲和α-螺旋为主要结构,β-转角为次要结构。将9个牛樟芝MYB转录因子与5个已知功能的MYB蛋白共同构建系统进化树,14个MYB转录因子分为Ⅰ、Ⅱ两个分支,其中ACMYB1、ACMYB5与冬虫夏草中参与菌丝生长的MYB-6聚为一支,ACMYB9与冬虫夏草中参与子实体生长的MYB-3聚为一支,ACMYB6与顶头孢霉AcMYBA聚为一支。分析牛樟芝MYB转录因子在不同段木菌丝和子实体中的相对表达量,发现ACMYB1、ACMYB5、ACMYB6均在香樟段木菌丝体阶段高表达,推测其参与了牛樟芝菌丝体的生长,ACMYB9基因在香樟段木子实体阶段表达量上调,说明ACMYB9可能参与调控牛樟芝子实体的发育。本研究结果可为进一步挖掘研究牛樟芝MYB转录因子的功能奠定基础。

关键词：牛樟芝 MYB转录因子生物信息学分析转录组分析

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基于转录组数据竹叶花椒WRKY基因家族的鉴定及表达分析

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分子植物育种 2022年第18期20卷 5984-5994页

作者：冯发玉王毅陆斌何家妮原晓龙西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 中国林业科学研究院热带林业实验中心凭祥532600

WRKY是一类重要的转录因子,广泛参与调控植物的生长发育和多种应激反应。本研究基于竹叶花椒不同组织(根,芽,皮刺,果)的转录组测序数据,通过BLAST比对获得WRKY基因序列,并对获得的基因进行生物信息学分析;结合竹叶花椒不同组织基因表达... 详细信息

WRKY是一类重要的转录因子,广泛参与调控植物的生长发育和多种应激反应。本研究基于竹叶花椒不同组织(根,芽,皮刺,果)的转录组测序数据,通过BLAST比对获得WRKY基因序列,并对获得的基因进行生物信息学分析;结合竹叶花椒不同组织基因表达数据,分析参与竹叶花椒生长发育相关的WRKY转录因子。从竹叶花椒转录组共鉴定出43个WRKY转录因子,其中包括Ⅰ型基因6个、Ⅱ-a型基因4个、Ⅱ-b型基因7个、Ⅱ-c型基因13个、Ⅱ-d型基因5个、Ⅱ-e型基因4个、Ⅲ型基因4个。ZaWRKY基因表达热图分析显示,ZaWRKY38基因只在芽中表达,ZaWRKY25、ZaWRKY26、ZaWRKY22、ZaWRKY29、ZaWRKY37、ZaWRKY41基因只在根中表达,ZaWRKY15、ZaWRKY30基因只在果中表达,ZaWRKY1、ZaWRKY2、ZaWRKY10、ZaWRKY18、ZaWRKY28、ZaWRKY36、ZaWRKY43基因只在皮刺中表达,而且ZaWRKY2、ZaWRKY10、ZaWRKY28这3个基因的表达量随着皮刺发育过程出现逐渐增长的现象,表明这3个基因可能参与调节皮刺的生长发育。本研究首次鉴定竹叶花椒WRKY转录因子家族结构特征和表达特性,这将为进一步解析竹叶花椒WRKY转录因子的功能提供研究基础。

关键词： WRKY 竹叶花椒转录组生物信息学基因表达

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竹叶花椒ZaGGPPS基因克隆与表达分析

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广西植物 2021年第4期41卷 598-605页

作者：关淑文王毅郝佳波原晓龙陆斌李贤忠西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGG... 详细信息

为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGGPPS,并利用NCBI、ProParam、SignalP 4.1 server、DNAMAN和MEGA 7.0软件对ZaGGPPS基因进行生物信息学分析,并比较其在嫁接树和实生树中的表达量。结果表明:ZaGGPPS包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由1086 bp组成,编码361个氨基酸。其蛋白的相对分子量为39079.14 Da,理论等电点pI为6.38。Blast比对结果显示该蛋白质属于GGPPS家族蛋白,含有2个GGPPS蛋白特有的天冬氨酸富集基序,分别是“DDXXXXD”和“DDXXD”,以及5个特征性功能结构域。系统进化树结果显示竹叶花椒与芸香科植物甜橙(Citrus sinensis)、克里曼丁桔(***)、柚子(***)等亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaGGPPS基因在竹叶花椒中的表达量从高到低分别为实生树的叶、嫁接树的叶、实生树的茎、嫁接树的茎。牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶是竹叶花椒萜类化合物生物合成途径中的关键酶,通过嫁接可影响ZaGGPPS基因在叶和茎中的表达量。该文对竹叶花椒ZaGGPPS基因进行了克隆与分析,为后续深入研究竹叶花椒香气形成的分子机理及利用分子生物学手段选育优良品种提供理论依据。

关键词：竹叶花椒牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶克隆生物信息学分析

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西南桦4CL基因的克隆及表达分析

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分子植物育种 2021年第1期19卷 118-122页

作者：李云琴原晓龙王毅张劲峰云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为研究西南桦(Betula alnoides)中木质素生物合成途径的关键酶4-香豆酸:辅酶A连接酶的调控机制,本研究采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到一个具有完整开放阅读框的4-香豆酸:辅酶A连接酶基因(Ba4CL, NCBI登录号为MK959316),该基因全长1 6... 详细信息

为研究西南桦(Betula alnoides)中木质素生物合成途径的关键酶4-香豆酸:辅酶A连接酶的调控机制,本研究采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到一个具有完整开放阅读框的4-香豆酸:辅酶A连接酶基因(Ba4CL, NCBI登录号为MK959316),该基因全长1 629 bp,共编码542个氨基酸。西南桦Ba4CL与光皮桦(Betula luminifera, ACJ38668.1) 4CL的蛋白序列同源性为99.63%,与白桦(Betula platyphylla, AAV65114.1)4CL同源性为99.45%;Ba4CL基因拥有4CL基因家族的保守域及具有保守序列SSGTTGLPKGV和GEICIRG,Ba4CL与桦木属植物白桦和光皮桦聚在一起。Ba4CL基因在西南桦的根、小枝、树皮和叶片中均有表达,且在小枝中表达量最高,树皮次之。本研究为培育西南桦优良用材品种提供参考。

关键词：西南桦(Betula alnoides) 4-香豆酸:辅酶A连接酶荧光定量PCR 基因功能分析

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迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构

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西部林业科学 2021年第2期50卷 71-77页

作者：陆婷陈少瑜吴涛肖良俊云南省林业和草原技术推广总站云南昆明650224 云南省林业和草原科学院经济林研究所云南昆明650201 云南省林业和草原科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因,平均每对引物9.5个。3个群体的观察杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))的变化范围分别为0.390~0.580和0.580~0.619,平均值分别为0.467和0.598;Shannon信息指数(I)介于1.153~1.313之间,平均为1.231,数据表明迪庆州核桃种质资源的遗传多样性属于中等水平。群体间的遗传分化系数(F_(ST))介于0.0052~0.2253之间,平均为0.0652,表明遗传变异主要来源于群体内的个体,仅有6.52%来源于群体间,各位点的基因流(N_(m))平均为4.2663(N_(m)>1),群体间的基因交流阻止了群体间的分化。STRUCTURE分析将161份核桃资源分成3个类群,而基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将3个群体划分成2组,维西和香格里拉聚为一组,德钦单独为一组。

关键词：深纹核桃种质资源遗传多样性遗传结构 SSR分子标记

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干旱胁迫条件下水杨酸浸种对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼苗生长的影响

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湖南林业科技 2022年第3期49卷 24-29页

作者：张永坤张珊珊勐海县林业和草原局技术推广服务中心云南勐海666200 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

通过采用不同浓度水杨酸溶液(简称SA,浓度0、0.50、0.75 g·L^(-1))进行浸种处理及不同浓度聚乙二醇6000溶液(简称PEG 6000,浓度5%、15%和20%)模拟不同强度的干旱胁迫,研究干旱胁迫条件下SA溶液浸种对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼... 详细信息

通过采用不同浓度水杨酸溶液(简称SA,浓度0、0.50、0.75 g·L^(-1))进行浸种处理及不同浓度聚乙二醇6000溶液(简称PEG 6000,浓度5%、15%和20%)模拟不同强度的干旱胁迫,研究干旱胁迫条件下SA溶液浸种对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼苗生长指标的影响。结果表明:当SA溶液浓度分别为0、0.50和0.75 g·L^(-1)时,随着PEG 6000溶液浓度的增加,八蕊单室茱萸种子的萌发率、发芽势、发芽指数、地上部分干重和地下部分干重都显著下降。但是,当SA溶液浓度分别为0.50和0.75 g·L^(-1)时,种子萌发和早期幼苗生长指标的值显著高于同等PEG 6000浓度条件下SA溶液浓度为0 g·L^(-1)时的数值;而且,随着SA溶液浓度的增加,各项指标的值先升后降,在浓度为0.50 g·L^(-1)时达到最高值,显著高于浓度为0和0.75 g·L^(-1)两种处理条件下的值。综上所述,SA溶液的浸种处理可一定程度上缓解干旱胁迫对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼苗生长的影响。本研究可为八蕊单室茱萸的育苗提供一定的科学依据。

关键词：八蕊单室茱萸种子萌发幼苗生长水杨酸干旱胁迫

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普文试验林场森林土壤养分状况研究

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林业调查规划 2024年第2期49卷 111-123页

作者：张传光沈艳龚纯伟毕波贠新华云南省林业和草原科学院云南昆明650201 昆明理工大学津桥学院云南昆明650106 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南滇中高原森林生态系统国家定位观测研究站云南昆明650201

为了解普文试验林场土壤养分状况,通过土壤类型调查和基本理化性质测定,采用修正的内梅罗综合指数法对土壤进行肥力评价。结果表明,普文试验林场土壤为紫色砂岩上发育的赤红壤,土壤pH值总体属于酸性水平且随土层加深酸性减弱。A层SOM含... 详细信息

为了解普文试验林场土壤养分状况,通过土壤类型调查和基本理化性质测定,采用修正的内梅罗综合指数法对土壤进行肥力评价。结果表明,普文试验林场土壤为紫色砂岩上发育的赤红壤,土壤pH值总体属于酸性水平且随土层加深酸性减弱。A层SOM含量高,随土层加深呈高—中—低明显变化。N含量水平高,随土层加深含量下降,但仍能达到中等及以上水平。土壤P素十分缺乏,区域内各土层AP大部分处于较缺乏水平,少部分区域极度缺乏。土壤K素较丰富,且随土层加深有升高趋势,可被植物利用的AK仅少部分区域处于丰富水平,大部分处于较缺水平。中量元素中AS基本与同区域农田土壤中含量处于同一水平,EMg含量较低,ECa十分缺乏。微量元素基本与同区域农田土壤中含量处于同一水平或略高。受生物富集过程影响,土壤养分表现出较明显的“表聚性”,大部分区域土壤肥力等级为中等肥沃,少数为贫瘠水平,土壤养分含量呈现出随海拔升高而下降的变化趋势。

关键词：森林土壤土壤养分土壤肥力评价内梅罗综合指数法普文试验林场

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水培条件下氮磷钾配比施肥对木荷幼苗生长的影响

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西部林业科学 2021年第4期50卷 88-94,112页

作者：罗婷康洪梅杨文忠张珊珊云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为探究木荷幼苗生长对不同氮磷钾配比营养液的响应情况,为木荷壮苗培育合理施肥提供科学的理论依据,选择1月龄木荷幼苗作为试验材料,以Hoagland营养液为母液,进行氮磷钾3因素6水平缺素试验,在水培条件下研究不同氮磷钾配比对木荷幼苗生... 详细信息

为探究木荷幼苗生长对不同氮磷钾配比营养液的响应情况,为木荷壮苗培育合理施肥提供科学的理论依据,选择1月龄木荷幼苗作为试验材料,以Hoagland营养液为母液,进行氮磷钾3因素6水平缺素试验,在水培条件下研究不同氮磷钾配比对木荷幼苗生长的影响。结果表明:不同的氮磷钾营养液配比中,木荷幼苗的各项指标变化趋势基本一致,氮磷钾肥对木荷幼苗生长的影响表现为P>K>N,处理15表现最佳,处理12幼苗长势最差;木荷幼苗的株高、生物量、SOD、POD、CAT、SP均表现出随着施肥水平的提高先升高后降低的变化趋势,Pro和MDA在高水平施肥时显著增加。研究显示,以Hoagland液为水培营养液母液,氮磷钾水平分别为母液中氮磷钾元素浓度的1、1和0.5倍时,木荷幼苗生长最佳。

关键词：木荷幼苗水培营养氮磷钾肥生长指标生理指标

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基于林分关键指标的云南省云南松地理分布格局

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西部林业科学 2021年第1期50卷 19-26页

作者：陈剑杨文忠张珊珊王有兵王磊郑畹王生李建伟云南省林业和草原科学院云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林草局重点实验室云南昆明650201 云南省林业调查规划院大理分院云南大理671000 云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省林业和草原科学院森林植物培育与开发利用省级重点实验室云南昆明650201

云南松是云南省重要的森林资源,其林分普遍存在退化情况,对其提质增效已是紧迫的任务,但目前尚缺乏全省云南松林分质量及其地理分布格局的定量评价作为参考。本文用MaxEnt模型,结合350个云南松分布点和47个环境变量,获得云南松适生区范... 详细信息

云南松是云南省重要的森林资源,其林分普遍存在退化情况,对其提质增效已是紧迫的任务,但目前尚缺乏全省云南松林分质量及其地理分布格局的定量评价作为参考。本文用MaxEnt模型,结合350个云南松分布点和47个环境变量,获得云南松适生区范围;并通过Arcgis 10.2平台,在云南松适生范围区内对1500个云南松小班的3个关键指标,即公顷蓄积、年龄、生长速度进行插值和分级计算,获得全省范围内各指标分级及其地理分布格局。结果显示:总体上,云南松林分的公顷蓄积、生长速度处于较低的等级,而年龄结构为衰退型;生境退化、优良种源丧失、自然演替被打断等因素,是造成云南松在整体分布上年龄结构不合理、生长速度慢和公顷蓄积低等退化特征的原因;建议对现有云南松林进行提质增效,对优良种源进行集中经营,促进地带性植被演替进程的恢复。本研究为云南省森林资源的可持续经营提供参考。

关键词：云南松林分关键指标分布格局公顷蓄积年龄结构生长速度

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